FuNGI

A0A1M2VPF6

Protein Details

Accession

A0A1M2VPF6

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
427-453	SEPASPVKEKAEKKRKRKSEVPDADGD	Basic
465-490	DDEAAKAERKRLKKEKKAAAEKAAKG	Basic
493-519	EEDEEARRERKRIKKEKKARESLGGES	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
369-382	PKAMEKKKMIKDGK
433-444	VKEKAEKKRKRK
470-513	KAERKRLKKEKKAAAEKAAKGGDEEDEEARRERKRIKKEKKARE

Subcellular Location(s)

cyto 13, mito 10, nucl 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012960 Dyskerin-like IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR002501 PsdUridine_synth_N IPR002478 PUA IPR015947 PUA-like_sf IPR036974 PUA_sf IPR004802 tRNA_PsdUridine_synth_B_fam IPR032819 TruB_C IPR004521 Uncharacterised_CHP00451
Gene Ontology	GO:1990904 C:ribonucleoprotein complex GO:0009982 F:pseudouridine synthase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis GO:0006396 P:RNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF08068 DKCLD PF01472 PUA PF16198 TruB_C_2 PF01509 TruB_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50890 PUA
CDD	cd02572 PseudoU_synth_hDyskerin cd21148 PUA_Cbf5

Amino Acid Sequences

MASSGTLSRGQVATAQLSGEYAIKPENAQPKLDTSQWPLLLKNYDKLLVRSAHFTPIPAGCSPLKRDITTYVKSGVINLDKPSNPSSHEVVAWLRRILRVEKTGHSGTLDPKVTGCLIVCIDRATRLVKSQQGAGKEYVAVLRLHSALSTPTALPRAISTLTGALFQRPPLISAVKRQLRVRTIYESKLLEFDEKRNLGVFWVSCEAGTYIRTLCVHLGLILGVGGHMQELRRVRSGALSENDDMVTMHDVLDAQWVYDNTRDETYLRRVIRPLESLLIGYKRIVVKDSAVNAVCYGAKLMIPGLLRYEADISLNEEVVLMTTKGEAIALAIAQMSTVELATCDHGVVAKVKRCIMERDTYPRRWGLGPKAMEKKKMIKDGKLGKFGEKTEATPAEWSRDYVDYTRDEPTAGPSAAAPAPAPAAPASEPASPVKEKAEKKRKRKSEVPDADGDVSMAVSADGGEDDEAAKAERKRLKKEKKAAAEKAAKGGDEEDEEARRERKRIKKEKKARESLGGES

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.18
3	0.14
4	0.14
5	0.15
6	0.13
7	0.11
8	0.1
9	0.12
10	0.12
11	0.14
12	0.2
13	0.28
14	0.29
15	0.31
16	0.31
17	0.36
18	0.39
19	0.42
20	0.4
21	0.38
22	0.43
23	0.45
24	0.45
25	0.4
26	0.41
27	0.44
28	0.42
29	0.4
30	0.35
31	0.35
32	0.36
33	0.37
34	0.38
35	0.35
36	0.34
37	0.35
38	0.33
39	0.35
40	0.33
41	0.32
42	0.3
43	0.27
44	0.29
45	0.24
46	0.26
47	0.23
48	0.28
49	0.31
50	0.36
51	0.38
52	0.35
53	0.38
54	0.42
55	0.46
56	0.44
57	0.42
58	0.36
59	0.35
60	0.34
61	0.33
62	0.31
63	0.28
64	0.28
65	0.28
66	0.31
67	0.29
68	0.33
69	0.34
70	0.3
71	0.28
72	0.3
73	0.31
74	0.26
75	0.26
76	0.25
77	0.27
78	0.3
79	0.29
80	0.27
81	0.25
82	0.25
83	0.28
84	0.29
85	0.31
86	0.32
87	0.34
88	0.35
89	0.4
90	0.39
91	0.37
92	0.35
93	0.31
94	0.28
95	0.32
96	0.3
97	0.24
98	0.22
99	0.23
100	0.22
101	0.2
102	0.17
103	0.11
104	0.11
105	0.13
106	0.13
107	0.13
108	0.13
109	0.13
110	0.15
111	0.15
112	0.15
113	0.17
114	0.22
115	0.25
116	0.26
117	0.3
118	0.32
119	0.33
120	0.34
121	0.32
122	0.28
123	0.23
124	0.23
125	0.18
126	0.16
127	0.13
128	0.1
129	0.11
130	0.11
131	0.1
132	0.1
133	0.09
134	0.08
135	0.09
136	0.11
137	0.09
138	0.11
139	0.12
140	0.12
141	0.12
142	0.12
143	0.13
144	0.12
145	0.12
146	0.11
147	0.11
148	0.11
149	0.13
150	0.13
151	0.12
152	0.13
153	0.13
154	0.16
155	0.14
156	0.15
157	0.15
158	0.19
159	0.18
160	0.24
161	0.33
162	0.34
163	0.38
164	0.4
165	0.44
166	0.44
167	0.48
168	0.45
169	0.43
170	0.42
171	0.41
172	0.42
173	0.37
174	0.33
175	0.3
176	0.27
177	0.24
178	0.21
179	0.21
180	0.25
181	0.24
182	0.24
183	0.23
184	0.22
185	0.18
186	0.19
187	0.16
188	0.11
189	0.12
190	0.12
191	0.11
192	0.12
193	0.11
194	0.1
195	0.1
196	0.09
197	0.07
198	0.09
199	0.09
200	0.09
201	0.09
202	0.09
203	0.09
204	0.08
205	0.07
206	0.06
207	0.05
208	0.04
209	0.04
210	0.03
211	0.03
212	0.03
213	0.02
214	0.03
215	0.03
216	0.07
217	0.09
218	0.12
219	0.13
220	0.14
221	0.14
222	0.16
223	0.18
224	0.19
225	0.19
226	0.2
227	0.19
228	0.19
229	0.19
230	0.16
231	0.14
232	0.1
233	0.09
234	0.06
235	0.06
236	0.05
237	0.06
238	0.05
239	0.08
240	0.07
241	0.06
242	0.07
243	0.07
244	0.08
245	0.1
246	0.11
247	0.1
248	0.11
249	0.11
250	0.11
251	0.14
252	0.18
253	0.23
254	0.23
255	0.23
256	0.23
257	0.26
258	0.28
259	0.26
260	0.23
261	0.17
262	0.16
263	0.15
264	0.16
265	0.14
266	0.12
267	0.1
268	0.12
269	0.11
270	0.11
271	0.12
272	0.11
273	0.12
274	0.15
275	0.17
276	0.17
277	0.16
278	0.16
279	0.15
280	0.15
281	0.13
282	0.1
283	0.09
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.07
289	0.07
290	0.08
291	0.09
292	0.09
293	0.09
294	0.09
295	0.11
296	0.08
297	0.08
298	0.08
299	0.09
300	0.09
301	0.09
302	0.08
303	0.07
304	0.07
305	0.06
306	0.07
307	0.05
308	0.04
309	0.04
310	0.05
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.03
315	0.04
316	0.03
317	0.03
318	0.03
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.03
324	0.03
325	0.03
326	0.03
327	0.04
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.06
333	0.07
334	0.12
335	0.16
336	0.2
337	0.22
338	0.24
339	0.26
340	0.28
341	0.32
342	0.31
343	0.33
344	0.34
345	0.42
346	0.47
347	0.48
348	0.49
349	0.45
350	0.44
351	0.4
352	0.41
353	0.38
354	0.39
355	0.4
356	0.45
357	0.54
358	0.54
359	0.56
360	0.55
361	0.56
362	0.55
363	0.61
364	0.58
365	0.53
366	0.59
367	0.64
368	0.67
369	0.66
370	0.6
371	0.54
372	0.54
373	0.5
374	0.48
375	0.38
376	0.33
377	0.31
378	0.32
379	0.28
380	0.28
381	0.28
382	0.26
383	0.26
384	0.25
385	0.22
386	0.21
387	0.23
388	0.2
389	0.23
390	0.21
391	0.23
392	0.25
393	0.22
394	0.21
395	0.19
396	0.21
397	0.23
398	0.2
399	0.18
400	0.15
401	0.18
402	0.18
403	0.18
404	0.14
405	0.09
406	0.1
407	0.1
408	0.11
409	0.08
410	0.09
411	0.09
412	0.12
413	0.15
414	0.14
415	0.16
416	0.17
417	0.22
418	0.2
419	0.21
420	0.25
421	0.31
422	0.37
423	0.47
424	0.56
425	0.62
426	0.72
427	0.81
428	0.85
429	0.86
430	0.88
431	0.86
432	0.87
433	0.87
434	0.82
435	0.76
436	0.7
437	0.62
438	0.53
439	0.43
440	0.31
441	0.21
442	0.15
443	0.09
444	0.05
445	0.03
446	0.03
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.05
452	0.05
453	0.06
454	0.06
455	0.08
456	0.13
457	0.14
458	0.23
459	0.31
460	0.38
461	0.48
462	0.59
463	0.69
464	0.75
465	0.83
466	0.86
467	0.89
468	0.92
469	0.89
470	0.89
471	0.87
472	0.79
473	0.76
474	0.67
475	0.56
476	0.46
477	0.4
478	0.31
479	0.25
480	0.25
481	0.2
482	0.21
483	0.23
484	0.26
485	0.29
486	0.31
487	0.35
488	0.42
489	0.49
490	0.58
491	0.68
492	0.75
493	0.81
494	0.88
495	0.93
496	0.94
497	0.95
498	0.9
499	0.89

A0A1M2VPF6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer