FuNGI

A0A1M2VVD1

Protein Details

Accession

A0A1M2VVD1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
238-271	ESTCYKKHPELRPQGKDKGKKKDKGKGKDTSNNH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
245-265	HPELRPQGKDKGKKKDKGKGK

Subcellular Location(s)

nucl 9, cyto 9, cyto_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2 PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MGDIKPDSVPILSSAAQYADWAAKMKGLLMFMNCWEVVSGSATQPTTDQADALKEWKKQNAQACGLLFMRTGPSFHYLLETKTEDQTDGAARAVVATLTAKQMWDALKSKFGTPNSAHVWGLFESLISESRMSDQRSLQDQMSRVVTRLREISTNGIALTEKIQALILLSKVPDSYRSMISALMATTELDNLTVDVILAKTLAEESMRKNGQAASRISQTKPKKTGPCGHCGSQTHHESTCYKKHPELRPQGKDKGKKKDKGKGKDTSNNHAHVAAPSANVLVAESAVAAAEMHASFYTAANAAGVRHTRWLMDSGASQHVTWCRADFATYQDYDTPVNFSTAAQGAGSVVQGIGEGTIKAQTFIDGVKWEITMPNVCYVPRASTRLFSTGTIERNGYSLFQGDGKMTIFDKLPKGSVVHGATVSIPGHKVLEAAYMPHSNLYELDLEIAASQTVNPAVRSYKTWHRRFGHAGKEALSKLPKNMKGVDAVDPPNSEPCEGCAYGKSHRSSFPPSEKRASEPLELVHTDLDGPMRTQSINGFLYFAGFIDDYSGLARAYYLKRKSDAPRAFDDFKAWAENQTGKKIKRVRSDRGGEYTSKEFTDHLRSLGIEHEKTMPKSPQQNGRAERWNRTIVEKAMSMLHKAGLSHGFWQLAVEAAVHIYNRQPMRRLKWHCPITVWDGTIPDVSYFRVFGCKAYVHVQKSERAGKLDKKAVEMTFVGYEPGSKGYRFWNPATRSIVVSRDVIFDEESFPARKTPGNRPVTPDDGPFPEYTGSSDDASNAEADDDLPIPLPIQIPEPQPEVHERPPSPAPPPAPPAPAPEPAPAVPERPPSPPPAVPVPRPSHQRNRHEPVGGPSIARDRPRRENVKLPGCYRNDNVYGDQPPAQVDAQSDSDLSAESFLCFLAAAQYKAGLPNSHRDAMKSPDAGKWQLAEKAEYESLLENKTWVLVPRPKDRHVVANRWVYDIKHDGRYKARLVAKGFTQVWGEDYHETFSPVARFESIRYLLAHAALEDWDIESMDVKTAFLNGDLDEEIYMEQPEGWVVRGKENHVCLLKKAIYGLKQASRQWNIKIHNSLLGMGFVRTHSDAGVYVYQRQGGDSVTIVVLYVDDLLIFGDRSKHITHVKDTLKKQYKMTDLGPVARFLGLRITRNRSTRTLDVDQTEYIQSVLERFNMADCKPARTPLPAGAEILASKQPASDSFRKRYQSLIGSLLYATLGTRPDIDFAVTRLSKYNANPNESHYNLAKYILRYLQGTKDYRLRYFGASNDGLLAYSDSDWADDRDDRHSTSGFVFLMAGGAVSWASRRQTTVSLSSTEAEYLTASDMLNF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.16
3	0.15
4	0.14
5	0.15
6	0.13
7	0.13
8	0.15
9	0.14
10	0.15
11	0.16
12	0.18
13	0.18
14	0.18
15	0.19
16	0.19
17	0.21
18	0.2
19	0.23
20	0.21
21	0.18
22	0.17
23	0.15
24	0.13
25	0.14
26	0.15
27	0.12
28	0.17
29	0.17
30	0.17
31	0.17
32	0.18
33	0.19
34	0.18
35	0.17
36	0.15
37	0.18
38	0.2
39	0.25
40	0.28
41	0.31
42	0.36
43	0.43
44	0.48
45	0.51
46	0.58
47	0.61
48	0.6
49	0.6
50	0.55
51	0.52
52	0.46
53	0.4
54	0.32
55	0.24
56	0.23
57	0.18
58	0.18
59	0.16
60	0.19
61	0.19
62	0.19
63	0.24
64	0.21
65	0.22
66	0.28
67	0.29
68	0.27
69	0.3
70	0.31
71	0.26
72	0.25
73	0.26
74	0.23
75	0.2
76	0.18
77	0.15
78	0.13
79	0.13
80	0.13
81	0.1
82	0.07
83	0.08
84	0.08
85	0.11
86	0.12
87	0.11
88	0.11
89	0.15
90	0.16
91	0.21
92	0.24
93	0.24
94	0.3
95	0.32
96	0.36
97	0.39
98	0.39
99	0.41
100	0.39
101	0.45
102	0.43
103	0.44
104	0.4
105	0.34
106	0.35
107	0.28
108	0.27
109	0.19
110	0.13
111	0.11
112	0.12
113	0.13
114	0.12
115	0.11
116	0.1
117	0.15
118	0.21
119	0.23
120	0.26
121	0.28
122	0.32
123	0.38
124	0.4
125	0.38
126	0.38
127	0.37
128	0.37
129	0.39
130	0.34
131	0.3
132	0.31
133	0.3
134	0.29
135	0.31
136	0.29
137	0.26
138	0.28
139	0.32
140	0.29
141	0.29
142	0.25
143	0.22
144	0.2
145	0.17
146	0.17
147	0.15
148	0.12
149	0.12
150	0.12
151	0.11
152	0.12
153	0.13
154	0.12
155	0.1
156	0.11
157	0.11
158	0.12
159	0.13
160	0.14
161	0.17
162	0.2
163	0.2
164	0.21
165	0.21
166	0.21
167	0.21
168	0.19
169	0.14
170	0.12
171	0.1
172	0.09
173	0.08
174	0.09
175	0.08
176	0.07
177	0.07
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.05
182	0.05
183	0.06
184	0.05
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.06
190	0.07
191	0.09
192	0.13
193	0.22
194	0.23
195	0.23
196	0.24
197	0.28
198	0.31
199	0.35
200	0.36
201	0.31
202	0.38
203	0.42
204	0.42
205	0.47
206	0.51
207	0.54
208	0.57
209	0.62
210	0.63
211	0.68
212	0.76
213	0.72
214	0.73
215	0.69
216	0.65
217	0.63
218	0.58
219	0.55
220	0.54
221	0.54
222	0.48
223	0.43
224	0.43
225	0.4
226	0.43
227	0.46
228	0.44
229	0.43
230	0.46
231	0.54
232	0.6
233	0.68
234	0.72
235	0.73
236	0.76
237	0.8
238	0.83
239	0.83
240	0.83
241	0.81
242	0.81
243	0.81
244	0.8
245	0.81
246	0.82
247	0.83
248	0.84
249	0.84
250	0.82
251	0.81
252	0.82
253	0.79
254	0.79
255	0.75
256	0.67
257	0.59
258	0.51
259	0.42
260	0.33
261	0.31
262	0.22
263	0.16
264	0.13
265	0.12
266	0.12
267	0.1
268	0.1
269	0.06
270	0.05
271	0.04
272	0.04
273	0.03
274	0.03
275	0.03
276	0.03
277	0.03
278	0.05
279	0.04
280	0.05
281	0.05
282	0.06
283	0.07
284	0.07
285	0.08
286	0.07
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.07
291	0.1
292	0.12
293	0.11
294	0.14
295	0.14
296	0.15
297	0.16
298	0.18
299	0.15
300	0.15
301	0.17
302	0.17
303	0.21
304	0.22
305	0.2
306	0.21
307	0.22
308	0.23
309	0.21
310	0.19
311	0.16
312	0.15
313	0.17
314	0.15
315	0.17
316	0.2
317	0.2
318	0.21
319	0.2
320	0.21
321	0.2
322	0.19
323	0.17
324	0.13
325	0.13
326	0.12
327	0.11
328	0.12
329	0.12
330	0.12
331	0.09
332	0.09
333	0.08
334	0.08
335	0.08
336	0.05
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.07
346	0.07
347	0.08
348	0.08
349	0.08
350	0.08
351	0.09
352	0.1
353	0.09
354	0.1
355	0.1
356	0.1
357	0.1
358	0.1
359	0.12
360	0.13
361	0.13
362	0.15
363	0.15
364	0.15
365	0.16
366	0.16
367	0.19
368	0.2
369	0.23
370	0.21
371	0.24
372	0.26
373	0.28
374	0.28
375	0.24
376	0.25
377	0.25
378	0.27
379	0.25
380	0.23
381	0.2
382	0.2
383	0.19
384	0.16
385	0.12
386	0.1
387	0.09
388	0.1
389	0.1
390	0.09
391	0.1
392	0.1
393	0.1
394	0.1
395	0.11
396	0.11
397	0.13
398	0.16
399	0.16
400	0.16
401	0.17
402	0.17
403	0.17
404	0.23
405	0.2
406	0.19
407	0.18
408	0.17
409	0.16
410	0.17
411	0.16
412	0.1
413	0.09
414	0.08
415	0.09
416	0.08
417	0.08
418	0.06
419	0.09
420	0.08
421	0.09
422	0.12
423	0.12
424	0.12
425	0.13
426	0.13
427	0.1
428	0.1
429	0.11
430	0.09
431	0.08
432	0.09
433	0.07
434	0.07
435	0.07
436	0.07
437	0.05
438	0.04
439	0.04
440	0.04
441	0.06
442	0.06
443	0.06
444	0.08
445	0.1
446	0.11
447	0.14
448	0.18
449	0.27
450	0.37
451	0.42
452	0.5
453	0.52
454	0.56
455	0.62
456	0.64
457	0.63
458	0.58
459	0.54
460	0.47
461	0.48
462	0.43
463	0.38
464	0.34
465	0.26
466	0.26
467	0.33
468	0.33
469	0.32
470	0.34
471	0.31
472	0.32
473	0.33
474	0.32
475	0.28
476	0.27
477	0.25
478	0.24
479	0.23
480	0.22
481	0.21
482	0.17
483	0.12
484	0.13
485	0.16
486	0.16
487	0.16
488	0.16
489	0.17
490	0.21
491	0.28
492	0.28
493	0.25
494	0.28
495	0.31
496	0.34
497	0.39
498	0.45
499	0.47
500	0.49
501	0.53
502	0.51
503	0.51
504	0.5
505	0.47
506	0.38
507	0.31
508	0.28
509	0.25
510	0.24
511	0.21
512	0.15
513	0.11
514	0.1
515	0.09
516	0.09
517	0.06
518	0.06
519	0.06
520	0.07
521	0.07
522	0.07
523	0.08
524	0.11
525	0.12
526	0.12
527	0.12
528	0.11
529	0.12
530	0.11
531	0.1
532	0.07
533	0.06
534	0.06
535	0.06
536	0.07
537	0.06
538	0.06
539	0.07
540	0.05
541	0.05
542	0.06
543	0.08
544	0.12
545	0.19
546	0.23
547	0.24
548	0.26
549	0.33
550	0.38
551	0.45
552	0.47
553	0.44
554	0.45
555	0.49
556	0.5
557	0.44
558	0.4
559	0.31
560	0.26
561	0.24
562	0.19
563	0.15
564	0.14
565	0.2
566	0.2
567	0.27
568	0.32
569	0.3
570	0.37
571	0.43
572	0.47
573	0.51
574	0.57
575	0.57
576	0.6
577	0.66
578	0.62
579	0.6
580	0.55
581	0.47
582	0.42
583	0.37
584	0.29
585	0.23
586	0.19
587	0.15
588	0.15
589	0.21
590	0.19
591	0.17
592	0.16
593	0.16
594	0.16
595	0.2
596	0.21
597	0.14
598	0.14
599	0.19
600	0.2
601	0.21
602	0.24
603	0.22
604	0.23
605	0.31
606	0.34
607	0.39
608	0.42
609	0.49
610	0.49
611	0.52
612	0.57
613	0.52
614	0.52
615	0.47
616	0.45
617	0.38
618	0.37
619	0.35
620	0.27
621	0.27
622	0.22
623	0.18
624	0.18
625	0.17
626	0.15
627	0.13
628	0.12
629	0.1
630	0.1
631	0.11
632	0.09
633	0.1
634	0.11
635	0.12
636	0.11
637	0.1
638	0.1
639	0.09
640	0.07
641	0.07
642	0.05
643	0.03
644	0.04
645	0.04
646	0.04
647	0.04
648	0.05
649	0.09
650	0.11
651	0.12
652	0.17
653	0.22
654	0.29
655	0.38
656	0.44
657	0.47
658	0.55
659	0.59
660	0.55
661	0.52
662	0.48
663	0.44
664	0.4
665	0.33
666	0.24
667	0.19
668	0.19
669	0.17
670	0.14
671	0.09
672	0.07
673	0.07
674	0.07
675	0.06
676	0.06
677	0.09
678	0.09
679	0.09
680	0.11
681	0.1
682	0.12
683	0.18
684	0.23
685	0.22
686	0.26
687	0.28
688	0.29
689	0.33
690	0.37
691	0.32
692	0.3
693	0.32
694	0.33
695	0.37
696	0.4
697	0.36
698	0.33
699	0.34
700	0.31
701	0.29
702	0.24
703	0.19
704	0.15
705	0.14
706	0.12
707	0.08
708	0.09
709	0.07
710	0.1
711	0.09
712	0.08
713	0.09
714	0.13
715	0.19
716	0.22
717	0.24
718	0.3
719	0.32
720	0.37
721	0.4
722	0.37
723	0.33
724	0.31
725	0.31
726	0.24
727	0.23
728	0.18
729	0.15
730	0.14
731	0.13
732	0.12
733	0.1
734	0.1
735	0.1
736	0.11
737	0.1
738	0.11
739	0.11
740	0.11
741	0.14
742	0.17
743	0.26
744	0.34
745	0.4
746	0.41
747	0.46
748	0.49
749	0.51
750	0.48
751	0.39
752	0.32
753	0.27
754	0.27
755	0.21
756	0.18
757	0.14
758	0.13
759	0.12
760	0.12
761	0.12
762	0.11
763	0.11
764	0.1
765	0.1
766	0.11
767	0.1
768	0.07
769	0.06
770	0.05
771	0.05
772	0.05
773	0.05
774	0.05
775	0.05
776	0.05
777	0.05
778	0.06
779	0.06
780	0.06
781	0.08
782	0.11
783	0.13
784	0.15
785	0.17
786	0.16
787	0.17
788	0.22
789	0.24
790	0.26
791	0.31
792	0.29
793	0.31
794	0.34
795	0.35
796	0.32
797	0.32
798	0.3
799	0.27
800	0.32
801	0.3
802	0.3
803	0.29
804	0.32
805	0.31
806	0.32
807	0.3
808	0.26
809	0.26
810	0.23
811	0.25
812	0.2
813	0.18
814	0.18
815	0.21
816	0.21
817	0.22
818	0.24
819	0.25
820	0.29
821	0.28
822	0.29
823	0.34
824	0.36
825	0.35
826	0.42
827	0.43
828	0.43
829	0.49
830	0.52
831	0.54
832	0.59
833	0.66
834	0.68
835	0.7
836	0.7
837	0.65
838	0.61
839	0.55
840	0.51
841	0.42
842	0.32
843	0.26
844	0.26
845	0.27
846	0.31
847	0.31
848	0.31
849	0.4
850	0.49
851	0.55
852	0.55
853	0.61
854	0.65
855	0.68
856	0.68
857	0.62
858	0.62
859	0.57
860	0.56
861	0.49
862	0.45
863	0.39
864	0.36
865	0.33
866	0.3
867	0.29
868	0.27
869	0.26
870	0.21
871	0.18
872	0.18
873	0.16
874	0.13
875	0.12
876	0.13
877	0.13
878	0.12
879	0.12
880	0.1
881	0.1
882	0.09
883	0.09
884	0.07
885	0.06
886	0.06
887	0.06
888	0.05
889	0.05
890	0.05
891	0.05
892	0.09
893	0.11
894	0.11
895	0.11
896	0.12
897	0.12
898	0.14
899	0.15
900	0.12
901	0.12
902	0.19
903	0.24
904	0.28
905	0.28
906	0.28
907	0.3
908	0.33
909	0.36
910	0.32
911	0.29
912	0.28
913	0.31
914	0.31
915	0.28
916	0.25
917	0.22
918	0.23
919	0.23
920	0.2
921	0.17
922	0.2
923	0.19
924	0.17
925	0.16
926	0.14
927	0.15
928	0.15
929	0.14
930	0.1
931	0.1
932	0.11
933	0.11
934	0.1
935	0.16
936	0.2
937	0.27
938	0.37
939	0.42
940	0.44
941	0.49
942	0.49
943	0.52
944	0.54
945	0.56
946	0.53
947	0.56
948	0.53
949	0.51
950	0.51
951	0.41
952	0.38
953	0.37
954	0.33
955	0.34
956	0.35
957	0.36
958	0.4
959	0.45
960	0.42
961	0.43
962	0.45
963	0.42
964	0.43
965	0.42
966	0.38
967	0.4
968	0.38
969	0.32
970	0.28
971	0.23
972	0.21
973	0.19
974	0.19
975	0.14
976	0.15
977	0.15
978	0.14
979	0.15
980	0.14
981	0.15
982	0.14
983	0.13
984	0.13
985	0.13
986	0.14
987	0.14
988	0.2
989	0.2
990	0.2
991	0.2
992	0.21
993	0.2
994	0.2
995	0.19
996	0.12
997	0.11
998	0.09
999	0.09
1000	0.07
1001	0.06
1002	0.06
1003	0.06
1004	0.06
1005	0.06
1006	0.06
1007	0.08
1008	0.08
1009	0.08
1010	0.08
1011	0.08
1012	0.09
1013	0.08
1014	0.09
1015	0.07
1016	0.09
1017	0.09
1018	0.09
1019	0.08
1020	0.08
1021	0.08
1022	0.08
1023	0.08
1024	0.06
1025	0.06
1026	0.05
1027	0.06
1028	0.06
1029	0.07
1030	0.11
1031	0.12
1032	0.18
1033	0.21
1034	0.24
1035	0.29
1036	0.31
1037	0.36
1038	0.36
1039	0.37
1040	0.32
1041	0.37
1042	0.36
1043	0.31
1044	0.32
1045	0.3
1046	0.29
1047	0.33
1048	0.37
1049	0.36
1050	0.39
1051	0.44
1052	0.49
1053	0.51
1054	0.52
1055	0.52
1056	0.54
1057	0.53
1058	0.55
1059	0.55
1060	0.47
1061	0.45
1062	0.42
1063	0.38
1064	0.3
1065	0.27
1066	0.2
1067	0.16
1068	0.15
1069	0.1
1070	0.12
1071	0.12
1072	0.11
1073	0.1
1074	0.1
1075	0.1
1076	0.13
1077	0.18
1078	0.16
1079	0.18
1080	0.19
1081	0.21
1082	0.2
1083	0.2
1084	0.18
1085	0.14
1086	0.14
1087	0.11
1088	0.12
1089	0.09
1090	0.09
1091	0.08
1092	0.07
1093	0.06
1094	0.05
1095	0.05
1096	0.04
1097	0.03
1098	0.04
1099	0.04
1100	0.05
1101	0.05
1102	0.05
1103	0.09
1104	0.1
1105	0.13
1106	0.14
1107	0.2
1108	0.26
1109	0.3
1110	0.34
1111	0.4
1112	0.48
1113	0.53
1114	0.57
1115	0.63
1116	0.66
1117	0.65
1118	0.65
1119	0.64
1120	0.61
1121	0.58
1122	0.55
1123	0.53
1124	0.46
1125	0.5
1126	0.47
1127	0.4
1128	0.34
1129	0.3
1130	0.28
1131	0.19
1132	0.25
1133	0.22
1134	0.27
1135	0.33
1136	0.39
1137	0.45
1138	0.51
1139	0.55
1140	0.51
1141	0.55
1142	0.54
1143	0.55
1144	0.53
1145	0.51
1146	0.49
1147	0.47
1148	0.43
1149	0.38
1150	0.33
1151	0.25
1152	0.19
1153	0.15
1154	0.12
1155	0.12
1156	0.12
1157	0.11
1158	0.11
1159	0.11
1160	0.15
1161	0.18
1162	0.18
1163	0.24
1164	0.24
1165	0.29
1166	0.3
1167	0.34
1168	0.33
1169	0.33
1170	0.36
1171	0.35
1172	0.41
1173	0.36
1174	0.35
1175	0.32
1176	0.3
1177	0.26
1178	0.25
1179	0.2
1180	0.13
1181	0.12
1182	0.12
1183	0.12
1184	0.15
1185	0.23
1186	0.3
1187	0.37
1188	0.44
1189	0.52
1190	0.56
1191	0.56
1192	0.56
1193	0.56
1194	0.53
1195	0.49
1196	0.46
1197	0.39
1198	0.35
1199	0.34
1200	0.3
1201	0.22
1202	0.15
1203	0.11
1204	0.09
1205	0.09
1206	0.09
1207	0.11
1208	0.11
1209	0.13
1210	0.13
1211	0.15
1212	0.14
1213	0.14
1214	0.23
1215	0.21
1216	0.22
1217	0.24
1218	0.25
1219	0.28
1220	0.31
1221	0.4
1222	0.38
1223	0.43
1224	0.44
1225	0.47
1226	0.54
1227	0.5
1228	0.51
1229	0.43
1230	0.4
1231	0.35
1232	0.38
1233	0.35
1234	0.28
1235	0.32
1236	0.31
1237	0.31
1238	0.3
1239	0.33
1240	0.36
1241	0.4
1242	0.42
1243	0.41
1244	0.46
1245	0.49
1246	0.49
1247	0.49
1248	0.44
1249	0.41
1250	0.41
1251	0.39
1252	0.38
1253	0.34
1254	0.32
1255	0.3
1256	0.27
1257	0.22
1258	0.19
1259	0.17
1260	0.11
1261	0.1
1262	0.11
1263	0.09
1264	0.1
1265	0.11
1266	0.12
1267	0.15
1268	0.17
1269	0.18
1270	0.23
1271	0.26
1272	0.27
1273	0.29
1274	0.29
1275	0.27
1276	0.25
1277	0.28
1278	0.23
1279	0.2
1280	0.18
1281	0.14
1282	0.14
1283	0.12
1284	0.1
1285	0.05
1286	0.05
1287	0.05
1288	0.05
1289	0.06
1290	0.1
1291	0.13
1292	0.14
1293	0.17
1294	0.2
1295	0.25
1296	0.3
1297	0.36
1298	0.35
1299	0.35
1300	0.35
1301	0.35
1302	0.32
1303	0.28
1304	0.23
1305	0.16
1306	0.13
1307	0.11
1308	0.11
1309	0.11

A0A1M2VVD1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer