FuNGI

A0A1M2V7Y8

Protein Details

Accession

A0A1M2V7Y8

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-29	ASLFHPKPSRPTLPKKDSPSTNTP	Hydrophilic
174-200	EAGEEKGKGKDKKKRFVKKTRQVFLVP	Basic
600-619	APGSVPRPKKRKAQLLPGAE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
179-193	KGKGKDKKKRFVKKT
582-587	KALKRK
599-611	GAPGSVPRPKKRK

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MAKGTASLFHPKPSRPTLPKKDSPSTNTPSPGPSQSTPGTPKKAATPATRTPQQQARRPVAPLPKPKAADDDKKQAPPEGPYAEFRLMSSKLNGWKYDVMKFESRKRIDINTWAAPVKLNRKEPRREDAPDAASQQAVSAMVGSDGKLVIGADGKVVMVDAAGRPVRAPVDADEAGEEKGKGKDKKKRFVKKTRQVFLVPEETRQLRREERHPWVMEDAKHEETWVGKMEEVAKSQTYAMFMPAADDVFKFVTAHRWYKFQKKPHYHIPNLEEAESLMTKMQKHKDTHWTLRQRTEQTSGGSSLVHSASTSLGPGGRKLRTVDNGPSELFGDDDEDGGDSKRKTKRELGAEGDLDELDFEDTFADDEEKMDLDDKEDDETKELEERLKKEYKNANKLREGHIDESDEEEEEAQLTGAGKNLQKTLKKLDKDGAYDDSDDEKNPYASEEEEEEEEVPFAPTGPAIQPVEPKPNARSASQTSPVVQAGKPTANGQPPSTPKTTEPLPQSISRPTSPAPAPGHGGHSVVARRATSPKMPKLKTAIPSRAGSPLASPNGASPPASRATSPTAGSPPPAPSAAGGAKALKRKATDDGSAGAAGGAPGSVPRPKKRKAQLLPGAELEDRMVIDWLRATPGATTRECILHFTPYLTDEEKKNKFTALVKEVAQLSKGVLVLRPAYRGAAASPAAG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.6
3	0.7
4	0.74
5	0.78
6	0.83
7	0.84
8	0.85
9	0.82
10	0.8
11	0.79
12	0.75
13	0.72
14	0.67
15	0.6
16	0.54
17	0.51
18	0.48
19	0.45
20	0.39
21	0.38
22	0.37
23	0.42
24	0.46
25	0.5
26	0.51
27	0.47
28	0.48
29	0.48
30	0.53
31	0.53
32	0.53
33	0.53
34	0.55
35	0.62
36	0.66
37	0.62
38	0.62
39	0.64
40	0.66
41	0.66
42	0.67
43	0.66
44	0.63
45	0.64
46	0.64
47	0.65
48	0.65
49	0.67
50	0.65
51	0.65
52	0.63
53	0.62
54	0.63
55	0.61
56	0.62
57	0.59
58	0.62
59	0.61
60	0.63
61	0.63
62	0.59
63	0.53
64	0.47
65	0.47
66	0.41
67	0.37
68	0.35
69	0.39
70	0.37
71	0.34
72	0.3
73	0.28
74	0.25
75	0.25
76	0.25
77	0.25
78	0.3
79	0.35
80	0.35
81	0.34
82	0.39
83	0.4
84	0.43
85	0.41
86	0.39
87	0.43
88	0.47
89	0.52
90	0.56
91	0.55
92	0.54
93	0.54
94	0.55
95	0.52
96	0.55
97	0.52
98	0.47
99	0.47
100	0.43
101	0.4
102	0.36
103	0.37
104	0.39
105	0.4
106	0.45
107	0.5
108	0.58
109	0.68
110	0.71
111	0.74
112	0.72
113	0.7
114	0.67
115	0.66
116	0.61
117	0.55
118	0.51
119	0.43
120	0.36
121	0.3
122	0.24
123	0.16
124	0.12
125	0.08
126	0.06
127	0.05
128	0.06
129	0.06
130	0.06
131	0.06
132	0.06
133	0.06
134	0.06
135	0.06
136	0.05
137	0.07
138	0.07
139	0.06
140	0.06
141	0.06
142	0.06
143	0.06
144	0.05
145	0.03
146	0.04
147	0.04
148	0.09
149	0.09
150	0.1
151	0.1
152	0.11
153	0.12
154	0.12
155	0.13
156	0.11
157	0.17
158	0.17
159	0.17
160	0.17
161	0.18
162	0.17
163	0.17
164	0.15
165	0.1
166	0.15
167	0.22
168	0.28
169	0.36
170	0.46
171	0.54
172	0.65
173	0.74
174	0.81
175	0.84
176	0.88
177	0.91
178	0.91
179	0.92
180	0.89
181	0.83
182	0.74
183	0.67
184	0.61
185	0.59
186	0.49
187	0.4
188	0.37
189	0.34
190	0.35
191	0.34
192	0.33
193	0.3
194	0.35
195	0.4
196	0.44
197	0.49
198	0.54
199	0.54
200	0.51
201	0.49
202	0.49
203	0.44
204	0.41
205	0.38
206	0.31
207	0.3
208	0.28
209	0.23
210	0.19
211	0.19
212	0.17
213	0.13
214	0.11
215	0.12
216	0.15
217	0.17
218	0.17
219	0.17
220	0.14
221	0.14
222	0.15
223	0.15
224	0.13
225	0.11
226	0.11
227	0.1
228	0.09
229	0.09
230	0.09
231	0.08
232	0.07
233	0.07
234	0.07
235	0.07
236	0.08
237	0.07
238	0.07
239	0.15
240	0.19
241	0.24
242	0.24
243	0.31
244	0.34
245	0.45
246	0.51
247	0.52
248	0.59
249	0.63
250	0.68
251	0.72
252	0.78
253	0.71
254	0.71
255	0.66
256	0.63
257	0.55
258	0.49
259	0.37
260	0.28
261	0.26
262	0.19
263	0.15
264	0.09
265	0.09
266	0.11
267	0.16
268	0.22
269	0.27
270	0.3
271	0.35
272	0.44
273	0.5
274	0.57
275	0.61
276	0.64
277	0.61
278	0.65
279	0.67
280	0.6
281	0.55
282	0.51
283	0.45
284	0.37
285	0.35
286	0.29
287	0.23
288	0.19
289	0.16
290	0.13
291	0.11
292	0.09
293	0.07
294	0.06
295	0.07
296	0.07
297	0.07
298	0.05
299	0.07
300	0.07
301	0.1
302	0.14
303	0.14
304	0.15
305	0.17
306	0.2
307	0.22
308	0.25
309	0.27
310	0.26
311	0.27
312	0.26
313	0.24
314	0.21
315	0.18
316	0.14
317	0.1
318	0.08
319	0.06
320	0.06
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.06
325	0.08
326	0.07
327	0.14
328	0.19
329	0.21
330	0.25
331	0.32
332	0.38
333	0.43
334	0.47
335	0.45
336	0.44
337	0.43
338	0.39
339	0.32
340	0.25
341	0.18
342	0.12
343	0.08
344	0.04
345	0.04
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.03
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.07
358	0.06
359	0.07
360	0.08
361	0.08
362	0.1
363	0.11
364	0.11
365	0.11
366	0.12
367	0.11
368	0.12
369	0.12
370	0.15
371	0.17
372	0.19
373	0.23
374	0.29
375	0.29
376	0.34
377	0.43
378	0.48
379	0.55
380	0.61
381	0.62
382	0.62
383	0.65
384	0.62
385	0.61
386	0.55
387	0.47
388	0.42
389	0.36
390	0.3
391	0.3
392	0.25
393	0.18
394	0.13
395	0.11
396	0.09
397	0.08
398	0.07
399	0.04
400	0.04
401	0.05
402	0.05
403	0.06
404	0.09
405	0.1
406	0.11
407	0.15
408	0.19
409	0.21
410	0.24
411	0.33
412	0.38
413	0.38
414	0.4
415	0.42
416	0.42
417	0.42
418	0.42
419	0.36
420	0.3
421	0.29
422	0.27
423	0.24
424	0.2
425	0.18
426	0.17
427	0.14
428	0.13
429	0.12
430	0.12
431	0.1
432	0.1
433	0.11
434	0.11
435	0.11
436	0.12
437	0.12
438	0.12
439	0.11
440	0.1
441	0.09
442	0.08
443	0.06
444	0.06
445	0.05
446	0.05
447	0.06
448	0.06
449	0.1
450	0.11
451	0.12
452	0.16
453	0.19
454	0.27
455	0.27
456	0.29
457	0.27
458	0.33
459	0.34
460	0.31
461	0.34
462	0.32
463	0.37
464	0.39
465	0.38
466	0.32
467	0.32
468	0.33
469	0.29
470	0.24
471	0.2
472	0.19
473	0.19
474	0.19
475	0.18
476	0.22
477	0.25
478	0.27
479	0.26
480	0.29
481	0.32
482	0.37
483	0.36
484	0.34
485	0.3
486	0.32
487	0.33
488	0.33
489	0.33
490	0.33
491	0.34
492	0.35
493	0.37
494	0.39
495	0.4
496	0.35
497	0.33
498	0.29
499	0.32
500	0.29
501	0.34
502	0.31
503	0.28
504	0.31
505	0.3
506	0.32
507	0.27
508	0.27
509	0.2
510	0.21
511	0.2
512	0.19
513	0.2
514	0.17
515	0.18
516	0.21
517	0.24
518	0.29
519	0.36
520	0.42
521	0.5
522	0.52
523	0.54
524	0.58
525	0.61
526	0.61
527	0.61
528	0.6
529	0.55
530	0.55
531	0.51
532	0.49
533	0.43
534	0.35
535	0.28
536	0.27
537	0.25
538	0.23
539	0.22
540	0.19
541	0.22
542	0.22
543	0.2
544	0.15
545	0.16
546	0.19
547	0.2
548	0.19
549	0.19
550	0.24
551	0.27
552	0.27
553	0.26
554	0.26
555	0.26
556	0.28
557	0.27
558	0.24
559	0.22
560	0.22
561	0.19
562	0.16
563	0.2
564	0.2
565	0.19
566	0.17
567	0.19
568	0.23
569	0.29
570	0.31
571	0.29
572	0.3
573	0.31
574	0.37
575	0.38
576	0.37
577	0.33
578	0.33
579	0.31
580	0.29
581	0.26
582	0.19
583	0.14
584	0.1
585	0.08
586	0.05
587	0.03
588	0.04
589	0.07
590	0.12
591	0.19
592	0.28
593	0.37
594	0.44
595	0.54
596	0.63
597	0.72
598	0.75
599	0.8
600	0.8
601	0.8
602	0.77
603	0.69
604	0.62
605	0.51
606	0.43
607	0.32
608	0.23
609	0.16
610	0.12
611	0.12
612	0.08
613	0.09
614	0.11
615	0.11
616	0.12
617	0.13
618	0.12
619	0.14
620	0.19
621	0.24
622	0.23
623	0.25
624	0.25
625	0.28
626	0.28
627	0.31
628	0.27
629	0.27
630	0.27
631	0.26
632	0.26
633	0.24
634	0.27
635	0.26
636	0.27
637	0.28
638	0.38
639	0.42
640	0.44
641	0.44
642	0.42
643	0.43
644	0.46
645	0.49
646	0.46
647	0.44
648	0.42
649	0.45
650	0.47
651	0.43
652	0.37
653	0.28
654	0.23
655	0.21
656	0.21
657	0.17
658	0.15
659	0.17
660	0.22
661	0.23
662	0.25
663	0.23
664	0.23
665	0.23
666	0.22
667	0.2
668	0.2

A0A1M2V7Y8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer