Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1M2VGH5

Protein Details
Accession A0A1M2VGH5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
234-263GKEGQGPKRRTWKKKSDEKGKGKEERRENEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
233-260GGKEGQGPKRRTWKKKSDEKGKGKEERR
Subcellular Location(s) cyto 11, nucl 8, mito 4, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
PF00665  rve  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50994  INTEGRASE  
Amino Acid Sequences MANIQHITPDPTSLSTSSDLSLTTSLKIPLLVKDGSNWVLYKAQFLTAKGLRRYLEGREHMPTPTSAPGVDSDADERYETALDKWTANHATIKMLLFQMLPESLKLEVLTLTRAVDMWRIVTSCYDNQGNFVQVNILAQIQRLKCNEGADPQPVLAQLAKLRSEYVTAGGTLSDEQYKVHILALLPLSYRPAVRAILTSAQATGMSITMTALLTAINDIARDEHALEGEQSRGGKEGQGPKRRTWKKKSDEKGKGKEERRENESAKAAAMSVSATLADATFWDGSACLVATDFAKVSASPLKPTPHTHLVDSDASRHFDPHRRNFTILRPITPIPINSADGRVFYATGEGDVRITVHHGRHNINFMLRNILYAPEMPIALTSVSQLVKSGFQVHFERDGCHITTPAGTSLPVITNRSGLYPLSGVQPSSEARAAEATAAAMLQLEFHRRMGHTYPPTLRKMVSKGVVTGVKLDAAEVDFCEVCVQAKQTRAPFPKERSSPCAEAYGDRIHTDMWGKAQVRTWDGKEYFITFLDDHADEAFVSLMRTKSEALSRCRAYEAWVKSHCGVQEIKTIQSDHGGEYTSHEFVEHLEKHGTTRRLTLPKFLWGEAVLHTCWLRNRTSGKNTPGTTPHEVATGEKPDLSHLPRFGAKCWILQQNVGKLDPKSKPGRWIGYSLESKGHKIYWPECRTVSIERDVRFEPDADPTAEVLIDMCVHSEGELTSGSVLNTPDSPSTSSSSSSSSLSPPSTPKLETPKTTAITPPSVSSLKAPQEQTSLKPIVAEQDAPKEPAEPITESRPKCERKPSAWVRNLQAGIGTTGGQGAQRVPLSILGEDAQLAAEFWEEMENEGELEDGTTQDTTPFDSPLFALAALGSDDEPTYHEAMAGSDKERWTAAMREELTWIEQLGTYELVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.2
3 0.21
4 0.2
5 0.18
6 0.17
7 0.16
8 0.18
9 0.16
10 0.15
11 0.17
12 0.17
13 0.17
14 0.2
15 0.19
16 0.2
17 0.24
18 0.23
19 0.21
20 0.23
21 0.27
22 0.27
23 0.27
24 0.24
25 0.22
26 0.26
27 0.25
28 0.27
29 0.23
30 0.27
31 0.27
32 0.28
33 0.34
34 0.34
35 0.42
36 0.41
37 0.44
38 0.39
39 0.41
40 0.43
41 0.42
42 0.46
43 0.43
44 0.44
45 0.44
46 0.45
47 0.42
48 0.41
49 0.34
50 0.28
51 0.27
52 0.24
53 0.19
54 0.19
55 0.19
56 0.2
57 0.2
58 0.18
59 0.16
60 0.17
61 0.18
62 0.17
63 0.16
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.13
68 0.18
69 0.19
70 0.19
71 0.2
72 0.26
73 0.26
74 0.27
75 0.31
76 0.25
77 0.26
78 0.28
79 0.28
80 0.24
81 0.22
82 0.22
83 0.17
84 0.16
85 0.16
86 0.14
87 0.14
88 0.12
89 0.13
90 0.12
91 0.13
92 0.12
93 0.11
94 0.1
95 0.11
96 0.12
97 0.12
98 0.12
99 0.11
100 0.12
101 0.12
102 0.13
103 0.13
104 0.12
105 0.13
106 0.13
107 0.14
108 0.16
109 0.2
110 0.19
111 0.23
112 0.26
113 0.24
114 0.26
115 0.28
116 0.28
117 0.23
118 0.21
119 0.17
120 0.13
121 0.14
122 0.12
123 0.11
124 0.09
125 0.1
126 0.17
127 0.17
128 0.23
129 0.24
130 0.27
131 0.28
132 0.3
133 0.31
134 0.3
135 0.33
136 0.3
137 0.3
138 0.26
139 0.25
140 0.23
141 0.21
142 0.16
143 0.14
144 0.14
145 0.17
146 0.18
147 0.17
148 0.18
149 0.17
150 0.19
151 0.17
152 0.16
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.12
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.11
169 0.15
170 0.16
171 0.16
172 0.15
173 0.15
174 0.16
175 0.15
176 0.15
177 0.12
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.15
182 0.16
183 0.18
184 0.2
185 0.19
186 0.16
187 0.15
188 0.14
189 0.13
190 0.1
191 0.07
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.11
221 0.12
222 0.17
223 0.27
224 0.35
225 0.44
226 0.47
227 0.52
228 0.63
229 0.71
230 0.75
231 0.75
232 0.76
233 0.77
234 0.84
235 0.88
236 0.89
237 0.9
238 0.9
239 0.9
240 0.88
241 0.88
242 0.84
243 0.82
244 0.8
245 0.76
246 0.72
247 0.7
248 0.62
249 0.58
250 0.55
251 0.46
252 0.37
253 0.31
254 0.25
255 0.17
256 0.15
257 0.09
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.06
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.06
282 0.06
283 0.08
284 0.14
285 0.15
286 0.16
287 0.2
288 0.23
289 0.26
290 0.3
291 0.35
292 0.36
293 0.37
294 0.36
295 0.34
296 0.35
297 0.36
298 0.33
299 0.3
300 0.24
301 0.24
302 0.23
303 0.23
304 0.23
305 0.26
306 0.34
307 0.4
308 0.47
309 0.48
310 0.51
311 0.52
312 0.55
313 0.58
314 0.51
315 0.43
316 0.38
317 0.36
318 0.36
319 0.34
320 0.27
321 0.21
322 0.22
323 0.21
324 0.18
325 0.2
326 0.17
327 0.16
328 0.16
329 0.12
330 0.1
331 0.08
332 0.09
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.05
341 0.08
342 0.1
343 0.12
344 0.15
345 0.19
346 0.22
347 0.24
348 0.28
349 0.27
350 0.26
351 0.27
352 0.24
353 0.26
354 0.23
355 0.22
356 0.18
357 0.18
358 0.15
359 0.12
360 0.13
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.06
367 0.06
368 0.05
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.08
375 0.09
376 0.14
377 0.11
378 0.15
379 0.17
380 0.18
381 0.23
382 0.22
383 0.23
384 0.2
385 0.22
386 0.19
387 0.18
388 0.17
389 0.12
390 0.12
391 0.11
392 0.1
393 0.08
394 0.07
395 0.07
396 0.08
397 0.09
398 0.1
399 0.11
400 0.1
401 0.11
402 0.11
403 0.12
404 0.12
405 0.1
406 0.09
407 0.08
408 0.08
409 0.1
410 0.1
411 0.09
412 0.08
413 0.1
414 0.1
415 0.11
416 0.12
417 0.09
418 0.09
419 0.1
420 0.1
421 0.08
422 0.08
423 0.05
424 0.04
425 0.04
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.04
431 0.06
432 0.07
433 0.08
434 0.09
435 0.09
436 0.12
437 0.14
438 0.21
439 0.21
440 0.25
441 0.29
442 0.33
443 0.35
444 0.33
445 0.32
446 0.27
447 0.28
448 0.28
449 0.26
450 0.22
451 0.2
452 0.23
453 0.23
454 0.2
455 0.18
456 0.14
457 0.11
458 0.11
459 0.1
460 0.07
461 0.06
462 0.06
463 0.05
464 0.06
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.06
471 0.08
472 0.09
473 0.12
474 0.16
475 0.19
476 0.27
477 0.31
478 0.36
479 0.41
480 0.44
481 0.49
482 0.52
483 0.52
484 0.5
485 0.51
486 0.47
487 0.41
488 0.39
489 0.32
490 0.27
491 0.26
492 0.24
493 0.19
494 0.17
495 0.16
496 0.12
497 0.13
498 0.14
499 0.11
500 0.09
501 0.14
502 0.14
503 0.16
504 0.19
505 0.2
506 0.22
507 0.24
508 0.24
509 0.26
510 0.26
511 0.26
512 0.24
513 0.24
514 0.21
515 0.19
516 0.2
517 0.12
518 0.12
519 0.13
520 0.12
521 0.1
522 0.09
523 0.09
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.04
528 0.05
529 0.06
530 0.06
531 0.07
532 0.08
533 0.08
534 0.1
535 0.15
536 0.21
537 0.24
538 0.31
539 0.32
540 0.32
541 0.33
542 0.31
543 0.3
544 0.32
545 0.3
546 0.3
547 0.31
548 0.32
549 0.31
550 0.34
551 0.3
552 0.25
553 0.23
554 0.17
555 0.23
556 0.22
557 0.23
558 0.22
559 0.23
560 0.2
561 0.22
562 0.21
563 0.14
564 0.13
565 0.13
566 0.11
567 0.14
568 0.16
569 0.13
570 0.12
571 0.12
572 0.11
573 0.11
574 0.19
575 0.16
576 0.16
577 0.17
578 0.17
579 0.2
580 0.26
581 0.28
582 0.21
583 0.26
584 0.31
585 0.38
586 0.38
587 0.43
588 0.38
589 0.42
590 0.43
591 0.39
592 0.32
593 0.25
594 0.25
595 0.2
596 0.21
597 0.13
598 0.13
599 0.12
600 0.13
601 0.15
602 0.17
603 0.16
604 0.19
605 0.25
606 0.31
607 0.4
608 0.46
609 0.49
610 0.54
611 0.54
612 0.52
613 0.51
614 0.5
615 0.46
616 0.4
617 0.34
618 0.29
619 0.28
620 0.26
621 0.26
622 0.22
623 0.18
624 0.17
625 0.16
626 0.17
627 0.21
628 0.22
629 0.21
630 0.2
631 0.22
632 0.26
633 0.27
634 0.27
635 0.3
636 0.28
637 0.27
638 0.31
639 0.35
640 0.31
641 0.35
642 0.37
643 0.36
644 0.37
645 0.36
646 0.34
647 0.29
648 0.35
649 0.34
650 0.37
651 0.38
652 0.38
653 0.45
654 0.48
655 0.54
656 0.49
657 0.5
658 0.46
659 0.47
660 0.47
661 0.4
662 0.39
663 0.34
664 0.33
665 0.31
666 0.28
667 0.23
668 0.26
669 0.3
670 0.35
671 0.38
672 0.4
673 0.39
674 0.4
675 0.41
676 0.4
677 0.39
678 0.36
679 0.37
680 0.35
681 0.38
682 0.37
683 0.36
684 0.32
685 0.29
686 0.22
687 0.21
688 0.22
689 0.2
690 0.19
691 0.17
692 0.16
693 0.15
694 0.13
695 0.09
696 0.07
697 0.06
698 0.05
699 0.06
700 0.06
701 0.06
702 0.06
703 0.06
704 0.06
705 0.06
706 0.07
707 0.06
708 0.07
709 0.08
710 0.08
711 0.09
712 0.1
713 0.1
714 0.1
715 0.12
716 0.12
717 0.13
718 0.15
719 0.15
720 0.18
721 0.18
722 0.19
723 0.19
724 0.21
725 0.2
726 0.2
727 0.19
728 0.18
729 0.2
730 0.2
731 0.21
732 0.22
733 0.25
734 0.27
735 0.27
736 0.3
737 0.37
738 0.41
739 0.42
740 0.45
741 0.48
742 0.47
743 0.47
744 0.46
745 0.4
746 0.39
747 0.36
748 0.31
749 0.28
750 0.27
751 0.26
752 0.25
753 0.28
754 0.29
755 0.34
756 0.34
757 0.32
758 0.38
759 0.39
760 0.39
761 0.4
762 0.36
763 0.3
764 0.29
765 0.27
766 0.25
767 0.25
768 0.26
769 0.2
770 0.27
771 0.28
772 0.29
773 0.29
774 0.25
775 0.24
776 0.24
777 0.25
778 0.2
779 0.22
780 0.3
781 0.38
782 0.37
783 0.43
784 0.48
785 0.5
786 0.54
787 0.62
788 0.61
789 0.59
790 0.7
791 0.74
792 0.77
793 0.78
794 0.78
795 0.72
796 0.71
797 0.65
798 0.54
799 0.45
800 0.35
801 0.29
802 0.23
803 0.18
804 0.1
805 0.1
806 0.1
807 0.09
808 0.09
809 0.08
810 0.12
811 0.12
812 0.13
813 0.13
814 0.15
815 0.17
816 0.16
817 0.17
818 0.13
819 0.13
820 0.12
821 0.12
822 0.09
823 0.07
824 0.07
825 0.06
826 0.05
827 0.05
828 0.05
829 0.07
830 0.07
831 0.08
832 0.09
833 0.09
834 0.09
835 0.09
836 0.09
837 0.07
838 0.07
839 0.07
840 0.06
841 0.07
842 0.07
843 0.07
844 0.09
845 0.09
846 0.13
847 0.14
848 0.15
849 0.14
850 0.15
851 0.15
852 0.15
853 0.16
854 0.12
855 0.1
856 0.09
857 0.09
858 0.09
859 0.09
860 0.07
861 0.07
862 0.07
863 0.07
864 0.09
865 0.11
866 0.12
867 0.12
868 0.12
869 0.12
870 0.13
871 0.18
872 0.19
873 0.18
874 0.21
875 0.22
876 0.22
877 0.23
878 0.23
879 0.22
880 0.25
881 0.27
882 0.31
883 0.33
884 0.32
885 0.34
886 0.33
887 0.31
888 0.27
889 0.23
890 0.15
891 0.15
892 0.15
893 0.15