FuNGI

A0A1M2VGD6

Protein Details

Accession

A0A1M2VGD6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
108-131	PIYAATKKKYKPVAKRTKPHSGVP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
115-123	KKYKPVAKR

Subcellular Location(s)

pero 10, nucl 8.5, cyto_nucl 8, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR041577 RT_RNaseH_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17919 RT_RNaseH_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MSDGEEVAIILSSPPSRPDSFTIDAFSFLSSDFNHENLDLLYLSACDPTILGTDSLADASFPYENFYQYTPDFDSLHFSSTAPSYYTQNHNTFSIHSHTRSNPLAFVPIYAATKKKYKPVAKRTKPHSGVPPFTEQLAESFAGRACGGILDLFVGYDERRLATISRDLTTFSTPFGARRLTTLPMGWTNSVPIFHDDLTYILQPEIPEFTQPFIDDVPARGPATRYELPDGGFETIPENAGIRRFVWEHLTNVNRIVQRVRYSGGTFSGTKSILCAAEYTVVGHRCTYAGRVPEPGNYDKVLNWGPCRSLSELTRKNAPFDWGPEQIAAQDDLKRALANSPALRPLDYKSAAEVILAVDTSKIAVGYLLAQCDLDKPSRRFYARFGSITLNDREAAYSQPKLELYGLFRSLKATKRLLIGIRNLVIEVDARYIRGMLNNPDEVPGASMNRWIVTILTFQFRLVHVPGVQHGPDGLSRRPPQPGDEPYEEEDEDWIDRLNGLLHLINPPAPLRIASAGTPVFTQTNADAQPVDIDIPRSTAAQLEDDRLCDVFRYLTTLTSPIMLTTEKERQAFTRQVLRFYTRGTQLFRHSPDGHNLLVLWPDQRLSILRQAHDNVGHKGVYATTALLAERFWWPHLQADVPPPITSFPAPPGVRWHVDTMHMPGPFKYYLHARCALTSFVKGRAVRRETGRVVGEWIFQDILCRWGAACEFITDNGTPFVAALDYLRKKYGITHIRISGYNSRANGIVKRPHYDMRQALFKAADGAQERWHQHVHNVQWANRITVRRRLGCSPFFAATGSHPLLPFDIVKATYLAPPPNAMPSTADLIASRARALARRAEDVDRLHTRVYNARVHAAHQLELKHPRSIRDFNFARGDLVLMRNKAIESALNRKMRPRYLGPYVILARNCSTAYIVCELNGAVLDRPIAAFRLVPYLARRTIDLAWLDDNTYLDISTARLREMEASHSQGDDEGEGTLDDEDFEQDAPER

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.18
3	0.2
4	0.24
5	0.28
6	0.33
7	0.36
8	0.37
9	0.38
10	0.33
11	0.33
12	0.3
13	0.26
14	0.18
15	0.15
16	0.15
17	0.11
18	0.16
19	0.17
20	0.17
21	0.18
22	0.18
23	0.19
24	0.16
25	0.18
26	0.12
27	0.11
28	0.1
29	0.09
30	0.1
31	0.09
32	0.09
33	0.07
34	0.07
35	0.07
36	0.09
37	0.1
38	0.1
39	0.1
40	0.11
41	0.11
42	0.12
43	0.1
44	0.08
45	0.07
46	0.09
47	0.1
48	0.09
49	0.12
50	0.13
51	0.14
52	0.16
53	0.17
54	0.2
55	0.19
56	0.24
57	0.23
58	0.25
59	0.25
60	0.24
61	0.29
62	0.26
63	0.28
64	0.24
65	0.21
66	0.2
67	0.2
68	0.21
69	0.16
70	0.17
71	0.18
72	0.23
73	0.3
74	0.35
75	0.38
76	0.39
77	0.39
78	0.39
79	0.37
80	0.35
81	0.34
82	0.32
83	0.3
84	0.34
85	0.35
86	0.41
87	0.44
88	0.42
89	0.38
90	0.33
91	0.36
92	0.29
93	0.27
94	0.23
95	0.2
96	0.21
97	0.21
98	0.23
99	0.22
100	0.3
101	0.33
102	0.39
103	0.46
104	0.53
105	0.62
106	0.7
107	0.78
108	0.81
109	0.88
110	0.87
111	0.88
112	0.83
113	0.79
114	0.78
115	0.76
116	0.72
117	0.67
118	0.66
119	0.55
120	0.51
121	0.45
122	0.34
123	0.27
124	0.23
125	0.19
126	0.12
127	0.13
128	0.13
129	0.13
130	0.13
131	0.11
132	0.08
133	0.08
134	0.08
135	0.06
136	0.06
137	0.05
138	0.05
139	0.05
140	0.05
141	0.06
142	0.06
143	0.08
144	0.08
145	0.08
146	0.09
147	0.1
148	0.11
149	0.14
150	0.2
151	0.21
152	0.22
153	0.22
154	0.23
155	0.24
156	0.27
157	0.23
158	0.18
159	0.19
160	0.18
161	0.19
162	0.21
163	0.22
164	0.18
165	0.21
166	0.23
167	0.22
168	0.23
169	0.23
170	0.24
171	0.25
172	0.27
173	0.25
174	0.22
175	0.22
176	0.21
177	0.21
178	0.19
179	0.18
180	0.18
181	0.17
182	0.17
183	0.15
184	0.15
185	0.16
186	0.16
187	0.13
188	0.11
189	0.12
190	0.11
191	0.12
192	0.14
193	0.12
194	0.14
195	0.13
196	0.15
197	0.15
198	0.15
199	0.15
200	0.12
201	0.14
202	0.13
203	0.13
204	0.14
205	0.16
206	0.16
207	0.16
208	0.16
209	0.16
210	0.23
211	0.25
212	0.26
213	0.27
214	0.28
215	0.28
216	0.29
217	0.28
218	0.23
219	0.19
220	0.17
221	0.14
222	0.13
223	0.12
224	0.11
225	0.1
226	0.08
227	0.1
228	0.11
229	0.1
230	0.13
231	0.13
232	0.15
233	0.21
234	0.22
235	0.23
236	0.29
237	0.31
238	0.29
239	0.29
240	0.33
241	0.28
242	0.27
243	0.28
244	0.25
245	0.27
246	0.28
247	0.28
248	0.26
249	0.26
250	0.26
251	0.25
252	0.23
253	0.2
254	0.2
255	0.21
256	0.19
257	0.17
258	0.16
259	0.16
260	0.13
261	0.13
262	0.12
263	0.09
264	0.11
265	0.11
266	0.12
267	0.14
268	0.16
269	0.16
270	0.15
271	0.15
272	0.13
273	0.14
274	0.15
275	0.15
276	0.17
277	0.18
278	0.22
279	0.22
280	0.25
281	0.3
282	0.29
283	0.27
284	0.24
285	0.24
286	0.2
287	0.23
288	0.23
289	0.21
290	0.21
291	0.21
292	0.21
293	0.22
294	0.24
295	0.23
296	0.23
297	0.25
298	0.33
299	0.38
300	0.39
301	0.46
302	0.44
303	0.43
304	0.41
305	0.41
306	0.32
307	0.3
308	0.33
309	0.26
310	0.27
311	0.24
312	0.23
313	0.2
314	0.19
315	0.16
316	0.12
317	0.12
318	0.12
319	0.13
320	0.13
321	0.12
322	0.12
323	0.12
324	0.14
325	0.16
326	0.17
327	0.18
328	0.21
329	0.22
330	0.22
331	0.22
332	0.21
333	0.23
334	0.22
335	0.21
336	0.18
337	0.19
338	0.18
339	0.17
340	0.15
341	0.08
342	0.07
343	0.07
344	0.06
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.03
350	0.03
351	0.03
352	0.03
353	0.06
354	0.07
355	0.07
356	0.08
357	0.08
358	0.08
359	0.09
360	0.11
361	0.13
362	0.2
363	0.21
364	0.27
365	0.33
366	0.36
367	0.35
368	0.38
369	0.43
370	0.41
371	0.4
372	0.37
373	0.34
374	0.34
375	0.37
376	0.34
377	0.25
378	0.2
379	0.19
380	0.17
381	0.15
382	0.15
383	0.13
384	0.14
385	0.13
386	0.14
387	0.14
388	0.15
389	0.15
390	0.14
391	0.14
392	0.16
393	0.19
394	0.17
395	0.17
396	0.19
397	0.22
398	0.25
399	0.27
400	0.26
401	0.25
402	0.26
403	0.29
404	0.3
405	0.3
406	0.28
407	0.26
408	0.25
409	0.23
410	0.21
411	0.17
412	0.15
413	0.11
414	0.09
415	0.08
416	0.07
417	0.07
418	0.07
419	0.08
420	0.08
421	0.09
422	0.11
423	0.12
424	0.15
425	0.16
426	0.16
427	0.16
428	0.16
429	0.14
430	0.13
431	0.1
432	0.08
433	0.08
434	0.09
435	0.08
436	0.08
437	0.08
438	0.07
439	0.07
440	0.06
441	0.08
442	0.08
443	0.1
444	0.1
445	0.1
446	0.11
447	0.11
448	0.12
449	0.11
450	0.11
451	0.1
452	0.11
453	0.12
454	0.13
455	0.13
456	0.1
457	0.09
458	0.09
459	0.1
460	0.13
461	0.12
462	0.17
463	0.19
464	0.21
465	0.25
466	0.25
467	0.26
468	0.29
469	0.32
470	0.32
471	0.32
472	0.33
473	0.32
474	0.33
475	0.3
476	0.23
477	0.19
478	0.13
479	0.11
480	0.08
481	0.06
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.04
487	0.05
488	0.05
489	0.06
490	0.07
491	0.07
492	0.08
493	0.08
494	0.08
495	0.07
496	0.07
497	0.07
498	0.07
499	0.08
500	0.08
501	0.08
502	0.1
503	0.1
504	0.1
505	0.1
506	0.1
507	0.08
508	0.08
509	0.08
510	0.06
511	0.09
512	0.09
513	0.09
514	0.09
515	0.08
516	0.09
517	0.08
518	0.09
519	0.06
520	0.07
521	0.06
522	0.08
523	0.08
524	0.08
525	0.08
526	0.09
527	0.09
528	0.1
529	0.11
530	0.13
531	0.13
532	0.13
533	0.14
534	0.12
535	0.12
536	0.09
537	0.09
538	0.06
539	0.06
540	0.09
541	0.09
542	0.1
543	0.1
544	0.11
545	0.11
546	0.11
547	0.11
548	0.07
549	0.08
550	0.07
551	0.08
552	0.11
553	0.16
554	0.18
555	0.19
556	0.2
557	0.21
558	0.26
559	0.29
560	0.28
561	0.32
562	0.3
563	0.32
564	0.34
565	0.35
566	0.31
567	0.29
568	0.31
569	0.26
570	0.28
571	0.27
572	0.28
573	0.3
574	0.35
575	0.35
576	0.37
577	0.35
578	0.34
579	0.36
580	0.35
581	0.3
582	0.25
583	0.22
584	0.16
585	0.15
586	0.14
587	0.09
588	0.07
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.08
593	0.1
594	0.16
595	0.19
596	0.2
597	0.22
598	0.24
599	0.25
600	0.28
601	0.29
602	0.24
603	0.22
604	0.22
605	0.19
606	0.17
607	0.15
608	0.12
609	0.09
610	0.07
611	0.06
612	0.06
613	0.06
614	0.06
615	0.06
616	0.06
617	0.08
618	0.09
619	0.09
620	0.1
621	0.11
622	0.13
623	0.15
624	0.15
625	0.15
626	0.19
627	0.22
628	0.22
629	0.21
630	0.19
631	0.19
632	0.19
633	0.17
634	0.14
635	0.11
636	0.19
637	0.19
638	0.2
639	0.25
640	0.28
641	0.29
642	0.29
643	0.29
644	0.22
645	0.24
646	0.25
647	0.23
648	0.23
649	0.23
650	0.22
651	0.2
652	0.22
653	0.21
654	0.19
655	0.17
656	0.2
657	0.23
658	0.27
659	0.32
660	0.29
661	0.29
662	0.31
663	0.31
664	0.25
665	0.25
666	0.22
667	0.2
668	0.25
669	0.26
670	0.29
671	0.36
672	0.38
673	0.39
674	0.42
675	0.46
676	0.42
677	0.45
678	0.42
679	0.33
680	0.32
681	0.29
682	0.26
683	0.19
684	0.18
685	0.14
686	0.12
687	0.13
688	0.11
689	0.12
690	0.1
691	0.09
692	0.08
693	0.1
694	0.1
695	0.1
696	0.1
697	0.1
698	0.1
699	0.11
700	0.13
701	0.12
702	0.12
703	0.11
704	0.1
705	0.09
706	0.08
707	0.08
708	0.05
709	0.05
710	0.05
711	0.13
712	0.16
713	0.18
714	0.19
715	0.18
716	0.19
717	0.23
718	0.32
719	0.32
720	0.35
721	0.39
722	0.43
723	0.45
724	0.46
725	0.47
726	0.44
727	0.38
728	0.37
729	0.32
730	0.28
731	0.28
732	0.29
733	0.28
734	0.28
735	0.32
736	0.31
737	0.35
738	0.37
739	0.41
740	0.42
741	0.46
742	0.46
743	0.42
744	0.47
745	0.44
746	0.42
747	0.37
748	0.33
749	0.29
750	0.23
751	0.23
752	0.19
753	0.2
754	0.22
755	0.28
756	0.29
757	0.29
758	0.31
759	0.27
760	0.28
761	0.34
762	0.33
763	0.36
764	0.39
765	0.38
766	0.43
767	0.43
768	0.42
769	0.4
770	0.43
771	0.38
772	0.43
773	0.49
774	0.47
775	0.5
776	0.54
777	0.56
778	0.54
779	0.54
780	0.49
781	0.43
782	0.38
783	0.34
784	0.28
785	0.22
786	0.26
787	0.22
788	0.19
789	0.18
790	0.18
791	0.18
792	0.19
793	0.17
794	0.12
795	0.13
796	0.11
797	0.12
798	0.13
799	0.13
800	0.16
801	0.19
802	0.2
803	0.18
804	0.19
805	0.19
806	0.23
807	0.23
808	0.2
809	0.18
810	0.18
811	0.22
812	0.21
813	0.2
814	0.15
815	0.17
816	0.18
817	0.17
818	0.14
819	0.12
820	0.13
821	0.17
822	0.19
823	0.25
824	0.26
825	0.3
826	0.33
827	0.34
828	0.38
829	0.36
830	0.42
831	0.39
832	0.37
833	0.34
834	0.33
835	0.33
836	0.35
837	0.38
838	0.36
839	0.34
840	0.38
841	0.37
842	0.37
843	0.42
844	0.37
845	0.34
846	0.31
847	0.32
848	0.32
849	0.4
850	0.41
851	0.4
852	0.4
853	0.42
854	0.46
855	0.52
856	0.5
857	0.51
858	0.5
859	0.49
860	0.54
861	0.49
862	0.43
863	0.35
864	0.32
865	0.25
866	0.29
867	0.28
868	0.22
869	0.23
870	0.22
871	0.22
872	0.22
873	0.2
874	0.19
875	0.19
876	0.27
877	0.35
878	0.41
879	0.42
880	0.48
881	0.55
882	0.56
883	0.58
884	0.56
885	0.55
886	0.57
887	0.62
888	0.56
889	0.56
890	0.55
891	0.53
892	0.47
893	0.42
894	0.35
895	0.32
896	0.3
897	0.23
898	0.21
899	0.17
900	0.19
901	0.19
902	0.18
903	0.15
904	0.16
905	0.15
906	0.14
907	0.13
908	0.11
909	0.09
910	0.09
911	0.09
912	0.09
913	0.1
914	0.1
915	0.1
916	0.1
917	0.1
918	0.11
919	0.17
920	0.17
921	0.19
922	0.23
923	0.28
924	0.31
925	0.31
926	0.31
927	0.29
928	0.3
929	0.33
930	0.3
931	0.26
932	0.25
933	0.25
934	0.25
935	0.22
936	0.21
937	0.17
938	0.15
939	0.12
940	0.1
941	0.1
942	0.11
943	0.15
944	0.16
945	0.15
946	0.15
947	0.16
948	0.2
949	0.22
950	0.26
951	0.25
952	0.29
953	0.29
954	0.29
955	0.28
956	0.25
957	0.24
958	0.19
959	0.14
960	0.1
961	0.09
962	0.09
963	0.09
964	0.09
965	0.07
966	0.07
967	0.07
968	0.08
969	0.09
970	0.09

A0A1M2VGD6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer