FuNGI

A0A1M2VUP4

Protein Details

Accession

A0A1M2VUP4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1067-1089	NELLDRFHRRHPRAPRPPDSVLY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 10, nucl 7.5, cyto_nucl 6, cyto 3.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR023780 Chromo_domain IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF00385 Chromo PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2 PS50994 INTEGRASE PS50878 RT_POL
CDD	cd00024 CD_CSD cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MSTSSALGTGSGPTETDPLSSSSPAPGIGSGQTGSPPIKISTLSASQFASETSGLPIGVLWYHEHGTPGYTLAAASIPSMSPPSRPPPLPDPAADDYIANIPEKYRDFASVFSPVEVERLPPHRPEFDMKIELEEGKSPPKGPLYHLSQTERQVLFDYVEDELRKGFIRRSTSPAASPVLFVKKKTGELRLCVDYRGLNAITKKNSYPLPLVDDILDRVQGCKVFSVIDLKSAFNLIRIREGDEWKTAFRTHLGLFEYTVMPFGLTNAPGVFQGFIQHVLRDLLDVVCVVYIDDILIFSRTQEEHDRHVRLVLERLRAAGLFANAKKCEFDRAEVEYLGFLLGADGVRMHPRKLAPIADWPAPRSVRDVQSFLGFTNFYRRFIDSYARICAPLNALTRKLARDAPFVFSDNAADAFATLKRAFTSSPLLRHYDPSLPCTLATDASDFAIAGVLHQPDQDGLLHPVGYFSRKLSPAEINYEIYDKELLAIVESFRDMRAWLIGTPAPVSVVSDHKNLEYFMTSRVLNRRQARWSTFLSEFNFVLAYAPGIKNPADAPSRRADFAPREGDETLQVNRKVLLTPQHTQGLFDAPSAAIRVAALTSLAVDNSDFLERYKAALREDQEWRAAITRSDKNFAVDGSLVYHDGLLYVPRSLRADIVSSRHDAPTGGHAGRVRTLAKLRADFSWPGMATYVRSYVRACDVCGRIKTPRHKPFGLLHPLDIPDRPWKGITMDHIVKLPSSHGYDSIWVVCDRLTRYAHFIPCNEAASAKDLAWLFLDRIFRYHGLPDSIISDRGTTFVSQFWTELTRLLQVELKHSTAYHPQTDGLTERTNQTLESYLRAYVSYQQDDWVDYLPLAEFAFNNHVNTSTKQTPFYANFGFHPVFSPRLTEPIRVPAAADLALRLARVHDELRAELRKAQAHQERYYNQRVSEAPKFQRDQLVWLLRRNIKTTRPSDKLDHRRLGPFPVERILSDVTYQLRLPPYLSRLHPVFHVSLLEPYHDPSDFHAHASPIPFGLADDTHVPLTIQTILDARKTGQRYEYLIRWHGLSEDDDSWLPLTDIPTTSNELLDRFHRRHPRAPRPPDSVLYATACTTFDEVSDAHSPSSASSSQVPSSAPPSASPPLPPPTSSLASPATAPAPFAPRPAAVPPARPRAPSPPPVHANPRVEYVPPAQTTLRSGRVSRPRPRRDA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.12
3	0.12
4	0.12
5	0.15
6	0.17
7	0.18
8	0.18
9	0.18
10	0.19
11	0.18
12	0.18
13	0.15
14	0.14
15	0.14
16	0.15
17	0.13
18	0.13
19	0.13
20	0.15
21	0.16
22	0.15
23	0.17
24	0.16
25	0.17
26	0.17
27	0.19
28	0.22
29	0.27
30	0.27
31	0.27
32	0.26
33	0.25
34	0.24
35	0.22
36	0.19
37	0.14
38	0.13
39	0.13
40	0.14
41	0.12
42	0.12
43	0.12
44	0.1
45	0.1
46	0.1
47	0.1
48	0.12
49	0.14
50	0.15
51	0.16
52	0.15
53	0.16
54	0.16
55	0.15
56	0.13
57	0.11
58	0.1
59	0.1
60	0.1
61	0.08
62	0.08
63	0.08
64	0.07
65	0.08
66	0.12
67	0.12
68	0.14
69	0.19
70	0.26
71	0.32
72	0.34
73	0.4
74	0.43
75	0.5
76	0.51
77	0.48
78	0.48
79	0.45
80	0.46
81	0.39
82	0.32
83	0.26
84	0.26
85	0.26
86	0.19
87	0.15
88	0.13
89	0.18
90	0.21
91	0.22
92	0.2
93	0.23
94	0.24
95	0.25
96	0.28
97	0.29
98	0.28
99	0.25
100	0.25
101	0.2
102	0.21
103	0.2
104	0.18
105	0.18
106	0.22
107	0.24
108	0.29
109	0.33
110	0.34
111	0.38
112	0.42
113	0.42
114	0.45
115	0.47
116	0.42
117	0.4
118	0.39
119	0.37
120	0.31
121	0.28
122	0.23
123	0.24
124	0.25
125	0.23
126	0.24
127	0.29
128	0.3
129	0.31
130	0.37
131	0.4
132	0.45
133	0.5
134	0.52
135	0.52
136	0.54
137	0.57
138	0.49
139	0.42
140	0.38
141	0.33
142	0.29
143	0.24
144	0.22
145	0.15
146	0.17
147	0.17
148	0.15
149	0.14
150	0.15
151	0.16
152	0.16
153	0.19
154	0.22
155	0.29
156	0.32
157	0.39
158	0.45
159	0.45
160	0.46
161	0.45
162	0.42
163	0.35
164	0.33
165	0.31
166	0.33
167	0.32
168	0.31
169	0.34
170	0.34
171	0.41
172	0.45
173	0.49
174	0.45
175	0.48
176	0.53
177	0.53
178	0.5
179	0.44
180	0.4
181	0.32
182	0.28
183	0.27
184	0.22
185	0.2
186	0.24
187	0.29
188	0.32
189	0.34
190	0.33
191	0.33
192	0.35
193	0.35
194	0.34
195	0.3
196	0.33
197	0.31
198	0.31
199	0.27
200	0.26
201	0.24
202	0.21
203	0.2
204	0.13
205	0.13
206	0.14
207	0.15
208	0.14
209	0.13
210	0.13
211	0.12
212	0.13
213	0.18
214	0.16
215	0.2
216	0.21
217	0.2
218	0.2
219	0.21
220	0.2
221	0.19
222	0.22
223	0.17
224	0.22
225	0.22
226	0.26
227	0.29
228	0.34
229	0.32
230	0.34
231	0.35
232	0.3
233	0.31
234	0.28
235	0.24
236	0.21
237	0.22
238	0.18
239	0.21
240	0.22
241	0.2
242	0.2
243	0.21
244	0.2
245	0.16
246	0.16
247	0.11
248	0.09
249	0.08
250	0.1
251	0.1
252	0.09
253	0.1
254	0.09
255	0.1
256	0.1
257	0.11
258	0.09
259	0.07
260	0.09
261	0.09
262	0.12
263	0.12
264	0.12
265	0.13
266	0.13
267	0.13
268	0.11
269	0.12
270	0.08
271	0.08
272	0.08
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.05
277	0.04
278	0.04
279	0.04
280	0.03
281	0.04
282	0.04
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.09
287	0.09
288	0.13
289	0.2
290	0.22
291	0.28
292	0.36
293	0.38
294	0.35
295	0.37
296	0.36
297	0.31
298	0.36
299	0.34
300	0.31
301	0.29
302	0.3
303	0.28
304	0.25
305	0.24
306	0.18
307	0.15
308	0.16
309	0.18
310	0.22
311	0.22
312	0.23
313	0.24
314	0.22
315	0.28
316	0.24
317	0.25
318	0.24
319	0.29
320	0.31
321	0.3
322	0.29
323	0.22
324	0.2
325	0.16
326	0.12
327	0.06
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.05
334	0.11
335	0.13
336	0.13
337	0.16
338	0.17
339	0.22
340	0.25
341	0.27
342	0.22
343	0.3
344	0.33
345	0.35
346	0.36
347	0.33
348	0.35
349	0.33
350	0.31
351	0.28
352	0.29
353	0.3
354	0.32
355	0.32
356	0.28
357	0.3
358	0.3
359	0.25
360	0.21
361	0.15
362	0.13
363	0.21
364	0.21
365	0.2
366	0.22
367	0.23
368	0.23
369	0.25
370	0.31
371	0.26
372	0.28
373	0.3
374	0.28
375	0.27
376	0.26
377	0.25
378	0.21
379	0.21
380	0.23
381	0.21
382	0.22
383	0.24
384	0.26
385	0.26
386	0.26
387	0.27
388	0.24
389	0.28
390	0.28
391	0.29
392	0.29
393	0.3
394	0.27
395	0.22
396	0.2
397	0.15
398	0.14
399	0.1
400	0.08
401	0.06
402	0.06
403	0.07
404	0.09
405	0.09
406	0.09
407	0.09
408	0.1
409	0.1
410	0.12
411	0.2
412	0.2
413	0.25
414	0.27
415	0.3
416	0.3
417	0.32
418	0.33
419	0.31
420	0.29
421	0.27
422	0.27
423	0.24
424	0.23
425	0.23
426	0.2
427	0.14
428	0.14
429	0.12
430	0.1
431	0.1
432	0.1
433	0.07
434	0.07
435	0.07
436	0.06
437	0.05
438	0.07
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.08
443	0.07
444	0.08
445	0.08
446	0.07
447	0.09
448	0.09
449	0.09
450	0.09
451	0.1
452	0.1
453	0.11
454	0.1
455	0.09
456	0.14
457	0.15
458	0.16
459	0.19
460	0.22
461	0.23
462	0.27
463	0.28
464	0.24
465	0.23
466	0.23
467	0.2
468	0.17
469	0.15
470	0.09
471	0.08
472	0.07
473	0.07
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.06
479	0.06
480	0.05
481	0.05
482	0.05
483	0.05
484	0.06
485	0.07
486	0.07
487	0.09
488	0.09
489	0.09
490	0.1
491	0.09
492	0.09
493	0.07
494	0.08
495	0.07
496	0.1
497	0.12
498	0.13
499	0.13
500	0.13
501	0.14
502	0.14
503	0.13
504	0.11
505	0.1
506	0.1
507	0.12
508	0.12
509	0.14
510	0.2
511	0.24
512	0.3
513	0.34
514	0.36
515	0.4
516	0.45
517	0.46
518	0.43
519	0.42
520	0.39
521	0.37
522	0.36
523	0.32
524	0.29
525	0.26
526	0.22
527	0.19
528	0.14
529	0.12
530	0.08
531	0.07
532	0.07
533	0.07
534	0.07
535	0.08
536	0.08
537	0.08
538	0.08
539	0.12
540	0.14
541	0.14
542	0.17
543	0.21
544	0.23
545	0.23
546	0.23
547	0.23
548	0.22
549	0.27
550	0.28
551	0.24
552	0.25
553	0.24
554	0.24
555	0.22
556	0.2
557	0.17
558	0.18
559	0.18
560	0.15
561	0.16
562	0.16
563	0.15
564	0.15
565	0.2
566	0.2
567	0.22
568	0.24
569	0.28
570	0.27
571	0.27
572	0.26
573	0.21
574	0.17
575	0.14
576	0.12
577	0.08
578	0.08
579	0.08
580	0.07
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.03
585	0.03
586	0.03
587	0.03
588	0.03
589	0.03
590	0.03
591	0.03
592	0.03
593	0.04
594	0.04
595	0.05
596	0.05
597	0.05
598	0.07
599	0.07
600	0.09
601	0.12
602	0.13
603	0.14
604	0.17
605	0.18
606	0.22
607	0.25
608	0.25
609	0.23
610	0.21
611	0.21
612	0.19
613	0.18
614	0.14
615	0.17
616	0.21
617	0.22
618	0.24
619	0.24
620	0.23
621	0.23
622	0.22
623	0.17
624	0.12
625	0.1
626	0.09
627	0.09
628	0.08
629	0.07
630	0.07
631	0.06
632	0.05
633	0.05
634	0.05
635	0.05
636	0.05
637	0.05
638	0.07
639	0.08
640	0.08
641	0.09
642	0.09
643	0.11
644	0.12
645	0.15
646	0.16
647	0.17
648	0.18
649	0.17
650	0.17
651	0.15
652	0.14
653	0.14
654	0.17
655	0.14
656	0.15
657	0.16
658	0.16
659	0.17
660	0.19
661	0.16
662	0.14
663	0.16
664	0.19
665	0.21
666	0.23
667	0.23
668	0.22
669	0.25
670	0.23
671	0.22
672	0.21
673	0.18
674	0.16
675	0.16
676	0.14
677	0.12
678	0.13
679	0.15
680	0.11
681	0.12
682	0.12
683	0.13
684	0.18
685	0.18
686	0.18
687	0.2
688	0.23
689	0.26
690	0.27
691	0.28
692	0.29
693	0.35
694	0.43
695	0.48
696	0.54
697	0.56
698	0.56
699	0.57
700	0.58
701	0.6
702	0.6
703	0.5
704	0.42
705	0.37
706	0.38
707	0.34
708	0.28
709	0.21
710	0.18
711	0.19
712	0.19
713	0.17
714	0.17
715	0.18
716	0.19
717	0.21
718	0.22
719	0.23
720	0.23
721	0.24
722	0.23
723	0.21
724	0.19
725	0.17
726	0.12
727	0.12
728	0.12
729	0.12
730	0.12
731	0.13
732	0.14
733	0.13
734	0.12
735	0.1
736	0.1
737	0.1
738	0.12
739	0.12
740	0.16
741	0.17
742	0.16
743	0.22
744	0.27
745	0.31
746	0.3
747	0.29
748	0.29
749	0.29
750	0.3
751	0.24
752	0.19
753	0.16
754	0.17
755	0.17
756	0.13
757	0.14
758	0.13
759	0.13
760	0.13
761	0.13
762	0.11
763	0.13
764	0.16
765	0.12
766	0.14
767	0.16
768	0.16
769	0.16
770	0.18
771	0.17
772	0.17
773	0.17
774	0.16
775	0.17
776	0.17
777	0.17
778	0.15
779	0.13
780	0.11
781	0.12
782	0.12
783	0.1
784	0.09
785	0.1
786	0.12
787	0.11
788	0.11
789	0.11
790	0.13
791	0.12
792	0.13
793	0.12
794	0.13
795	0.13
796	0.14
797	0.16
798	0.14
799	0.18
800	0.19
801	0.19
802	0.17
803	0.17
804	0.18
805	0.23
806	0.26
807	0.24
808	0.22
809	0.22
810	0.22
811	0.24
812	0.23
813	0.19
814	0.17
815	0.16
816	0.17
817	0.18
818	0.18
819	0.16
820	0.15
821	0.17
822	0.15
823	0.17
824	0.16
825	0.15
826	0.16
827	0.16
828	0.15
829	0.17
830	0.22
831	0.21
832	0.2
833	0.21
834	0.22
835	0.22
836	0.22
837	0.17
838	0.12
839	0.1
840	0.1
841	0.08
842	0.08
843	0.07
844	0.07
845	0.05
846	0.07
847	0.13
848	0.13
849	0.14
850	0.14
851	0.16
852	0.18
853	0.2
854	0.25
855	0.26
856	0.27
857	0.28
858	0.3
859	0.34
860	0.34
861	0.37
862	0.32
863	0.27
864	0.26
865	0.3
866	0.28
867	0.23
868	0.23
869	0.2
870	0.2
871	0.19
872	0.21
873	0.16
874	0.24
875	0.26
876	0.26
877	0.25
878	0.3
879	0.32
880	0.28
881	0.28
882	0.21
883	0.21
884	0.19
885	0.17
886	0.09
887	0.09
888	0.09
889	0.09
890	0.08
891	0.07
892	0.08
893	0.1
894	0.11
895	0.12
896	0.13
897	0.15
898	0.21
899	0.24
900	0.24
901	0.25
902	0.28
903	0.29
904	0.3
905	0.37
906	0.39
907	0.42
908	0.44
909	0.49
910	0.49
911	0.52
912	0.59
913	0.52
914	0.45
915	0.43
916	0.42
917	0.42
918	0.45
919	0.47
920	0.44
921	0.49
922	0.51
923	0.49
924	0.53
925	0.47
926	0.44
927	0.44
928	0.48
929	0.43
930	0.45
931	0.51
932	0.49
933	0.51
934	0.51
935	0.48
936	0.46
937	0.52
938	0.56
939	0.57
940	0.57
941	0.59
942	0.63
943	0.68
944	0.71
945	0.72
946	0.7
947	0.65
948	0.66
949	0.63
950	0.6
951	0.56
952	0.49
953	0.42
954	0.4
955	0.37
956	0.31
957	0.32
958	0.29
959	0.22
960	0.2
961	0.2
962	0.17
963	0.18
964	0.18
965	0.18
966	0.18
967	0.18
968	0.19
969	0.2
970	0.22
971	0.27
972	0.28
973	0.31
974	0.3
975	0.3
976	0.31
977	0.31
978	0.28
979	0.23
980	0.23
981	0.18
982	0.21
983	0.2
984	0.21
985	0.17
986	0.18
987	0.19
988	0.18
989	0.17
990	0.17
991	0.25
992	0.23
993	0.25
994	0.25
995	0.24
996	0.26
997	0.27
998	0.24
999	0.16
1000	0.16
1001	0.13
1002	0.11
1003	0.12
1004	0.1
1005	0.1
1006	0.11
1007	0.12
1008	0.12
1009	0.12
1010	0.12
1011	0.1
1012	0.12
1013	0.12
1014	0.1
1015	0.1
1016	0.13
1017	0.14
1018	0.16
1019	0.17
1020	0.17
1021	0.21
1022	0.24
1023	0.26
1024	0.27
1025	0.3
1026	0.34
1027	0.39
1028	0.42
1029	0.42
1030	0.43
1031	0.41
1032	0.37
1033	0.34
1034	0.29
1035	0.25
1036	0.22
1037	0.2
1038	0.17
1039	0.19
1040	0.18
1041	0.18
1042	0.18
1043	0.16
1044	0.15
1045	0.12
1046	0.12
1047	0.12
1048	0.13
1049	0.15
1050	0.16
1051	0.21
1052	0.21
1053	0.21
1054	0.2
1055	0.19
1056	0.2
1057	0.25
1058	0.31
1059	0.3
1060	0.38
1061	0.47
1062	0.52
1063	0.61
1064	0.69
1065	0.74
1066	0.77
1067	0.84
1068	0.83
1069	0.81
1070	0.8
1071	0.74
1072	0.69
1073	0.6
1074	0.53
1075	0.45
1076	0.37
1077	0.3
1078	0.26
1079	0.23
1080	0.18
1081	0.17
1082	0.13
1083	0.11
1084	0.12
1085	0.11
1086	0.15
1087	0.18
1088	0.18
1089	0.16
1090	0.17
1091	0.17
1092	0.16
1093	0.2
1094	0.16
1095	0.15
1096	0.18
1097	0.22
1098	0.22
1099	0.24
1100	0.24
1101	0.21
1102	0.25
1103	0.27
1104	0.23
1105	0.2
1106	0.25
1107	0.27
1108	0.28
1109	0.29
1110	0.3
1111	0.33
1112	0.35
1113	0.35
1114	0.33
1115	0.35
1116	0.37
1117	0.35
1118	0.34
1119	0.29
1120	0.28
1121	0.27
1122	0.25
1123	0.21
1124	0.18
1125	0.19
1126	0.17
1127	0.21
1128	0.21
1129	0.22
1130	0.23
1131	0.22
1132	0.25
1133	0.27
1134	0.33
1135	0.3
1136	0.38
1137	0.44
1138	0.51
1139	0.53
1140	0.53
1141	0.54
1142	0.55
1143	0.61
1144	0.62
1145	0.6
1146	0.6
1147	0.63
1148	0.67
1149	0.71
1150	0.7
1151	0.68
1152	0.6
1153	0.59
1154	0.52
1155	0.47
1156	0.44
1157	0.4
1158	0.39
1159	0.34
1160	0.35
1161	0.31
1162	0.31
1163	0.35
1164	0.37
1165	0.4
1166	0.36
1167	0.37
1168	0.44
1169	0.53
1170	0.61
1171	0.66
1172	0.71

A0A1M2VUP4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer