FuNGI

A0A1M2VW86

Protein Details

Accession

A0A1M2VW86

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
266-306	ASDDDRERSRRRKRKSRDEDDSPKRKRKRSKRSRSSSESDS	Basic
309-360	ESESEDEREKRKRRKKRKSRDDSSASESEDEKERRKRKKKRSRETSANDGED	Basic
364-393	SDEEGKRRSKSRSKSKKRRKHDTDSSSDSE	Basic
399-430	DSRSRSSKSKSSRSKAKSKSKRERSSSPAPGL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
272-299	ERSRRRKRKSRDEDDSPKRKRKRSKRSR
316-351	REKRKRRKKRKSRDDSSASESEDEKERRKRKKKRSR
368-383	GKRRSKSRSKSKKRRK
402-422	SRSSKSKSSRSKAKSKSKRER

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSGRKLNPLEQKLHQAALADSKKTLTQKECEVLIPDAGARTGALNFLLGTGLLKALKDAKGAVSFRAVMKKELDVKKDMSGEESMILSYIQAAATEGIWTKHLKAKTELHQTVIDRCLKSLTQKALIKAVKSVKFPTRKIYMLAHLEPSVEMTGGPWYTDNELDTEFIKLLCSACLRFIRDKSAPKQKGGDSDSSNLLYPISASPSYPTAQQLLAFLSKSRITETQLSVEHVEMLLNVLVLDGDVERVPAFGAAMWDTSEDRAGDASDDDRERSRRRKRKSRDEDDSPKRKRKRSKRSRSSSESDSDSESESEDEREKRKRRKKRKSRDDSSASESEDEKERRKRKKKRSRETSANDGEDVQMSDEEGKRRSKSRSKSKKRRKHDTDSSSDSESDSGSDSRSRSSKSKSSRSKAKSKSKRERSSSPAPGLSQEFGGDEFGGGGAYVYRAVRQERIAGGLSQTPCLRCPSADFCKTGGPVNPQECTYYDTWLVAADVAKG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.38
3	0.33
4	0.37
5	0.37
6	0.29
7	0.27
8	0.27
9	0.31
10	0.33
11	0.39
12	0.35
13	0.36
14	0.42
15	0.45
16	0.46
17	0.43
18	0.43
19	0.37
20	0.32
21	0.27
22	0.21
23	0.17
24	0.15
25	0.13
26	0.09
27	0.09
28	0.09
29	0.09
30	0.08
31	0.08
32	0.08
33	0.08
34	0.08
35	0.06
36	0.06
37	0.06
38	0.08
39	0.08
40	0.08
41	0.09
42	0.14
43	0.15
44	0.16
45	0.16
46	0.18
47	0.25
48	0.26
49	0.26
50	0.24
51	0.25
52	0.27
53	0.34
54	0.32
55	0.28
56	0.29
57	0.33
58	0.4
59	0.44
60	0.45
61	0.41
62	0.42
63	0.44
64	0.45
65	0.4
66	0.33
67	0.28
68	0.25
69	0.22
70	0.2
71	0.15
72	0.12
73	0.11
74	0.08
75	0.07
76	0.06
77	0.05
78	0.05
79	0.06
80	0.06
81	0.06
82	0.07
83	0.08
84	0.08
85	0.1
86	0.11
87	0.13
88	0.19
89	0.21
90	0.24
91	0.29
92	0.36
93	0.43
94	0.53
95	0.52
96	0.49
97	0.51
98	0.49
99	0.48
100	0.46
101	0.43
102	0.32
103	0.31
104	0.31
105	0.27
106	0.31
107	0.33
108	0.32
109	0.34
110	0.37
111	0.39
112	0.45
113	0.46
114	0.41
115	0.4
116	0.44
117	0.4
118	0.39
119	0.43
120	0.43
121	0.49
122	0.5
123	0.5
124	0.48
125	0.45
126	0.45
127	0.44
128	0.42
129	0.4
130	0.4
131	0.36
132	0.3
133	0.29
134	0.26
135	0.23
136	0.16
137	0.1
138	0.08
139	0.06
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.07
144	0.08
145	0.1
146	0.1
147	0.1
148	0.09
149	0.1
150	0.1
151	0.1
152	0.1
153	0.09
154	0.08
155	0.08
156	0.08
157	0.07
158	0.08
159	0.09
160	0.09
161	0.13
162	0.17
163	0.2
164	0.24
165	0.25
166	0.31
167	0.35
168	0.42
169	0.45
170	0.53
171	0.52
172	0.5
173	0.54
174	0.49
175	0.51
176	0.47
177	0.45
178	0.37
179	0.36
180	0.35
181	0.31
182	0.29
183	0.21
184	0.17
185	0.12
186	0.1
187	0.08
188	0.09
189	0.08
190	0.08
191	0.09
192	0.11
193	0.12
194	0.12
195	0.13
196	0.11
197	0.11
198	0.12
199	0.11
200	0.11
201	0.11
202	0.1
203	0.1
204	0.1
205	0.11
206	0.11
207	0.13
208	0.12
209	0.15
210	0.19
211	0.2
212	0.22
213	0.22
214	0.23
215	0.21
216	0.2
217	0.17
218	0.12
219	0.11
220	0.06
221	0.06
222	0.05
223	0.04
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.02
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.04
235	0.04
236	0.03
237	0.03
238	0.03
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.05
244	0.05
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.06
254	0.08
255	0.08
256	0.09
257	0.11
258	0.16
259	0.21
260	0.31
261	0.41
262	0.48
263	0.58
264	0.68
265	0.76
266	0.83
267	0.89
268	0.89
269	0.87
270	0.88
271	0.88
272	0.88
273	0.88
274	0.85
275	0.83
276	0.8
277	0.79
278	0.8
279	0.8
280	0.82
281	0.83
282	0.86
283	0.88
284	0.91
285	0.92
286	0.89
287	0.84
288	0.77
289	0.7
290	0.62
291	0.52
292	0.43
293	0.34
294	0.27
295	0.22
296	0.17
297	0.14
298	0.11
299	0.12
300	0.13
301	0.16
302	0.2
303	0.29
304	0.38
305	0.48
306	0.57
307	0.67
308	0.75
309	0.83
310	0.9
311	0.92
312	0.95
313	0.95
314	0.93
315	0.93
316	0.89
317	0.82
318	0.77
319	0.69
320	0.58
321	0.49
322	0.41
323	0.32
324	0.32
325	0.3
326	0.3
327	0.36
328	0.44
329	0.54
330	0.64
331	0.73
332	0.77
333	0.86
334	0.9
335	0.92
336	0.94
337	0.94
338	0.94
339	0.9
340	0.89
341	0.85
342	0.75
343	0.64
344	0.53
345	0.43
346	0.33
347	0.26
348	0.17
349	0.09
350	0.08
351	0.1
352	0.13
353	0.15
354	0.18
355	0.22
356	0.25
357	0.3
358	0.39
359	0.45
360	0.53
361	0.61
362	0.7
363	0.77
364	0.85
365	0.91
366	0.93
367	0.94
368	0.95
369	0.93
370	0.93
371	0.92
372	0.9
373	0.87
374	0.84
375	0.77
376	0.68
377	0.59
378	0.48
379	0.38
380	0.28
381	0.2
382	0.15
383	0.12
384	0.11
385	0.14
386	0.14
387	0.18
388	0.21
389	0.25
390	0.29
391	0.36
392	0.43
393	0.49
394	0.59
395	0.65
396	0.71
397	0.78
398	0.8
399	0.83
400	0.85
401	0.87
402	0.87
403	0.88
404	0.9
405	0.9
406	0.93
407	0.9
408	0.88
409	0.85
410	0.85
411	0.82
412	0.77
413	0.7
414	0.6
415	0.56
416	0.5
417	0.43
418	0.33
419	0.24
420	0.18
421	0.15
422	0.15
423	0.11
424	0.08
425	0.07
426	0.07
427	0.06
428	0.05
429	0.05
430	0.04
431	0.04
432	0.06
433	0.07
434	0.09
435	0.12
436	0.15
437	0.19
438	0.2
439	0.25
440	0.24
441	0.28
442	0.28
443	0.25
444	0.25
445	0.28
446	0.27
447	0.26
448	0.27
449	0.25
450	0.25
451	0.29
452	0.29
453	0.23
454	0.29
455	0.34
456	0.41
457	0.45
458	0.45
459	0.42
460	0.47
461	0.47
462	0.45
463	0.42
464	0.4
465	0.43
466	0.45
467	0.45
468	0.4
469	0.41
470	0.38
471	0.37
472	0.31
473	0.27
474	0.24
475	0.22
476	0.21
477	0.19
478	0.18
479	0.15

A0A1M2VW86

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer