FuNGI

G8YF94

Protein Details

Accession

G8YF94

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
69-89	GKNFTRPVRLHRKDPRNIQFH	Hydrophilic
130-158	PDGGARRSKKSLFKRKTRQVNLMDPKKRK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
134-158	ARRSKKSLFKRKTRQVNLMDPKKRK

Subcellular Location(s)

nucl 27

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSSSPVKKETNIKKEDSDNILLDNSAYKNERNTSQDGWQEIPLKCTGDDIQDIRCHIMKFHSKQDVDIGKNFTRPVRLHRKDPRNIQFHLTREEIDRRKKEENEAKVDKEQKSENEESNPNEPDMSQVAPDGGARRSKKSLFKRKTRQVNLMDPKKRKLRYEEYYPWVMEDYDGQNVFVGNYEAGLSDTQHVLFVFDKDGFRMVPAEKVYKFTPRNKYATLTLEEAEAKMEKNSSVPRWLMKHMEESNGQDATPDQRFRRPASNGNVSVPSAAEKRRLRMVSGGANPNDRDSDHDEIDFDEEFADDEEAPIIDGDEEENKLSEQKIKKEMLKAAHFDGQSDAEGDDDDINDLFEVEKSRKVDKEGRKLRKFLNKTEGGVYDSDDDDNLNPYLSKSDLESNDESDDEITVKQEDNDALLKDGSDAKSGRRNIFVNDVGNGFVVIKAPLEFLKSFPPGDWNPNTPKRAFSTETESNKKAKRDDDSSVKLKLSLKNNGSSSNGNTPTPSETGAYDLNSAGPGNMLVTVNEVLDIVKNKPLTTKELLFNLKSRVNSHKDNKQRIINIVKQNLKLADGKLVLKEQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.67
3	0.63
4	0.57
5	0.48
6	0.43
7	0.39
8	0.34
9	0.28
10	0.25
11	0.19
12	0.18
13	0.2
14	0.2
15	0.25
16	0.29
17	0.35
18	0.36
19	0.4
20	0.39
21	0.44
22	0.47
23	0.45
24	0.43
25	0.42
26	0.45
27	0.4
28	0.39
29	0.35
30	0.31
31	0.28
32	0.28
33	0.25
34	0.22
35	0.26
36	0.25
37	0.28
38	0.29
39	0.31
40	0.31
41	0.33
42	0.29
43	0.25
44	0.32
45	0.37
46	0.39
47	0.47
48	0.53
49	0.5
50	0.51
51	0.58
52	0.57
53	0.51
54	0.52
55	0.49
56	0.42
57	0.45
58	0.46
59	0.39
60	0.38
61	0.37
62	0.41
63	0.46
64	0.5
65	0.57
66	0.66
67	0.74
68	0.76
69	0.84
70	0.84
71	0.79
72	0.75
73	0.72
74	0.68
75	0.61
76	0.58
77	0.49
78	0.41
79	0.4
80	0.47
81	0.48
82	0.52
83	0.54
84	0.55
85	0.61
86	0.62
87	0.68
88	0.67
89	0.68
90	0.67
91	0.67
92	0.66
93	0.65
94	0.7
95	0.61
96	0.56
97	0.52
98	0.46
99	0.48
100	0.49
101	0.45
102	0.43
103	0.46
104	0.45
105	0.46
106	0.43
107	0.35
108	0.31
109	0.27
110	0.23
111	0.21
112	0.18
113	0.12
114	0.11
115	0.11
116	0.11
117	0.12
118	0.12
119	0.12
120	0.19
121	0.21
122	0.25
123	0.3
124	0.36
125	0.45
126	0.53
127	0.62
128	0.65
129	0.74
130	0.8
131	0.85
132	0.9
133	0.88
134	0.86
135	0.82
136	0.83
137	0.82
138	0.82
139	0.81
140	0.74
141	0.75
142	0.74
143	0.71
144	0.66
145	0.64
146	0.64
147	0.63
148	0.68
149	0.69
150	0.65
151	0.65
152	0.59
153	0.5
154	0.41
155	0.34
156	0.24
157	0.19
158	0.15
159	0.15
160	0.15
161	0.14
162	0.13
163	0.13
164	0.13
165	0.1
166	0.09
167	0.05
168	0.05
169	0.05
170	0.05
171	0.06
172	0.06
173	0.06
174	0.07
175	0.08
176	0.08
177	0.08
178	0.08
179	0.08
180	0.09
181	0.09
182	0.09
183	0.11
184	0.11
185	0.11
186	0.12
187	0.1
188	0.1
189	0.12
190	0.11
191	0.13
192	0.15
193	0.19
194	0.18
195	0.22
196	0.23
197	0.29
198	0.34
199	0.39
200	0.47
201	0.48
202	0.53
203	0.52
204	0.53
205	0.48
206	0.47
207	0.41
208	0.33
209	0.27
210	0.24
211	0.22
212	0.19
213	0.16
214	0.12
215	0.09
216	0.08
217	0.08
218	0.07
219	0.1
220	0.13
221	0.14
222	0.18
223	0.19
224	0.22
225	0.24
226	0.27
227	0.28
228	0.25
229	0.31
230	0.28
231	0.3
232	0.28
233	0.28
234	0.28
235	0.24
236	0.23
237	0.15
238	0.15
239	0.15
240	0.18
241	0.19
242	0.17
243	0.22
244	0.25
245	0.28
246	0.34
247	0.34
248	0.38
249	0.42
250	0.48
251	0.45
252	0.44
253	0.42
254	0.35
255	0.31
256	0.23
257	0.18
258	0.13
259	0.12
260	0.18
261	0.18
262	0.21
263	0.27
264	0.27
265	0.26
266	0.27
267	0.29
268	0.28
269	0.32
270	0.34
271	0.28
272	0.3
273	0.29
274	0.26
275	0.24
276	0.17
277	0.16
278	0.16
279	0.18
280	0.17
281	0.17
282	0.17
283	0.16
284	0.18
285	0.14
286	0.09
287	0.06
288	0.05
289	0.05
290	0.06
291	0.06
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.03
300	0.03
301	0.04
302	0.04
303	0.05
304	0.05
305	0.06
306	0.06
307	0.07
308	0.07
309	0.13
310	0.16
311	0.21
312	0.27
313	0.31
314	0.34
315	0.38
316	0.42
317	0.43
318	0.43
319	0.4
320	0.36
321	0.38
322	0.34
323	0.3
324	0.26
325	0.2
326	0.16
327	0.15
328	0.12
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.06
333	0.05
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.05
341	0.07
342	0.08
343	0.12
344	0.14
345	0.18
346	0.19
347	0.24
348	0.33
349	0.4
350	0.5
351	0.57
352	0.65
353	0.67
354	0.7
355	0.72
356	0.74
357	0.69
358	0.66
359	0.65
360	0.58
361	0.54
362	0.53
363	0.47
364	0.38
365	0.34
366	0.27
367	0.19
368	0.16
369	0.14
370	0.11
371	0.1
372	0.08
373	0.1
374	0.09
375	0.08
376	0.07
377	0.08
378	0.09
379	0.09
380	0.09
381	0.09
382	0.15
383	0.16
384	0.21
385	0.22
386	0.22
387	0.23
388	0.22
389	0.21
390	0.15
391	0.14
392	0.1
393	0.09
394	0.08
395	0.08
396	0.08
397	0.08
398	0.1
399	0.09
400	0.11
401	0.13
402	0.12
403	0.13
404	0.12
405	0.12
406	0.11
407	0.15
408	0.14
409	0.16
410	0.16
411	0.18
412	0.26
413	0.3
414	0.32
415	0.33
416	0.33
417	0.32
418	0.38
419	0.38
420	0.32
421	0.29
422	0.27
423	0.22
424	0.21
425	0.18
426	0.12
427	0.09
428	0.08
429	0.06
430	0.06
431	0.06
432	0.07
433	0.08
434	0.11
435	0.11
436	0.12
437	0.18
438	0.19
439	0.2
440	0.19
441	0.25
442	0.24
443	0.31
444	0.34
445	0.34
446	0.41
447	0.49
448	0.52
449	0.47
450	0.48
451	0.45
452	0.47
453	0.45
454	0.4
455	0.4
456	0.46
457	0.53
458	0.56
459	0.54
460	0.55
461	0.57
462	0.58
463	0.54
464	0.51
465	0.51
466	0.5
467	0.55
468	0.57
469	0.6
470	0.59
471	0.58
472	0.52
473	0.48
474	0.48
475	0.47
476	0.44
477	0.46
478	0.45
479	0.49
480	0.5
481	0.49
482	0.48
483	0.44
484	0.42
485	0.42
486	0.4
487	0.34
488	0.33
489	0.31
490	0.31
491	0.3
492	0.26
493	0.18
494	0.16
495	0.19
496	0.2
497	0.19
498	0.16
499	0.15
500	0.14
501	0.14
502	0.13
503	0.1
504	0.08
505	0.07
506	0.06
507	0.08
508	0.08
509	0.07
510	0.1
511	0.11
512	0.1
513	0.1
514	0.1
515	0.08
516	0.11
517	0.14
518	0.13
519	0.17
520	0.18
521	0.19
522	0.24
523	0.27
524	0.31
525	0.35
526	0.39
527	0.39
528	0.46
529	0.51
530	0.49
531	0.5
532	0.49
533	0.47
534	0.43
535	0.43
536	0.44
537	0.46
538	0.53
539	0.57
540	0.61
541	0.68
542	0.75
543	0.79
544	0.78
545	0.77
546	0.75
547	0.76
548	0.75
549	0.74
550	0.73
551	0.72
552	0.65
553	0.65
554	0.58
555	0.52
556	0.47
557	0.39
558	0.37
559	0.33
560	0.34

G8YF94

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer