FuNGI

A0A1M2VMA4

Protein Details

Accession

A0A1M2VMA4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1001-1023	MTEPPPKAKRSNQPRWKKEQMTS	Hydrophilic
1206-1234	EELEEEVKPKKRKPKKSAKSKEDVEQRLA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1213-1226	KPKKRKPKKSAKSK

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 10, cyto 7.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MEYPPFMPSSSSSIHNDMHGFLRRPAQYTILPAPLPADAADEAHQHLFTDSPTQDRIAVMDACLHDLHDVPRAKEIFELLRESMRGDQLLDVRLYNHFLQAFYEMATRKESSNHAHWLEEAWILYNEMETGREGVQPTANTYAIMLRMWLRFGPDSESPVQISAAKVHDPMSLLRSMIGRAVAPALVVADRAFTTSEEATEAIKALSRAAVQMSLPSIVNELGLADSLGRQVDDPLEDVPEAIPVMKTKDLSAAVEARRNEDGTVSQFTTDEPAPRLDGDIPFNLETLRRHLGQVILARRVLSEDLVLRQRLLEESVYNVAVERLKHQAELFDQLGLPNKSLHSTDLRTWMWHWHVKLQARIEAELANLEVEERVIARLKRKGSKEDPQLSPFLKLLKPEKLSLITVLELMHLHGSGGVQDGMKTARALLAVGRAVEGEHKAEMCKKNNISVPNANPARSGDQNVFTNLGYRDLHARRVTARKYMEDSEEWTSDWSQLVRVKIGSFLVDCLMDVATVQRSIKDPRTGEKLTEEQPAFFHSYEYQRGHKLGVIKFNPAVAERMSKEPLAETLHPRHLPMLVKPKPWLSYNNGGYLYNRTWAMRFKESREQELYLRHASDAGRLELVFAGLDVLSSTPWQINRSVFDVVLKVWNSGERFAKIPPAVPDEPEPERPPNMDFDNKAKMVYLERQKSWMQTKAANHSDRCSINYKVEIARAFLGDTIYLPHNVDFRGRAYPIPPHLSHIGDDLSRGLLLFGEAKPLGARGLRWLKIHLANLAGYDKASFDERVEFVHEHLDDIYDSAERPLEGGRWWTKADDPWQCLATCIELKAALTSPEPEAYECALPVHQDGTCNGLQHYAALGGDAVGAAQVNLAAADRPSDVYTYVAKMVEDQIQRDLKEDHPFAKLLAGKISRKVVKQTVMTTVYGVTFVGARDQIERQLKDRGDVPIEQCWLAASYLAKKVLASIGDLFKGAKEIQTWLNTCARLVAKAIPQDRLVQSMTEPPPKAKRSNQPRWKKEQMTSVVWTTPLGLPIVQPYRSIKRKQVMTALQTVFISDPNIPSTVNAQKQASAFPPNFIHSLDATHMMLTALECRSQGLTFASVHDSYWTHAGSIDQMNAIIRDTFIALHSSDVLSALAQEFRERYADYKVPLVSLQGPAMKKLNLEGAAAPEDIQALKEIVSDEVEKPEEEEASLVLDAEDDLELEELEEEVKPKKRKPKKSAKSKEDVEQRLAGKFVNLVDILPALPEKGKFDVKAIKESQYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.33
3	0.32
4	0.28
5	0.32
6	0.35
7	0.34
8	0.32
9	0.4
10	0.39
11	0.42
12	0.42
13	0.4
14	0.35
15	0.39
16	0.41
17	0.38
18	0.35
19	0.32
20	0.31
21	0.26
22	0.25
23	0.18
24	0.16
25	0.11
26	0.13
27	0.14
28	0.15
29	0.17
30	0.17
31	0.17
32	0.15
33	0.15
34	0.14
35	0.13
36	0.18
37	0.17
38	0.19
39	0.21
40	0.22
41	0.23
42	0.22
43	0.22
44	0.19
45	0.19
46	0.16
47	0.19
48	0.18
49	0.19
50	0.19
51	0.18
52	0.15
53	0.16
54	0.17
55	0.2
56	0.24
57	0.23
58	0.3
59	0.31
60	0.3
61	0.3
62	0.32
63	0.29
64	0.29
65	0.32
66	0.26
67	0.28
68	0.28
69	0.28
70	0.29
71	0.26
72	0.23
73	0.2
74	0.22
75	0.22
76	0.25
77	0.24
78	0.21
79	0.2
80	0.21
81	0.24
82	0.21
83	0.21
84	0.19
85	0.18
86	0.19
87	0.2
88	0.19
89	0.16
90	0.2
91	0.17
92	0.18
93	0.21
94	0.21
95	0.2
96	0.24
97	0.28
98	0.3
99	0.35
100	0.42
101	0.39
102	0.39
103	0.38
104	0.36
105	0.33
106	0.28
107	0.22
108	0.16
109	0.14
110	0.15
111	0.14
112	0.12
113	0.11
114	0.09
115	0.1
116	0.09
117	0.1
118	0.11
119	0.13
120	0.14
121	0.15
122	0.19
123	0.19
124	0.21
125	0.23
126	0.22
127	0.19
128	0.18
129	0.19
130	0.16
131	0.15
132	0.14
133	0.13
134	0.14
135	0.16
136	0.16
137	0.17
138	0.18
139	0.19
140	0.24
141	0.22
142	0.26
143	0.27
144	0.28
145	0.25
146	0.24
147	0.24
148	0.2
149	0.19
150	0.18
151	0.18
152	0.17
153	0.18
154	0.18
155	0.19
156	0.19
157	0.2
158	0.19
159	0.18
160	0.16
161	0.17
162	0.17
163	0.16
164	0.16
165	0.15
166	0.12
167	0.11
168	0.12
169	0.1
170	0.09
171	0.09
172	0.08
173	0.07
174	0.07
175	0.06
176	0.06
177	0.06
178	0.08
179	0.08
180	0.08
181	0.11
182	0.11
183	0.12
184	0.12
185	0.12
186	0.12
187	0.12
188	0.12
189	0.09
190	0.1
191	0.1
192	0.09
193	0.1
194	0.1
195	0.11
196	0.11
197	0.12
198	0.1
199	0.12
200	0.13
201	0.12
202	0.12
203	0.11
204	0.12
205	0.1
206	0.1
207	0.08
208	0.07
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.05
213	0.05
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.07
219	0.09
220	0.09
221	0.1
222	0.1
223	0.11
224	0.11
225	0.11
226	0.1
227	0.09
228	0.08
229	0.08
230	0.08
231	0.08
232	0.11
233	0.13
234	0.14
235	0.13
236	0.18
237	0.19
238	0.19
239	0.21
240	0.24
241	0.25
242	0.3
243	0.3
244	0.28
245	0.29
246	0.28
247	0.25
248	0.2
249	0.2
250	0.18
251	0.23
252	0.2
253	0.18
254	0.18
255	0.18
256	0.2
257	0.19
258	0.18
259	0.15
260	0.16
261	0.17
262	0.17
263	0.19
264	0.18
265	0.19
266	0.19
267	0.19
268	0.21
269	0.2
270	0.2
271	0.18
272	0.18
273	0.17
274	0.19
275	0.21
276	0.19
277	0.19
278	0.21
279	0.22
280	0.24
281	0.29
282	0.28
283	0.28
284	0.27
285	0.27
286	0.25
287	0.25
288	0.22
289	0.15
290	0.12
291	0.11
292	0.15
293	0.19
294	0.19
295	0.18
296	0.17
297	0.18
298	0.17
299	0.17
300	0.14
301	0.1
302	0.13
303	0.14
304	0.14
305	0.13
306	0.12
307	0.12
308	0.13
309	0.13
310	0.13
311	0.16
312	0.17
313	0.18
314	0.18
315	0.19
316	0.19
317	0.24
318	0.22
319	0.17
320	0.17
321	0.17
322	0.23
323	0.21
324	0.2
325	0.16
326	0.16
327	0.16
328	0.17
329	0.19
330	0.17
331	0.2
332	0.22
333	0.29
334	0.29
335	0.28
336	0.29
337	0.32
338	0.32
339	0.33
340	0.32
341	0.3
342	0.36
343	0.39
344	0.44
345	0.41
346	0.4
347	0.37
348	0.36
349	0.31
350	0.25
351	0.2
352	0.16
353	0.13
354	0.08
355	0.07
356	0.06
357	0.05
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.05
362	0.09
363	0.12
364	0.17
365	0.22
366	0.29
367	0.36
368	0.4
369	0.48
370	0.51
371	0.59
372	0.64
373	0.67
374	0.66
375	0.61
376	0.62
377	0.54
378	0.48
379	0.39
380	0.33
381	0.25
382	0.25
383	0.27
384	0.3
385	0.31
386	0.31
387	0.33
388	0.31
389	0.31
390	0.27
391	0.24
392	0.17
393	0.15
394	0.14
395	0.11
396	0.09
397	0.09
398	0.07
399	0.06
400	0.05
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.06
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.07
409	0.07
410	0.08
411	0.08
412	0.07
413	0.07
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.09
418	0.09
419	0.09
420	0.09
421	0.08
422	0.08
423	0.09
424	0.1
425	0.08
426	0.08
427	0.08
428	0.09
429	0.16
430	0.22
431	0.25
432	0.31
433	0.31
434	0.36
435	0.4
436	0.43
437	0.41
438	0.42
439	0.4
440	0.43
441	0.44
442	0.38
443	0.35
444	0.33
445	0.31
446	0.26
447	0.26
448	0.19
449	0.21
450	0.22
451	0.22
452	0.21
453	0.17
454	0.19
455	0.17
456	0.18
457	0.14
458	0.14
459	0.21
460	0.21
461	0.27
462	0.24
463	0.25
464	0.27
465	0.35
466	0.36
467	0.36
468	0.37
469	0.34
470	0.37
471	0.38
472	0.36
473	0.29
474	0.3
475	0.27
476	0.25
477	0.22
478	0.19
479	0.17
480	0.15
481	0.15
482	0.11
483	0.11
484	0.13
485	0.14
486	0.14
487	0.14
488	0.14
489	0.14
490	0.14
491	0.12
492	0.09
493	0.09
494	0.08
495	0.07
496	0.07
497	0.06
498	0.06
499	0.05
500	0.05
501	0.05
502	0.05
503	0.06
504	0.07
505	0.07
506	0.1
507	0.14
508	0.18
509	0.23
510	0.24
511	0.27
512	0.34
513	0.34
514	0.33
515	0.33
516	0.32
517	0.28
518	0.34
519	0.3
520	0.23
521	0.22
522	0.24
523	0.22
524	0.19
525	0.17
526	0.13
527	0.16
528	0.21
529	0.23
530	0.23
531	0.23
532	0.23
533	0.23
534	0.23
535	0.26
536	0.23
537	0.29
538	0.28
539	0.28
540	0.28
541	0.28
542	0.26
543	0.2
544	0.19
545	0.11
546	0.14
547	0.13
548	0.16
549	0.17
550	0.16
551	0.15
552	0.14
553	0.15
554	0.16
555	0.16
556	0.18
557	0.21
558	0.26
559	0.26
560	0.26
561	0.24
562	0.24
563	0.23
564	0.24
565	0.3
566	0.29
567	0.31
568	0.32
569	0.34
570	0.33
571	0.33
572	0.32
573	0.27
574	0.32
575	0.32
576	0.35
577	0.33
578	0.31
579	0.3
580	0.3
581	0.25
582	0.17
583	0.16
584	0.12
585	0.13
586	0.17
587	0.21
588	0.25
589	0.26
590	0.29
591	0.38
592	0.39
593	0.42
594	0.41
595	0.38
596	0.33
597	0.34
598	0.33
599	0.26
600	0.24
601	0.2
602	0.18
603	0.17
604	0.18
605	0.16
606	0.13
607	0.12
608	0.11
609	0.12
610	0.1
611	0.1
612	0.06
613	0.04
614	0.04
615	0.03
616	0.03
617	0.03
618	0.03
619	0.03
620	0.03
621	0.04
622	0.05
623	0.06
624	0.07
625	0.09
626	0.1
627	0.12
628	0.14
629	0.15
630	0.14
631	0.14
632	0.13
633	0.11
634	0.14
635	0.12
636	0.1
637	0.09
638	0.12
639	0.12
640	0.14
641	0.15
642	0.13
643	0.14
644	0.14
645	0.18
646	0.16
647	0.17
648	0.17
649	0.22
650	0.21
651	0.21
652	0.23
653	0.22
654	0.25
655	0.26
656	0.26
657	0.21
658	0.22
659	0.21
660	0.2
661	0.19
662	0.2
663	0.2
664	0.19
665	0.21
666	0.25
667	0.25
668	0.24
669	0.21
670	0.19
671	0.18
672	0.23
673	0.28
674	0.27
675	0.27
676	0.31
677	0.31
678	0.35
679	0.37
680	0.36
681	0.3
682	0.3
683	0.33
684	0.38
685	0.44
686	0.44
687	0.4
688	0.36
689	0.39
690	0.34
691	0.34
692	0.3
693	0.24
694	0.23
695	0.23
696	0.24
697	0.2
698	0.22
699	0.2
700	0.17
701	0.16
702	0.14
703	0.13
704	0.11
705	0.1
706	0.07
707	0.07
708	0.07
709	0.07
710	0.08
711	0.08
712	0.08
713	0.09
714	0.1
715	0.11
716	0.1
717	0.11
718	0.13
719	0.14
720	0.14
721	0.14
722	0.18
723	0.21
724	0.25
725	0.24
726	0.24
727	0.26
728	0.26
729	0.24
730	0.21
731	0.19
732	0.13
733	0.13
734	0.1
735	0.08
736	0.07
737	0.07
738	0.05
739	0.04
740	0.04
741	0.06
742	0.05
743	0.08
744	0.08
745	0.08
746	0.08
747	0.09
748	0.09
749	0.08
750	0.08
751	0.13
752	0.2
753	0.22
754	0.23
755	0.24
756	0.28
757	0.31
758	0.32
759	0.25
760	0.2
761	0.18
762	0.18
763	0.17
764	0.13
765	0.09
766	0.08
767	0.07
768	0.07
769	0.08
770	0.08
771	0.08
772	0.1
773	0.11
774	0.11
775	0.15
776	0.14
777	0.13
778	0.17
779	0.16
780	0.14
781	0.13
782	0.13
783	0.1
784	0.1
785	0.1
786	0.06
787	0.06
788	0.06
789	0.06
790	0.05
791	0.06
792	0.06
793	0.07
794	0.07
795	0.13
796	0.15
797	0.16
798	0.17
799	0.18
800	0.19
801	0.21
802	0.28
803	0.29
804	0.3
805	0.3
806	0.31
807	0.3
808	0.29
809	0.26
810	0.22
811	0.16
812	0.13
813	0.11
814	0.1
815	0.1
816	0.1
817	0.11
818	0.09
819	0.09
820	0.1
821	0.1
822	0.11
823	0.12
824	0.11
825	0.12
826	0.12
827	0.12
828	0.11
829	0.1
830	0.09
831	0.09
832	0.09
833	0.09
834	0.08
835	0.09
836	0.09
837	0.13
838	0.14
839	0.14
840	0.14
841	0.13
842	0.13
843	0.12
844	0.12
845	0.08
846	0.07
847	0.06
848	0.06
849	0.04
850	0.05
851	0.04
852	0.03
853	0.03
854	0.03
855	0.02
856	0.02
857	0.02
858	0.02
859	0.02
860	0.03
861	0.03
862	0.03
863	0.05
864	0.05
865	0.06
866	0.07
867	0.08
868	0.08
869	0.1
870	0.11
871	0.11
872	0.13
873	0.12
874	0.11
875	0.12
876	0.14
877	0.19
878	0.19
879	0.18
880	0.23
881	0.25
882	0.25
883	0.26
884	0.27
885	0.24
886	0.3
887	0.3
888	0.27
889	0.26
890	0.26
891	0.24
892	0.26
893	0.25
894	0.19
895	0.24
896	0.26
897	0.26
898	0.29
899	0.36
900	0.35
901	0.34
902	0.39
903	0.38
904	0.39
905	0.41
906	0.4
907	0.4
908	0.39
909	0.37
910	0.32
911	0.27
912	0.21
913	0.18
914	0.15
915	0.08
916	0.06
917	0.06
918	0.08
919	0.08
920	0.08
921	0.1
922	0.11
923	0.18
924	0.25
925	0.26
926	0.27
927	0.34
928	0.33
929	0.33
930	0.35
931	0.32
932	0.28
933	0.3
934	0.3
935	0.28
936	0.29
937	0.27
938	0.23
939	0.2
940	0.18
941	0.15
942	0.14
943	0.1
944	0.12
945	0.16
946	0.17
947	0.17
948	0.15
949	0.16
950	0.17
951	0.16
952	0.14
953	0.14
954	0.15
955	0.16
956	0.16
957	0.15
958	0.12
959	0.14
960	0.13
961	0.11
962	0.1
963	0.13
964	0.17
965	0.23
966	0.24
967	0.25
968	0.3
969	0.28
970	0.27
971	0.29
972	0.25
973	0.21
974	0.21
975	0.22
976	0.22
977	0.28
978	0.31
979	0.28
980	0.29
981	0.33
982	0.32
983	0.31
984	0.27
985	0.21
986	0.2
987	0.26
988	0.3
989	0.32
990	0.32
991	0.33
992	0.41
993	0.46
994	0.51
995	0.51
996	0.57
997	0.61
998	0.71
999	0.77
1000	0.8
1001	0.84
1002	0.86
1003	0.88
1004	0.85
1005	0.79
1006	0.77
1007	0.73
1008	0.68
1009	0.63
1010	0.56
1011	0.47
1012	0.4
1013	0.34
1014	0.27
1015	0.22
1016	0.17
1017	0.14
1018	0.11
1019	0.1
1020	0.17
1021	0.21
1022	0.19
1023	0.2
1024	0.25
1025	0.34
1026	0.41
1027	0.46
1028	0.48
1029	0.52
1030	0.57
1031	0.6
1032	0.64
1033	0.62
1034	0.59
1035	0.63
1036	0.55
1037	0.48
1038	0.42
1039	0.38
1040	0.29
1041	0.23
1042	0.2
1043	0.11
1044	0.12
1045	0.12
1046	0.13
1047	0.12
1048	0.12
1049	0.17
1050	0.24
1051	0.27
1052	0.29
1053	0.28
1054	0.31
1055	0.32
1056	0.34
1057	0.32
1058	0.32
1059	0.28
1060	0.28
1061	0.3
1062	0.29
1063	0.29
1064	0.27
1065	0.26
1066	0.19
1067	0.2
1068	0.18
1069	0.19
1070	0.16
1071	0.15
1072	0.15
1073	0.12
1074	0.12
1075	0.1
1076	0.12
1077	0.1
1078	0.11
1079	0.11
1080	0.12
1081	0.13
1082	0.13
1083	0.14
1084	0.12
1085	0.14
1086	0.14
1087	0.16
1088	0.19
1089	0.18
1090	0.18
1091	0.19
1092	0.17
1093	0.16
1094	0.19
1095	0.17
1096	0.13
1097	0.14
1098	0.14
1099	0.16
1100	0.18
1101	0.17
1102	0.14
1103	0.14
1104	0.15
1105	0.15
1106	0.15
1107	0.11
1108	0.09
1109	0.09
1110	0.09
1111	0.09
1112	0.09
1113	0.11
1114	0.1
1115	0.1
1116	0.11
1117	0.11
1118	0.1
1119	0.1
1120	0.09
1121	0.07
1122	0.08
1123	0.08
1124	0.09
1125	0.09
1126	0.12
1127	0.12
1128	0.13
1129	0.16
1130	0.16
1131	0.17
1132	0.22
1133	0.26
1134	0.26
1135	0.3
1136	0.29
1137	0.28
1138	0.28
1139	0.28
1140	0.24
1141	0.22
1142	0.23
1143	0.23
1144	0.24
1145	0.25
1146	0.29
1147	0.26
1148	0.24
1149	0.24
1150	0.27
1151	0.23
1152	0.24
1153	0.22
1154	0.22
1155	0.24
1156	0.23
1157	0.22
1158	0.15
1159	0.15
1160	0.13
1161	0.12
1162	0.1
1163	0.08
1164	0.08
1165	0.09
1166	0.1
1167	0.1
1168	0.12
1169	0.14
1170	0.15
1171	0.19
1172	0.2
1173	0.19
1174	0.19
1175	0.2
1176	0.18
1177	0.16
1178	0.15
1179	0.1
1180	0.11
1181	0.11
1182	0.1
1183	0.08
1184	0.07
1185	0.07
1186	0.07
1187	0.07
1188	0.05
1189	0.05
1190	0.06
1191	0.06
1192	0.06
1193	0.06
1194	0.05
1195	0.06
1196	0.07
1197	0.08
1198	0.14
1199	0.23
1200	0.3
1201	0.37
1202	0.48
1203	0.58
1204	0.69
1205	0.78
1206	0.84
1207	0.86
1208	0.91
1209	0.95
1210	0.94
1211	0.94
1212	0.88
1213	0.87
1214	0.86
1215	0.8
1216	0.74
1217	0.69
1218	0.61
1219	0.53
1220	0.48
1221	0.38
1222	0.29
1223	0.26
1224	0.21
1225	0.19
1226	0.17
1227	0.14
1228	0.15
1229	0.15
1230	0.14
1231	0.12
1232	0.12
1233	0.09
1234	0.12
1235	0.13
1236	0.15
1237	0.2
1238	0.25
1239	0.25
1240	0.31
1241	0.39
1242	0.4
1243	0.48
1244	0.48
1245	0.5
1246	0.49

A0A1M2VMA4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer