Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1M2VPM2

Protein Details
Accession A0A1M2VPM2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
295-320EDQSGAGSKRRRKDKKETKEKDAFYABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
150-157RPKKKRKV
301-315GSKRRRKDKKETKEK
Subcellular Location(s) mito 19, mito_nucl 12.666, cyto_mito 11.666, nucl 5, cyto_nucl 4.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040447  RRM_Rrp7  
IPR040446  RRP7  
IPR024326  RRP7_C  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF17799  RRM_Rrp7  
PF12923  RRP7  
Amino Acid Sequences MGSASSPKKASRARAASTSAGSSSALPASVSGFTVLPVIYASSATHILYARAHSAPKHSDAKGKQKERAAALPEGRTLFLVNVPPDATERELTVLFKPCGTVERVVFSTGGGGAPQEEEMLEDESESEDDDAHESAAGSEDKDDEDVESRPKKKRKVAEPQAPRVVPLPSPPIRTLRRTGHTAYVVFLDSSSLARALKPPQKPYTWPVDKEALLGLEHYASLYSALRPPLDVVRAHADSWMEAFEYEQAKKKHESKYNKGEAIVDEDGFTLVTRGGAYGKTLGGGVGVASKRFHEDQSGAGSKRRRKDKKETKEKDAFYAFQIHEKKRKHIIDLKTRFQEDTAKIEKLKERRKFNPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.63
3 0.58
4 0.54
5 0.47
6 0.37
7 0.3
8 0.26
9 0.2
10 0.17
11 0.14
12 0.12
13 0.1
14 0.1
15 0.11
16 0.11
17 0.11
18 0.1
19 0.09
20 0.09
21 0.1
22 0.1
23 0.08
24 0.08
25 0.08
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.09
30 0.1
31 0.1
32 0.12
33 0.12
34 0.13
35 0.14
36 0.16
37 0.17
38 0.18
39 0.2
40 0.19
41 0.25
42 0.28
43 0.32
44 0.37
45 0.35
46 0.42
47 0.48
48 0.57
49 0.61
50 0.64
51 0.64
52 0.63
53 0.67
54 0.63
55 0.62
56 0.56
57 0.52
58 0.49
59 0.45
60 0.42
61 0.37
62 0.33
63 0.26
64 0.22
65 0.16
66 0.14
67 0.16
68 0.14
69 0.14
70 0.14
71 0.14
72 0.15
73 0.16
74 0.16
75 0.13
76 0.13
77 0.13
78 0.14
79 0.15
80 0.18
81 0.21
82 0.19
83 0.19
84 0.19
85 0.17
86 0.19
87 0.21
88 0.2
89 0.15
90 0.19
91 0.2
92 0.2
93 0.19
94 0.16
95 0.14
96 0.11
97 0.1
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.04
105 0.05
106 0.06
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.07
114 0.06
115 0.04
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.05
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.08
133 0.09
134 0.14
135 0.2
136 0.25
137 0.32
138 0.39
139 0.46
140 0.52
141 0.59
142 0.63
143 0.69
144 0.75
145 0.77
146 0.79
147 0.79
148 0.78
149 0.69
150 0.59
151 0.49
152 0.4
153 0.3
154 0.23
155 0.23
156 0.19
157 0.22
158 0.23
159 0.28
160 0.3
161 0.33
162 0.37
163 0.36
164 0.37
165 0.37
166 0.38
167 0.35
168 0.34
169 0.31
170 0.26
171 0.21
172 0.18
173 0.14
174 0.12
175 0.08
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.08
183 0.15
184 0.21
185 0.25
186 0.31
187 0.35
188 0.37
189 0.4
190 0.42
191 0.46
192 0.45
193 0.43
194 0.4
195 0.4
196 0.37
197 0.35
198 0.32
199 0.21
200 0.15
201 0.14
202 0.1
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.08
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.11
216 0.13
217 0.15
218 0.14
219 0.14
220 0.19
221 0.2
222 0.2
223 0.2
224 0.18
225 0.15
226 0.15
227 0.13
228 0.08
229 0.06
230 0.07
231 0.09
232 0.12
233 0.13
234 0.2
235 0.21
236 0.24
237 0.3
238 0.37
239 0.42
240 0.48
241 0.57
242 0.6
243 0.69
244 0.75
245 0.71
246 0.65
247 0.58
248 0.5
249 0.47
250 0.38
251 0.27
252 0.19
253 0.17
254 0.16
255 0.14
256 0.13
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.06
264 0.08
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.09
274 0.1
275 0.11
276 0.11
277 0.12
278 0.17
279 0.18
280 0.19
281 0.18
282 0.19
283 0.21
284 0.29
285 0.35
286 0.32
287 0.36
288 0.42
289 0.45
290 0.53
291 0.61
292 0.63
293 0.65
294 0.75
295 0.81
296 0.85
297 0.89
298 0.89
299 0.88
300 0.88
301 0.82
302 0.78
303 0.72
304 0.62
305 0.53
306 0.53
307 0.43
308 0.42
309 0.48
310 0.47
311 0.5
312 0.54
313 0.58
314 0.6
315 0.64
316 0.64
317 0.65
318 0.69
319 0.71
320 0.76
321 0.78
322 0.75
323 0.73
324 0.64
325 0.58
326 0.56
327 0.48
328 0.48
329 0.44
330 0.41
331 0.4
332 0.46
333 0.51
334 0.53
335 0.6
336 0.6
337 0.64