FuNGI

A0A1M2VVW9

Protein Details

Accession

A0A1M2VVW9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
220-242	LEEWERRRDEKKSKKSKDTGVAA	Basic
245-265	VSTEKPKWKGRGKGPQRPVGV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
225-238	RRRDEKKSKKSKDT
247-259	TEKPKWKGRGKGP

Subcellular Location(s)

cyto 16.5, cyto_nucl 12.5, nucl 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50158 ZF_CCHC

Amino Acid Sequences

MSSTNSPSLSDFIAGVEKLDSKGSNWLLFEQQFTIAVKQKEVWGHFDGTSVRPAQAGDTATPAETTAIAAWEKKENFALYLLTLKIAPATYAKHKRKGDLSKVWAAIVQEFTSKSLLARSNLRRDFLNMRADPGQDLRSEIDRLQLAYENMLTYDITVSDTEYASVIINFLPDTLSAFISQLSAQMKLHARLTPATASTSSTTTETPPAIEPDLMLELVLEEWERRRDEKKSKKSKDTGVAASAVSTEKPKWKGRGKGPQRPVGVCWNCGGKGHREASCPSPKSDSSKGKGHSKPNETKPAAGAANVAVARPARIVEAPQAPGYEGAWSAVYAAASVETDDESSKDGNDAWSSAGLSGYTALTEGSDTDSDSMPGLQTVTASSVLSSAEDDHAAGPTEEDEPTPAPEPVPMTERMRNVEDWVRNALGPDDVPSPPRAAAAHTPIAAAATANQVVDLYDSGATHHMSPYREDFISFTATANKPLNAANQQQFLAKGVGEMPVSIPNAPAADSRITLTGVLYTPSLGFNLISIGRIDDAGCSATFADGQCVIVAEDGQTVGRIPKSGGLYIVTRERETAAAHAVSDSLEELTEDEAHRRFGHIAIRSIRELVSKGYITGVKLVKSGESKPCEACIRAKSSRKPVPTERQGERATEFGEELHSDVWGPARTVTIGGRKYYISFTDDKSRHSTLYLLRKKSEAFESFKAFEAWLERHHGVQIRFLNVDRGGEYLSDEFKDYLDERGIEYKLSVHDTSEEAGVSERLNRTLMEKVRAMMITSGLPPFLWGEAAMHATWLKNRTATKALDGRTPFEAVTGTPPDMRGIPVWGSKVWVHDTTDGKLGERAKCGHWVGFDAQSQGSRVYWPNRRTVTVERSLRFADPGLPLDLDSDAVELEGVDDSESGDGDVQDKPDEPSLEPLEDDAGPLPADLPATLPAEPPAAPLAAPPAAPHDAPAALPPAADLPSTTRRS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.15
3	0.14
4	0.15
5	0.15
6	0.17
7	0.17
8	0.14
9	0.23
10	0.26
11	0.27
12	0.27
13	0.29
14	0.32
15	0.33
16	0.33
17	0.27
18	0.24
19	0.23
20	0.24
21	0.26
22	0.27
23	0.27
24	0.27
25	0.27
26	0.31
27	0.36
28	0.36
29	0.37
30	0.34
31	0.36
32	0.34
33	0.36
34	0.34
35	0.29
36	0.31
37	0.27
38	0.23
39	0.21
40	0.21
41	0.19
42	0.2
43	0.21
44	0.17
45	0.18
46	0.19
47	0.18
48	0.18
49	0.17
50	0.13
51	0.11
52	0.11
53	0.08
54	0.1
55	0.11
56	0.12
57	0.14
58	0.21
59	0.22
60	0.23
61	0.26
62	0.25
63	0.25
64	0.25
65	0.24
66	0.18
67	0.21
68	0.19
69	0.16
70	0.15
71	0.14
72	0.14
73	0.13
74	0.12
75	0.11
76	0.16
77	0.25
78	0.36
79	0.44
80	0.52
81	0.55
82	0.61
83	0.68
84	0.74
85	0.74
86	0.73
87	0.73
88	0.72
89	0.69
90	0.63
91	0.55
92	0.45
93	0.38
94	0.3
95	0.23
96	0.18
97	0.17
98	0.18
99	0.18
100	0.17
101	0.14
102	0.18
103	0.21
104	0.22
105	0.31
106	0.38
107	0.48
108	0.51
109	0.52
110	0.47
111	0.48
112	0.51
113	0.47
114	0.49
115	0.39
116	0.4
117	0.41
118	0.41
119	0.38
120	0.35
121	0.31
122	0.21
123	0.23
124	0.21
125	0.21
126	0.22
