FuNGI

A0A1L9SVP1

Protein Details

Accession

A0A1L9SVP1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-21	MPPKAAPRRTATRRQPAPEPE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
124-163	RNRERLAEVAAIRRGRGDGGRGAHGRGGQGGRGGARRGRG

Subcellular Location(s)

mito 13, nucl 9.5, cyto_nucl 7.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKAAPRRTATRRQPAPEPEAGTAASSTSGAVDPVGQNESVTPSEGGSRPASTRPPVQRLQSLKKRTPAGSIAPATKKQPSALGGGPAGDGSTTKPTLKYQPKAVMRRSKEEREALEKLEAERNRERLAEVAAIRRGRGDGGRGAHGRGGQGGRGGARRGRGGIFSVDSSRASSMSRRSRSIIDAGGAGGRGGEDYSSDEDREGLRISIDEINLESDSEDDYGDSKKGKMAARNSYGGVRALRPIRVERYEHEERVVSVNMESSTTSKPAEETAEEEADPEDLTAEDDNTLFVEQDAPDDTHVKQEPADGDEVMTDDIPHADDTIITDDGFLPEQTVKVRRKLQAKEAPAPAPATVTIAAAPTKKKKDPRDLLRTKEELEEYDRHLEDLDAVKDLLYFEPKEPAPATVTTEKSKSPVEAGGEGDKGEDKTGEKEEEEKEEEETEEEPTNEKLAGQLFLMQFPPMTPNLVVSGSTNEQPGDREAEPRSTQPGPLGGVKREQQDGDDDALEVTGESVGAPPHESSKIVTATNRQLHAGRVGKLNVHASGRVTMDWGGISFELDRATAVGFLQEALIVSAPSHDLTTGEVMPDEKRVWAMGQLSGKFTVMPNWEEIL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.8
2	0.81
3	0.79
4	0.77
5	0.73
6	0.66
7	0.57
8	0.5
9	0.44
10	0.36
11	0.28
12	0.21
13	0.15
14	0.11
15	0.09
16	0.08
17	0.08
18	0.07
19	0.08
20	0.1
21	0.1
22	0.13
23	0.15
24	0.13
25	0.13
26	0.14
27	0.17
28	0.15
29	0.17
30	0.14
31	0.13
32	0.18
33	0.19
34	0.22
35	0.21
36	0.22
37	0.23
38	0.27
39	0.32
40	0.31
41	0.39
42	0.44
43	0.49
44	0.53
45	0.56
46	0.6
47	0.64
48	0.7
49	0.71
50	0.72
51	0.71
52	0.73
53	0.74
54	0.67
55	0.64
56	0.59
57	0.55
58	0.54
59	0.52
60	0.52
61	0.5
62	0.52
63	0.49
64	0.49
65	0.44
66	0.37
67	0.37
68	0.32
69	0.32
70	0.31
71	0.31
72	0.27
73	0.25
74	0.24
75	0.19
76	0.17
77	0.11
78	0.09
79	0.08
80	0.12
81	0.14
82	0.15
83	0.17
84	0.21
85	0.31
86	0.4
87	0.44
88	0.47
89	0.55
90	0.63
91	0.7
92	0.75
93	0.75
94	0.71
95	0.75
96	0.75
97	0.73
98	0.71
99	0.69
100	0.65
101	0.62
102	0.59
103	0.52
104	0.48
105	0.42
106	0.37
107	0.39
108	0.36
109	0.35
110	0.37
111	0.38
112	0.36
113	0.35
114	0.33
115	0.27
116	0.28
117	0.27
118	0.23
119	0.25
120	0.28
121	0.28
122	0.27
123	0.26
124	0.24
125	0.21
126	0.2
127	0.18
128	0.18
129	0.2
130	0.27
131	0.27
132	0.27
133	0.27
134	0.27
135	0.24
136	0.22
137	0.21
138	0.15
139	0.15
140	0.16
141	0.16
142	0.17
143	0.19
144	0.17
145	0.19
146	0.2
147	0.2
148	0.2
149	0.19
150	0.19
151	0.19
152	0.18
153	0.17
154	0.18
155	0.17
156	0.16
157	0.16
158	0.15
159	0.13
160	0.13
161	0.15
162	0.22
163	0.3
164	0.34
165	0.35
166	0.37
167	0.39
168	0.41
169	0.41
170	0.33
171	0.25
172	0.21
173	0.19
174	0.17
175	0.14
176	0.11
177	0.07
178	0.05
179	0.04
180	0.04
181	0.04
182	0.04
183	0.06
184	0.09
185	0.1
186	0.11
187	0.11
188	0.12
189	0.12
190	0.13
191	0.12
192	0.09
193	0.08
194	0.08
195	0.11
196	0.12
197	0.12
198	0.11
199	0.1
200	0.11
201	0.11
202	0.11
203	0.08
204	0.06
205	0.07
206	0.07
207	0.06
208	0.05
209	0.06
210	0.07
211	0.09
212	0.09
213	0.09
214	0.1
215	0.16
216	0.19
217	0.24
218	0.3
219	0.37
220	0.4
221	0.42
222	0.41
223	0.37
224	0.35
225	0.31
226	0.25
227	0.18
228	0.18
229	0.18
230	0.19
231	0.2
232	0.22
233	0.24
234	0.27
235	0.28
236	0.25
237	0.32
238	0.35
239	0.34
240	0.32
241	0.28
242	0.25
243	0.26
244	0.24
245	0.16
246	0.11
247	0.12
248	0.11
249	0.11
250	0.1
251	0.1
252	0.1
253	0.11
254	0.11
255	0.09
256	0.1
257	0.1
258	0.12
259	0.1
260	0.11
261	0.12
262	0.13
263	0.13
264	0.13
265	0.11
266	0.1
267	0.09
268	0.07
269	0.05
270	0.04
271	0.05
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.04
280	0.04
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.07
285	0.07
286	0.07
287	0.09
288	0.09
289	0.13
290	0.13
291	0.13
292	0.12
293	0.13
294	0.14
295	0.13
296	0.14
297	0.09
298	0.09
299	0.09
300	0.09
301	0.07
302	0.06
303	0.05
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.05
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.07
318	0.08
319	0.07
320	0.06
321	0.05
322	0.06
323	0.08
324	0.15
325	0.18
326	0.23
327	0.3
328	0.34
329	0.42
330	0.45
331	0.53
332	0.54
333	0.57
334	0.58
335	0.56
336	0.51
337	0.44
338	0.41
339	0.31
340	0.23
341	0.18
342	0.13
343	0.09
344	0.08
345	0.07
346	0.07
347	0.08
348	0.1
349	0.13
350	0.18
351	0.23
352	0.28
353	0.36
354	0.44
355	0.54
356	0.62
357	0.69
358	0.74
359	0.76
360	0.77
361	0.76
362	0.69
363	0.6
364	0.53
365	0.43
366	0.34
367	0.31
368	0.27
369	0.23
370	0.26
371	0.24
372	0.21
373	0.2
374	0.19
375	0.16
376	0.17
377	0.15
378	0.11
379	0.11
380	0.1
381	0.11
382	0.11
383	0.1
384	0.09
385	0.1
386	0.1
387	0.15
388	0.15
389	0.17
390	0.17
391	0.17
392	0.17
393	0.17
394	0.21
395	0.22
396	0.25
397	0.24
398	0.25
399	0.25
400	0.25
401	0.25
402	0.21
403	0.17
404	0.17
405	0.17
406	0.17
407	0.19
408	0.19
409	0.18
410	0.17
411	0.15
412	0.14
413	0.12
414	0.11
415	0.1
416	0.09
417	0.12
418	0.15
419	0.16
420	0.15
421	0.19
422	0.21
423	0.24
424	0.26
425	0.24
426	0.22
427	0.22
428	0.21
429	0.18
430	0.17
431	0.15
432	0.13
433	0.13
434	0.13
435	0.12
436	0.13
437	0.12
438	0.11
439	0.1
440	0.1
441	0.11
442	0.09
443	0.14
444	0.13
445	0.15
446	0.15
447	0.14
448	0.12
449	0.12
450	0.14
451	0.1
452	0.12
453	0.1
454	0.11
455	0.13
456	0.13
457	0.13
458	0.12
459	0.15
460	0.15
461	0.16
462	0.16
463	0.14
464	0.14
465	0.15
466	0.16
467	0.17
468	0.16
469	0.19
470	0.21
471	0.27
472	0.28
473	0.29
474	0.32
475	0.28
476	0.28
477	0.26
478	0.26
479	0.23
480	0.27
481	0.29
482	0.26
483	0.3
484	0.33
485	0.34
486	0.34
487	0.32
488	0.27
489	0.27
490	0.28
491	0.25
492	0.21
493	0.18
494	0.16
495	0.15
496	0.14
497	0.1
498	0.07
499	0.04
500	0.04
501	0.04
502	0.05
503	0.05
504	0.06
505	0.07
506	0.08
507	0.11
508	0.13
509	0.13
510	0.14
511	0.19
512	0.21
513	0.22
514	0.24
515	0.28
516	0.36
517	0.41
518	0.41
519	0.38
520	0.36
521	0.36
522	0.42
523	0.41
524	0.35
525	0.34
526	0.35
527	0.34
528	0.37
529	0.38
530	0.32
531	0.29
532	0.27
533	0.24
534	0.26
535	0.25
536	0.21
537	0.2
538	0.17
539	0.16
540	0.14
541	0.13
542	0.11
543	0.1
544	0.1
545	0.09
546	0.1
547	0.1
548	0.09
549	0.09
550	0.08
551	0.08
552	0.08
553	0.07
554	0.07
555	0.07
556	0.07
557	0.07
558	0.07
559	0.06
560	0.07
561	0.07
562	0.06
563	0.06
564	0.07
565	0.08
566	0.08
567	0.09
568	0.08
569	0.08
570	0.1
571	0.14
572	0.13
573	0.13
574	0.13
575	0.14
576	0.15
577	0.18
578	0.17
579	0.14
580	0.15
581	0.16
582	0.16
583	0.19
584	0.2
585	0.23
586	0.29
587	0.29
588	0.31
589	0.31
590	0.3
591	0.27
592	0.25
593	0.26
594	0.23
595	0.23

A0A1L9SVP1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer