Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1M2VUD2

Protein Details
Accession A0A1M2VUD2    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-53MSSRREPIRRDRSRDRDDRGGGRDRYPPRGAPRRSRSRSPPRRGERNWRGSGMBasic
201-220SADVKKMRTWRQYMNRRGGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-48REPIRRDRSRDRDDRGGGRDRYPPRGAPRRSRSRSPPRRGERNW
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSSRREPIRRDRSRDRDDRGGGRDRYPPRGAPRRSRSRSPPRRGERNWRGSGMRLCNVYYNSRSVSTVCLQTGEIPQVVIEKTIVATGTGGMTVGTIDETTGGATTGTGETTTATQDGNPFRLPGLTETECVTGTGTLGTPEVEPSGSRPPTEAEAPADGAEEGETMDATNEDDAAMMAMMGLSGFGTTKGKHVEGNQEGSADVKKMRTWRQYMNRRGGFNRPLDKIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.84
3 0.82
4 0.79
5 0.77
6 0.73
7 0.72
8 0.64
9 0.59
10 0.6
11 0.55
12 0.56
13 0.53
14 0.52
15 0.53
16 0.61
17 0.65
18 0.67
19 0.73
20 0.77
21 0.79
22 0.82
23 0.83
24 0.84
25 0.87
26 0.86
27 0.87
28 0.85
29 0.89
30 0.87
31 0.88
32 0.87
33 0.86
34 0.81
35 0.74
36 0.66
37 0.62
38 0.62
39 0.56
40 0.49
41 0.4
42 0.36
43 0.36
44 0.36
45 0.35
46 0.29
47 0.26
48 0.24
49 0.24
50 0.24
51 0.21
52 0.22
53 0.2
54 0.21
55 0.18
56 0.17
57 0.16
58 0.17
59 0.18
60 0.16
61 0.13
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.11
66 0.09
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.04
77 0.04
78 0.03
79 0.03
80 0.03
81 0.03
82 0.03
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.09
104 0.1
105 0.12
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.12
110 0.12
111 0.1
112 0.15
113 0.14
114 0.14
115 0.15
116 0.16
117 0.16
118 0.15
119 0.14
120 0.08
121 0.07
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.08
133 0.16
134 0.16
135 0.16
136 0.16
137 0.17
138 0.2
139 0.22
140 0.2
141 0.15
142 0.15
143 0.16
144 0.15
145 0.14
146 0.11
147 0.09
148 0.08
149 0.06
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.03
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.02
169 0.02
170 0.02
171 0.02
172 0.03
173 0.04
174 0.06
175 0.07
176 0.11
177 0.15
178 0.16
179 0.19
180 0.22
181 0.31
182 0.34
183 0.39
184 0.36
185 0.32
186 0.31
187 0.3
188 0.28
189 0.2
190 0.17
191 0.14
192 0.17
193 0.24
194 0.33
195 0.4
196 0.45
197 0.54
198 0.63
199 0.72
200 0.78
201 0.82
202 0.79
203 0.76
204 0.74
205 0.73
206 0.69
207 0.68
208 0.66