FuNGI

A0A1M2VHV5

Protein Details

Accession

A0A1M2VHV5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
88-109	HGAPRSEKTRREEQRKDKAEYL	Basic
134-158	IAALPPRFSRRPKERKPTIAAIREK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
143-149	RRPKERK

Subcellular Location(s)

cyto 12.5, cyto_nucl 8.5, nucl 3.5, mito 3, E.R. 3, plas 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MALGNAFNGAGVEVVEWVKLRVSVPDCTWSSVSVHAFIVPSLCAPIILGTPFFVRNNILVDVAHKALWHVESGRDLTIVSSPTSSVEHGAPRSEKTRREEQRKDKAEYLELQRRLAFTAHRDTAREIAVNVPTIAALPPRFSRRPKERKPTIAAIREKVEELALLESLKREDAHMKERFADCFPEDIPHLRDLPTDVVHEINLKDANLTIVRRQYDCPKKYREVWKTLLQQHLDAGRLRPSSSPYASPSFLVPKSDPSALPRWVNDYRVLNDNTIPDVHPLPSIQEILSDCGRGIIWAKLDMTNSFYQTPMKPEHIKYTAVTTPFGLYEWTVMPQGCRNAPSTHQRRMFSALREHIGVICHVYLDDIIIWSSSLEEHRRNVETVLNALRKNKLYCSLKKTDLFCIELGFLGHKISRNGIAPDGEKVAKIANWPTPKNATDVRSFLGLVRYVASFLPHLAELTTVLNPLTTKEAEKNFEWNSKHDEAFDAVKGLVLSHECLTVIDHQNLGDNKIFVSTDASDYCTGAVLMYGPTVEAARPVAFESSQLNSAELNYPVHEKELLAIVRALKKWRIDLLGVPFTVFTDHRTLENFATQKHLSRRQARWQEFLGQYDYTIAYIKGSDNGAADALSRLTVPVIDPSSLSDPAIATLTLLDGALAGLTAVERTHVTVRPTVAAIGALRVASDPVWLERIRAGYADDAWSMRLLAMLNDGRLDTFEKFRAGNLDGRESTGIAVRNSLLYIGDRLCIPRVSDLREGIFRMAHDSLGHFGFDKSYAAIRDAYFWPNMRTELEKLYIPSCDACQRNKGTTRKPAGPLHPLPVPDGRCDSVAIDFIGPLPEDGGFNSICTMTDRLGSELRFVPCRTDMTAEDFA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.07
2	0.08
3	0.08
4	0.09
5	0.1
6	0.11
7	0.11
8	0.17
9	0.21
10	0.25
11	0.27
12	0.35
13	0.35
14	0.38
15	0.38
16	0.32
17	0.3
18	0.31
19	0.3
20	0.24
21	0.23
22	0.21
23	0.2
24	0.19
25	0.19
26	0.13
27	0.11
28	0.11
29	0.1
30	0.08
31	0.08
32	0.09
33	0.1
34	0.11
35	0.11
36	0.11
37	0.13
38	0.16
39	0.16
40	0.17
41	0.16
42	0.17
43	0.2
44	0.2
45	0.19
46	0.16
47	0.17
48	0.2
49	0.19
50	0.18
51	0.14
52	0.13
53	0.15
54	0.16
55	0.17
56	0.15
57	0.16
58	0.19
59	0.21
60	0.21
61	0.18
62	0.18
63	0.16
64	0.17
65	0.17
66	0.14
67	0.13
68	0.12
69	0.13
70	0.15
71	0.15
72	0.14
73	0.16
74	0.2
75	0.21
76	0.26
77	0.27
78	0.29
79	0.36
80	0.4
81	0.44
82	0.45
83	0.55
84	0.6
85	0.68
86	0.75
87	0.79
88	0.83
89	0.84
90	0.84
91	0.8
92	0.73
93	0.68
94	0.65
95	0.64
96	0.62
97	0.56
98	0.52
99	0.47
100	0.43
101	0.4
102	0.34
103	0.28
104	0.25
105	0.31
106	0.34
107	0.35
108	0.36
109	0.37
110	0.38
111	0.36
112	0.32
113	0.23
114	0.22
115	0.22
116	0.22
117	0.19
118	0.16
119	0.13
120	0.13
121	0.13
122	0.13
123	0.11
124	0.13
125	0.18
126	0.26
127	0.32
128	0.37
129	0.47
130	0.54
131	0.65
132	0.72
133	0.78
134	0.81
135	0.84
136	0.86
137	0.86
138	0.84
139	0.83
140	0.78
141	0.71
142	0.65
143	0.57
144	0.5
145	0.4
146	0.31
147	0.22
148	0.16
149	0.13
150	0.1
151	0.09
152	0.09
153	0.09
154	0.1
155	0.11
156	0.1
157	0.11
158	0.17
159	0.21
160	0.3
161	0.34
162	0.35
163	0.4
164	0.42
165	0.42
166	0.37
167	0.36
168	0.28
169	0.26
170	0.24
171	0.21
172	0.21
173	0.22
174	0.23
175	0.22
176	0.22
177	0.2
178	0.2
179	0.2
180	0.21
181	0.19
182	0.17
183	0.16
184	0.15
185	0.15
186	0.17
187	0.15
188	0.15
189	0.14
190	0.13
191	0.12
192	0.12
193	0.14
194	0.14
195	0.16
196	0.16
197	0.2
198	0.23
199	0.24
200	0.27
201	0.35
202	0.43
203	0.48
204	0.51
205	0.54
206	0.57
207	0.64
208	0.72
209	0.7
210	0.67
211	0.67
212	0.68
213	0.7
214	0.7
215	0.68
216	0.59
217	0.5
218	0.46
219	0.42
220	0.36
221	0.29
222	0.24
223	0.23
224	0.22
225	0.23
226	0.21
227	0.23
228	0.26
229	0.27
230	0.28
231	0.27
232	0.3
233	0.3
234	0.29
235	0.27
236	0.27
237	0.25
238	0.26
239	0.22
240	0.22
241	0.25
242	0.26
243	0.25
244	0.24
245	0.29
246	0.29
247	0.31
248	0.27
249	0.31
250	0.31
251	0.32
252	0.32
253	0.31
254	0.29
255	0.33
256	0.34
257	0.28
258	0.28
259	0.27
260	0.23
261	0.21
262	0.19
263	0.14
264	0.14
265	0.14
266	0.13
267	0.12
268	0.12
269	0.12
270	0.13
271	0.1
272	0.12
273	0.12
274	0.14
275	0.14
276	0.13
277	0.11
278	0.11
279	0.11
280	0.09
281	0.1
282	0.09
283	0.09
284	0.1
285	0.11
286	0.12
287	0.13
288	0.13
289	0.16
290	0.16
291	0.17
292	0.16
293	0.16
294	0.17
295	0.17
296	0.21
297	0.2
298	0.24
299	0.27
300	0.28
301	0.35
302	0.34
303	0.35
304	0.31
305	0.33
306	0.31
307	0.27
308	0.26
309	0.19
310	0.17
311	0.16
312	0.15
313	0.11
314	0.07
315	0.08
316	0.08
317	0.08
318	0.09
319	0.09
320	0.09
321	0.11
322	0.14
323	0.14
324	0.15
325	0.16
326	0.17
327	0.22
328	0.31
329	0.35
330	0.42
331	0.46
332	0.46
333	0.45
334	0.5
335	0.49
336	0.43
337	0.43
338	0.37
339	0.33
340	0.32
341	0.31
342	0.25
343	0.21
344	0.18
345	0.12
346	0.08
347	0.07
348	0.06
349	0.06
350	0.05
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.07
361	0.1
362	0.12
363	0.14
364	0.17
365	0.19
366	0.19
367	0.19
368	0.2
369	0.17
370	0.18
371	0.22
372	0.22
373	0.22
374	0.23
375	0.25
376	0.25
377	0.26
378	0.25
379	0.27
380	0.31
381	0.36
382	0.42
383	0.44
384	0.47
385	0.5
386	0.51
387	0.47
388	0.43
389	0.39
390	0.31
391	0.27
392	0.21
393	0.17
394	0.15
395	0.1
396	0.08
397	0.06
398	0.07
399	0.08
400	0.08
401	0.09
402	0.11
403	0.12
404	0.13
405	0.13
406	0.14
407	0.13
408	0.13
409	0.14
410	0.13
411	0.11
412	0.1
413	0.1
414	0.09
415	0.09
416	0.11
417	0.14
418	0.19
419	0.2
420	0.22
421	0.25
422	0.25
423	0.27
424	0.28
425	0.26
426	0.23
427	0.24
428	0.22
429	0.19
430	0.19
431	0.16
432	0.15
433	0.12
434	0.1
435	0.09
436	0.09
437	0.09
438	0.08
439	0.08
440	0.06
441	0.06
442	0.07
443	0.06
444	0.06
445	0.05
446	0.05
447	0.05
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.06
452	0.06
453	0.06
454	0.07
455	0.08
456	0.08
457	0.09
458	0.13
459	0.16
460	0.19
461	0.2
462	0.24
463	0.24
464	0.3
465	0.3
466	0.28
467	0.32
468	0.31
469	0.31
470	0.26
471	0.25
472	0.2
473	0.21
474	0.19
475	0.12
476	0.1
477	0.1
478	0.09
479	0.08
480	0.07
481	0.06
482	0.07
483	0.07
484	0.07
485	0.06
486	0.07
487	0.08
488	0.12
489	0.15
490	0.14
491	0.14
492	0.14
493	0.18
494	0.18
495	0.19
496	0.15
497	0.12
498	0.12
499	0.12
500	0.12
501	0.08
502	0.11
503	0.09
504	0.1
505	0.1
506	0.12
507	0.12
508	0.12
509	0.12
510	0.09
511	0.08
512	0.06
513	0.06
514	0.04
515	0.04
516	0.04
517	0.04
518	0.03
519	0.04
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.05
524	0.05
525	0.06
526	0.07
527	0.07
528	0.07
529	0.08
530	0.1
531	0.1
532	0.13
533	0.13
534	0.12
535	0.12
536	0.13
537	0.14
538	0.13
539	0.12
540	0.1
541	0.12
542	0.11
543	0.12
544	0.11
545	0.09
546	0.09
547	0.14
548	0.13
549	0.12
550	0.13
551	0.15
552	0.18
553	0.2
554	0.22
555	0.2
556	0.22
557	0.23
558	0.25
559	0.24
560	0.22
561	0.25
562	0.29
563	0.29
564	0.27
565	0.25
566	0.22
567	0.2
568	0.21
569	0.16
570	0.12
571	0.12
572	0.13
573	0.14
574	0.16
575	0.19
576	0.18
577	0.23
578	0.22
579	0.18
580	0.23
581	0.23
582	0.27
583	0.32
584	0.4
585	0.43
586	0.51
587	0.56
588	0.61
589	0.71
590	0.69
591	0.66
592	0.6
593	0.6
594	0.53
595	0.49
596	0.41
597	0.3
598	0.27
599	0.23
600	0.21
601	0.13
602	0.12
603	0.09
604	0.07
605	0.08
606	0.08
607	0.09
608	0.09
609	0.1
610	0.1
611	0.1
612	0.1
613	0.09
614	0.09
615	0.07
616	0.07
617	0.06
618	0.05
619	0.05
620	0.05
621	0.05
622	0.05
623	0.09
624	0.1
625	0.1
626	0.1
627	0.13
628	0.16
629	0.16
630	0.16
631	0.13
632	0.11
633	0.12
634	0.13
635	0.1
636	0.06
637	0.06
638	0.06
639	0.05
640	0.05
641	0.04
642	0.03
643	0.03
644	0.03
645	0.03
646	0.02
647	0.02
648	0.02
649	0.03
650	0.03
651	0.04
652	0.04
653	0.07
654	0.1
655	0.14
656	0.16
657	0.19
658	0.2
659	0.21
660	0.21
661	0.2
662	0.16
663	0.15
664	0.12
665	0.1
666	0.1
667	0.08
668	0.07
669	0.07
670	0.08
671	0.06
672	0.07
673	0.07
674	0.07
675	0.12
676	0.12
677	0.12
678	0.14
679	0.16
680	0.16
681	0.15
682	0.15
683	0.13
684	0.15
685	0.15
686	0.14
687	0.13
688	0.13
689	0.12
690	0.11
691	0.09
692	0.09
693	0.08
694	0.07
695	0.13
696	0.13
697	0.13
698	0.14
699	0.14
700	0.12
701	0.13
702	0.16
703	0.12
704	0.15
705	0.17
706	0.18
707	0.19
708	0.2
709	0.23
710	0.23
711	0.26
712	0.25
713	0.3
714	0.28
715	0.3
716	0.29
717	0.25
718	0.23
719	0.22
720	0.22
721	0.15
722	0.16
723	0.15
724	0.15
725	0.14
726	0.14
727	0.11
728	0.09
729	0.12
730	0.11
731	0.12
732	0.12
733	0.14
734	0.16
735	0.17
736	0.17
737	0.22
738	0.25
739	0.29
740	0.33
741	0.34
742	0.35
743	0.36
744	0.37
745	0.31
746	0.28
747	0.23
748	0.23
749	0.21
750	0.19
751	0.16
752	0.16
753	0.18
754	0.17
755	0.17
756	0.13
757	0.12
758	0.13
759	0.13
760	0.12
761	0.11
762	0.14
763	0.15
764	0.15
765	0.18
766	0.17
767	0.21
768	0.23
769	0.24
770	0.25
771	0.25
772	0.27
773	0.26
774	0.28
775	0.26
776	0.27
777	0.27
778	0.28
779	0.29
780	0.28
781	0.28
782	0.28
783	0.26
784	0.24
785	0.22
786	0.21
787	0.26
788	0.29
789	0.31
790	0.38
791	0.42
792	0.49
793	0.56
794	0.62
795	0.64
796	0.69
797	0.74
798	0.73
799	0.75
800	0.75
801	0.73
802	0.74
803	0.69
804	0.63
805	0.58
806	0.51
807	0.47
808	0.46
809	0.41
810	0.35
811	0.36
812	0.32
813	0.3
814	0.3
815	0.27
816	0.22
817	0.22
818	0.2
819	0.15
820	0.14
821	0.13
822	0.14
823	0.13
824	0.11
825	0.1
826	0.09
827	0.09
828	0.1
829	0.12
830	0.1
831	0.1
832	0.11
833	0.11
834	0.11
835	0.14
836	0.15
837	0.13
838	0.17
839	0.19
840	0.21
841	0.25
842	0.25
843	0.27
844	0.31
845	0.34
846	0.34
847	0.33
848	0.35
849	0.33
850	0.36
851	0.34
852	0.33
853	0.31

A0A1M2VHV5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer