Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1M2W6L1

Protein Details
Accession A0A1M2W6L1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-46YYSYRPYEDRSRKQPAKPNFDTRNHydrophilic
174-194DEGGPKKKKKKDGPGVTARNMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
178-187PKKKKKKDGP
Subcellular Location(s) nucl 8, mito 8, mito_nucl 8, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MPPRWLMLLQAEEESLQRSNDNYYSYRPYEDRSRKQPAKPNFDTRNIGQTMRAIGTQHKVPKIPEDSVNYLALALRTRLQDLITAMIAAAQHRNDAQFDRPATTYEDGRPMWNIVVRSDVSKQLAAIEKVEREEEMRIRRERKERIEAAAAAQSAALAAAVTGSSAAESVGMEDEGGPKKKKKKDGPGVTARNMPEDLRKKMSNAVAKQAAGLGTSKYAWMSAANGGAAPAKAKPAPAPAAVRASTPATTTAPAQGGPGSSGWARPYQSTKPNGQNSQQQREDDGRMAVTLRDAIFVVENEKGHGGGRGAARGWT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.16
3 0.13
4 0.13
5 0.13
6 0.17
7 0.19
8 0.23
9 0.23
10 0.27
11 0.33
12 0.34
13 0.38
14 0.35
15 0.38
16 0.45
17 0.53
18 0.57
19 0.59
20 0.68
21 0.71
22 0.78
23 0.82
24 0.82
25 0.81
26 0.8
27 0.82
28 0.78
29 0.77
30 0.74
31 0.67
32 0.65
33 0.57
34 0.49
35 0.4
36 0.35
37 0.31
38 0.26
39 0.25
40 0.18
41 0.19
42 0.22
43 0.27
44 0.31
45 0.31
46 0.33
47 0.33
48 0.4
49 0.41
50 0.4
51 0.4
52 0.4
53 0.41
54 0.41
55 0.41
56 0.32
57 0.28
58 0.25
59 0.2
60 0.15
61 0.11
62 0.12
63 0.12
64 0.13
65 0.14
66 0.13
67 0.15
68 0.14
69 0.15
70 0.12
71 0.11
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.09
76 0.1
77 0.08
78 0.09
79 0.1
80 0.11
81 0.11
82 0.13
83 0.16
84 0.19
85 0.19
86 0.21
87 0.21
88 0.22
89 0.24
90 0.24
91 0.23
92 0.19
93 0.24
94 0.22
95 0.22
96 0.21
97 0.18
98 0.18
99 0.18
100 0.17
101 0.12
102 0.14
103 0.14
104 0.15
105 0.16
106 0.18
107 0.16
108 0.16
109 0.15
110 0.16
111 0.19
112 0.17
113 0.17
114 0.16
115 0.15
116 0.16
117 0.16
118 0.13
119 0.11
120 0.13
121 0.16
122 0.2
123 0.25
124 0.3
125 0.34
126 0.4
127 0.47
128 0.52
129 0.54
130 0.57
131 0.53
132 0.51
133 0.51
134 0.44
135 0.38
136 0.32
137 0.25
138 0.17
139 0.14
140 0.1
141 0.07
142 0.06
143 0.04
144 0.02
145 0.02
146 0.02
147 0.02
148 0.02
149 0.02
150 0.02
151 0.02
152 0.02
153 0.02
154 0.02
155 0.02
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.07
162 0.1
163 0.13
164 0.15
165 0.2
166 0.29
167 0.35
168 0.45
169 0.52
170 0.6
171 0.67
172 0.76
173 0.8
174 0.82
175 0.81
176 0.74
177 0.69
178 0.58
179 0.49
180 0.39
181 0.31
182 0.29
183 0.29
184 0.31
185 0.31
186 0.32
187 0.31
188 0.36
189 0.41
190 0.41
191 0.36
192 0.39
193 0.37
194 0.36
195 0.35
196 0.3
197 0.24
198 0.17
199 0.16
200 0.09
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.07
218 0.09
219 0.09
220 0.1
221 0.12
222 0.16
223 0.19
224 0.22
225 0.25
226 0.25
227 0.3
228 0.29
229 0.28
230 0.25
231 0.24
232 0.21
233 0.18
234 0.18
235 0.14
236 0.15
237 0.15
238 0.16
239 0.15
240 0.15
241 0.15
242 0.13
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.11
247 0.1
248 0.12
249 0.13
250 0.16
251 0.17
252 0.19
253 0.25
254 0.3
255 0.38
256 0.42
257 0.49
258 0.54
259 0.62
260 0.65
261 0.64
262 0.66
263 0.67
264 0.71
265 0.69
266 0.6
267 0.56
268 0.55
269 0.53
270 0.46
271 0.39
272 0.3
273 0.25
274 0.25
275 0.2
276 0.16
277 0.16
278 0.13
279 0.13
280 0.12
281 0.12
282 0.13
283 0.14
284 0.15
285 0.15
286 0.15
287 0.16
288 0.16
289 0.16
290 0.15
291 0.17
292 0.15
293 0.17
294 0.19
295 0.2