FuNGI

A0A1M2VRU9

Protein Details

Accession

A0A1M2VRU9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
176-199	AQKQQLKKGRGKGKQKGPLKPKAE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
182-197	KKGRGKGKQKGPLKPK

Subcellular Location(s)

cyto 16, nucl 5, pero 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2 PF00665 rve
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

PAVTQPTDPAAAKEWKEAHKEHMDWVLRDNAAQGTILVSSDKSAQVHVDGCKMAKEMWDKLKKVYVTHQQRINVHYHFKELYTTKYVKGTSMSKHIARILRLKQAIRDCGEEVPDLHVARALILSLLKTPSWDVIKIQLFLLESKDLTSELVGARLQAKANCRTRDNSSNEAALLAQKQQLKKGRGKGKQKGPLKPKAEDEWRYCRAKGHWAKTCPRCLEDEKKDGAGSANLAIGQFVSLELGHHILAAIDETQVALVAMSTRQVILDTGATARMFCSRELFTLYSTMVTSETISVGDNGCLPVAGRGDVTIACRLPEGHRTVTLRDVMHVPGLMTNLVSLGTLQRCGATFETCGEDGLSVKHNQEELFRAYLSGTTGTLYIIDQVPARTGEVACMAGSSGSMRIWHRHLAHLNLEAIREMSKKGLVDGLNITSAQEFDQICEGCVLGKSHRLPFPKQSTTTYDKCELLVVDTTGPMSHPTWTGMWYTLVVVEVSCRFGVGDLLPSKERMAESLINTVARLERQSGKKVRMIRSDNGSEFVNSTVERICKAQGIIHQTTVPYTPEYNRIGERAIAIYFEMVRCMLHTAGVPSEYWGGVFMYAVHIRSMSYMSALNGIVPYEAWTGRKPDVSHLRVFGSIAYANIPKKLRGGKLEVTSVKCRLLGWWADETKGYRLEDVKTRKLITSRDVRFIEDDHPSDLAIVEGDGVAPTAKALDDLVLDLKPPQNENSMPHPPPPATPVSASRRATPTIASTFCATSPRFKDDLRKRFDITDLGELHFILGIHVVRDRSARAIYLNQTAYIHATLDKFGMGNCAPTSTPLAVKERLTAAQSPSTPEEKADYESYAHNLKYLEIVGAVLYVTQTRPNIQYTIGVLAQFGANPGKPHLEALKRVLRYLKGTAHLSLRLGGQNSDTELVGWTDSDWAQDVDSHCSVGGFVFEVAGGVVLWSSKKQPTVALSTVEAEYMATSNATKEAVWLCTLLADLGFKQVLTTVLFGDNQGCIALSRNP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.43
3	0.48
4	0.49
5	0.51
6	0.53
7	0.53
8	0.5
9	0.53
10	0.52
11	0.46
12	0.48
13	0.46
14	0.37
15	0.36
16	0.33
17	0.25
18	0.2
19	0.2
20	0.16
21	0.1
22	0.11
23	0.11
24	0.09
25	0.08
26	0.09
27	0.12
28	0.14
29	0.14
30	0.14
31	0.15
32	0.18
33	0.22
34	0.23
35	0.24
36	0.24
37	0.24
38	0.25
39	0.25
40	0.23
41	0.24
42	0.28
43	0.31
44	0.4
45	0.48
46	0.48
47	0.51
48	0.58
49	0.53
50	0.52
51	0.53
52	0.53
53	0.55
54	0.61
55	0.63
56	0.63
57	0.65
58	0.65
59	0.62
60	0.57
61	0.54
62	0.48
63	0.46
64	0.41
65	0.37
66	0.41
67	0.36
68	0.37
69	0.36
70	0.38
71	0.35
72	0.39
73	0.39
74	0.34
75	0.37
76	0.37
77	0.34
78	0.41
79	0.45
80	0.41
81	0.44
82	0.49
83	0.48
84	0.47
85	0.51
86	0.48
87	0.51
88	0.54
89	0.53
90	0.54
91	0.57
92	0.59
93	0.53
94	0.51
95	0.43
96	0.4
97	0.4
98	0.34
99	0.27
100	0.24
101	0.25
102	0.21
103	0.19
104	0.19
105	0.16
106	0.16
107	0.15
108	0.11
109	0.08
110	0.09
111	0.09
112	0.1
113	0.12
114	0.11
115	0.12
116	0.13
117	0.17
118	0.19
119	0.2
120	0.19
121	0.25
122	0.29
123	0.29
124	0.28
125	0.25
126	0.23
127	0.23
128	0.25
129	0.18
130	0.14
131	0.14
132	0.14
133	0.12
134	0.12
135	0.11
136	0.1
137	0.09
138	0.11
139	0.1
140	0.11
141	0.12
142	0.14
143	0.16
144	0.17
145	0.23
146	0.3
147	0.39
148	0.43
149	0.45
150	0.47
151	0.53
152	0.59
153	0.6
154	0.56
155	0.5
156	0.47
157	0.43
158	0.39
159	0.32
160	0.25
161	0.2
162	0.16
163	0.17
164	0.2
165	0.22
166	0.29
167	0.37
168	0.41
169	0.48
170	0.55
171	0.61
172	0.66
173	0.75
174	0.78
175	0.8
176	0.83
177	0.83
178	0.84
179	0.83
180	0.83
181	0.78
182	0.73
183	0.68
184	0.67
185	0.68
186	0.65
187	0.63
188	0.62
189	0.63
190	0.62
191	0.56
192	0.53
193	0.47
194	0.5
195	0.53
196	0.53
197	0.56
198	0.6
199	0.69
200	0.72
201	0.78
202	0.71
203	0.63
204	0.59
205	0.58
206	0.61
207	0.59
208	0.59
209	0.53
210	0.5
211	0.48
212	0.43
213	0.37
214	0.27
215	0.2
216	0.14
217	0.12
218	0.1
219	0.1
220	0.09
221	0.08
222	0.07
223	0.05
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.04
228	0.05
229	0.06
230	0.06
231	0.06
232	0.06
233	0.05
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.03
244	0.03
245	0.04
246	0.04
247	0.05
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.07
255	0.07
256	0.07
257	0.09
258	0.09
259	0.09
260	0.09
261	0.12
262	0.13
263	0.12
264	0.16
265	0.15
266	0.16
267	0.21
268	0.21
269	0.17
270	0.18
271	0.18
272	0.15
273	0.14
274	0.13
275	0.09
276	0.09
277	0.09
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.08
284	0.08
285	0.08
286	0.07
287	0.07
288	0.06
289	0.06
290	0.07
291	0.07
292	0.08
293	0.07
294	0.07
295	0.08
296	0.09
297	0.11
298	0.11
299	0.11
300	0.11
301	0.11
302	0.12
303	0.13
304	0.19
305	0.21
306	0.2
307	0.25
308	0.26
309	0.28
310	0.3
311	0.32
312	0.26
313	0.23
314	0.23
315	0.19
316	0.18
317	0.17
318	0.13
319	0.1
320	0.11
321	0.09
322	0.07
323	0.06
324	0.06
325	0.05
326	0.05
327	0.04
328	0.07
329	0.07
330	0.08
331	0.08
332	0.09
333	0.09
334	0.12
335	0.13
336	0.11
337	0.11
338	0.12
339	0.14
340	0.14
341	0.14
342	0.11
343	0.1
344	0.09
345	0.1
346	0.12
347	0.1
348	0.11
349	0.12
350	0.13
351	0.13
352	0.14
353	0.17
354	0.16
355	0.17
356	0.16
357	0.15
358	0.14
359	0.14
360	0.13
361	0.1
362	0.08
363	0.07
364	0.07
365	0.06
366	0.07
367	0.06
368	0.07
369	0.06
370	0.07
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.08
375	0.09
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.08
381	0.07
382	0.07
383	0.06
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.04
389	0.07
390	0.08
391	0.11
392	0.13
393	0.19
394	0.2
395	0.24
396	0.27
397	0.28
398	0.29
399	0.29
400	0.29
401	0.24
402	0.23
403	0.17
404	0.15
405	0.13
406	0.11
407	0.09
408	0.08
409	0.09
410	0.09
411	0.09
412	0.13
413	0.12
414	0.13
415	0.14
416	0.14
417	0.13
418	0.13
419	0.13
420	0.08
421	0.08
422	0.07
423	0.09
424	0.08
425	0.08
426	0.12
427	0.12
428	0.12
429	0.12
430	0.11
431	0.08
432	0.09
433	0.1
434	0.07
435	0.13
436	0.15
437	0.19
438	0.23
439	0.26
440	0.28
441	0.36
442	0.43
443	0.43
444	0.43
445	0.42
446	0.44
447	0.47
448	0.47
449	0.42
450	0.37
451	0.32
452	0.3
453	0.28
454	0.21
455	0.16
456	0.14
457	0.11
458	0.08
459	0.07
460	0.07
461	0.06
462	0.06
463	0.07
464	0.06
465	0.07
466	0.07
467	0.08
468	0.09
469	0.1
470	0.1
471	0.1
472	0.09
473	0.09
474	0.08
475	0.07
476	0.07
477	0.06
478	0.05
479	0.05
480	0.05
481	0.06
482	0.06
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.06
487	0.05
488	0.1
489	0.1
490	0.12
491	0.12
492	0.13
493	0.13
494	0.13
495	0.13
496	0.09
497	0.11
498	0.12
499	0.13
500	0.15
501	0.16
502	0.14
503	0.14
504	0.14
505	0.11
506	0.09
507	0.09
508	0.09
509	0.14
510	0.17
511	0.25
512	0.29
513	0.32
514	0.36
515	0.42
516	0.45
517	0.48
518	0.5
519	0.46
520	0.47
521	0.48
522	0.44
523	0.39
524	0.33
525	0.25
526	0.2
527	0.17
528	0.12
529	0.08
530	0.09
531	0.09
532	0.09
533	0.09
534	0.1
535	0.1
536	0.1
537	0.11
538	0.12
539	0.14
540	0.21
541	0.21
542	0.21
543	0.21
544	0.2
545	0.2
546	0.19
547	0.16
548	0.1
549	0.1
550	0.11
551	0.15
552	0.17
553	0.19
554	0.18
555	0.18
556	0.18
557	0.17
558	0.16
559	0.12
560	0.1
561	0.08
562	0.08
563	0.07
564	0.07
565	0.06
566	0.06
567	0.05
568	0.05
569	0.05
570	0.07
571	0.06
572	0.06
573	0.07
574	0.07
575	0.08
576	0.08
577	0.08
578	0.07
579	0.08
580	0.07
581	0.07
582	0.06
583	0.06
584	0.05
585	0.05
586	0.05
587	0.07
588	0.08
589	0.08
590	0.08
591	0.08
592	0.08
593	0.09
594	0.1
595	0.07
596	0.07
597	0.07
598	0.07
599	0.09
600	0.09
601	0.08
602	0.07
603	0.07
604	0.06
605	0.06
606	0.07
607	0.07
608	0.08
609	0.09
610	0.1
611	0.13
612	0.15
613	0.19
614	0.17
615	0.24
616	0.33
617	0.35
618	0.36
619	0.35
620	0.35
621	0.32
622	0.31
623	0.23
624	0.15
625	0.12
626	0.1
627	0.1
628	0.12
629	0.12
630	0.17
631	0.17
632	0.16
633	0.2
634	0.25
635	0.27
636	0.28
637	0.34
638	0.35
639	0.37
640	0.43
641	0.42
642	0.41
643	0.41
644	0.39
645	0.33
646	0.28
647	0.25
648	0.2
649	0.2
650	0.18
651	0.18
652	0.22
653	0.22
654	0.22
655	0.24
656	0.25
657	0.22
658	0.24
659	0.21
660	0.17
661	0.18
662	0.21
663	0.28
664	0.33
665	0.36
666	0.36
667	0.37
668	0.37
669	0.39
670	0.39
671	0.37
672	0.41
673	0.38
674	0.43
675	0.42
676	0.41
677	0.39
678	0.38
679	0.34
680	0.29
681	0.27
682	0.2
683	0.19
684	0.18
685	0.17
686	0.15
687	0.11
688	0.06
689	0.05
690	0.04
691	0.03
692	0.04
693	0.03
694	0.03
695	0.03
696	0.03
697	0.03
698	0.03
699	0.03
700	0.04
701	0.04
702	0.04
703	0.05
704	0.06
705	0.07
706	0.07
707	0.07
708	0.09
709	0.11
710	0.12
711	0.14
712	0.15
713	0.18
714	0.2
715	0.23
716	0.29
717	0.35
718	0.35
719	0.36
720	0.38
721	0.34
722	0.33
723	0.33
724	0.28
725	0.22
726	0.24
727	0.29
728	0.33
729	0.41
730	0.41
731	0.41
732	0.41
733	0.4
734	0.39
735	0.32
736	0.3
737	0.27
738	0.27
739	0.24
740	0.22
741	0.21
742	0.21
743	0.24
744	0.21
745	0.23
746	0.26
747	0.3
748	0.32
749	0.32
750	0.42
751	0.49
752	0.57
753	0.57
754	0.58
755	0.54
756	0.53
757	0.54
758	0.48
759	0.41
760	0.38
761	0.33
762	0.29
763	0.28
764	0.25
765	0.23
766	0.19
767	0.15
768	0.08
769	0.08
770	0.07
771	0.08
772	0.1
773	0.1
774	0.11
775	0.12
776	0.13
777	0.14
778	0.15
779	0.15
780	0.15
781	0.2
782	0.22
783	0.27
784	0.27
785	0.25
786	0.25
787	0.24
788	0.24
789	0.19
790	0.17
791	0.12
792	0.12
793	0.12
794	0.12
795	0.12
796	0.1
797	0.09
798	0.13
799	0.11
800	0.13
801	0.12
802	0.14
803	0.14
804	0.15
805	0.19
806	0.16
807	0.18
808	0.19
809	0.24
810	0.25
811	0.26
812	0.27
813	0.26
814	0.26
815	0.27
816	0.26
817	0.25
818	0.28
819	0.28
820	0.29
821	0.3
822	0.31
823	0.28
824	0.26
825	0.26
826	0.22
827	0.25
828	0.23
829	0.21
830	0.2
831	0.21
832	0.23
833	0.24
834	0.22
835	0.2
836	0.19
837	0.18
838	0.18
839	0.17
840	0.14
841	0.1
842	0.1
843	0.08
844	0.08
845	0.07
846	0.05
847	0.05
848	0.06
849	0.06
850	0.09
851	0.1
852	0.13
853	0.16
854	0.19
855	0.2
856	0.2
857	0.22
858	0.21
859	0.24
860	0.22
861	0.19
862	0.16
863	0.16
864	0.15
865	0.12
866	0.12
867	0.1
868	0.11
869	0.12
870	0.14
871	0.17
872	0.17
873	0.2
874	0.26
875	0.29
876	0.33
877	0.39
878	0.45
879	0.43
880	0.45
881	0.47
882	0.43
883	0.42
884	0.43
885	0.41
886	0.39
887	0.41
888	0.41
889	0.4
890	0.39
891	0.35
892	0.31
893	0.28
894	0.26
895	0.25
896	0.22
897	0.2
898	0.19
899	0.2
900	0.2
901	0.17
902	0.13
903	0.13
904	0.13
905	0.12
906	0.1
907	0.08
908	0.1
909	0.1
910	0.11
911	0.11
912	0.11
913	0.11
914	0.14
915	0.16
916	0.2
917	0.2
918	0.19
919	0.18
920	0.17
921	0.17
922	0.14
923	0.13
924	0.07
925	0.07
926	0.06
927	0.06
928	0.06
929	0.06
930	0.06
931	0.05
932	0.04
933	0.04
934	0.05
935	0.06
936	0.08
937	0.12
938	0.16
939	0.19
940	0.2
941	0.25
942	0.29
943	0.36
944	0.38
945	0.37
946	0.34
947	0.34
948	0.33
949	0.28
950	0.23
951	0.15
952	0.13
953	0.1
954	0.09
955	0.07
956	0.07
957	0.08
958	0.09
959	0.1
960	0.09
961	0.12
962	0.15
963	0.16
964	0.17
965	0.16
966	0.15
967	0.15
968	0.15
969	0.12
970	0.09
971	0.09
972	0.09
973	0.12
974	0.12
975	0.11
976	0.11
977	0.12
978	0.14
979	0.14
980	0.14
981	0.12
982	0.14
983	0.15
984	0.16
985	0.16
986	0.14
987	0.13
988	0.12
989	0.1
990	0.08

A0A1M2VRU9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer