Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1M2VMY6

Protein Details
Accession A0A1M2VMY6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
347-366KEKLRLQRRKEQEANVQRKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
331-375KKSKAEAKAQKADHAAKEKLRLQRRKEQEANVQRKKAALEGDKKG
445-458PRPPPKKLKTKSKR
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 10.833, nucl 6.5, cyto_nucl 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MARKRKNRTHLKGGVASNPGAAEGVPKSFVIKHGQVGSSLAQLVRDFRKVMEPNTASRLRERARNKLRDFLTMAPALGVTHLLAFTLTDVAPSMRIVRLSAGPTLSFRVERYSLMKDLVNSSRRARSMSTVEYLSSPLLVLASFPPPSPTTPPHLTLLMKTFQSLFPPLAPQSLSLSSARRVVLVHYNAERGTVDVRHYLITVKPYGVSKRIRRVLEGASAKSAPSTATAHATLDLGSEKDVADFLLRRRGEPGPSSDGYESAASSASSAGGDDGDAISLADDYVGRNNKKGQKRAVKLDEVGPRMELRLIKIVEGVPGKEGGVLYHEFVKKSKAEAKAQKADHAAKEKLRLQRRKEQEANVQRKKAALEGDKKGKNAGEDEDDEDQDGENDEDMEADEDVISGGEEDLSGDDADDGEGAWDDEEMISEGEDEDESGSESEEEAPRPPPKKLKTKSKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.65
3 0.55
4 0.45
5 0.37
6 0.29
7 0.21
8 0.17
9 0.13
10 0.11
11 0.12
12 0.12
13 0.12
14 0.14
15 0.16
16 0.19
17 0.24
18 0.25
19 0.29
20 0.33
21 0.34
22 0.32
23 0.33
24 0.31
25 0.25
26 0.24
27 0.19
28 0.16
29 0.16
30 0.2
31 0.22
32 0.23
33 0.22
34 0.22
35 0.31
36 0.33
37 0.35
38 0.4
39 0.39
40 0.4
41 0.47
42 0.5
43 0.42
44 0.42
45 0.48
46 0.41
47 0.48
48 0.5
49 0.53
50 0.6
51 0.68
52 0.68
53 0.68
54 0.67
55 0.64
56 0.62
57 0.55
58 0.5
59 0.4
60 0.37
61 0.28
62 0.26
63 0.2
64 0.16
65 0.12
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.07
74 0.07
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.08
79 0.09
80 0.1
81 0.09
82 0.1
83 0.11
84 0.12
85 0.15
86 0.16
87 0.18
88 0.17
89 0.16
90 0.17
91 0.19
92 0.19
93 0.16
94 0.15
95 0.18
96 0.18
97 0.2
98 0.23
99 0.24
100 0.24
101 0.25
102 0.26
103 0.22
104 0.26
105 0.32
106 0.31
107 0.3
108 0.32
109 0.36
110 0.36
111 0.37
112 0.33
113 0.31
114 0.33
115 0.34
116 0.33
117 0.28
118 0.28
119 0.26
120 0.25
121 0.19
122 0.14
123 0.1
124 0.07
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.08
130 0.09
131 0.09
132 0.11
133 0.12
134 0.15
135 0.19
136 0.2
137 0.25
138 0.28
139 0.31
140 0.3
141 0.32
142 0.3
143 0.28
144 0.29
145 0.24
146 0.21
147 0.19
148 0.18
149 0.16
150 0.17
151 0.17
152 0.14
153 0.12
154 0.14
155 0.14
156 0.14
157 0.14
158 0.13
159 0.14
160 0.14
161 0.15
162 0.14
163 0.15
164 0.15
165 0.18
166 0.17
167 0.15
168 0.14
169 0.14
170 0.2
171 0.2
172 0.22
173 0.2
174 0.22
175 0.21
176 0.21
177 0.19
178 0.12
179 0.12
180 0.1
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.13
189 0.13
190 0.11
191 0.12
192 0.14
193 0.15
194 0.2
195 0.26
196 0.29
197 0.38
198 0.44
199 0.43
200 0.43
201 0.44
202 0.41
203 0.41
204 0.39
205 0.3
206 0.25
207 0.25
208 0.23
209 0.2
210 0.17
211 0.09
212 0.08
213 0.09
214 0.08
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.09
221 0.08
222 0.07
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.05
231 0.07
232 0.08
233 0.15
234 0.16
235 0.16
236 0.19
237 0.21
238 0.23
239 0.23
240 0.27
241 0.25
242 0.25
243 0.27
244 0.24
245 0.22
246 0.21
247 0.19
248 0.14
249 0.08
250 0.08
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.04
271 0.09
272 0.15
273 0.15
274 0.17
275 0.25
276 0.33
277 0.41
278 0.47
279 0.52
280 0.57
281 0.62
282 0.71
283 0.7
284 0.66
285 0.6
286 0.6
287 0.57
288 0.48
289 0.42
290 0.33
291 0.27
292 0.24
293 0.24
294 0.18
295 0.13
296 0.18
297 0.18
298 0.17
299 0.19
300 0.18
301 0.2
302 0.2
303 0.19
304 0.13
305 0.13
306 0.13
307 0.12
308 0.11
309 0.08
310 0.09
311 0.1
312 0.1
313 0.16
314 0.18
315 0.18
316 0.19
317 0.22
318 0.2
319 0.24
320 0.3
321 0.3
322 0.38
323 0.47
324 0.55
325 0.6
326 0.6
327 0.6
328 0.59
329 0.57
330 0.53
331 0.51
332 0.46
333 0.41
334 0.47
335 0.48
336 0.51
337 0.56
338 0.59
339 0.6
340 0.66
341 0.71
342 0.75
343 0.75
344 0.74
345 0.74
346 0.77
347 0.8
348 0.79
349 0.73
350 0.64
351 0.59
352 0.53
353 0.46
354 0.43
355 0.4
356 0.4
357 0.46
358 0.55
359 0.56
360 0.55
361 0.54
362 0.48
363 0.42
364 0.36
365 0.32
366 0.28
367 0.27
368 0.3
369 0.3
370 0.29
371 0.27
372 0.24
373 0.2
374 0.15
375 0.14
376 0.1
377 0.08
378 0.08
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.08
383 0.07
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.05
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.05
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.07
402 0.06
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.06
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.08
418 0.08
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.08
423 0.08
424 0.09
425 0.08
426 0.09
427 0.13
428 0.15
429 0.16
430 0.17
431 0.23
432 0.31
433 0.34
434 0.4
435 0.46
436 0.53
437 0.63
438 0.71