FuNGI

A0A1M2VSK3

Protein Details

Accession

A0A1M2VSK3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
108-128	DGVAPRAKMNQQRSRRFRTAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 12.5, cyto_mito 11, cyto 8.5, nucl 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSKKYPKIILPVVEAEATKVPGDDGNEVTVPVLMTDPNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPETEEEMMIEIFTYTERVVNMVRPRKLLFMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRTAQEAKEKEEAHKESVILWEAMGKTLSEDEKSKKPWDSNAITPGTPFMDILSASLRYWVVNKMNTDPGWADIQVIISDASVPGEGEHKIMDWIRRQRSNPGHDPNTRHVIYGLDADLIMLSLATHEPHFRVLREDVFHQEGSRTACRICGQEGHYAAQCTGTKAEIKKPPAEKKPFIWLDVAILREYLEAELNVPQVPFPFSFEQAIDDWVLLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLLKIWRTELPRMGGYITNHGQLELTRAQIILEGLAKREDEIFRRRRESEERQDQSAKRRKLEKEIRDGTANGTIAPSASLNLTANPTAPSSLPARPDFAAKADSIGLGGPKTSETAAHAPAAARALAGSNRDIVANRHAIRLANMSAAEMLKAEMASLVPVKPSKNSLSTTAATPAPLATDNSVEPTTAPSATFPSGDELEIPGLGGVSSTPPTGAVETNAPSEPMHVENGTAPKANGEAETPVVEAEDVVMDDTTARGRKRSIHEVEAEDANVDADGDVTVDIGDDDDDPAPTNTSMKLKVNPDGTVEQEDIVKLWEPGYRERYYRQKFGVEYDDKAFRKEVTTRYVEGMAWVLQYYYQGTPSWTWYYPYHFAPFAADFEDLDKMDLQFNLGKPFRPFEQLMGVFPAASRQHIPSTFHDLMTEETSPIIDFYPSTFEIDMNGKRMAWQGVALLPFIDEKRLLEAMGTRYDGLTEEEKRRNTMGHDVLFAYESNALYPSLEALYGKRKKDEPMPIDVKVSKGISGFLLRNPDCIPDSTYFNPLPTQDLPDIKNDRSLSAFYLFPKQLSPHRSILLPGVRRPAPILNSSDLEQARRGGPSSRGRGGGGYDRGGRGGFRGGQGGGDYGNRSNGGWQNGGSQNQSYNNNQQSYTQQSYSSSYQSYQRGRGGFSQPSSAPRGQYNDFAAAPSRGRGGYGGGGQGNSYGGYGGGGGGGGGYGGGARGGYNGQSQGGYSQGGYNQGGGQGGYSQGGGGYNGGSQGYGGYGGAQNGQAPASNGGYGGGGSYGNARGGYNGGGRGRGRGGRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.61
3	0.65
4	0.67
5	0.62
6	0.58
7	0.53
8	0.48
9	0.41
10	0.37
11	0.31
12	0.26
13	0.23
14	0.18
15	0.15
16	0.14
17	0.14
18	0.17
19	0.18
20	0.17
21	0.19
22	0.19
23	0.19
24	0.18
25	0.17
26	0.14
27	0.11
28	0.1
29	0.08
30	0.09
31	0.15
32	0.16
33	0.18
34	0.2
35	0.19
36	0.21
37	0.21
38	0.23
39	0.2
40	0.21
41	0.19
42	0.18
43	0.19
44	0.16
45	0.15
46	0.13
47	0.1
48	0.08
49	0.09
50	0.09
51	0.09
52	0.1
53	0.13
54	0.17
55	0.2
56	0.2
57	0.27
58	0.33
59	0.36
60	0.41
61	0.4
62	0.4
63	0.39
64	0.42
65	0.36
66	0.33
67	0.28
68	0.24
69	0.22
70	0.17
71	0.14
72	0.1
73	0.09
74	0.06
75	0.07
76	0.06
77	0.08
78	0.09
79	0.1
80	0.12
81	0.19
82	0.28
83	0.36
84	0.39
85	0.41
86	0.43
87	0.44
88	0.44
89	0.42
90	0.34
91	0.29
92	0.29
93	0.25
94	0.25
95	0.21
96	0.21
97	0.18
98	0.16
99	0.12
100	0.14
101	0.2
102	0.27
103	0.37
104	0.45
105	0.55
106	0.66
107	0.75
108	0.8
109	0.82
110	0.79
111	0.76
112	0.77
113	0.77
114	0.75
115	0.78
116	0.72
117	0.69
118	0.71
119	0.65
120	0.58
121	0.57
122	0.52
123	0.45
124	0.43
125	0.38
126	0.32
127	0.34
128	0.32
129	0.23
130	0.19
131	0.19
132	0.17
133	0.18
134	0.17
135	0.13
136	0.11
137	0.14
138	0.16
139	0.15
140	0.19
141	0.23
142	0.31
143	0.36
144	0.4
145	0.43
146	0.45
147	0.49
148	0.54
149	0.55
150	0.54
151	0.57
152	0.54
153	0.48
154	0.45
155	0.39
156	0.31
157	0.25
158	0.19
159	0.12
160	0.1
161	0.1
162	0.1
163	0.11
164	0.11
165	0.11
166	0.13
167	0.12
168	0.12
169	0.14
170	0.19
171	0.21
172	0.25
173	0.27
174	0.29
175	0.36
176	0.35
177	0.36
178	0.31
179	0.28
180	0.26
181	0.23
182	0.2
183	0.14
184	0.15
185	0.12
186	0.12
187	0.1
188	0.07
189	0.07
190	0.06
191	0.06
192	0.06
193	0.06
194	0.05
195	0.07
196	0.08
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.11
201	0.14
202	0.18
203	0.25
204	0.34
205	0.41
206	0.48
207	0.5
208	0.57
209	0.64
210	0.68
211	0.69
212	0.7
213	0.69
214	0.69
215	0.73
216	0.69
217	0.68
218	0.59
219	0.5
220	0.41
221	0.34
222	0.29
223	0.25
224	0.2
225	0.12
226	0.11
227	0.1
228	0.1
229	0.08
230	0.07
231	0.04
232	0.03
233	0.04
234	0.04
235	0.05
236	0.06
237	0.08
238	0.09
239	0.14
240	0.16
241	0.16
242	0.2
243	0.23
244	0.26
245	0.28
246	0.29
247	0.29
248	0.31
249	0.3
250	0.26
251	0.24
252	0.23
253	0.25
254	0.25
255	0.22
256	0.18
257	0.21
258	0.23
259	0.24
260	0.23
261	0.23
262	0.24
263	0.29
264	0.31
265	0.3
266	0.3
267	0.29
268	0.26
269	0.25
270	0.23
271	0.19
272	0.17
273	0.16
274	0.19
275	0.21
276	0.29
277	0.32
278	0.35
279	0.41
280	0.49
281	0.57
282	0.63
283	0.69
284	0.65
285	0.61
286	0.67
287	0.62
288	0.55
289	0.47
290	0.37
291	0.32
292	0.31
293	0.28
294	0.18
295	0.16
296	0.14
297	0.13
298	0.13
299	0.09
300	0.07
301	0.06
302	0.07
303	0.09
304	0.09
305	0.1
306	0.09
307	0.09
308	0.09
309	0.11
310	0.11
311	0.14
312	0.15
313	0.16
314	0.17
315	0.17
316	0.19
317	0.17
318	0.18
319	0.14
320	0.11
321	0.1
322	0.08
323	0.08
324	0.05
325	0.04
326	0.03
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.03
331	0.04
332	0.06
333	0.06
334	0.07
335	0.07
336	0.08
337	0.08
338	0.08
339	0.12
340	0.13
341	0.13
342	0.12
343	0.13
344	0.12
345	0.12
346	0.11
347	0.08
348	0.06
349	0.09
350	0.1
351	0.1
352	0.1
353	0.11
354	0.16
355	0.19
356	0.23
357	0.24
358	0.26
359	0.26
360	0.27
361	0.27
362	0.25
363	0.22
364	0.25
365	0.22
366	0.21
367	0.2
368	0.2
369	0.18
370	0.15
371	0.19
372	0.14
373	0.13
374	0.11
375	0.11
376	0.11
377	0.12
378	0.12
379	0.08
380	0.1
381	0.09
382	0.1
383	0.11
384	0.11
385	0.1
386	0.13
387	0.14
388	0.16
389	0.25
390	0.32
391	0.37
392	0.42
393	0.43
394	0.46
395	0.53
396	0.58
397	0.59
398	0.63
399	0.6
400	0.6
401	0.65
402	0.62
403	0.64
404	0.64
405	0.57
406	0.52
407	0.57
408	0.56
409	0.6
410	0.67
411	0.65
412	0.66
413	0.66
414	0.63
415	0.56
416	0.54
417	0.44
418	0.38
419	0.3
420	0.2
421	0.15
422	0.12
423	0.1
424	0.1
425	0.08
426	0.05
427	0.05
428	0.06
429	0.06
430	0.07
431	0.08
432	0.08
433	0.09
434	0.09
435	0.09
436	0.09
437	0.09
438	0.1
439	0.12
440	0.15
441	0.18
442	0.18
443	0.2
444	0.19
445	0.21
446	0.2
447	0.18
448	0.17
449	0.13
450	0.13
451	0.11
452	0.1
453	0.09
454	0.08
455	0.07
456	0.06
457	0.06
458	0.05
459	0.05
460	0.06
461	0.05
462	0.05
463	0.08
464	0.11
465	0.12
466	0.12
467	0.13
468	0.12
469	0.13
470	0.13
471	0.1
472	0.07
473	0.05
474	0.06
475	0.07
476	0.08
477	0.08
478	0.08
479	0.08
480	0.09
481	0.09
482	0.1
483	0.12
484	0.18
485	0.18
486	0.18
487	0.19
488	0.19
489	0.19
490	0.2
491	0.17
492	0.12
493	0.11
494	0.1
495	0.1
496	0.1
497	0.09
498	0.06
499	0.06
500	0.05
501	0.04
502	0.04
503	0.04
504	0.03
505	0.04
506	0.05
507	0.05
508	0.06
509	0.08
510	0.08
511	0.09
512	0.13
513	0.14
514	0.17
515	0.19
516	0.21
517	0.25
518	0.25
519	0.25
520	0.24
521	0.22
522	0.18
523	0.17
524	0.13
525	0.09
526	0.09
527	0.08
528	0.06
529	0.07
530	0.07
531	0.09
532	0.09
533	0.09
534	0.08
535	0.09
536	0.1
537	0.09
538	0.09
539	0.07
540	0.09
541	0.09
542	0.1
543	0.08
544	0.1
545	0.1
546	0.1
547	0.09
548	0.08
549	0.08
550	0.07
551	0.07
552	0.04
553	0.04
554	0.03
555	0.03
556	0.02
557	0.03
558	0.04
559	0.04
560	0.04
561	0.04
562	0.05
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.07
567	0.08
568	0.1
569	0.1
570	0.1
571	0.09
572	0.09
573	0.09
574	0.09
575	0.09
576	0.07
577	0.08
578	0.09
579	0.11
580	0.11
581	0.11
582	0.09
583	0.09
584	0.09
585	0.09
586	0.08
587	0.07
588	0.06
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.06
593	0.06
594	0.05
595	0.04
596	0.04
597	0.03
598	0.03
599	0.03
600	0.03
601	0.03
602	0.03
603	0.03
604	0.05
605	0.08
606	0.09
607	0.1
608	0.11
609	0.18
610	0.23
611	0.33
612	0.35
613	0.35
614	0.39
615	0.39
616	0.4
617	0.34
618	0.29
619	0.19
620	0.15
621	0.11
622	0.07
623	0.05
624	0.03
625	0.03
626	0.03
627	0.03
628	0.03
629	0.03
630	0.03
631	0.03
632	0.03
633	0.03
634	0.03
635	0.03
636	0.04
637	0.04
638	0.05
639	0.06
640	0.06
641	0.07
642	0.07
643	0.07
644	0.08
645	0.1
646	0.13
647	0.14
648	0.19
649	0.2
650	0.25
651	0.26
652	0.25
653	0.26
654	0.24
655	0.24
656	0.21
657	0.19
658	0.15
659	0.13
660	0.13
661	0.1
662	0.09
663	0.08
664	0.06
665	0.06
666	0.08
667	0.09
668	0.14
669	0.2
670	0.21
671	0.22
672	0.27
673	0.37
674	0.4
675	0.44
676	0.42
677	0.4
678	0.39
679	0.41
680	0.45
681	0.37
682	0.34
683	0.32
684	0.37
685	0.33
686	0.33
687	0.3
688	0.22
689	0.22
690	0.25
691	0.26
692	0.24
693	0.27
694	0.28
695	0.29
696	0.29
697	0.26
698	0.22
699	0.19
700	0.13
701	0.1
702	0.08
703	0.07
704	0.06
705	0.06
706	0.08
707	0.07
708	0.08
709	0.08
710	0.09
711	0.1
712	0.14
713	0.17
714	0.16
715	0.18
716	0.19
717	0.24
718	0.25
719	0.27
720	0.26
721	0.22
722	0.22
723	0.21
724	0.21
725	0.16
726	0.15
727	0.13
728	0.1
729	0.11
730	0.13
731	0.1
732	0.1
733	0.1
734	0.09
735	0.1
736	0.1
737	0.1
738	0.11
739	0.12
740	0.19
741	0.19
742	0.21
743	0.21
744	0.23
745	0.23
746	0.25
747	0.25
748	0.2
749	0.27
750	0.26
751	0.25
752	0.26
753	0.24
754	0.19
755	0.18
756	0.2
757	0.12
758	0.13
759	0.14
760	0.13
761	0.17
762	0.19
763	0.24
764	0.23
765	0.32
766	0.32
767	0.3
768	0.29
769	0.26
770	0.25
771	0.24
772	0.21
773	0.12
774	0.1
775	0.1
776	0.1
777	0.1
778	0.08
779	0.05
780	0.05
781	0.06
782	0.1
783	0.1
784	0.12
785	0.12
786	0.11
787	0.13
788	0.18
789	0.19
790	0.18
791	0.18
792	0.16
793	0.17
794	0.19
795	0.18
796	0.14
797	0.13
798	0.11
799	0.13
800	0.13
801	0.12
802	0.1
803	0.09
804	0.1
805	0.1
806	0.1
807	0.08
808	0.08
809	0.11
810	0.11
811	0.11
812	0.1
813	0.14
814	0.15
815	0.17
816	0.18
817	0.14
818	0.14
819	0.14
820	0.14
821	0.14
822	0.15
823	0.18
824	0.24
825	0.3
826	0.32
827	0.33
828	0.34
829	0.32
830	0.31
831	0.35
832	0.33
833	0.29
834	0.29
835	0.28
836	0.27
837	0.27
838	0.23
839	0.16
840	0.12
841	0.1
842	0.09
843	0.09
844	0.09
845	0.08
846	0.08
847	0.08
848	0.06
849	0.07
850	0.07
851	0.08
852	0.18
853	0.24
854	0.26
855	0.29
856	0.31
857	0.35
858	0.43
859	0.52
860	0.45
861	0.49
862	0.52
863	0.5
864	0.52
865	0.49
866	0.41
867	0.35
868	0.31
869	0.22
870	0.18
871	0.17
872	0.15
873	0.18
874	0.18
875	0.17
876	0.25
877	0.24
878	0.26
879	0.25
880	0.26
881	0.24
882	0.24
883	0.25
884	0.19
885	0.24
886	0.24
887	0.29
888	0.26
889	0.26
890	0.26
891	0.23
892	0.25
893	0.21
894	0.24
895	0.22
896	0.26
897	0.26
898	0.33
899	0.37
900	0.33
901	0.38
902	0.34
903	0.31
904	0.29
905	0.29
906	0.24
907	0.22
908	0.23
909	0.18
910	0.25
911	0.24
912	0.23
913	0.24
914	0.25
915	0.29
916	0.32
917	0.36
918	0.32
919	0.33
920	0.34
921	0.33
922	0.37
923	0.38
924	0.37
925	0.35
926	0.37
927	0.37
928	0.36
929	0.38
930	0.36
931	0.31
932	0.31
933	0.32
934	0.29
935	0.3
936	0.3
937	0.34
938	0.3
939	0.28
940	0.25
941	0.23
942	0.22
943	0.21
944	0.21
945	0.18
946	0.26
947	0.33
948	0.38
949	0.4
950	0.4
951	0.4
952	0.39
953	0.39
954	0.39
955	0.33
956	0.29
957	0.28
958	0.27
959	0.27
960	0.26
961	0.23
962	0.17
963	0.18
964	0.17
965	0.15
966	0.17
967	0.16
968	0.17
969	0.17
970	0.16
971	0.12
972	0.12
973	0.13
974	0.11
975	0.13
976	0.13
977	0.12
978	0.17
979	0.21
980	0.23
981	0.23
982	0.22
983	0.28
984	0.32
985	0.34
986	0.3
987	0.27
988	0.27
989	0.31
990	0.35
991	0.33
992	0.37
993	0.42
994	0.42
995	0.42
996	0.4
997	0.41
998	0.45
999	0.45
1000	0.37
1001	0.32
1002	0.32
1003	0.36
1004	0.36
1005	0.34
1006	0.28
1007	0.25
1008	0.3
1009	0.37
1010	0.4
1011	0.4
1012	0.43
1013	0.42
1014	0.43
1015	0.47
1016	0.47
1017	0.45
1018	0.42
1019	0.42
1020	0.38
1021	0.4
1022	0.44
1023	0.4
1024	0.36
1025	0.34
1026	0.38
1027	0.34
1028	0.37
1029	0.37
1030	0.34
1031	0.32
1032	0.3
1033	0.29
1034	0.26
1035	0.24
1036	0.21
1037	0.2
1038	0.16
1039	0.16
1040	0.16
1041	0.16
1042	0.16
1043	0.17
1044	0.19
1045	0.18
1046	0.18
1047	0.17
1048	0.17
1049	0.15
1050	0.12
1051	0.1
1052	0.07
1053	0.05
1054	0.05
1055	0.05
1056	0.05
1057	0.04
1058	0.04
1059	0.04
1060	0.03
1061	0.03
1062	0.03
1063	0.02
1064	0.02
1065	0.02
1066	0.02
1067	0.03
1068	0.03
1069	0.03
1070	0.05
1071	0.06
1072	0.08
1073	0.1
1074	0.11
1075	0.12
1076	0.13
1077	0.13
1078	0.13
1079	0.14
1080	0.13
1081	0.11
1082	0.12
1083	0.13
1084	0.17
1085	0.17
1086	0.17
1087	0.16
1088	0.17
1089	0.17
1090	0.14
1091	0.13
1092	0.1
1093	0.1
1094	0.09
1095	0.09
1096	0.07
1097	0.07
1098	0.08
1099	0.08
1100	0.07
1101	0.07
1102	0.07
1103	0.08
1104	0.08
1105	0.07
1106	0.07
1107	0.07
1108	0.07
1109	0.07
1110	0.06
1111	0.07
1112	0.09
1113	0.1
1114	0.11
1115	0.11
1116	0.12
1117	0.12
1118	0.13
1119	0.12
1120	0.12
1121	0.15
1122	0.15
1123	0.14
1124	0.13
1125	0.13
1126	0.13
1127	0.11
1128	0.1
1129	0.08
1130	0.06
1131	0.06
1132	0.09
1133	0.1
1134	0.11
1135	0.11
1136	0.11
1137	0.11
1138	0.13
1139	0.16
1140	0.16
1141	0.2
1142	0.21
1143	0.25
1144	0.26
1145	0.28
1146	0.33

A0A1M2VSK3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer