Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1M2VFL4

Protein Details
Accession A0A1M2VFL4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-99TPPPDVLKPPSRKRRRTLPYQGPDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
87-90RKRR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024738  Hfi1/Tada1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0070461  C:SAGA-type complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF12767  SAGA-Tad1  
Amino Acid Sequences MSLSSTTTIKNQLSTALGPKAPPYFSVLKDYLSGHISRTEYDDQVKTHLDSTHLVQLHNTLIVSLFDTSAHLAPPTPPPDVLKPPSRKRRRTLPYQGPDAMDEGTLRSARLKKWTVGLGRRERDRIRALETVALNEPVVPKDYTDEIAAERGVTLMQERGESPGSRLPLHLASMTRAPTMQHISDRINLICAQHNLGAPSRDVASLMMLAFEAKLKQLITQALQLTSSSHAISSIRAAEPHSHSYVLSASSFDSLFSVSPAALPNKSATAMRLAVGDNDTTEDDVILKNKDMRDRRWQLFALLGERSTVKEALRTLH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.29
3 0.28
4 0.28
5 0.26
6 0.29
7 0.3
8 0.28
9 0.26
10 0.27
11 0.27
12 0.28
13 0.35
14 0.32
15 0.3
16 0.32
17 0.32
18 0.29
19 0.26
20 0.25
21 0.19
22 0.23
23 0.22
24 0.21
25 0.25
26 0.26
27 0.25
28 0.3
29 0.32
30 0.27
31 0.3
32 0.31
33 0.27
34 0.26
35 0.25
36 0.22
37 0.21
38 0.24
39 0.27
40 0.26
41 0.25
42 0.22
43 0.23
44 0.22
45 0.21
46 0.17
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.1
51 0.09
52 0.08
53 0.07
54 0.08
55 0.1
56 0.09
57 0.1
58 0.08
59 0.09
60 0.1
61 0.17
62 0.19
63 0.19
64 0.19
65 0.22
66 0.27
67 0.34
68 0.37
69 0.41
70 0.47
71 0.56
72 0.66
73 0.74
74 0.76
75 0.76
76 0.81
77 0.8
78 0.81
79 0.82
80 0.82
81 0.78
82 0.77
83 0.73
84 0.62
85 0.55
86 0.45
87 0.34
88 0.23
89 0.17
90 0.11
91 0.1
92 0.09
93 0.09
94 0.12
95 0.15
96 0.17
97 0.24
98 0.27
99 0.26
100 0.3
101 0.36
102 0.38
103 0.42
104 0.49
105 0.51
106 0.53
107 0.54
108 0.57
109 0.52
110 0.51
111 0.49
112 0.42
113 0.38
114 0.36
115 0.33
116 0.32
117 0.31
118 0.27
119 0.23
120 0.21
121 0.15
122 0.13
123 0.13
124 0.09
125 0.11
126 0.09
127 0.08
128 0.09
129 0.1
130 0.11
131 0.1
132 0.11
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.07
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.08
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.12
151 0.14
152 0.14
153 0.14
154 0.14
155 0.13
156 0.14
157 0.13
158 0.11
159 0.11
160 0.13
161 0.14
162 0.12
163 0.11
164 0.11
165 0.12
166 0.15
167 0.15
168 0.14
169 0.16
170 0.17
171 0.2
172 0.21
173 0.19
174 0.17
175 0.17
176 0.16
177 0.17
178 0.16
179 0.15
180 0.16
181 0.16
182 0.16
183 0.17
184 0.17
185 0.13
186 0.14
187 0.13
188 0.11
189 0.1
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.06
203 0.08
204 0.11
205 0.13
206 0.13
207 0.18
208 0.19
209 0.18
210 0.18
211 0.17
212 0.15
213 0.15
214 0.15
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.11
221 0.12
222 0.11
223 0.12
224 0.14
225 0.18
226 0.22
227 0.26
228 0.26
229 0.23
230 0.22
231 0.23
232 0.23
233 0.19
234 0.15
235 0.11
236 0.1
237 0.11
238 0.11
239 0.1
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.06
246 0.07
247 0.11
248 0.13
249 0.13
250 0.14
251 0.15
252 0.16
253 0.17
254 0.17
255 0.15
256 0.17
257 0.17
258 0.16
259 0.17
260 0.16
261 0.17
262 0.17
263 0.16
264 0.12
265 0.13
266 0.13
267 0.12
268 0.11
269 0.1
270 0.09
271 0.11
272 0.13
273 0.13
274 0.15
275 0.19
276 0.23
277 0.32
278 0.38
279 0.43
280 0.51
281 0.59
282 0.6
283 0.63
284 0.6
285 0.53
286 0.52
287 0.49
288 0.42
289 0.35
290 0.31
291 0.25
292 0.25
293 0.25
294 0.22
295 0.21
296 0.17
297 0.19