127	0.2
128	0.22
129	0.21
130	0.21
131	0.21
132	0.22
133	0.19
134	0.19
135	0.19
136	0.14
137	0.13
138	0.14
139	0.11
140	0.08
141	0.09
142	0.07
143	0.08
144	0.08
145	0.08
146	0.09
147	0.09
148	0.09
149	0.09
150	0.09
151	0.08
152	0.08
153	0.08
154	0.06
155	0.07
156	0.06
157	0.06
158	0.06
159	0.05
160	0.08
161	0.09
162	0.09
163	0.09
164	0.1
165	0.1
166	0.1
167	0.1
168	0.12
169	0.12
170	0.13
171	0.12
172	0.18
173	0.21
174	0.23
175	0.26
176	0.24
177	0.25
178	0.25
179	0.27
180	0.24
181	0.22
182	0.22
183	0.19
184	0.2
185	0.19
186	0.19
187	0.17
188	0.16
189	0.16
190	0.15
191	0.18
192	0.16
193	0.16
194	0.16
195	0.18
196	0.18
197	0.17
198	0.15
199	0.14
200	0.15
201	0.13
202	0.11
203	0.08
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.05
208	0.05
209	0.07
210	0.12
211	0.14
212	0.17
213	0.22
214	0.31
215	0.42
216	0.52
217	0.61
218	0.68
219	0.76
220	0.83
221	0.85
222	0.85
223	0.83
224	0.79
225	0.72
226	0.63
227	0.55
228	0.44
229	0.37
230	0.29
231	0.2
232	0.14
233	0.12
234	0.12
235	0.17
236	0.24
237	0.29
238	0.37
239	0.45
240	0.54
241	0.62
242	0.71
243	0.75
244	0.79
245	0.81
246	0.8
247	0.76
248	0.69
249	0.62
250	0.61
251	0.53
252	0.44
253	0.38
254	0.33
255	0.29
256	0.3
257	0.3
258	0.24
259	0.28
260	0.32
261	0.33
262	0.33
263	0.35
264	0.4
265	0.47
266	0.44
267	0.39
268	0.39
269	0.38
270	0.42
271	0.49
272	0.49
273	0.45
274	0.5
275	0.53
276	0.58
277	0.63
278	0.65
279	0.65
280	0.66
281	0.7
282	0.71
283	0.77
284	0.68
285	0.63
286	0.55
287	0.5
288	0.41
289	0.32
290	0.24
291	0.14
292	0.16
293	0.15
294	0.13
295	0.09
296	0.09
297	0.09
298	0.09
299	0.09
300	0.07
301	0.07
302	0.09
303	0.12
304	0.16
305	0.17
306	0.18
307	0.18
308	0.17
309	0.17
310	0.16
311	0.11
312	0.08
313	0.07
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.04
323	0.05
324	0.04
325	0.04
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.06
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.08
335	0.08
336	0.08
337	0.08
338	0.08
339	0.08
340	0.08
341	0.07
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.05
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.05
353	0.05
354	0.06
355	0.07
356	0.07
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.06
361	0.06
362	0.06
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.07
381	0.06
382	0.05
383	0.06
384	0.07
385	0.07
386	0.06
387	0.07
388	0.07
389	0.09
390	0.1
391	0.09
392	0.08
393	0.09
394	0.11
395	0.11
396	0.13
397	0.14
398	0.17
399	0.21
400	0.23
401	0.24
402	0.25
403	0.24
404	0.24
405	0.28
406	0.26
407	0.23
408	0.24
409	0.22
410	0.2
411	0.2
412	0.17
413	0.11
414	0.1
415	0.1
416	0.1
417	0.09
418	0.11
419	0.11
420	0.11
421	0.11
422	0.12
423	0.1
424	0.1
425	0.13
426	0.16
427	0.17
428	0.16
429	0.16
430	0.15
431	0.15
432	0.12
433	0.09
434	0.06
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.04
444	0.04
445	0.04
446	0.05
447	0.06
448	0.07
449	0.07
450	0.08
451	0.1
452	0.11
453	0.12
454	0.14
455	0.16
456	0.16
457	0.16
458	0.15
459	0.14
460	0.16
461	0.14
462	0.12
463	0.15
464	0.15
465	0.19
466	0.19
467	0.17
468	0.16
469	0.16
470	0.19
471	0.16
472	0.21
473	0.19
474	0.2
475	0.21
476	0.2
477	0.2
478	0.18
479	0.15
480	0.1
481	0.08
482	0.07
483	0.08
484	0.07
485	0.07
486	0.06
487	0.08
488	0.09
489	0.08
490	0.08
491	0.07
492	0.07
493	0.08
494	0.07
495	0.07
496	0.08
497	0.08
498	0.09
499	0.09
500	0.09
501	0.08
502	0.08
503	0.07
504	0.07
505	0.07
506	0.06
507	0.06
508	0.06
509	0.06
510	0.06
511	0.05
512	0.05
513	0.04
514	0.06
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.06
519	0.06
520	0.06
521	0.06
522	0.05
523	0.05
524	0.05
525	0.05
526	0.05
527	0.05
528	0.05
529	0.06
530	0.06
531	0.06
532	0.06
533	0.06
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.05
538	0.05
539	0.04
540	0.04
541	0.04
542	0.04
543	0.04
544	0.04
545	0.05
546	0.06
547	0.06
548	0.06
549	0.1
550	0.11
551	0.12
552	0.12
553	0.12
554	0.13
555	0.15
556	0.19
557	0.16
558	0.15
559	0.15
560	0.15
561	0.15
562	0.14
563	0.14
564	0.11
565	0.1
566	0.1
567	0.1
568	0.09
569	0.08
570	0.07
571	0.06
572	0.04
573	0.04
574	0.04
575	0.04
576	0.05
577	0.06
578	0.06
579	0.08
580	0.09
581	0.11
582	0.11
583	0.12
584	0.12
585	0.13
586	0.18
587	0.19
588	0.25
589	0.27
590	0.29
591	0.29
592	0.29
593	0.27
594	0.22
595	0.2
596	0.15
597	0.15
598	0.12
599	0.12
600	0.13
601	0.14
602	0.13
603	0.18
604	0.18
605	0.15
606	0.16
607	0.16
608	0.17
609	0.18
610	0.22
611	0.24
612	0.26
613	0.28
614	0.28
615	0.31
616	0.31
617	0.3
618	0.31
619	0.28
620	0.32
621	0.38
622	0.45
623	0.48
624	0.56
625	0.61
626	0.61
627	0.63
628	0.64
629	0.67
630	0.69
631	0.7
632	0.63
633	0.64
634	0.6
635	0.56
636	0.48
637	0.39
638	0.3
639	0.23
640	0.2
641	0.12
642	0.12
643	0.1
644	0.09
645	0.08
646	0.07
647	0.06
648	0.07
649	0.09
650	0.08
651	0.09
652	0.08
653	0.09
654	0.09
655	0.1
656	0.13
657	0.17
658	0.19
659	0.19
660	0.2
661	0.2
662	0.21
663	0.22
664	0.21
665	0.18
666	0.18
667	0.21
668	0.29
669	0.3
670	0.32
671	0.36
672	0.36
673	0.32
674	0.31
675	0.32
676	0.29
677	0.39
678	0.44
679	0.41
680	0.41
681	0.42
682	0.43
683	0.42
684	0.42
685	0.37
686	0.35
687	0.35
688	0.39
689	0.39
690	0.39
691	0.36
692	0.28
693	0.24
694	0.22
695	0.19
696	0.16
697	0.21
698	0.2
699	0.2
700	0.23
701	0.28
702	0.24
703	0.3
704	0.31
705	0.27
706	0.28
707	0.28
708	0.29
709	0.24
710	0.25
711	0.18
712	0.15
713	0.13
714	0.12
715	0.13
716	0.11
717	0.11
718	0.11
719	0.12
720	0.11
721	0.11
722	0.13
723	0.13
724	0.14
725	0.14
726	0.14
727	0.15
728	0.19
729	0.19
730	0.17
731	0.16
732	0.16
733	0.16
734	0.2
735	0.18
736	0.15
737	0.16
738	0.17
739	0.18
740	0.16
741	0.14
742	0.1
743	0.1
744	0.1
745	0.09
746	0.13
747	0.13
748	0.13
749	0.14
750	0.14
751	0.16
752	0.23
753	0.27
754	0.27
755	0.27
756	0.26
757	0.29
758	0.29
759	0.27
760	0.2
761	0.18
762	0.15
763	0.15
764	0.15
765	0.11
766	0.11
767	0.1
768	0.1
769	0.09
770	0.08
771	0.06
772	0.07
773	0.08
774	0.11
775	0.1
776	0.1
777	0.1
778	0.11
779	0.15
780	0.16
781	0.16
782	0.19
783	0.21
784	0.26
785	0.31
786	0.32
787	0.36
788	0.39
789	0.4
790	0.42
791	0.42
792	0.39
793	0.36
794	0.36
795	0.28
796	0.22
797	0.21
798	0.14
799	0.18
800	0.18
801	0.17
802	0.17
803	0.17
804	0.18
805	0.18
806	0.19
807	0.15
808	0.15
809	0.17
810	0.19
811	0.2
812	0.19
813	0.21
814	0.21
815	0.24
816	0.25
817	0.25
818	0.24
819	0.29
820	0.31
821	0.3
822	0.35
823	0.32
824	0.28
825	0.3
826	0.33
827	0.3
828	0.32
829	0.33
830	0.29
831	0.35
832	0.37
833	0.35
834	0.31
835	0.31
836	0.3
837	0.32
838	0.31
839	0.27
840	0.25
841	0.24
842	0.24
843	0.21
844	0.18
845	0.17
846	0.21
847	0.28
848	0.36
849	0.38
850	0.46
851	0.48
852	0.51
853	0.53
854	0.56
855	0.56
856	0.57
857	0.62
858	0.54
859	0.54
860	0.53
861	0.49
862	0.41
863	0.34
864	0.29
865	0.24
866	0.25
867	0.23
868	0.21
869	0.2
870	0.2
871	0.19
872	0.15
873	0.12
874	0.1
875	0.07
876	0.07
877	0.06
878	0.05
879	0.06
880	0.05
881	0.05
882	0.05
883	0.05
884	0.06
885	0.06
886	0.06
887	0.06
888	0.07
889	0.07
890	0.08
891	0.1
892	0.11
893	0.12
894	0.13
895	0.16
896	0.2
897	0.22
898	0.21
899	0.27
900	0.29
901	0.29
902	0.28
903	0.26
904	0.24
905	0.21
906	0.21
907	0.14
908	0.12
909	0.11
910	0.1
911	0.1
912	0.08
913	0.09
914	0.08
915	0.09
916	0.11
917	0.13
918	0.13
919	0.14
920	0.14
921	0.16
922	0.16
923	0.16
924	0.14
925	0.13
926	0.12
927	0.12
928	0.15
929	0.15
930	0.15
931	0.14
932	0.17
933	0.2
934	0.2
935	0.21
936	0.19
937	0.18
938	0.18
939	0.2
940	0.18
941	0.15
942	0.15
943	0.14
944	0.14
945	0.14
946	0.14
947	0.13
948	0.15

A0A1M2VVW9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer