Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1M2V4A4

Protein Details
Accession A0A1M2V4A4    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-27AAEKPAKLAKKKSQDLKADAPHydrophilic
45-69TDAPSSSKAKKEKKGKAAAKEPEPEHydrophilic
168-190QPAPSKKESKKTKTKATPKAPSPHydrophilic
247-268DETVKRKLEKAKRKPTEDRGVIBasic
291-311TVTRLRLSRNKKTGKSKHYAFHydrophilic
379-405QEQDKAERRLLKRQDQRKRKLEEAGIKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-32KPAKLAKKKSQDLKADAPVKAKK
51-84SKAKKEKKGKAAAKEPEPESAPAPAKAKGEKKKK
106-111KKKRKV
121-187SPEKSKKKRRGSIAAPSAEVASKEAVKEAAEPKTTKKGKAAPHESPVQPAPSKKESKKTKTKATPKA
251-260KRKLEKAKRK
383-398KAERRLLKRQDQRKRK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAKGTAAAEKPAKLAKKKSQDLKADAPVKAKKTKQTEEVVASAATDAPSSSKAKKEKKGKAAAKEPEPESAPAPAKAKGEKKKKVTIVEDAPAEAEKVEAAAPVDKKKRKVAAVEENSEESPEKSKKKRRGSIAAPSAEVASKEAVKEAAEPKTTKKGKAAPHESPVQPAPSKKESKKTKTKATPKAPSPEPEASADEAEADGADEEDAEKEFYGFSSDDDDSSDEEMAEDIPGIDIGKLPTIAKDDETVKRKLEKAKRKPTEDRGVIYLGRIPHGFFEAQMRAYFAQFGTVTRLRLSRNKKTGKSKHYAFIEFDSSSVAQIVAETMDNYLLMGHILTCKLIPKDQVHPELWVGANRKWRAVPRDRVARVAHNKPRTEQEQDKAERRLLKRQDQRKRKLEEAGIKYDFEAVAYKKKPKPTEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.54
3 0.62
4 0.7
5 0.77
6 0.79
7 0.81
8 0.81
9 0.79
10 0.79
11 0.75
12 0.68
13 0.67
14 0.63
15 0.6
16 0.62
17 0.59
18 0.58
19 0.61
20 0.66
21 0.66
22 0.67
23 0.68
24 0.64
25 0.6
26 0.53
27 0.43
28 0.36
29 0.28
30 0.21
31 0.14
32 0.1
33 0.08
34 0.08
35 0.11
36 0.15
37 0.18
38 0.25
39 0.35
40 0.44
41 0.54
42 0.63
43 0.7
44 0.76
45 0.84
46 0.84
47 0.84
48 0.85
49 0.84
50 0.8
51 0.77
52 0.69
53 0.62
54 0.56
55 0.48
56 0.4
57 0.37
58 0.32
59 0.28
60 0.29
61 0.28
62 0.29
63 0.34
64 0.42
65 0.46
66 0.54
67 0.6
68 0.65
69 0.71
70 0.74
71 0.75
72 0.71
73 0.7
74 0.65
75 0.61
76 0.54
77 0.45
78 0.39
79 0.31
80 0.26
81 0.17
82 0.11
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.1
89 0.13
90 0.21
91 0.3
92 0.34
93 0.39
94 0.45
95 0.51
96 0.51
97 0.56
98 0.58
99 0.6
100 0.63
101 0.62
102 0.57
103 0.53
104 0.48
105 0.42
106 0.33
107 0.23
108 0.22
109 0.24
110 0.3
111 0.37
112 0.47
113 0.56
114 0.66
115 0.73
116 0.75
117 0.79
118 0.79
119 0.8
120 0.79
121 0.71
122 0.61
123 0.53
124 0.45
125 0.35
126 0.28
127 0.18
128 0.1
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.12
135 0.15
136 0.18
137 0.2
138 0.21
139 0.24
140 0.34
141 0.36
142 0.34
143 0.36
144 0.39
145 0.43
146 0.53
147 0.57
148 0.51
149 0.53
150 0.58
151 0.52
152 0.49
153 0.42
154 0.36
155 0.3
156 0.28
157 0.29
158 0.3
159 0.38
160 0.38
161 0.47
162 0.53
163 0.61
164 0.7
165 0.71
166 0.74
167 0.77
168 0.83
169 0.84
170 0.84
171 0.82
172 0.77
173 0.77
174 0.69
175 0.62
176 0.58
177 0.5
178 0.42
179 0.35
180 0.31
181 0.25
182 0.22
183 0.19
184 0.13
185 0.1
186 0.08
187 0.06
188 0.04
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.02
193 0.03
194 0.03
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.11
208 0.12
209 0.1
210 0.11
211 0.11
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.04
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.11
233 0.15
234 0.21
235 0.26
236 0.27
237 0.27
238 0.3
239 0.34
240 0.41
241 0.47
242 0.51
243 0.58
244 0.67
245 0.73
246 0.77
247 0.82
248 0.82
249 0.82
250 0.75
251 0.66
252 0.57
253 0.52
254 0.44
255 0.35
256 0.29
257 0.19
258 0.17
259 0.15
260 0.12
261 0.1
262 0.12
263 0.12
264 0.09
265 0.14
266 0.14
267 0.15
268 0.15
269 0.16
270 0.15
271 0.15
272 0.15
273 0.11
274 0.12
275 0.11
276 0.11
277 0.16
278 0.18
279 0.18
280 0.19
281 0.22
282 0.22
283 0.31
284 0.39
285 0.42
286 0.5
287 0.58
288 0.65
289 0.73
290 0.8
291 0.81
292 0.81
293 0.76
294 0.73
295 0.7
296 0.66
297 0.57
298 0.5
299 0.46
300 0.36
301 0.32
302 0.26
303 0.2
304 0.17
305 0.15
306 0.12
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.05
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.07
326 0.12
327 0.13
328 0.16
329 0.22
330 0.24
331 0.33
332 0.4
333 0.46
334 0.43
335 0.43
336 0.41
337 0.39
338 0.36
339 0.32
340 0.29
341 0.27
342 0.34
343 0.33
344 0.36
345 0.37
346 0.43
347 0.47
348 0.53
349 0.6
350 0.6
351 0.7
352 0.69
353 0.7
354 0.67
355 0.67
356 0.66
357 0.66
358 0.67
359 0.64
360 0.65
361 0.63
362 0.68
363 0.63
364 0.63
365 0.6
366 0.58
367 0.6
368 0.64
369 0.68
370 0.63
371 0.63
372 0.63
373 0.59
374 0.62
375 0.61
376 0.65
377 0.68
378 0.74
379 0.8
380 0.82
381 0.89
382 0.88
383 0.87
384 0.82
385 0.81
386 0.8
387 0.79
388 0.76
389 0.74
390 0.67
391 0.59
392 0.53
393 0.47
394 0.37
395 0.27
396 0.25
397 0.19
398 0.27
399 0.32
400 0.41
401 0.45
402 0.54