Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1M2V4V0

Protein Details
Accession A0A1M2V4V0    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
317-342SESHVGKEKKVKQPRKTNTPFQRVKAHydrophilic
378-404IVTRGAGFRKEKNKKKRGSYRGGDITLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
180-208KGKKVEAKVVPKKVDATKVVAKKADAKKA
259-280KTKKPAAKAKAAVKVSKPKEEP
287-288KK
384-395GFRKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAIEQGKSSVDGSLAATYTYIYSFLVNKEHTKAAEALKKAAKDVVVLKDGMSHDGPSLDVIVKEWKQLKAKAKAESSDSSDSDDSSSEDSSSSDSSDSDDDSDSSDSSSSSAATPTAQTKTILKAIVDEKPKPSPAKVKAKAASPARSSETLASEDSASSDSSSESSSSDESSDDEKPTKGKKVEAKVVPKKVDATKVVAKKADAKKAKESSSDSSDSSESSDSSDSDKDEVKESSSSSSESSDSSDSDSDSDSDDEAKTKKPAAKAKAAVKVSKPKEEPVDVKVTKKRRTDESGASVPTAITETARETESAAPEASESHVGKEKKVKQPRKTNTPFQRVKAEEVHVDERLRDNTFESRLAQGASISDYGARAARDLIVTRGAGFRKEKNKKKRGSYRGGDITLATHSIKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.11
3 0.11
4 0.1
5 0.11
6 0.1
7 0.09
8 0.07
9 0.09
10 0.11
11 0.14
12 0.19
13 0.22
14 0.25
15 0.29
16 0.32
17 0.3
18 0.32
19 0.34
20 0.36
21 0.4
22 0.38
23 0.41
24 0.42
25 0.42
26 0.4
27 0.39
28 0.31
29 0.28
30 0.32
31 0.31
32 0.28
33 0.28
34 0.26
35 0.29
36 0.29
37 0.29
38 0.24
39 0.18
40 0.16
41 0.17
42 0.17
43 0.12
44 0.13
45 0.11
46 0.1
47 0.1
48 0.17
49 0.17
50 0.23
51 0.27
52 0.31
53 0.36
54 0.44
55 0.52
56 0.55
57 0.6
58 0.62
59 0.62
60 0.6
61 0.59
62 0.55
63 0.52
64 0.46
65 0.41
66 0.37
67 0.33
68 0.3
69 0.26
70 0.22
71 0.17
72 0.14
73 0.14
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.09
81 0.09
82 0.11
83 0.11
84 0.12
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.12
89 0.13
90 0.11
91 0.11
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.08
101 0.1
102 0.12
103 0.14
104 0.15
105 0.15
106 0.17
107 0.2
108 0.22
109 0.22
110 0.18
111 0.21
112 0.23
113 0.28
114 0.31
115 0.3
116 0.3
117 0.32
118 0.37
119 0.34
120 0.35
121 0.38
122 0.43
123 0.52
124 0.53
125 0.58
126 0.57
127 0.59
128 0.63
129 0.59
130 0.56
131 0.47
132 0.45
133 0.4
134 0.38
135 0.35
136 0.3
137 0.26
138 0.21
139 0.19
140 0.17
141 0.14
142 0.12
143 0.12
144 0.1
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.11
160 0.13
161 0.13
162 0.14
163 0.14
164 0.17
165 0.2
166 0.25
167 0.24
168 0.28
169 0.34
170 0.39
171 0.47
172 0.51
173 0.58
174 0.59
175 0.65
176 0.6
177 0.54
178 0.51
179 0.45
180 0.43
181 0.34
182 0.32
183 0.32
184 0.34
185 0.35
186 0.32
187 0.3
188 0.34
189 0.38
190 0.42
191 0.41
192 0.4
193 0.46
194 0.5
195 0.51
196 0.46
197 0.45
198 0.4
199 0.39
200 0.38
201 0.3
202 0.27
203 0.25
204 0.21
205 0.19
206 0.15
207 0.1
208 0.09
209 0.1
210 0.08
211 0.1
212 0.11
213 0.1
214 0.11
215 0.13
216 0.13
217 0.14
218 0.14
219 0.14
220 0.14
221 0.14
222 0.15
223 0.13
224 0.13
225 0.12
226 0.13
227 0.12
228 0.11
229 0.13
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.11
244 0.12
245 0.13
246 0.14
247 0.17
248 0.21
249 0.26
250 0.34
251 0.38
252 0.45
253 0.5
254 0.55
255 0.59
256 0.59
257 0.55
258 0.53
259 0.57
260 0.52
261 0.53
262 0.47
263 0.43
264 0.45
265 0.47
266 0.44
267 0.39
268 0.45
269 0.39
270 0.43
271 0.47
272 0.51
273 0.53
274 0.57
275 0.57
276 0.54
277 0.61
278 0.61
279 0.62
280 0.61
281 0.58
282 0.52
283 0.48
284 0.41
285 0.33
286 0.26
287 0.19
288 0.12
289 0.07
290 0.07
291 0.09
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.12
296 0.15
297 0.16
298 0.17
299 0.15
300 0.13
301 0.13
302 0.13
303 0.13
304 0.15
305 0.14
306 0.15
307 0.22
308 0.23
309 0.26
310 0.35
311 0.42
312 0.48
313 0.58
314 0.66
315 0.69
316 0.8
317 0.86
318 0.88
319 0.87
320 0.88
321 0.88
322 0.89
323 0.85
324 0.78
325 0.78
326 0.69
327 0.66
328 0.61
329 0.53
330 0.47
331 0.46
332 0.45
333 0.38
334 0.36
335 0.33
336 0.31
337 0.31
338 0.29
339 0.24
340 0.24
341 0.26
342 0.29
343 0.29
344 0.27
345 0.26
346 0.25
347 0.25
348 0.22
349 0.17
350 0.15
351 0.15
352 0.13
353 0.11
354 0.11
355 0.1
356 0.11
357 0.13
358 0.12
359 0.1
360 0.11
361 0.12
362 0.14
363 0.15
364 0.16
365 0.17
366 0.17
367 0.18
368 0.22
369 0.22
370 0.26
371 0.29
372 0.35
373 0.43
374 0.54
375 0.63
376 0.69
377 0.78
378 0.82
379 0.89
380 0.91
381 0.91
382 0.91
383 0.88
384 0.87
385 0.86
386 0.79
387 0.69
388 0.58
389 0.49
390 0.4
391 0.34
392 0.25
393 0.17