Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9SWZ0

Protein Details
Accession A0A1L9SWZ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-38NPSNQSAKRRKGGDKWRKQQGNKATIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-29AKRRKGGDKWRK
Subcellular Location(s) cyto 7.5, cyto_nucl 7.5, nucl 6.5, mito 5, plas 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004114  THUMP_dom  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006400  P:tRNA modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF02926  THUMP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51165  THUMP  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MAAAGKRTMPGNPSNQSAKRRKGGDKWRKQQGNKATIESGDWGVFVTCDMGREQKCVAEVLDLFSQSVEDATGDVEGDDEFDADADDIEAQIKREMEELQPDSKKPKLFREIRLDIPCVTFIRFDKSIDPVKMVHDLCLDAHANPDRKRSRWVKRLNPVSSIRKTLSVDLSEFAKEILKPHFHSGGPPRKYAIRPSIRGKSKFDRDGVIKTVADAVGPEHPVDLKNYDLVILVDIIQNVIGMSVVGSDYDKLKRFNLAELYDPTPKLQAATVGKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.52
3 0.59
4 0.64
5 0.66
6 0.66
7 0.7
8 0.72
9 0.74
10 0.78
11 0.8
12 0.82
13 0.83
14 0.86
15 0.88
16 0.84
17 0.83
18 0.82
19 0.81
20 0.73
21 0.68
22 0.58
23 0.49
24 0.46
25 0.39
26 0.3
27 0.2
28 0.16
29 0.13
30 0.11
31 0.1
32 0.09
33 0.08
34 0.07
35 0.08
36 0.09
37 0.16
38 0.17
39 0.19
40 0.2
41 0.19
42 0.2
43 0.2
44 0.19
45 0.15
46 0.15
47 0.16
48 0.17
49 0.16
50 0.15
51 0.13
52 0.13
53 0.09
54 0.09
55 0.06
56 0.04
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.05
65 0.05
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.05
76 0.06
77 0.06
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.1
82 0.11
83 0.11
84 0.17
85 0.19
86 0.24
87 0.25
88 0.26
89 0.28
90 0.3
91 0.34
92 0.3
93 0.36
94 0.4
95 0.45
96 0.52
97 0.58
98 0.58
99 0.61
100 0.61
101 0.54
102 0.45
103 0.39
104 0.33
105 0.24
106 0.2
107 0.15
108 0.13
109 0.16
110 0.16
111 0.16
112 0.16
113 0.2
114 0.24
115 0.23
116 0.23
117 0.19
118 0.19
119 0.24
120 0.23
121 0.19
122 0.15
123 0.14
124 0.13
125 0.15
126 0.14
127 0.08
128 0.11
129 0.14
130 0.18
131 0.19
132 0.28
133 0.29
134 0.3
135 0.38
136 0.45
137 0.51
138 0.55
139 0.64
140 0.65
141 0.71
142 0.8
143 0.74
144 0.71
145 0.68
146 0.66
147 0.59
148 0.53
149 0.45
150 0.38
151 0.37
152 0.33
153 0.29
154 0.23
155 0.21
156 0.18
157 0.18
158 0.15
159 0.14
160 0.12
161 0.1
162 0.09
163 0.11
164 0.14
165 0.17
166 0.19
167 0.22
168 0.26
169 0.24
170 0.29
171 0.37
172 0.42
173 0.41
174 0.4
175 0.39
176 0.4
177 0.43
178 0.44
179 0.44
180 0.43
181 0.46
182 0.53
183 0.61
184 0.64
185 0.66
186 0.66
187 0.65
188 0.65
189 0.64
190 0.59
191 0.55
192 0.5
193 0.51
194 0.47
195 0.42
196 0.33
197 0.28
198 0.28
199 0.22
200 0.18
201 0.14
202 0.11
203 0.11
204 0.12
205 0.11
206 0.1
207 0.11
208 0.12
209 0.14
210 0.14
211 0.12
212 0.13
213 0.13
214 0.13
215 0.12
216 0.12
217 0.1
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.05
227 0.04
228 0.03
229 0.03
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.06
235 0.1
236 0.15
237 0.19
238 0.21
239 0.23
240 0.29
241 0.3
242 0.35
243 0.39
244 0.37
245 0.38
246 0.41
247 0.44
248 0.42
249 0.42
250 0.37
251 0.31
252 0.29
253 0.25
254 0.21
255 0.24