FuNGI

A0A1M2VH18

Protein Details

Accession

A0A1M2VH18

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
821-846	AAPPEPQLGRRQRVRKPSAYVRRLNE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
255-285	RKGGGKEGQGPKQQTAKRGRGRGRGGGGGRS

Subcellular Location(s)

mito 9, cyto_nucl 8, nucl 7, cyto 7, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50158 ZF_CCHC

Amino Acid Sequences

CGNREKWASGRWRDNGRITEPAQSAERTPGPTTESEALSTARGEAAKPEPGSKPDPLASLSDDDYFAKVEAAETKIDEYEQKEFATCQQIYGTITDSLLLKVKDLLSASAVWSAVMKEHEGKSEMYASSVRTRLLNTRCSEGRDVREHFDTLVRLREELAGMGSPLPNAEFSAAIFQSLPESYGTLLTTLSTAARMTGNLLSPGDIIFAVSEEFDRRKLNTPGTSSKSALAAQSSTQLECYNCKRKGHVKADCWRKGGGKEGQGPKQQTAKRGRGRGRGGGGGRSANVAKAKVDDEECAFTTLALGSAARFEFNPHSRDRIEVYDSGATRHISPYRDTFISFTELDPPLPINTADGHSFSAVGEGSVHVEVPNGDSQTAVTLQRVLYAPEIAFALVSIPRADEAGFSAVFEKGECRLYRRSNQTTIGRIPLKDGLYQVRRQDVAAATGFGKGPDLKLTNHELHRRMGHISPFVSRSAVKQGRICGIKLTDNSTDEVCEACIQAKITRKPVPDERESELAEEYGERFHADTWTADVTSLGGNKYATMWTDDAKRWTRTVPQKEKSQALPAYKALEAEIETQEGRRIKQLQTDGGGEFWGIDFDNYVKSRGTFHRTSVHDTPEENGVSERVNRTLGEHSRAMLIDSGLPRSLWPYSMVHATWLKNRTPTRALKGLTPFEARYGKAPDLRDLHRFGAKVWVRKERSGKTESKAREGRFVGYSQKSKGYQVYWPDKRSVTVERNVRFVEDEPDAVEQDDAPLEGARQDKGEQPTSPSLPTTQTSETAGAPTPEATPPPVQPTPSSPASQTTVEDAPDEDDDEEEAAPPEPQLGRRQRVRKPSAYVRRLNEGKGTIDGHRSRHPRGVQASELMGAATRRATA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.73
2	0.71
3	0.66
4	0.64
5	0.56
6	0.57
7	0.5
8	0.46
9	0.41
10	0.37
11	0.34
12	0.33
13	0.35
14	0.3
15	0.3
16	0.29
17	0.3
18	0.29
19	0.33
20	0.31
21	0.28
22	0.25
23	0.26
24	0.24
25	0.22
26	0.21
27	0.16
28	0.14
29	0.13
30	0.12
31	0.16
32	0.19
33	0.25
34	0.26
35	0.3
36	0.31
37	0.36
38	0.4
39	0.38
40	0.39
41	0.35
42	0.36
43	0.33
44	0.32
45	0.29
46	0.28
47	0.27
48	0.23
49	0.22
50	0.2
51	0.19
52	0.18
53	0.15
54	0.12
55	0.11
56	0.11
57	0.14
58	0.15
59	0.15
60	0.15
61	0.16
62	0.16
63	0.17
64	0.19
65	0.18
66	0.21
67	0.21
68	0.21
69	0.21
70	0.21
71	0.25
72	0.3
73	0.27
74	0.24
75	0.23
76	0.24
77	0.25
78	0.25
79	0.23
80	0.15
81	0.15
82	0.15
83	0.14
84	0.14
85	0.17
86	0.16
87	0.14
88	0.16
89	0.16
90	0.18
91	0.18
92	0.18
93	0.15
94	0.16
95	0.16
96	0.15
97	0.15
98	0.12
99	0.12
100	0.11
101	0.12
102	0.12
103	0.13
104	0.16
105	0.18
106	0.21
107	0.22
108	0.23
109	0.23
110	0.26
111	0.24
112	0.21
113	0.21
114	0.21
115	0.25
116	0.26
117	0.24
118	0.21
119	0.24
120	0.3
121	0.35
122	0.39
123	0.36
124	0.41
125	0.42
126	0.46
127	0.49
128	0.47
129	0.48
130	0.49
131	0.5
132	0.48
133	0.49
134	0.44
135	0.39
136	0.36
137	0.32
138	0.27
139	0.3
140	0.26
141	0.23
142	0.24
143	0.24
144	0.21
145	0.18
146	0.17
147	0.1
148	0.1
149	0.11
150	0.1
151	0.09
152	0.08
153	0.08
154	0.07
155	0.07
156	0.08
157	0.07
158	0.07
159	0.12
160	0.12
161	0.12
162	0.11
163	0.11
164	0.12
165	0.12
166	0.12
167	0.08
168	0.08
169	0.08
170	0.09
171	0.1
172	0.08
173	0.08
174	0.07
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.06
179	0.06
180	0.07
181	0.07
182	0.07
183	0.09
184	0.11
185	0.12
186	0.13
187	0.13
188	0.12
189	0.12
190	0.12
191	0.1
192	0.08
193	0.07
194	0.05
195	0.05
196	0.05
197	0.05
198	0.06
199	0.08
200	0.09
201	0.12
202	0.14
203	0.16
204	0.23
205	0.27
206	0.33
207	0.36
208	0.41
209	0.47
210	0.51
211	0.52
212	0.47
213	0.43
214	0.39
215	0.34
216	0.29
217	0.22
218	0.17
219	0.13
220	0.18
221	0.17
222	0.16
223	0.15
224	0.16
225	0.16
226	0.2
227	0.28
228	0.32
229	0.36
230	0.38
231	0.43
232	0.5
233	0.6
234	0.65
235	0.66
236	0.65
237	0.7
238	0.79
239	0.78
240	0.72
241	0.64
242	0.57
243	0.49
244	0.48
245	0.45
246	0.41
247	0.44
248	0.49
249	0.53
250	0.55
251	0.56
252	0.51
253	0.54
254	0.49
255	0.49
256	0.52
257	0.54
258	0.56
259	0.63
260	0.67
261	0.67
262	0.7
263	0.67
264	0.61
265	0.57
266	0.51
267	0.45
268	0.4
269	0.31
270	0.27
271	0.22
272	0.19
273	0.16
274	0.16
275	0.14
276	0.12
277	0.13
278	0.14
279	0.14
280	0.15
281	0.14
282	0.14
283	0.16
284	0.16
285	0.16
286	0.15
287	0.13
288	0.12
289	0.11
290	0.09
291	0.07
292	0.06
293	0.04
294	0.06
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.08
299	0.14
300	0.18
301	0.21
302	0.21
303	0.25
304	0.25
305	0.27
306	0.27
307	0.24
308	0.24
309	0.22
310	0.23
311	0.23
312	0.23
313	0.22
314	0.21
315	0.18
316	0.16
317	0.18
318	0.19
319	0.16
320	0.19
321	0.21
322	0.23
323	0.23
324	0.23
325	0.21
326	0.19
327	0.21
328	0.19
329	0.16
330	0.18
331	0.17
332	0.17
333	0.16
334	0.15
335	0.12
336	0.12
337	0.12
338	0.07
339	0.08
340	0.09
341	0.1
342	0.1
343	0.1
344	0.09
345	0.09
346	0.08
347	0.08
348	0.06
349	0.06
350	0.05
351	0.04
352	0.06
353	0.05
354	0.06
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.07
359	0.08
360	0.08
361	0.07
362	0.07
363	0.07
364	0.08
365	0.1
366	0.08
367	0.07
368	0.08
369	0.08
370	0.1
371	0.11
372	0.11
373	0.1
374	0.1
375	0.1
376	0.09
377	0.09
378	0.07
379	0.06
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.07
392	0.06
393	0.06
394	0.07
395	0.07
396	0.07
397	0.07
398	0.07
399	0.07
400	0.11
401	0.11
402	0.14
403	0.21
404	0.25
405	0.33
406	0.41
407	0.44
408	0.44
409	0.49
410	0.49
411	0.47
412	0.44
413	0.43
414	0.36
415	0.31
416	0.29
417	0.27
418	0.24
419	0.21
420	0.21
421	0.21
422	0.22
423	0.26
424	0.25
425	0.24
426	0.23
427	0.22
428	0.24
429	0.18
430	0.17
431	0.14
432	0.13
433	0.11
434	0.11
435	0.11
436	0.09
437	0.09
438	0.06
439	0.07
440	0.09
441	0.1
442	0.1
443	0.13
444	0.18
445	0.21
446	0.26
447	0.3
448	0.3
449	0.3
450	0.31
451	0.3
452	0.27
453	0.26
454	0.23
455	0.21
456	0.2
457	0.19
458	0.19
459	0.18
460	0.17
461	0.15
462	0.14
463	0.21
464	0.24
465	0.24
466	0.25
467	0.27
468	0.31
469	0.32
470	0.31
471	0.23
472	0.22
473	0.23
474	0.22
475	0.24
476	0.2
477	0.2
478	0.21
479	0.18
480	0.17
481	0.14
482	0.13
483	0.09
484	0.07
485	0.07
486	0.06
487	0.07
488	0.08
489	0.11
490	0.18
491	0.21
492	0.27
493	0.32
494	0.33
495	0.37
496	0.44
497	0.47
498	0.44
499	0.45
500	0.43
501	0.42
502	0.41
503	0.36
504	0.29
505	0.22
506	0.17
507	0.13
508	0.1
509	0.07
510	0.06
511	0.05
512	0.05
513	0.06
514	0.07
515	0.07
516	0.07
517	0.09
518	0.1
519	0.09
520	0.09
521	0.08
522	0.08
523	0.08
524	0.09
525	0.07
526	0.07
527	0.07
528	0.07
529	0.08
530	0.08
531	0.08
532	0.09
533	0.1
534	0.11
535	0.15
536	0.17
537	0.22
538	0.26
539	0.28
540	0.26
541	0.28
542	0.35
543	0.4
544	0.5
545	0.54
546	0.55
547	0.61
548	0.65
549	0.67
550	0.6
551	0.58
552	0.52
553	0.44
554	0.42
555	0.35
556	0.33
557	0.29
558	0.27
559	0.19
560	0.15
561	0.13
562	0.13
563	0.12
564	0.11
565	0.11
566	0.11
567	0.15
568	0.16
569	0.15
570	0.17
571	0.21
572	0.21
573	0.27
574	0.31
575	0.29
576	0.3
577	0.32
578	0.27
579	0.24
580	0.22
581	0.16
582	0.12
583	0.09
584	0.07
585	0.04
586	0.04
587	0.04
588	0.05
589	0.1
590	0.11
591	0.12
592	0.12
593	0.13
594	0.18
595	0.23
596	0.29
597	0.26
598	0.29
599	0.36
600	0.38
601	0.45
602	0.45
603	0.43
604	0.38
605	0.37
606	0.35
607	0.31
608	0.29
609	0.22
610	0.18
611	0.15
612	0.14
613	0.16
614	0.16
615	0.13
616	0.14
617	0.14
618	0.16
619	0.23
620	0.25
621	0.27
622	0.26
623	0.25
624	0.26
625	0.26
626	0.24
627	0.17
628	0.14
629	0.13
630	0.13
631	0.14
632	0.13
633	0.13
634	0.12
635	0.14
636	0.14
637	0.11
638	0.12
639	0.12
640	0.14
641	0.17
642	0.17
643	0.19
644	0.23
645	0.24
646	0.28
647	0.31
648	0.31
649	0.35
650	0.38
651	0.4
652	0.43
653	0.48
654	0.48
655	0.51
656	0.5
657	0.49
658	0.53
659	0.51
660	0.47
661	0.43
662	0.37
663	0.35
664	0.36
665	0.31
666	0.28
667	0.3
668	0.3
669	0.31
670	0.32
671	0.34
672	0.36
673	0.39
674	0.4
675	0.39
676	0.38
677	0.37
678	0.36
679	0.3
680	0.35
681	0.37
682	0.39
683	0.41
684	0.47
685	0.48
686	0.54
687	0.63
688	0.59
689	0.61
690	0.61
691	0.61
692	0.57
693	0.62
694	0.58
695	0.59
696	0.59
697	0.54
698	0.55
699	0.51
700	0.49
701	0.43
702	0.42
703	0.4
704	0.4
705	0.43
706	0.37
707	0.41
708	0.39
709	0.4
710	0.42
711	0.36
712	0.35
713	0.4
714	0.49
715	0.5
716	0.52
717	0.53
718	0.5
719	0.49
720	0.48
721	0.47
722	0.43
723	0.43
724	0.49
725	0.46
726	0.5
727	0.49
728	0.45
729	0.39
730	0.33
731	0.3
732	0.23
733	0.22
734	0.18
735	0.19
736	0.19
737	0.17
738	0.15
739	0.1
740	0.1
741	0.09
742	0.08
743	0.07
744	0.07
745	0.07
746	0.1
747	0.12
748	0.11
749	0.13
750	0.14
751	0.2
752	0.26
753	0.3
754	0.28
755	0.33
756	0.39
757	0.4
758	0.39
759	0.34
760	0.31
761	0.3
762	0.3
763	0.29
764	0.25
765	0.24
766	0.25
767	0.26
768	0.24
769	0.23
770	0.23
771	0.18
772	0.17
773	0.16
774	0.15
775	0.15
776	0.16
777	0.17
778	0.19
779	0.2
780	0.27
781	0.29
782	0.29
783	0.3
784	0.34
785	0.37
786	0.38
787	0.37
788	0.31
789	0.33
790	0.35
791	0.34
792	0.29
793	0.27
794	0.25
795	0.24
796	0.23
797	0.2
798	0.18
799	0.17
800	0.18
801	0.13
802	0.12
803	0.12
804	0.12
805	0.12
806	0.1
807	0.1
808	0.09
809	0.09
810	0.09
811	0.12
812	0.13
813	0.17
814	0.26
815	0.34
816	0.43
817	0.52
818	0.61
819	0.66
820	0.75
821	0.81
822	0.79
823	0.79
824	0.81
825	0.82
826	0.83
827	0.83
828	0.77
829	0.78
830	0.73
831	0.67
832	0.62
833	0.54
834	0.47
835	0.43
836	0.41
837	0.34
838	0.4
839	0.41
840	0.39
841	0.45
842	0.49
843	0.5
844	0.56
845	0.57
846	0.56
847	0.6
848	0.62
849	0.56
850	0.53
851	0.5
852	0.42
853	0.38
854	0.29
855	0.23
856	0.17
857	0.14

A0A1M2VH18

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer