Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1M2VAT9

Protein Details
Accession A0A1M2VAT9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
142-167LYCSKRCQTADWKRHKKFCRRVSTTAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 5, mito 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
IPR002893  Znf_MYND  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13424  TPR_12  
PF01753  zf-MYND  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
PS50293  TPR_REGION  
Amino Acid Sequences MNFTHINPSMGMAMSLTSGVGLNNQALQLERQGDLQAAERVHLQAIQVKEAGLGTDHFTTAVSYNGLGELYLKMDRLDEAEEYLNKALRIRSHSGPKADLAVTRDNLGRLHEMRGDMQAAQDIRLQGASDNNIACGNYTAILYCSKRCQTADWKRHKKFCRRVSTTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.06
4 0.05
5 0.05
6 0.05
7 0.06
8 0.07
9 0.07
10 0.08
11 0.08
12 0.08
13 0.09
14 0.1
15 0.12
16 0.13
17 0.13
18 0.13
19 0.13
20 0.13
21 0.13
22 0.15
23 0.16
24 0.14
25 0.14
26 0.14
27 0.14
28 0.14
29 0.13
30 0.11
31 0.12
32 0.13
33 0.14
34 0.13
35 0.13
36 0.13
37 0.12
38 0.11
39 0.07
40 0.07
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.05
55 0.05
56 0.04
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.07
63 0.07
64 0.08
65 0.06
66 0.08
67 0.09
68 0.09
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.09
73 0.1
74 0.1
75 0.11
76 0.16
77 0.2
78 0.24
79 0.31
80 0.35
81 0.35
82 0.35
83 0.33
84 0.3
85 0.26
86 0.24
87 0.19
88 0.19
89 0.17
90 0.18
91 0.18
92 0.17
93 0.16
94 0.16
95 0.17
96 0.14
97 0.16
98 0.17
99 0.17
100 0.17
101 0.18
102 0.17
103 0.14
104 0.13
105 0.14
106 0.12
107 0.12
108 0.14
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.12
113 0.09
114 0.12
115 0.13
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.14
120 0.13
121 0.13
122 0.12
123 0.1
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.14
129 0.16
130 0.17
131 0.24
132 0.26
133 0.3
134 0.31
135 0.36
136 0.42
137 0.52
138 0.59
139 0.64
140 0.72
141 0.77
142 0.86
143 0.89
144 0.89
145 0.89
146 0.89
147 0.89