FuNGI

A0A1M2VF37

Protein Details

Accession

A0A1M2VF37

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
629-649	EACIRAKSTRKHVPTERQGTR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
225-239	RRRDDKKGKKSKDTG
247-259	TEKPKWKGKGKGP

Subcellular Location(s)

cyto 13.5, cyto_nucl 12, nucl 9.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2 PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC

Amino Acid Sequences

MSSTNSPSLSDFIAGVEKLDSMGSNWLISEQQFTIAVKQKEVWGHFDGTTVRPTQAGDTATPAETTTITAWEKKENFTLYLLTLKIVPATYAKHKRKGDTAKIWKAITQEFTSKSLLARSNLRRDFLNMRADPSQDLRSEIDRLQLTYENLLMYDVAISSTEYASVIINFLPDTLSAFILQLSAQMKLQARLTPATPSSDSSTALDTPAIEPDLMIELVLEEWERRRDDKKGKKSKDTGVAASAVSTEKPKWKGKGKGPQRPVGVCWNCGGKGHREADCPSPKSDSSKGKGAPKGQGRSNDSKPAAGAANVAVARSARIEEVPIIHGPGYEGAWSAMLRGPLAADSGTDEDIWSSAGDSAYSELTEATDSDSPPSLQTVSGSMLSCPEDDVAAAQDNVEPSPPPLERVPLLQRMRNVEDWVLNAAETSQASPPAQASAALAPTAAVAAANQVIDLYDSGATHHMSPYREDFASFTATTNKPLNAANQQQFLAKGVGEMIIPVPNAPAVDSRMTLTDVLYTPSLGFNLISVGRIDDAGCSATFADGQCIIVAEDGQTIGRIPKSRGLYLVTRERETPAANAAVDTPEELTEDEAHCRFGHIAIRSIRELVSKGFITGVKLVRSGNSKPCEACIRAKSTRKHVPTERQGTRASEFGEELHSDVW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.15
3	0.13
4	0.12
5	0.11
6	0.11
7	0.1
8	0.08
9	0.13
10	0.13
11	0.13
12	0.13
13	0.14
14	0.15
15	0.15
16	0.17
17	0.13
18	0.14
19	0.16
20	0.17
21	0.23
22	0.3
23	0.31
24	0.29
25	0.3
26	0.33
27	0.38
28	0.39
29	0.38
30	0.33
31	0.35
32	0.33
33	0.35
34	0.33
35	0.28
36	0.3
37	0.26
38	0.23
39	0.2
40	0.21
41	0.2
42	0.22
43	0.22
44	0.19
45	0.21
46	0.23
47	0.23
48	0.22
49	0.2
50	0.16
51	0.14
52	0.15
53	0.12
54	0.14
55	0.16
56	0.19
57	0.21
58	0.28
59	0.3
60	0.31
61	0.37
62	0.35
63	0.34
64	0.32
65	0.33
66	0.26
67	0.28
68	0.25
69	0.2
70	0.17
71	0.16
72	0.15
73	0.14
74	0.13
75	0.11
76	0.15
77	0.25
78	0.36
79	0.43
80	0.5
81	0.55
82	0.59
83	0.66
84	0.72
85	0.72
86	0.73
87	0.77
88	0.76
89	0.77
90	0.73
91	0.66
92	0.59
93	0.52
94	0.46
95	0.39
96	0.35
97	0.32
98	0.35
99	0.34
100	0.31
101	0.28
102	0.29
103	0.29
104	0.26
105	0.33
106	0.38
107	0.47
108	0.49
109	0.5
110	0.45
111	0.46
112	0.48
113	0.45
114	0.47
115	0.38
116	0.39
117	0.4
118	0.4
119	0.37
120	0.35
121	0.33
122	0.23
123	0.25
124	0.23
125	0.23
126	0.26
127	0.24
128	0.26
129	0.23
130	0.23
131	0.23
132	0.24
133	0.23
134	0.21
135	0.21
136	0.15
137	0.14
138	0.13
139	0.1
140	0.07
141	0.07
142	0.05
143	0.05
144	0.05
145	0.05
146	0.06
147	0.06
148	0.06
149	0.06
150	0.06
151	0.06
152	0.06
153	0.07
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.06
158	0.06
159	0.05
160	0.07
161	0.08
162	0.08
163	0.08
164	0.08
165	0.08
166	0.08
167	0.08
168	0.09
169	0.09
170	0.09
171	0.09
172	0.13
173	0.15
174	0.16
175	0.19
176	0.18
177	0.19
178	0.2
179	0.2
180	0.2
181	0.2
182	0.22
183	0.21
184	0.21
185	0.23
186	0.22
187	0.22
188	0.19
189	0.21
190	0.17
191	0.16
192	0.15
193	0.11
194	0.1
195	0.1
196	0.1
197	0.08
198	0.07
199	0.07
200	0.08
201	0.08
202	0.07
203	0.05
204	0.05
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.04
209	0.06
210	0.1
211	0.12
212	0.14
213	0.18
214	0.26
215	0.37
216	0.47
217	0.56
218	0.64
219	0.7
220	0.76
221	0.8
222	0.79
223	0.78
224	0.71
225	0.61
226	0.52
227	0.46
228	0.37
229	0.3
230	0.23
231	0.14
232	0.1
233	0.1
234	0.1
235	0.15
236	0.21
237	0.26
238	0.31
239	0.4
240	0.48
241	0.56
242	0.65
243	0.69
244	0.73
245	0.74
246	0.74
247	0.7
248	0.62
249	0.56
250	0.56
251	0.47
252	0.38
253	0.34
254	0.29
255	0.25
256	0.26
257	0.26
258	0.19
259	0.24
260	0.27
261	0.27
262	0.28
263	0.3
264	0.36
265	0.42
266	0.4
267	0.34
268	0.34
269	0.32
270	0.34
271	0.39
272	0.38
273	0.34
274	0.39
275	0.41
276	0.45
277	0.49
278	0.47
279	0.47
280	0.47
281	0.48
282	0.45
283	0.48
284	0.47
285	0.5
286	0.5
287	0.5
288	0.43
289	0.39
290	0.35
291	0.3
292	0.24
293	0.17
294	0.15
295	0.07
296	0.09
297	0.09
298	0.09
299	0.07
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.07
304	0.04
305	0.05
306	0.05
307	0.06
308	0.07
309	0.08
310	0.08
311	0.08
312	0.08
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.06
317	0.05
318	0.05
319	0.04
320	0.05
321	0.05
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.05
329	0.06
330	0.05
331	0.03
332	0.05
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.05
338	0.05
339	0.06
340	0.05
341	0.04
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.06
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.04
351	0.04
352	0.05
353	0.05
354	0.06
355	0.07
356	0.08
357	0.09
358	0.09
359	0.09
360	0.09
361	0.1
362	0.08
363	0.07
364	0.07
365	0.08
366	0.08
367	0.1
368	0.1
369	0.09
370	0.1
371	0.11
372	0.1
373	0.09
374	0.08
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.06
387	0.06
388	0.1
389	0.1
390	0.12
391	0.12
392	0.14
393	0.14
394	0.19
395	0.23
396	0.28
397	0.31
398	0.31
399	0.33
400	0.36
401	0.39
402	0.36
403	0.33
404	0.25
405	0.24
406	0.22
407	0.21
408	0.16
409	0.12
410	0.1
411	0.08
412	0.08
413	0.07
414	0.07
415	0.06
416	0.08
417	0.08
418	0.09
419	0.09
420	0.09
421	0.09
422	0.08
423	0.08
424	0.08
425	0.08
426	0.08
427	0.07
428	0.06
429	0.06
430	0.06
431	0.04
432	0.03
433	0.02
434	0.03
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.04
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.06
446	0.08
447	0.09
448	0.09
449	0.11
450	0.13
451	0.14
452	0.16
453	0.19
454	0.22
455	0.21
456	0.21
457	0.2
458	0.18
459	0.22
460	0.2
461	0.17
462	0.2
463	0.21
464	0.24
465	0.25
466	0.24
467	0.21
468	0.22
469	0.25
470	0.26
471	0.34
472	0.34
473	0.34
474	0.34
475	0.33
476	0.32
477	0.3
478	0.24
479	0.15
480	0.11
481	0.09
482	0.09
483	0.08
484	0.08
485	0.07
486	0.07
487	0.07
488	0.07
489	0.07
490	0.07
491	0.07
492	0.08
493	0.09
494	0.1
495	0.11
496	0.12
497	0.13
498	0.13
499	0.15
500	0.14
501	0.12
502	0.13
503	0.12
504	0.13
505	0.13
506	0.12
507	0.11
508	0.12
509	0.12
510	0.09
511	0.08
512	0.06
513	0.09
514	0.08
515	0.09
516	0.08
517	0.09
518	0.09
519	0.09
520	0.09
521	0.07
522	0.08
523	0.09
524	0.08
525	0.08
526	0.08
527	0.08
528	0.09
529	0.09
530	0.1
531	0.09
532	0.1
533	0.09
534	0.09
535	0.09
536	0.08
537	0.08
538	0.06
539	0.06
540	0.06
541	0.06
542	0.06
543	0.07
544	0.09
545	0.13
546	0.15
547	0.17
548	0.24
549	0.28
550	0.3
551	0.32
552	0.34
553	0.35
554	0.4
555	0.47
556	0.45
557	0.42
558	0.42
559	0.42
560	0.4
561	0.36
562	0.3
563	0.25
564	0.23
565	0.21
566	0.2
567	0.19
568	0.17
569	0.15
570	0.14
571	0.11
572	0.09
573	0.1
574	0.09
575	0.1
576	0.12
577	0.13
578	0.17
579	0.17
580	0.18
581	0.17
582	0.19
583	0.17
584	0.17
585	0.23
586	0.21
587	0.28
588	0.31
589	0.35
590	0.35
591	0.35
592	0.34
593	0.3
594	0.29
595	0.24
596	0.24
597	0.21
598	0.2
599	0.21
600	0.21
601	0.22
602	0.26
603	0.28
604	0.24
605	0.26
606	0.26
607	0.27
608	0.32
609	0.35
610	0.38
611	0.38
612	0.41
613	0.4
614	0.44
615	0.48
616	0.46
617	0.49
618	0.47
619	0.51
620	0.57
621	0.65
622	0.67
623	0.7
624	0.76
625	0.73
626	0.76
627	0.77
628	0.79
629	0.81
630	0.84
631	0.8
632	0.75
633	0.73
634	0.68
635	0.61
636	0.53
637	0.45
638	0.36
639	0.31
640	0.27
641	0.27
642	0.23

A0A1M2VF37

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer