Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1M2VVB3

Protein Details
Accession A0A1M2VVB3    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
87-113VDDTLKWIKKSKKREKELAKKRQEELEBasic
266-292QPGDVGFKKPKTKKKRSTRRAVVEESDHydrophilic
668-697LDSQPLTKGKTEKKKEKKKSDKGATPQLDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-108IKKSKKREKELAKKR
273-285KKPKTKKKRSTRR
334-343RRAKLQRPKK
597-623SHKFHGKGSGKAKTEKRLKKIAEERKK
675-689KGKTEKKKEKKKSDK
774-775KR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 10.833, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MSMEESISLEETNKIRISLGLKPLTDDSTPANDKEKEAEDNYAKKREAEVKAKESKAVQDRLAKVRNRRELNAKLKGSTLGDVDADVDDTLKWIKKSKKREKELAKKRQEELEDMDKQFQDEYGEKDLAGLKVSHDFDGLEEGEARILTLKDSRVLDNEEDELQNVEMAEQEKEEKNKELKIKRRDYTGYDDEEFAPGQAGMKRAVLAKYDEFLEGSKESDFRLGSSSAVMREKKDKRDEPTSMSVNKTMLSIDYAKNIESADYLQPGDVGFKKPKTKKKRSTRRAVVEESDIAPANGEDQMQVDEKPIVPRQRNLDANFVDDDELQAALARSRRAKLQRPKKLSPEEIAAKIAAERESSLAKEVIDVDDLQEDEGGLTIDDTSEFVRAITYDPTPVKREPAEASLKRAVSQEPSRQASAGPSKAEVVDDPMEEIEAGEVVVKEEEDEEAILNAIENAIRETEAAERVAQESGEPVGTASEQTFGAGMAATLTILRQQGVLAQPNADLRERERTQLQRDVWLAEYRRIQAQRELERTAKRGGNKDQATREYENRVREQQEARQMLEAFRDYKPDVNIVYHDEFGRELTPKEAWKALSHKFHGKGSGKAKTEKRLKKIAEERKKEAMASGDTPLSMNQAFQKRQEKTGQAHFVLSVGNRGAVPQFGDFLDSQPLTKGKTEKKKEKKKSDKGATPQLDSTGFMTLPAPVLNNGSPAGSTSNGSPAPRPGFSRIASVVESDTPKESTPVPSERLRVAFGLGTKRKAAGEATDSPPPKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.23
4 0.26
5 0.28
6 0.36
7 0.37
8 0.36
9 0.38
10 0.4
11 0.4
12 0.36
13 0.3
14 0.25
15 0.29
16 0.31
17 0.3
18 0.35
19 0.33
20 0.34
21 0.37
22 0.37
23 0.34
24 0.34
25 0.4
26 0.41
27 0.48
28 0.53
29 0.55
30 0.52
31 0.48
32 0.52
33 0.53
34 0.55
35 0.56
36 0.58
37 0.6
38 0.68
39 0.68
40 0.65
41 0.58
42 0.58
43 0.57
44 0.53
45 0.5
46 0.5
47 0.55
48 0.6
49 0.66
50 0.64
51 0.65
52 0.7
53 0.74
54 0.71
55 0.71
56 0.71
57 0.73
58 0.77
59 0.77
60 0.7
61 0.61
62 0.57
63 0.54
64 0.46
65 0.38
66 0.3
67 0.21
68 0.18
69 0.17
70 0.16
71 0.13
72 0.11
73 0.09
74 0.08
75 0.07
76 0.08
77 0.11
78 0.14
79 0.15
80 0.23
81 0.33
82 0.41
83 0.53
84 0.63
85 0.7
86 0.76
87 0.85
88 0.89
89 0.9
90 0.93
91 0.93
92 0.92
93 0.88
94 0.82
95 0.79
96 0.7
97 0.64
98 0.59
99 0.57
100 0.54
101 0.49
102 0.49
103 0.42
104 0.39
105 0.35
106 0.28
107 0.24
108 0.19
109 0.21
110 0.22
111 0.22
112 0.21
113 0.22
114 0.25
115 0.21
116 0.2
117 0.16
118 0.13
119 0.19
120 0.21
121 0.19
122 0.17
123 0.16
124 0.15
125 0.18
126 0.18
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.1
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.11
137 0.12
138 0.17
139 0.19
140 0.2
141 0.21
142 0.25
143 0.25
144 0.24
145 0.25
146 0.22
147 0.2
148 0.19
149 0.17
150 0.13
151 0.13
152 0.1
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.13
159 0.16
160 0.19
161 0.22
162 0.26
163 0.28
164 0.34
165 0.43
166 0.48
167 0.54
168 0.62
169 0.69
170 0.66
171 0.7
172 0.68
173 0.64
174 0.63
175 0.59
176 0.54
177 0.46
178 0.45
179 0.38
180 0.35
181 0.3
182 0.21
183 0.15
184 0.1
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.12
190 0.13
191 0.15
192 0.16
193 0.16
194 0.18
195 0.17
196 0.17
197 0.18
198 0.17
199 0.15
200 0.14
201 0.15
202 0.12
203 0.12
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.13
208 0.13
209 0.11
210 0.13
211 0.13
212 0.12
213 0.14
214 0.14
215 0.15
216 0.2
217 0.21
218 0.2
219 0.3
220 0.36
221 0.43
222 0.51
223 0.54
224 0.55
225 0.63
226 0.64
227 0.61
228 0.62
229 0.58
230 0.52
231 0.48
232 0.42
233 0.34
234 0.3
235 0.24
236 0.17
237 0.12
238 0.12
239 0.13
240 0.12
241 0.16
242 0.16
243 0.16
244 0.16
245 0.16
246 0.13
247 0.1
248 0.12
249 0.1
250 0.11
251 0.11
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.12
256 0.12
257 0.14
258 0.17
259 0.22
260 0.31
261 0.39
262 0.5
263 0.58
264 0.67
265 0.74
266 0.81
267 0.88
268 0.89
269 0.92
270 0.93
271 0.91
272 0.87
273 0.81
274 0.72
275 0.63
276 0.55
277 0.44
278 0.35
279 0.25
280 0.18
281 0.14
282 0.11
283 0.09
284 0.07
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.09
293 0.1
294 0.13
295 0.17
296 0.22
297 0.24
298 0.28
299 0.32
300 0.38
301 0.43
302 0.42
303 0.44
304 0.38
305 0.38
306 0.35
307 0.3
308 0.23
309 0.17
310 0.15
311 0.08
312 0.08
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.08
318 0.1
319 0.12
320 0.13
321 0.19
322 0.25
323 0.35
324 0.44
325 0.53
326 0.61
327 0.68
328 0.73
329 0.75
330 0.76
331 0.69
332 0.61
333 0.57
334 0.5
335 0.43
336 0.38
337 0.29
338 0.22
339 0.19
340 0.17
341 0.11
342 0.08
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.09
349 0.08
350 0.08
351 0.09
352 0.08
353 0.08
354 0.07
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.06
359 0.05
360 0.05
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.05
376 0.06
377 0.07
378 0.07
379 0.1
380 0.11
381 0.14
382 0.17
383 0.17
384 0.19
385 0.18
386 0.2
387 0.19
388 0.23
389 0.29
390 0.27
391 0.31
392 0.33
393 0.32
394 0.31
395 0.3
396 0.26
397 0.22
398 0.26
399 0.27
400 0.29
401 0.31
402 0.3
403 0.3
404 0.29
405 0.28
406 0.28
407 0.25
408 0.19
409 0.17
410 0.18
411 0.18
412 0.18
413 0.13
414 0.11
415 0.1
416 0.09
417 0.09
418 0.09
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.04
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.05
449 0.07
450 0.08
451 0.09
452 0.08
453 0.09
454 0.1
455 0.1
456 0.09
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.06
461 0.06
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.06
466 0.05
467 0.06
468 0.05
469 0.06
470 0.06
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.04
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.05
481 0.05
482 0.06
483 0.05
484 0.06
485 0.09
486 0.12
487 0.16
488 0.14
489 0.14
490 0.15
491 0.17
492 0.19
493 0.16
494 0.14
495 0.13
496 0.22
497 0.23
498 0.24
499 0.3
500 0.34
501 0.38
502 0.45
503 0.44
504 0.4
505 0.4
506 0.39
507 0.34
508 0.34
509 0.3
510 0.26
511 0.28
512 0.25
513 0.3
514 0.3
515 0.29
516 0.3
517 0.37
518 0.4
519 0.42
520 0.44
521 0.43
522 0.45
523 0.46
524 0.46
525 0.41
526 0.38
527 0.41
528 0.44
529 0.48
530 0.5
531 0.53
532 0.53
533 0.54
534 0.55
535 0.52
536 0.49
537 0.47
538 0.48
539 0.46
540 0.45
541 0.46
542 0.42
543 0.44
544 0.45
545 0.42
546 0.47
547 0.44
548 0.41
549 0.39
550 0.38
551 0.33
552 0.32
553 0.28
554 0.22
555 0.19
556 0.22
557 0.19
558 0.22
559 0.23
560 0.22
561 0.21
562 0.2
563 0.21
564 0.23
565 0.24
566 0.22
567 0.21
568 0.18
569 0.17
570 0.17
571 0.17
572 0.13
573 0.12
574 0.13
575 0.16
576 0.17
577 0.19
578 0.21
579 0.21
580 0.24
581 0.3
582 0.34
583 0.4
584 0.42
585 0.48
586 0.48
587 0.49
588 0.53
589 0.5
590 0.51
591 0.51
592 0.55
593 0.51
594 0.56
595 0.59
596 0.6
597 0.67
598 0.68
599 0.67
600 0.68
601 0.66
602 0.69
603 0.74
604 0.75
605 0.75
606 0.75
607 0.74
608 0.72
609 0.71
610 0.61
611 0.52
612 0.46
613 0.39
614 0.33
615 0.29
616 0.22
617 0.21
618 0.21
619 0.19
620 0.17
621 0.13
622 0.12
623 0.17
624 0.24
625 0.26
626 0.33
627 0.42
628 0.42
629 0.48
630 0.54
631 0.54
632 0.52
633 0.6
634 0.6
635 0.52
636 0.5
637 0.44
638 0.37
639 0.33
640 0.27
641 0.2
642 0.13
643 0.13
644 0.11
645 0.12
646 0.12
647 0.11
648 0.13
649 0.1
650 0.11
651 0.1
652 0.13
653 0.13
654 0.14
655 0.18
656 0.17
657 0.17
658 0.19
659 0.2
660 0.2
661 0.24
662 0.31
663 0.35
664 0.46
665 0.56
666 0.64
667 0.74
668 0.83
669 0.89
670 0.93
671 0.94
672 0.94
673 0.95
674 0.95
675 0.93
676 0.91
677 0.91
678 0.84
679 0.77
680 0.67
681 0.59
682 0.49
683 0.4
684 0.32
685 0.24
686 0.18
687 0.15
688 0.14
689 0.12
690 0.12
691 0.11
692 0.11
693 0.09
694 0.13
695 0.13
696 0.15
697 0.14
698 0.14
699 0.13
700 0.13
701 0.15
702 0.12
703 0.13
704 0.12
705 0.18
706 0.21
707 0.22
708 0.23
709 0.27
710 0.31
711 0.33
712 0.36
713 0.35
714 0.39
715 0.39
716 0.43
717 0.38
718 0.36
719 0.34
720 0.31
721 0.28
722 0.26
723 0.27
724 0.23
725 0.23
726 0.22
727 0.22
728 0.22
729 0.22
730 0.24
731 0.28
732 0.32
733 0.35
734 0.38
735 0.41
736 0.45
737 0.45
738 0.41
739 0.35
740 0.31
741 0.3
742 0.29
743 0.36
744 0.36
745 0.37
746 0.36
747 0.37
748 0.36
749 0.35
750 0.33
751 0.28
752 0.3
753 0.33
754 0.36
755 0.43
756 0.45