Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8YDC0

Protein Details
Accession G8YDC0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
398-431VILVKKFYTRKSKKSKNRKWKLKRMAKEYNESNNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
407-423RKSKKSKNRKWKLKRMA
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039768  Nmd3  
IPR007064  Nmd3_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0043023  F:ribosomal large subunit binding  
GO:0015031  P:protein transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF04981  NMD3  
Amino Acid Sequences MSNYMHLENMGEGQNTVATMLCCNCGVPMDGSSGLVMCYDCIKLTVDITAGIPRESNVSFCRNCERFLQPPGQWIKADLESRELLALCLRRLKGLNKVRLVDASFIWTEPHSRRIRLKVTVQGEAISNAIIQQTFEVEYVVIAMQCPDCARSYTANTWRATVQIRQKVAHKRTFLYLEQLILKHNAHLDTVSIQETKDGLDFFYSQKNHAAKMLDFLNTVVPVRTKKSEELVSQDIHSGSSSYKFSFSVELVPICRDDLVVLPKNLAQQLGYISRLVLCSKVSNLVQFLDPMSLQTADMVPQVYWRNPFPSLLDTTQLVEFIVLDVEPTGDMKGKHVLADITVSRASDLGVNDNSFYVRSHLGAILHPGDSCLGYYLTNTNLNSDLFDSLDTDNLPEVILVKKFYTRKSKKSKNRKWKLKRMAKEYNESNNESRLAKAEQEKAERDYELFLQELEEDEELRQTVNLYKSENANQQDEDDIEEDDEAPEIAVDELLDELDEMTLDEH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.12
4 0.1
5 0.08
6 0.1
7 0.12
8 0.13
9 0.12
10 0.13
11 0.13
12 0.12
13 0.14
14 0.14
15 0.14
16 0.16
17 0.16
18 0.16
19 0.16
20 0.15
21 0.12
22 0.11
23 0.1
24 0.07
25 0.08
26 0.09
27 0.09
28 0.1
29 0.12
30 0.12
31 0.13
32 0.14
33 0.12
34 0.13
35 0.14
36 0.16
37 0.15
38 0.14
39 0.14
40 0.13
41 0.16
42 0.16
43 0.18
44 0.18
45 0.25
46 0.26
47 0.29
48 0.39
49 0.36
50 0.38
51 0.4
52 0.43
53 0.41
54 0.46
55 0.51
56 0.42
57 0.49
58 0.52
59 0.5
60 0.44
61 0.4
62 0.38
63 0.36
64 0.38
65 0.3
66 0.29
67 0.26
68 0.26
69 0.26
70 0.22
71 0.16
72 0.17
73 0.19
74 0.17
75 0.22
76 0.22
77 0.24
78 0.27
79 0.31
80 0.37
81 0.44
82 0.51
83 0.5
84 0.52
85 0.5
86 0.5
87 0.48
88 0.4
89 0.31
90 0.26
91 0.21
92 0.19
93 0.18
94 0.15
95 0.18
96 0.19
97 0.27
98 0.27
99 0.32
100 0.38
101 0.45
102 0.51
103 0.53
104 0.56
105 0.56
106 0.56
107 0.55
108 0.48
109 0.41
110 0.36
111 0.29
112 0.24
113 0.15
114 0.11
115 0.08
116 0.08
117 0.07
118 0.06
119 0.05
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.1
137 0.12
138 0.15
139 0.19
140 0.27
141 0.35
142 0.4
143 0.39
144 0.39
145 0.37
146 0.36
147 0.34
148 0.33
149 0.34
150 0.34
151 0.36
152 0.37
153 0.44
154 0.51
155 0.56
156 0.56
157 0.5
158 0.46
159 0.47
160 0.5
161 0.44
162 0.39
163 0.32
164 0.27
165 0.27
166 0.25
167 0.22
168 0.2
169 0.19
170 0.15
171 0.16
172 0.14
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.1
177 0.11
178 0.12
179 0.1
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.09
189 0.1
190 0.16
191 0.16
192 0.16
193 0.22
194 0.23
195 0.22
196 0.24
197 0.25
198 0.19
199 0.21
200 0.22
201 0.16
202 0.16
203 0.15
204 0.13
205 0.11
206 0.12
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.12
211 0.15
212 0.16
213 0.17
214 0.21
215 0.25
216 0.25
217 0.29
218 0.29
219 0.27
220 0.25
221 0.25
222 0.2
223 0.16
224 0.15
225 0.1
226 0.07
227 0.09
228 0.1
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.12
237 0.12
238 0.11
239 0.12
240 0.11
241 0.1
242 0.09
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.13
247 0.15
248 0.15
249 0.15
250 0.16
251 0.18
252 0.18
253 0.16
254 0.1
255 0.08
256 0.1
257 0.11
258 0.11
259 0.1
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.12
273 0.12
274 0.11
275 0.11
276 0.09
277 0.08
278 0.07
279 0.08
280 0.07
281 0.06
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.06
288 0.09
289 0.12
290 0.13
291 0.15
292 0.15
293 0.17
294 0.18
295 0.18
296 0.17
297 0.18
298 0.2
299 0.19
300 0.2
301 0.17
302 0.18
303 0.17
304 0.16
305 0.12
306 0.08
307 0.07
308 0.06
309 0.05
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.13
321 0.13
322 0.13
323 0.14
324 0.14
325 0.12
326 0.15
327 0.14
328 0.12
329 0.12
330 0.12
331 0.11
332 0.11
333 0.11
334 0.1
335 0.1
336 0.12
337 0.13
338 0.13
339 0.13
340 0.14
341 0.14
342 0.12
343 0.11
344 0.1
345 0.09
346 0.1
347 0.11
348 0.12
349 0.13
350 0.13
351 0.16
352 0.15
353 0.14
354 0.14
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.1
359 0.08
360 0.07
361 0.07
362 0.08
363 0.09
364 0.12
365 0.16
366 0.16
367 0.16
368 0.17
369 0.17
370 0.17
371 0.16
372 0.14
373 0.11
374 0.11
375 0.11
376 0.1
377 0.11
378 0.1
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.06
384 0.07
385 0.09
386 0.1
387 0.11
388 0.12
389 0.18
390 0.22
391 0.3
392 0.4
393 0.46
394 0.55
395 0.65
396 0.75
397 0.79
398 0.87
399 0.92
400 0.92
401 0.94
402 0.95
403 0.95
404 0.96
405 0.96
406 0.95
407 0.93
408 0.92
409 0.91
410 0.86
411 0.84
412 0.81
413 0.79
414 0.74
415 0.7
416 0.62
417 0.54
418 0.5
419 0.42
420 0.35
421 0.29
422 0.25
423 0.26
424 0.31
425 0.35
426 0.39
427 0.44
428 0.46
429 0.46
430 0.46
431 0.42
432 0.36
433 0.31
434 0.27
435 0.23
436 0.19
437 0.16
438 0.14
439 0.13
440 0.14
441 0.13
442 0.11
443 0.1
444 0.1
445 0.12
446 0.11
447 0.11
448 0.1
449 0.1
450 0.15
451 0.19
452 0.21
453 0.23
454 0.26
455 0.3
456 0.37
457 0.43
458 0.41
459 0.4
460 0.39
461 0.37
462 0.37
463 0.32
464 0.28
465 0.22
466 0.18
467 0.15
468 0.15
469 0.14
470 0.11
471 0.11
472 0.08
473 0.07
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.05
482 0.05
483 0.05
484 0.05
485 0.05
486 0.05