Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1M2VXD8

Protein Details
Accession A0A1M2VXD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
219-241KPGNKPKCWKCGKPGYQRDCPNHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
244-263KKPSGKGGKGGDKGKGKPGT
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 10, nucl 7.5, mito 7
Family & Domain DBs
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
Amino Acid Sequences MSSSTNPLDRIRIEKLKGPDGWTAWKVLMEDYLWNAKVWGYVAGTTKKPTAKAEAKAGDKAEAQVDTKEIDEWEEKDRLALSLIRACVSPSILDLVLGCKTSADAWKALSANFEKKGLMELISVRRKLLQAQYSDGDDLEEWLREMSKLRTRLSTLGNPMPDKEFSITLITGLPGSWDSFVGGLNLRSDLDDADELMSRIREMGGXLANAEVAMAARMHKPGNKPKCWKCGKPGYQRDCPNHDKKPSGKGGKGGDKGKGKPGTPKALVTETADRDSDDDGDSCHFTYASTDEPDAVALSIVDADAWLADTGTTVHVARERANFSSYVATPGRTLRGAGSTPILGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.51
3 0.53
4 0.53
5 0.52
6 0.49
7 0.44
8 0.48
9 0.42
10 0.39
11 0.32
12 0.31
13 0.27
14 0.22
15 0.21
16 0.15
17 0.15
18 0.17
19 0.22
20 0.21
21 0.2
22 0.2
23 0.18
24 0.18
25 0.17
26 0.16
27 0.12
28 0.14
29 0.2
30 0.24
31 0.26
32 0.27
33 0.32
34 0.32
35 0.34
36 0.34
37 0.38
38 0.41
39 0.44
40 0.51
41 0.52
42 0.53
43 0.54
44 0.51
45 0.44
46 0.37
47 0.34
48 0.27
49 0.22
50 0.2
51 0.16
52 0.16
53 0.14
54 0.14
55 0.14
56 0.11
57 0.13
58 0.14
59 0.15
60 0.19
61 0.19
62 0.19
63 0.19
64 0.19
65 0.16
66 0.16
67 0.16
68 0.14
69 0.17
70 0.18
71 0.17
72 0.17
73 0.17
74 0.16
75 0.15
76 0.12
77 0.08
78 0.1
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.07
87 0.07
88 0.09
89 0.12
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.17
94 0.18
95 0.17
96 0.2
97 0.2
98 0.22
99 0.23
100 0.23
101 0.19
102 0.19
103 0.21
104 0.17
105 0.15
106 0.11
107 0.14
108 0.22
109 0.27
110 0.27
111 0.25
112 0.26
113 0.26
114 0.28
115 0.31
116 0.28
117 0.25
118 0.28
119 0.29
120 0.28
121 0.28
122 0.24
123 0.18
124 0.12
125 0.12
126 0.09
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.08
133 0.12
134 0.17
135 0.21
136 0.23
137 0.25
138 0.27
139 0.3
140 0.33
141 0.32
142 0.31
143 0.3
144 0.31
145 0.29
146 0.28
147 0.26
148 0.22
149 0.19
150 0.15
151 0.12
152 0.11
153 0.12
154 0.11
155 0.09
156 0.09
157 0.08
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.05
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.04
199 0.03
200 0.03
201 0.05
202 0.05
203 0.07
204 0.09
205 0.12
206 0.19
207 0.29
208 0.39
209 0.47
210 0.56
211 0.62
212 0.71
213 0.76
214 0.74
215 0.73
216 0.75
217 0.76
218 0.77
219 0.8
220 0.77
221 0.78
222 0.81
223 0.78
224 0.75
225 0.73
226 0.7
227 0.67
228 0.65
229 0.63
230 0.59
231 0.62
232 0.64
233 0.63
234 0.57
235 0.55
236 0.58
237 0.59
238 0.62
239 0.56
240 0.53
241 0.52
242 0.52
243 0.55
244 0.52
245 0.44
246 0.47
247 0.52
248 0.53
249 0.49
250 0.5
251 0.45
252 0.43
253 0.43
254 0.38
255 0.37
256 0.31
257 0.31
258 0.29
259 0.25
260 0.23
261 0.23
262 0.2
263 0.15
264 0.12
265 0.11
266 0.13
267 0.14
268 0.13
269 0.13
270 0.11
271 0.1
272 0.11
273 0.13
274 0.14
275 0.15
276 0.15
277 0.15
278 0.15
279 0.15
280 0.14
281 0.12
282 0.08
283 0.06
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.04
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.05
296 0.06
297 0.07
298 0.09
299 0.08
300 0.1
301 0.13
302 0.15
303 0.19
304 0.25
305 0.28
306 0.28
307 0.3
308 0.29
309 0.27
310 0.32
311 0.28
312 0.28
313 0.26
314 0.24
315 0.24
316 0.27
317 0.29
318 0.24
319 0.24
320 0.2
321 0.24
322 0.24
323 0.24
324 0.25