FuNGI

A0A1L9SEK0

Protein Details

Accession

A0A1L9SEK0

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
48-70	EESQFTRPVRLQRRDPRTKYGEN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
327-349	EKREKEARRVLGKKVRKALQKRE
413-419	LKKAKKR

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, mito_nucl 10.5, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MAFNGFSGPLLSETYVDYPLVTTKRALREGLKFHIARFSSKKPVDPREESQFTRPVRLQRRDPRTKYGENEAGKAANREFNSDGNPITDDAEIDELEARKAAREKERAENLAQIAPSVGTSQKRTNVAKQKTQQVSKIDLTPEEIAKARIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGNYEAALSETHAVFVLDGSGKMRMIPVEKWYKFNAKSQFKALTIEEAEKFMSKKIKDPRWFMEKQQEMAEQKELEQYARQRKVYAGKQGAPGGGEGLEADDMDFEEDRFADDEEHDDLFHEDEDAKAAEKRIKEDQLKANVFDLKQEKEYEEEELREKREKEARRVLGKKVRKALQKREKNFDYSSGSDFNPYSDEESSEDSEEERAKEEERKAEEEKNRKDAATASKGSTTPSGRLKTTDPLKKAKKRVGSPSLSDASGTDTSRKQTKNRHLAPQVASRPMSPSAANQATIGKKRMRNGPGGGAGSTSDLDGGAGSAGEMSETGKSKKLKLTSTLPSQVGTPQGSRANSPAPPGVRGNTGSRASSPEGGMRVPGRVSTPIPSGPQSFPTPAEIHAAIPPSGILSSDLLKKFRLRIGESKENHRRFITIVKDVGVYGKEDRLLRPGVLKDK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.16
3	0.15
4	0.14
5	0.13
6	0.18
7	0.19
8	0.19
9	0.2
10	0.25
11	0.33
12	0.37
13	0.4
14	0.4
15	0.47
16	0.52
17	0.55
18	0.57
19	0.5
20	0.48
21	0.52
22	0.47
23	0.46
24	0.47
25	0.47
26	0.48
27	0.51
28	0.58
29	0.59
30	0.67
31	0.69
32	0.69
33	0.69
34	0.68
35	0.71
36	0.67
37	0.64
38	0.62
39	0.54
40	0.54
41	0.53
42	0.53
43	0.57
44	0.62
45	0.66
46	0.69
47	0.78
48	0.82
49	0.83
50	0.83
51	0.81
52	0.8
53	0.74
54	0.73
55	0.71
56	0.63
57	0.6
58	0.52
59	0.47
60	0.41
61	0.39
62	0.31
63	0.29
64	0.27
65	0.28
66	0.28
67	0.27
68	0.3
69	0.28
70	0.27
71	0.22
72	0.23
73	0.19
74	0.19
75	0.16
76	0.12
77	0.12
78	0.12
79	0.11
80	0.1
81	0.13
82	0.11
83	0.11
84	0.13
85	0.12
86	0.14
87	0.18
88	0.24
89	0.3
90	0.37
91	0.42
92	0.5
93	0.58
94	0.57
95	0.55
96	0.53
97	0.47
98	0.43
99	0.38
100	0.28
101	0.21
102	0.17
103	0.16
104	0.12
105	0.13
106	0.13
107	0.18
108	0.22
109	0.27
110	0.34
111	0.38
112	0.46
113	0.53
114	0.57
115	0.63
116	0.65
117	0.7
118	0.72
119	0.72
120	0.69
121	0.63
122	0.62
123	0.55
124	0.53
125	0.44
126	0.36
127	0.35
128	0.31
129	0.27
130	0.23
131	0.21
132	0.19
133	0.21
134	0.22
135	0.2
136	0.19
137	0.2
138	0.2
139	0.23
140	0.26
141	0.25
142	0.28
143	0.28
144	0.27
145	0.26
146	0.25
147	0.22
148	0.19
149	0.2
150	0.21
151	0.21
152	0.2
153	0.21
154	0.21
155	0.2
156	0.18
157	0.15
158	0.11
159	0.1
160	0.1
161	0.09
162	0.09
163	0.09
164	0.08
165	0.09
166	0.08
167	0.08
168	0.08
169	0.07
170	0.07
171	0.06
172	0.07
173	0.06
174	0.06
175	0.07
176	0.08
177	0.08
178	0.08
179	0.09
180	0.08
181	0.11
182	0.12
183	0.18
184	0.28
185	0.29
186	0.32
187	0.35
188	0.42
189	0.41
190	0.47
191	0.5
192	0.47
193	0.48
194	0.5
195	0.51
196	0.44
197	0.45
198	0.38
199	0.32
200	0.26
201	0.27
202	0.22
203	0.19
204	0.18
205	0.17
206	0.17
207	0.15
208	0.2
209	0.17
210	0.24
211	0.33
212	0.42
213	0.48
214	0.54
215	0.57
216	0.59
217	0.61
218	0.57
219	0.58
220	0.52
221	0.46
222	0.43
223	0.42
224	0.35
225	0.35
226	0.34
227	0.24
228	0.21
229	0.22
230	0.19
231	0.15
232	0.17
233	0.22
234	0.29
235	0.34
236	0.34
237	0.32
238	0.34
239	0.42
240	0.44
241	0.46
242	0.41
243	0.39
244	0.42
245	0.42
246	0.39
247	0.32
248	0.26
249	0.17
250	0.12
251	0.09
252	0.06
253	0.05
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.03
258	0.03
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.05
265	0.05
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.08
270	0.09
271	0.09
272	0.09
273	0.08
274	0.08
275	0.08
276	0.08
277	0.07
278	0.05
279	0.05
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.07
284	0.08
285	0.11
286	0.11
287	0.15
288	0.18
289	0.25
290	0.27
291	0.32
292	0.37
293	0.43
294	0.43
295	0.41
296	0.38
297	0.34
298	0.31
299	0.3
300	0.26
301	0.19
302	0.19
303	0.19
304	0.18
305	0.17
306	0.18
307	0.17
308	0.16
309	0.16
310	0.17
311	0.19
312	0.21
313	0.23
314	0.23
315	0.25
316	0.31
317	0.35
318	0.4
319	0.47
320	0.51
321	0.56
322	0.59
323	0.61
324	0.63
325	0.64
326	0.62
327	0.6
328	0.6
329	0.59
330	0.63
331	0.67
332	0.69
333	0.72
334	0.72
335	0.73
336	0.7
337	0.66
338	0.59
339	0.52
340	0.47
341	0.39
342	0.36
343	0.29
344	0.27
345	0.24
346	0.23
347	0.18
348	0.15
349	0.13
350	0.13
351	0.11
352	0.11
353	0.11
354	0.14
355	0.14
356	0.14
357	0.13
358	0.11
359	0.13
360	0.13
361	0.12
362	0.11
363	0.11
364	0.12
365	0.18
366	0.2
367	0.24
368	0.26
369	0.31
370	0.32
371	0.39
372	0.45
373	0.49
374	0.52
375	0.53
376	0.51
377	0.46
378	0.44
379	0.41
380	0.41
381	0.38
382	0.35
383	0.29
384	0.31
385	0.31
386	0.31
387	0.31
388	0.25
389	0.22
390	0.27
391	0.28
392	0.26
393	0.28
394	0.3
395	0.33
396	0.4
397	0.43
398	0.4
399	0.47
400	0.57
401	0.63
402	0.69
403	0.68
404	0.68
405	0.68
406	0.73
407	0.73
408	0.68
409	0.63
410	0.61
411	0.56
412	0.47
413	0.4
414	0.3
415	0.26
416	0.23
417	0.21
418	0.18
419	0.17
420	0.2
421	0.28
422	0.31
423	0.33
424	0.4
425	0.5
426	0.58
427	0.63
428	0.7
429	0.67
430	0.71
431	0.69
432	0.68
433	0.62
434	0.56
435	0.5
436	0.41
437	0.39
438	0.33
439	0.3
440	0.21
441	0.18
442	0.22
443	0.23
444	0.23
445	0.2
446	0.24
447	0.28
448	0.31
449	0.34
450	0.33
451	0.35
452	0.4
453	0.48
454	0.47
455	0.48
456	0.48
457	0.49
458	0.48
459	0.45
460	0.4
461	0.31
462	0.27
463	0.22
464	0.19
465	0.13
466	0.07
467	0.06
468	0.06
469	0.05
470	0.05
471	0.04
472	0.03
473	0.03
474	0.03
475	0.03
476	0.03
477	0.03
478	0.04
479	0.07
480	0.09
481	0.11
482	0.17
483	0.19
484	0.24
485	0.3
486	0.35
487	0.37
488	0.42
489	0.48
490	0.5
491	0.56
492	0.58
493	0.52
494	0.47
495	0.43
496	0.39
497	0.35
498	0.3
499	0.23
500	0.21
501	0.25
502	0.26
503	0.26
504	0.27
505	0.27
506	0.26
507	0.29
508	0.3
509	0.26
510	0.29
511	0.3
512	0.29
513	0.28
514	0.3
515	0.31
516	0.32
517	0.33
518	0.31
519	0.29
520	0.32
521	0.31
522	0.31
523	0.28
524	0.25
525	0.24
526	0.23
527	0.25
528	0.22
529	0.21
530	0.18
531	0.18
532	0.17
533	0.19
534	0.2
535	0.21
536	0.24
537	0.25
538	0.27
539	0.29
540	0.31
541	0.3
542	0.33
543	0.33
544	0.31
545	0.3
546	0.31
547	0.29
548	0.26
549	0.29
550	0.25
551	0.23
552	0.23
553	0.24
554	0.19
555	0.18
556	0.17
557	0.13
558	0.12
559	0.11
560	0.1
561	0.09
562	0.12
563	0.2
564	0.23
565	0.24
566	0.27
567	0.3
568	0.34
569	0.36
570	0.4
571	0.39
572	0.46
573	0.54
574	0.61
575	0.62
576	0.68
577	0.75
578	0.72
579	0.7
580	0.62
581	0.54
582	0.46
583	0.5
584	0.47
585	0.43
586	0.41
587	0.38
588	0.37
589	0.36
590	0.36
591	0.29
592	0.24
593	0.19
594	0.2
595	0.23
596	0.24
597	0.26
598	0.28
599	0.29
600	0.28
601	0.32

A0A1L9SEK0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer