FuNGI

A0A1M2VCD3

Protein Details

Accession

A0A1M2VCD3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
69-92	PIYAATKKKYKPVAKRTKPVLAPL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 8, cyto_nucl 8, nucl 6, pero 6, extr 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR041577 RT_RNaseH_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17919 RT_RNaseH_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

LLYLSACNPTLLGTDSLCDPSFPYENLYHYTPDLDSLRFSASAPSYYTENHNAFSIHSHTRSDSLAFIPIYAATKKKYKPVAKRTKPVLAPLPDQFRIIRDIRGDPLAGMPPLSRTPPPFVPTGRYTEERKRGIDALHSGDFLWPQERLLVHQLIAQQNAGFAWNDSERGQFREDFFPPVVIPVVEHTPWVQKNIPIPPGLFDDVCDIIRKKEAAGVYEPSNSSYRSRWFCVVKKDGKSLRLVHSLEPLNAVTIAHSGVPPFTEQLAESFAGRACGGILDLFVGYDERRLATISRDLTTFSTPFGARRLTTLPMGWTNSVPIFHDDLTYILQPEIPEFTQPFIDDVPARGPATRYELPDGGFETIPENAGIRRFVWEHLTNVNRIVQRVRYSGGTFSGTKSILCAAEYTVVGHRCTYAGRVPEPGNYDKVLNWGPCRSLSELTRKNAPFDWGPEQIAAQDDLKRALANSPALRPLDYKSAAEVILAVDTSKIAVGYLLAQCDLDKPSRRFYARFGSITLNDREAAYSQPKLELYGLFRSLKATKRLLIGIRNLVIEVDARYIRGMLNNPDEVPGASMNRWIVTILTFQFRLVHVPGIQHGPDGLSRRPPQPGDEPYEEEDEDWIDRLNGLLHLINPPTPLRVASAGTPVFTQAEADTSPLEIPRSDAAELEDARLRDVYRYLTTLLPPATLATDKERQAFTRQVLRFYTRGTQLFRRSADGHNLLVLWPEQRLSILRQAHDDVGHKGVYATTALLAERFWWPHLQADVVWYVRSCHLCQVRQLRHVIAPPITSFPAPPGVRWHVDTMHMPGPFKYYLHARCALTSFVEGRAVRRETGKVIGEWIFQDILCRWGAACELISDNGTPFVAALEYLRKKYGIVHIRISGYNSRANGVVEHPHYDMRQSLFKAADGVQEKWHQHVHHIQWADRITIRRRLGCSPFFAATGSHPLLPFDIIEATYLAPPPEAMPSTTELIASRARALARRAEDVDRLRTRVYEARAHAARQLELKHPRSIRDFNFARGDLVLMRNKAIESALNRKMRPRYLGPYVILARNCSTAYIVCELNGAVLDRPIAAFRLVPYLARRTIDLAWLDDDAYLDVSTARLREMEASRSQGDDDDDADSEGSLDEEDLERDAPAR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.16
3	0.19
4	0.19
5	0.17
6	0.15
7	0.19
8	0.22
9	0.21
10	0.24
11	0.23
12	0.26
13	0.3
14	0.31
15	0.28
16	0.26
17	0.28
18	0.23
19	0.25
20	0.25
21	0.21
22	0.2
23	0.2
24	0.22
25	0.2
26	0.2
27	0.21
28	0.21
29	0.22
30	0.22
31	0.23
32	0.22
33	0.24
34	0.29
35	0.31
36	0.3
37	0.29
38	0.29
39	0.27
40	0.26
41	0.28
42	0.28
43	0.26
44	0.27
45	0.28
46	0.28
47	0.3
48	0.31
49	0.29
50	0.26
51	0.21
52	0.24
53	0.21
54	0.2
55	0.18
56	0.18
57	0.19
58	0.2
59	0.21
60	0.2
61	0.29
62	0.32
63	0.4
64	0.49
65	0.55
66	0.64
67	0.72
68	0.79
69	0.81
70	0.88
71	0.88
72	0.87
73	0.8
74	0.77
75	0.75
76	0.69
77	0.64
78	0.61
79	0.61
80	0.52
81	0.51
82	0.44
83	0.36
84	0.36
85	0.33
86	0.3
87	0.27
88	0.29
89	0.3
90	0.32
91	0.3
92	0.25
93	0.26
94	0.25
95	0.21
96	0.18
97	0.15
98	0.16
99	0.18
100	0.21
101	0.21
102	0.22
103	0.28
104	0.33
105	0.35
106	0.37
107	0.37
108	0.4
109	0.41
110	0.43
111	0.42
112	0.41
113	0.45
114	0.51
115	0.58
116	0.56
117	0.54
118	0.52
119	0.5
120	0.47
121	0.47
122	0.42
123	0.39
124	0.35
125	0.34
126	0.3
127	0.28
128	0.27
129	0.22
130	0.19
131	0.13
132	0.11
133	0.15
134	0.15
135	0.17
136	0.22
137	0.22
138	0.2
139	0.23
140	0.28
141	0.27
142	0.28
143	0.25
144	0.19
145	0.18
146	0.18
147	0.17
148	0.11
149	0.09
150	0.11
151	0.12
152	0.13
153	0.14
154	0.19
155	0.2
156	0.22
157	0.25
158	0.24
159	0.26
160	0.31
161	0.32
162	0.32
163	0.31
164	0.29
165	0.26
166	0.25
167	0.22
168	0.15
169	0.14
170	0.12
171	0.15
172	0.14
173	0.14
174	0.14
175	0.21
176	0.22
177	0.26
178	0.26
179	0.25
180	0.32
181	0.37
182	0.39
183	0.34
184	0.33
185	0.31
186	0.34
187	0.33
188	0.26
189	0.21
190	0.21
191	0.2
192	0.2
193	0.22
194	0.18
195	0.17
196	0.21
197	0.2
198	0.17
199	0.2
200	0.21
201	0.21
202	0.24
203	0.26
204	0.24
205	0.28
206	0.28
207	0.26
208	0.26
209	0.24
210	0.23
211	0.23
212	0.29
213	0.3
214	0.34
215	0.38
216	0.43
217	0.47
218	0.55
219	0.6
220	0.61
221	0.6
222	0.66
223	0.65
224	0.62
225	0.62
226	0.58
227	0.54
228	0.54
229	0.51
230	0.43
231	0.45
232	0.43
233	0.37
234	0.34
235	0.28
236	0.2
237	0.19
238	0.17
239	0.1
240	0.09
241	0.09
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.08
252	0.09
253	0.12
254	0.11
255	0.11
256	0.11
257	0.11
258	0.11
259	0.11
260	0.1
261	0.07
262	0.07
263	0.07
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.04
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.06
273	0.07
274	0.07
275	0.07
276	0.09
277	0.09
278	0.12
279	0.18
280	0.19
281	0.19
282	0.19
283	0.2
284	0.21
285	0.24
286	0.21
287	0.15
288	0.17
289	0.16
290	0.17
291	0.18
292	0.19
293	0.16
294	0.18
295	0.2
296	0.19
297	0.2
298	0.2
299	0.2
300	0.21
301	0.23
302	0.21
303	0.19
304	0.18
305	0.18
306	0.17
307	0.16
308	0.15
309	0.15
310	0.14
311	0.15
312	0.13
313	0.13
314	0.14
315	0.14
316	0.11
317	0.09
318	0.1
319	0.1
320	0.1
321	0.12
322	0.1
323	0.12
324	0.11
325	0.12
326	0.12
327	0.13
328	0.13
329	0.1
330	0.12
331	0.11
332	0.11
333	0.12
334	0.13
335	0.13
336	0.13
337	0.14
338	0.14
339	0.21
340	0.23
341	0.23
342	0.25
343	0.25
344	0.26
345	0.26
346	0.25
347	0.2
348	0.17
349	0.15
350	0.12
351	0.11
352	0.11
353	0.1
354	0.09
355	0.07
356	0.09
357	0.1
358	0.09
359	0.11
360	0.12
361	0.13
362	0.18
363	0.19
364	0.2
365	0.26
366	0.27
367	0.26
368	0.26
369	0.3
370	0.25
371	0.24
372	0.25
373	0.22
374	0.24
375	0.25
376	0.25
377	0.22
378	0.22
379	0.22
380	0.22
381	0.21
382	0.18
383	0.17
384	0.19
385	0.17
386	0.15
387	0.14
388	0.14
389	0.12
390	0.11
391	0.1
392	0.08
393	0.1
394	0.1
395	0.11
396	0.13
397	0.14
398	0.14
399	0.14
400	0.13
401	0.12
402	0.12
403	0.13
404	0.13
405	0.15
406	0.16
407	0.19
408	0.2
409	0.23
410	0.27
411	0.26
412	0.24
413	0.22
414	0.22
415	0.18
416	0.21
417	0.21
418	0.19
419	0.19
420	0.18
421	0.19
422	0.19
423	0.21
424	0.2
425	0.2
426	0.22
427	0.3
428	0.35
429	0.36
430	0.43
431	0.41
432	0.41
433	0.39
434	0.38
435	0.29
436	0.27
437	0.3
438	0.24
439	0.24
440	0.22
441	0.21
442	0.18
443	0.17
444	0.14
445	0.1
446	0.11
447	0.11
448	0.11
449	0.11
450	0.11
451	0.1
452	0.11
453	0.12
454	0.14
455	0.15
456	0.16
457	0.19
458	0.19
459	0.19
460	0.19
461	0.18
462	0.2
463	0.2
464	0.19
465	0.16
466	0.17
467	0.16
468	0.15
469	0.13
470	0.07
471	0.06
472	0.06
473	0.05
474	0.04
475	0.03
476	0.04
477	0.03
478	0.03
479	0.03
480	0.03
481	0.03
482	0.06
483	0.07
484	0.07
485	0.07
486	0.07
487	0.07
488	0.09
489	0.1
490	0.12
491	0.18
492	0.2
493	0.24
494	0.3
495	0.33
496	0.32
497	0.35
498	0.4
499	0.38
500	0.37
501	0.34
502	0.31
503	0.32
504	0.34
505	0.31
506	0.23
507	0.18
508	0.17
509	0.16
510	0.13
511	0.13
512	0.12
513	0.12
514	0.11
515	0.13
516	0.13
517	0.13
518	0.13
519	0.12
520	0.13
521	0.14
522	0.17
523	0.16
524	0.16
525	0.17
526	0.2
527	0.23
528	0.25
529	0.24
530	0.23
531	0.24
532	0.27
533	0.27
534	0.27
535	0.26
536	0.23
537	0.23
538	0.21
539	0.19
540	0.15
541	0.13
542	0.1
543	0.08
544	0.07
545	0.06
546	0.06
547	0.06
548	0.07
549	0.07
550	0.08
551	0.1
552	0.11
553	0.14
554	0.14
555	0.14
556	0.15
557	0.15
558	0.13
559	0.12
560	0.09
561	0.08
562	0.07
563	0.08
564	0.08
565	0.07
566	0.08
567	0.07
568	0.06
569	0.06
570	0.08
571	0.08
572	0.09
573	0.09
574	0.09
575	0.1
576	0.1
577	0.12
578	0.11
579	0.11
580	0.1
581	0.1
582	0.12
583	0.12
584	0.12
585	0.1
586	0.09
587	0.08
588	0.1
589	0.13
590	0.12
591	0.17
592	0.2
593	0.22
594	0.25
595	0.25
596	0.26
597	0.3
598	0.33
599	0.33
600	0.33
601	0.34
602	0.33
603	0.34
604	0.31
605	0.24
606	0.2
607	0.14
608	0.11
609	0.09
610	0.07
611	0.04
612	0.04
613	0.05
614	0.05
615	0.04
616	0.05
617	0.05
618	0.06
619	0.08
620	0.08
621	0.09
622	0.09
623	0.09
624	0.09
625	0.09
626	0.09
627	0.09
628	0.1
629	0.1
630	0.1
631	0.14
632	0.13
633	0.13
634	0.13
635	0.12
636	0.11
637	0.1
638	0.1
639	0.05
640	0.06
641	0.06
642	0.07
643	0.06
644	0.06
645	0.07
646	0.07
647	0.07
648	0.06
649	0.07
650	0.08
651	0.1
652	0.09
653	0.09
654	0.1
655	0.13
656	0.13
657	0.13
658	0.14
659	0.13
660	0.13
661	0.13
662	0.12
663	0.1
664	0.11
665	0.12
666	0.11
667	0.12
668	0.14
669	0.14
670	0.15
671	0.17
672	0.15
673	0.13
674	0.12
675	0.11
676	0.1
677	0.09
678	0.1
679	0.12
680	0.17
681	0.18
682	0.21
683	0.22
684	0.22
685	0.26
686	0.29
687	0.27
688	0.32
689	0.31
690	0.32
691	0.34
692	0.35
693	0.32
694	0.3
695	0.32
696	0.27
697	0.3
698	0.3
699	0.34
700	0.37
701	0.41
702	0.4
703	0.39
704	0.37
705	0.36
706	0.39
707	0.35
708	0.29
709	0.24
710	0.23
711	0.19
712	0.18
713	0.16
714	0.09
715	0.07
716	0.07
717	0.06
718	0.07
719	0.08
720	0.1
721	0.17
722	0.2
723	0.2
724	0.22
725	0.24
726	0.25
727	0.25
728	0.24
729	0.19
730	0.18
731	0.17
732	0.15
733	0.13
734	0.12
735	0.1
736	0.09
737	0.07
738	0.05
739	0.06
740	0.06
741	0.06
742	0.06
743	0.07
744	0.08
745	0.09
746	0.1
747	0.11
748	0.11
749	0.14
750	0.15
751	0.14
752	0.12
753	0.14
754	0.15
755	0.14
756	0.14
757	0.11
758	0.12
759	0.15
760	0.17
761	0.16
762	0.2
763	0.26
764	0.28
765	0.35
766	0.43
767	0.46
768	0.48
769	0.5
770	0.45
771	0.42
772	0.43
773	0.4
774	0.31
775	0.26
776	0.22
777	0.22
778	0.21
779	0.18
780	0.15
781	0.13
782	0.2
783	0.19
784	0.19
785	0.23
786	0.26
787	0.28
788	0.3
789	0.31
790	0.23
791	0.26
792	0.27
793	0.25
794	0.25
795	0.24
796	0.23
797	0.21
798	0.23
799	0.22
800	0.2
801	0.18
802	0.21
803	0.24
804	0.28
805	0.33
806	0.3
807	0.31
808	0.33
809	0.31
810	0.24
811	0.22
812	0.18
813	0.14
814	0.19
815	0.17
816	0.18
817	0.24
818	0.24
819	0.24
820	0.25
821	0.26
822	0.23
823	0.28
824	0.28
825	0.21
826	0.23
827	0.23
828	0.22
829	0.2
830	0.19
831	0.15
832	0.12
833	0.14
834	0.11
835	0.12
836	0.11
837	0.11
838	0.09
839	0.09
840	0.1
841	0.09
842	0.09
843	0.08
844	0.09
845	0.09
846	0.1
847	0.1
848	0.09
849	0.09
850	0.09
851	0.07
852	0.06
853	0.06
854	0.05
855	0.05
856	0.06
857	0.14
858	0.17
859	0.18
860	0.19
861	0.19
862	0.19
863	0.24
864	0.32
865	0.33
866	0.34
867	0.37
868	0.4
869	0.43
870	0.43
871	0.43
872	0.38
873	0.31
874	0.31
875	0.27
876	0.24
877	0.22
878	0.22
879	0.2
880	0.18
881	0.21
882	0.19
883	0.22
884	0.22
885	0.23
886	0.23
887	0.22
888	0.23
889	0.2
890	0.24
891	0.23
892	0.25
893	0.24
894	0.24
895	0.25
896	0.23
897	0.27
898	0.25
899	0.25
900	0.25
901	0.31
902	0.31
903	0.32
904	0.36
905	0.29
906	0.31
907	0.38
908	0.38
909	0.4
910	0.42
911	0.4
912	0.41
913	0.42
914	0.39
915	0.34
916	0.35
917	0.33
918	0.4
919	0.43
920	0.43
921	0.45
922	0.5
923	0.53
924	0.51
925	0.51
926	0.46
927	0.43
928	0.38
929	0.35
930	0.28
931	0.23
932	0.26
933	0.23
934	0.2
935	0.19
936	0.19
937	0.19
938	0.18
939	0.16
940	0.1
941	0.1
942	0.08
943	0.09
944	0.09
945	0.09
946	0.1
947	0.11
948	0.1
949	0.09
950	0.09
951	0.09
952	0.12
953	0.12
954	0.12
955	0.13
956	0.16
957	0.19
958	0.19
959	0.18
960	0.15
961	0.17
962	0.18
963	0.17
964	0.16
965	0.16
966	0.17
967	0.2
968	0.23
969	0.28
970	0.29
971	0.33
972	0.35
973	0.35
974	0.41
975	0.42
976	0.49
977	0.45
978	0.44
979	0.4
980	0.37
981	0.39
982	0.39
983	0.39
984	0.37
985	0.36
986	0.42
987	0.44
988	0.44
989	0.44
990	0.4
991	0.37
992	0.34
993	0.34
994	0.34
995	0.41
996	0.44
997	0.48
998	0.48
999	0.51
1000	0.54
1001	0.59
1002	0.54
1003	0.55
1004	0.53
1005	0.51
1006	0.55
1007	0.5
1008	0.44
1009	0.35
1010	0.33
1011	0.26
1012	0.29
1013	0.29
1014	0.23
1015	0.23
1016	0.23
1017	0.22
1018	0.22
1019	0.2
1020	0.19
1021	0.19
1022	0.28
1023	0.35
1024	0.41
1025	0.42
1026	0.49
1027	0.55
1028	0.57
1029	0.58
1030	0.56
1031	0.56
1032	0.58
1033	0.63
1034	0.57
1035	0.57
1036	0.55
1037	0.53
1038	0.47
1039	0.42
1040	0.36
1041	0.32
1042	0.3
1043	0.24
1044	0.21
1045	0.17
1046	0.19
1047	0.2
1048	0.18
1049	0.16
1050	0.16
1051	0.15
1052	0.14
1053	0.14
1054	0.11
1055	0.09
1056	0.09
1057	0.1
1058	0.09
1059	0.1
1060	0.1
1061	0.1
1062	0.1
1063	0.11
1064	0.11
1065	0.17
1066	0.17
1067	0.19
1068	0.23
1069	0.28
1070	0.31
1071	0.31
1072	0.31
1073	0.29
1074	0.3
1075	0.33
1076	0.3
1077	0.26
1078	0.24
1079	0.24
1080	0.23
1081	0.19
1082	0.18
1083	0.13
1084	0.12
1085	0.1
1086	0.08
1087	0.08
1088	0.08
1089	0.1
1090	0.1
1091	0.1
1092	0.09
1093	0.1
1094	0.17
1095	0.2
1096	0.26
1097	0.29
1098	0.33
1099	0.34
1100	0.34
1101	0.34
1102	0.29
1103	0.29
1104	0.24
1105	0.21
1106	0.18
1107	0.17
1108	0.17
1109	0.16
1110	0.14
1111	0.11
1112	0.1
1113	0.09
1114	0.06
1115	0.06
1116	0.07
1117	0.08
1118	0.09
1119	0.09
1120	0.1

A0A1M2VCD3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer