FuNGI

A0A1M2VSS2

Protein Details

Accession

A0A1M2VSS2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1031-1054	SELLERWHRRHPRAPRPPHSLLWH	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 9, nucl 7, cyto 4, plas 3, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR023780 Chromo_domain IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF00385 Chromo PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2 PS50994 INTEGRASE PS50878 RT_POL
CDD	cd00024 CD_CSD cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MRFRKLARNSETAALRYHPAGSRGYVLASTQLDTPPSPPSSDSPPPEPPLNDHAKHVPDKYHPYADVFSPIDVEKLPPHRPGFDAAIEVEDGASPPFGPLYHLSKTERALVLDYVESNLRKGFIRRSSSSAGAPILFARKKTGELRLCVDYRGLNAITKKNRYPLPLINDLLDRVQGCTVFTTLDLKNAFNLIRIREGDEWKTAFRTHLGLFEYLVMPFGLTNAPGTFQAYIQDALRDLLDVICVVYIDDILIFSRTQAEHNQHVTMVLDRLRKAGLFANAKKCAFDQPEVEYVGYIINQDGIRMDPKKLNTVIDWPMPGSVKEVQSFLGFTNFYRRFIQNYARIALPLNRLTTKAAKGAPFEWTPEANAAFEALRDAVLSAPVLRHFDPSCPSTLSTDASDFAIAGVLHQPDDQGLLHPVAFFSRKLTPAEINYEVYDKELLAIVESFRTFRAWLIGTVVPVAVVSDHKNLEYFMSSRVLNRRQARWSMFLSEFNFRLDYAPGIKNPADAPSRRADFAPREGDAVLSENHKALLSPVHTERIFDPARRDTSSAASVHLAALTTISLDRADFQERLKAALRSDPEWREAVRRGDPDFVVKGSLVYHRNLLFIPRPLRSEILFSRHDSVSAGHPGRERTRELVARDFSWPGVSTYVRQYVESCDTCGRVKVPRHKPFGLLQPLEIPRRPWQDITMDHIVKLPPSHGFDSVWVVCDRLTRYAHFIPCTESSDAPEFAWLFLDRIFRHHGMPESIVSDRGPVFVSRFWNTLTSLLHTKLKYSTAYHPQTDGLTERTNQSLETYLRAYVSTQQDDWVDYLPLAEFAFNNHVNASTKQSPFYANLGYHPTFDPLITPPSVTVPAAGDLAQRLTRIHNECRAQLLASQDRQSRYYNERVKDAPAFKEGDLVWLLRRHIKTTRPSDKLDHRRLGPFPIETKLSDLVYRLRLPAYLSRLHPVFHVSLLEPYSAHPDLHPLPEPIPFDLSNELPPSEPQSVLDCRRTGRRFEYLVHWKGLPAEEDSWTPIIDLPSTPAVSELLERWHRRHPRAPRPPHSLLWHNPSIDSANPTIHTPVPQVAEEDASALAPSSFQVAEEDPPPSSSRPPAPAVAPSRLIIRLPPSRQPVAPRVRRTPSPVPSRENLRAEYTPPTQTTTRSGRVARPVAKYDP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.36
3	0.31
4	0.32
5	0.28
6	0.26
7	0.27
8	0.26
9	0.27
10	0.25
11	0.25
12	0.21
13	0.19
14	0.21
15	0.2
16	0.19
17	0.18
18	0.18
19	0.19
20	0.19
21	0.21
22	0.22
23	0.22
24	0.23
25	0.23
26	0.25
27	0.32
28	0.39
29	0.43
30	0.43
31	0.48
32	0.51
33	0.54
34	0.52
35	0.49
36	0.49
37	0.53
38	0.48
39	0.46
40	0.48
41	0.49
42	0.53
43	0.51
44	0.49
45	0.47
46	0.55
47	0.57
48	0.56
49	0.51
50	0.5
51	0.49
52	0.44
53	0.43
54	0.35
55	0.29
56	0.25
57	0.24
58	0.21
59	0.19
60	0.19
61	0.19
62	0.25
63	0.29
64	0.34
65	0.37
66	0.38
67	0.4
68	0.42
69	0.4
70	0.35
71	0.33
72	0.26
73	0.25
74	0.22
75	0.2
76	0.16
77	0.11
78	0.1
79	0.08
80	0.07
81	0.06
82	0.06
83	0.07
84	0.07
85	0.1
86	0.14
87	0.19
88	0.22
89	0.27
90	0.3
91	0.34
92	0.36
93	0.4
94	0.37
95	0.33
96	0.32
97	0.28
98	0.26
99	0.24
100	0.22
101	0.17
102	0.19
103	0.18
104	0.17
105	0.17
106	0.16
107	0.18
108	0.21
109	0.28
110	0.33
111	0.41
112	0.43
113	0.49
114	0.52
115	0.52
116	0.5
117	0.44
118	0.37
119	0.29
120	0.26
121	0.22
122	0.26
123	0.25
124	0.23
125	0.26
126	0.25
127	0.3
128	0.35
129	0.42
130	0.41
131	0.43
132	0.47
133	0.49
134	0.49
135	0.44
136	0.41
137	0.32
138	0.27
139	0.27
140	0.24
141	0.21
142	0.25
143	0.33
144	0.39
145	0.44
146	0.46
147	0.48
148	0.52
149	0.52
150	0.54
151	0.54
152	0.53
153	0.54
154	0.52
155	0.47
156	0.44
157	0.4
158	0.34
159	0.28
160	0.21
161	0.15
162	0.15
163	0.13
164	0.13
165	0.13
166	0.12
167	0.11
168	0.11
169	0.14
170	0.13
171	0.18
172	0.19
173	0.18
174	0.19
175	0.21
176	0.21
177	0.2
178	0.23
179	0.2
180	0.25
181	0.25
182	0.29
183	0.31
184	0.35
185	0.34
186	0.36
187	0.35
188	0.31
189	0.33
190	0.29
191	0.25
192	0.23
193	0.24
194	0.19
195	0.22
196	0.23
197	0.21
198	0.2
199	0.21
200	0.2
201	0.16
202	0.15
203	0.11
204	0.08
205	0.07
206	0.08
207	0.06
208	0.06
209	0.07
210	0.07
211	0.08
212	0.08
213	0.1
214	0.1
215	0.1
216	0.11
217	0.12
218	0.13
219	0.12
220	0.13
221	0.12
222	0.12
223	0.11
224	0.1
225	0.09
226	0.07
227	0.07
228	0.06
229	0.06
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.04
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.06
240	0.05
241	0.06
242	0.1
243	0.1
244	0.12
245	0.18
246	0.23
247	0.28
248	0.31
249	0.31
250	0.27
251	0.28
252	0.26
253	0.22
254	0.2
255	0.18
256	0.19
257	0.19
258	0.2
259	0.2
260	0.19
261	0.19
262	0.21
263	0.24
264	0.29
265	0.35
266	0.43
267	0.48
268	0.48
269	0.47
270	0.43
271	0.43
272	0.39
273	0.35
274	0.3
275	0.28
276	0.32
277	0.32
278	0.31
279	0.23
280	0.19
281	0.17
282	0.14
283	0.1
284	0.06
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.09
289	0.09
290	0.15
291	0.16
292	0.19
293	0.2
294	0.22
295	0.28
296	0.29
297	0.29
298	0.26
299	0.3
300	0.31
301	0.29
302	0.28
303	0.22
304	0.22
305	0.21
306	0.2
307	0.17
308	0.18
309	0.18
310	0.18
311	0.18
312	0.17
313	0.17
314	0.18
315	0.15
316	0.14
317	0.12
318	0.11
319	0.21
320	0.21
321	0.23
322	0.26
323	0.27
324	0.28
325	0.32
326	0.4
327	0.37
328	0.39
329	0.38
330	0.35
331	0.34
332	0.32
333	0.31
334	0.29
335	0.24
336	0.24
337	0.22
338	0.23
339	0.26
340	0.28
341	0.26
342	0.26
343	0.26
344	0.25
345	0.27
346	0.27
347	0.29
348	0.25
349	0.25
350	0.23
351	0.2
352	0.19
353	0.18
354	0.18
355	0.13
356	0.12
357	0.11
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.06
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.06
370	0.07
371	0.1
372	0.1
373	0.13
374	0.14
375	0.16
376	0.19
377	0.2
378	0.21
379	0.2
380	0.2
381	0.19
382	0.2
383	0.19
384	0.17
385	0.16
386	0.14
387	0.13
388	0.12
389	0.1
390	0.08
391	0.08
392	0.06
393	0.06
394	0.08
395	0.08
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.07
400	0.08
401	0.08
402	0.07
403	0.08
404	0.08
405	0.08
406	0.08
407	0.08
408	0.09
409	0.1
410	0.09
411	0.1
412	0.13
413	0.15
414	0.17
415	0.19
416	0.21
417	0.22
418	0.27
419	0.26
420	0.24
421	0.22
422	0.22
423	0.19
424	0.17
425	0.15
426	0.1
427	0.08
428	0.08
429	0.07
430	0.06
431	0.07
432	0.06
433	0.07
434	0.07
435	0.08
436	0.07
437	0.08
438	0.08
439	0.07
440	0.1
441	0.1
442	0.1
443	0.14
444	0.14
445	0.13
446	0.13
447	0.13
448	0.09
449	0.08
450	0.08
451	0.04
452	0.05
453	0.06
454	0.09
455	0.09
456	0.1
457	0.1
458	0.1
459	0.11
460	0.11
461	0.1
462	0.1
463	0.12
464	0.12
465	0.15
466	0.21
467	0.25
468	0.31
469	0.35
470	0.38
471	0.4
472	0.46
473	0.46
474	0.43
475	0.4
476	0.38
477	0.34
478	0.33
479	0.31
480	0.28
481	0.26
482	0.22
483	0.21
484	0.16
485	0.16
486	0.12
487	0.11
488	0.13
489	0.14
490	0.13
491	0.16
492	0.16
493	0.16
494	0.16
495	0.19
496	0.18
497	0.17
498	0.2
499	0.22
500	0.24
501	0.24
502	0.24
503	0.24
504	0.23
505	0.28
506	0.28
507	0.23
508	0.22
509	0.22
510	0.21
511	0.17
512	0.16
513	0.11
514	0.09
515	0.09
516	0.08
517	0.08
518	0.08
519	0.08
520	0.07
521	0.09
522	0.09
523	0.12
524	0.13
525	0.17
526	0.17
527	0.18
528	0.17
529	0.21
530	0.21
531	0.2
532	0.23
533	0.23
534	0.26
535	0.27
536	0.27
537	0.22
538	0.23
539	0.25
540	0.21
541	0.17
542	0.15
543	0.14
544	0.13
545	0.12
546	0.09
547	0.05
548	0.05
549	0.04
550	0.03
551	0.03
552	0.03
553	0.03
554	0.03
555	0.04
556	0.06
557	0.09
558	0.09
559	0.1
560	0.13
561	0.13
562	0.16
563	0.17
564	0.17
565	0.15
566	0.18
567	0.19
568	0.17
569	0.22
570	0.21
571	0.21
572	0.21
573	0.21
574	0.21
575	0.23
576	0.25
577	0.24
578	0.25
579	0.24
580	0.25
581	0.25
582	0.24
583	0.21
584	0.17
585	0.14
586	0.11
587	0.1
588	0.09
589	0.13
590	0.13
591	0.12
592	0.15
593	0.15
594	0.16
595	0.16
596	0.17
597	0.15
598	0.18
599	0.21
600	0.2
601	0.21
602	0.21
603	0.23
604	0.21
605	0.23
606	0.2
607	0.22
608	0.23
609	0.22
610	0.25
611	0.23
612	0.23
613	0.19
614	0.18
615	0.16
616	0.2
617	0.19
618	0.17
619	0.19
620	0.22
621	0.24
622	0.26
623	0.25
624	0.21
625	0.26
626	0.28
627	0.29
628	0.32
629	0.3
630	0.28
631	0.28
632	0.26
633	0.21
634	0.18
635	0.16
636	0.11
637	0.12
638	0.11
639	0.11
640	0.13
641	0.19
642	0.18
643	0.18
644	0.18
645	0.19
646	0.25
647	0.23
648	0.22
649	0.18
650	0.19
651	0.19
652	0.2
653	0.18
654	0.19
655	0.26
656	0.34
657	0.44
658	0.51
659	0.57
660	0.57
661	0.59
662	0.56
663	0.58
664	0.56
665	0.45
666	0.37
667	0.37
668	0.39
669	0.39
670	0.35
671	0.29
672	0.27
673	0.32
674	0.33
675	0.27
676	0.26
677	0.29
678	0.29
679	0.33
680	0.35
681	0.3
682	0.28
683	0.29
684	0.27
685	0.22
686	0.21
687	0.16
688	0.11
689	0.14
690	0.15
691	0.14
692	0.15
693	0.15
694	0.2
695	0.19
696	0.18
697	0.15
698	0.14
699	0.13
700	0.15
701	0.15
702	0.15
703	0.17
704	0.15
705	0.21
706	0.26
707	0.29
708	0.27
709	0.26
710	0.26
711	0.26
712	0.29
713	0.25
714	0.2
715	0.2
716	0.22
717	0.22
718	0.18
719	0.18
720	0.14
721	0.12
722	0.14
723	0.11
724	0.09
725	0.1
726	0.14
727	0.13
728	0.15
729	0.2
730	0.19
731	0.2
732	0.22
733	0.22
734	0.2
735	0.21
736	0.19
737	0.17
738	0.16
739	0.16
740	0.14
741	0.13
742	0.11
743	0.11
744	0.11
745	0.09
746	0.11
747	0.13
748	0.17
749	0.17
750	0.18
751	0.18
752	0.19
753	0.19
754	0.2
755	0.18
756	0.17
757	0.18
758	0.19
759	0.23
760	0.22
761	0.23
762	0.22
763	0.23
764	0.22
765	0.23
766	0.28
767	0.33
768	0.38
769	0.37
770	0.36
771	0.35
772	0.33
773	0.31
774	0.26
775	0.19
776	0.16
777	0.16
778	0.17
779	0.17
780	0.17
781	0.16
782	0.15
783	0.16
784	0.15
785	0.16
786	0.16
787	0.15
788	0.15
789	0.15
790	0.15
791	0.17
792	0.21
793	0.21
794	0.2
795	0.21
796	0.21
797	0.22
798	0.22
799	0.16
800	0.12
801	0.09
802	0.1
803	0.08
804	0.08
805	0.07
806	0.07
807	0.05
808	0.07
809	0.13
810	0.13
811	0.13
812	0.12
813	0.14
814	0.17
815	0.18
816	0.24
817	0.25
818	0.26
819	0.26
820	0.27
821	0.28
822	0.27
823	0.29
824	0.25
825	0.19
826	0.2
827	0.26
828	0.25
829	0.25
830	0.23
831	0.22
832	0.19
833	0.18
834	0.17
835	0.13
836	0.15
837	0.14
838	0.13
839	0.12
840	0.14
841	0.15
842	0.13
843	0.12
844	0.1
845	0.1
846	0.11
847	0.11
848	0.09
849	0.08
850	0.11
851	0.11
852	0.1
853	0.1
854	0.12
855	0.19
856	0.24
857	0.29
858	0.34
859	0.36
860	0.37
861	0.4
862	0.39
863	0.32
864	0.29
865	0.31
866	0.3
867	0.3
868	0.34
869	0.34
870	0.35
871	0.37
872	0.38
873	0.36
874	0.36
875	0.42
876	0.45
877	0.44
878	0.46
879	0.45
880	0.47
881	0.49
882	0.47
883	0.4
884	0.36
885	0.36
886	0.31
887	0.34
888	0.29
889	0.25
890	0.22
891	0.2
892	0.19
893	0.19
894	0.21
895	0.24
896	0.25
897	0.26
898	0.31
899	0.38
900	0.44
901	0.52
902	0.6
903	0.58
904	0.61
905	0.65
906	0.71
907	0.74
908	0.74
909	0.69
910	0.63
911	0.64
912	0.62
913	0.6
914	0.53
915	0.45
916	0.39
917	0.35
918	0.34
919	0.28
920	0.3
921	0.27
922	0.24
923	0.21
924	0.2
925	0.21
926	0.24
927	0.24
928	0.22
929	0.2
930	0.2
931	0.23
932	0.27
933	0.27
934	0.28
935	0.28
936	0.32
937	0.32
938	0.32
939	0.3
940	0.27
941	0.24
942	0.19
943	0.2
944	0.15
945	0.17
946	0.18
947	0.18
948	0.14
949	0.14
950	0.19
951	0.18
952	0.18
953	0.15
954	0.19
955	0.21
956	0.25
957	0.27
958	0.22
959	0.22
960	0.27
961	0.29
962	0.24
963	0.26
964	0.22
965	0.21
966	0.22
967	0.23
968	0.22
969	0.22
970	0.21
971	0.18
972	0.18
973	0.22
974	0.21
975	0.2
976	0.18
977	0.21
978	0.28
979	0.32
980	0.37
981	0.34
982	0.35
983	0.44
984	0.46
985	0.47
986	0.46
987	0.49
988	0.47
989	0.48
990	0.55
991	0.55
992	0.56
993	0.52
994	0.46
995	0.39
996	0.39
997	0.37
998	0.29
999	0.23
1000	0.21
1001	0.2
1002	0.2
1003	0.22
1004	0.2
1005	0.18
1006	0.17
1007	0.15
1008	0.14
1009	0.14
1010	0.13
1011	0.14
1012	0.17
1013	0.17
1014	0.16
1015	0.15
1016	0.14
1017	0.14
1018	0.15
1019	0.13
1020	0.18
1021	0.26
1022	0.29
1023	0.32
1024	0.41
1025	0.5
1026	0.56
1027	0.63
1028	0.66
1029	0.7
1030	0.78
1031	0.85
1032	0.85
1033	0.85
1034	0.84
1035	0.81
1036	0.77
1037	0.74
1038	0.71
1039	0.68
1040	0.63
1041	0.55
1042	0.49
1043	0.44
1044	0.4
1045	0.33
1046	0.3
1047	0.24
1048	0.21
1049	0.22
1050	0.23
1051	0.24
1052	0.23
1053	0.22
1054	0.21
1055	0.23
1056	0.24
1057	0.23
1058	0.23
1059	0.21
1060	0.21
1061	0.19
1062	0.18
1063	0.14
1064	0.11
1065	0.1
1066	0.09
1067	0.07
1068	0.06
1069	0.06
1070	0.08
1071	0.07
1072	0.08
1073	0.1
1074	0.11
1075	0.14
1076	0.16
1077	0.18
1078	0.16
1079	0.18
1080	0.21
1081	0.21
1082	0.23
1083	0.27
1084	0.31
1085	0.34
1086	0.37
1087	0.39
1088	0.39
1089	0.45
1090	0.46
1091	0.45
1092	0.41
1093	0.37
1094	0.36
1095	0.35
1096	0.33
1097	0.28
1098	0.3
1099	0.34
1100	0.36
1101	0.43
1102	0.47
1103	0.5
1104	0.53
1105	0.57
1106	0.59
1107	0.61
1108	0.66
1109	0.67
1110	0.69
1111	0.72
1112	0.74
1113	0.75
1114	0.75
1115	0.74
1116	0.75
1117	0.73
1118	0.71
1119	0.7
1120	0.73
1121	0.73
1122	0.68
1123	0.62
1124	0.58
1125	0.53
1126	0.49
1127	0.5
1128	0.45
1129	0.42
1130	0.39
1131	0.4
1132	0.35
1133	0.36
1134	0.41
1135	0.42
1136	0.44
1137	0.45
1138	0.48
1139	0.49
1140	0.57
1141	0.63
1142	0.63
1143	0.61

A0A1M2VSS2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer