Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9SC50

Protein Details
Accession A0A1L9SC50    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-37VSPPAKKTKKVEAKSKEAAKDHydrophilic
61-82SSNLNGKPTRQVKPRKRAADFLHydrophilic
90-116AKAAPKSEPKPDKKKVKNSKKVEVVAEHydrophilic
165-192VPRIPDSKKAKRKILKKQKKSDEPDEPGBasic
279-307KGANRRFKKTPWNRIEKKRLEKGKTRDKWBasic
373-401PEEKAESTPKKAKKEKKAAKSPAAEKETPHydrophilic
415-435ASPAAKTGAKAKKTKKSKISAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-51KDNKRKAATATVSPPAKKTKKVEAKSKEAAKDAPKSILKKKPASAP
70-77RQVKPRKR
92-110AAPKSEPKPDKKKVKNSKK
171-184SKKAKRKILKKQKK
279-324KGANRRFKKTPWNRIEKKRLEKGKTRDKWSKSIDQEQKRRLAKAEK
381-406PKKAKKEKKAAKSPAAEKETPKSATK
416-434SPAAKTGAKAKKTKKSKIS
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPDKKDNKRKAATATVSPPAKKTKKVEAKSKEAAKDAPKSILKKKPASAPATDAKASASSSNLNGKPTRQVKPRKRAADFLSEDEDEEAKAAPKSEPKPDKKKVKNSKKVEVVAEESDDESEASVASEEDEAEDDQTTALIKGFESSGDEDASDDEGFDPDQPVPRIPDSKKAKRKILKKQKKSDEPDEPGTVYVGRIPHGFYEHQMRAYFSQFGDITRLRLSRNRITGRSKHYAFVEFSSVAVAKIVAETMDNYLMYGHILKCRFVPKEQLHPEIWKGANRRFKKTPWNRIEKKRLEKGKTRDKWSKSIDQEQKRRLAKAEKLKALGYEFEIPQLKSVDDVPMQDATEALEAPAETDKAIEAAPAVEATQPEEKAESTPKKAKKEKKAAKSPAAEKETPKSATKNTAAAESTASPAAKTGAKAKKTKKSKISA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.67
3 0.65
4 0.63
5 0.59
6 0.55
7 0.56
8 0.56
9 0.56
10 0.56
11 0.59
12 0.64
13 0.72
14 0.78
15 0.76
16 0.8
17 0.81
18 0.83
19 0.76
20 0.69
21 0.67
22 0.63
23 0.62
24 0.56
25 0.55
26 0.53
27 0.54
28 0.6
29 0.62
30 0.64
31 0.63
32 0.66
33 0.67
34 0.69
35 0.68
36 0.62
37 0.6
38 0.58
39 0.56
40 0.51
41 0.41
42 0.34
43 0.3
44 0.27
45 0.22
46 0.17
47 0.14
48 0.17
49 0.25
50 0.26
51 0.29
52 0.29
53 0.31
54 0.38
55 0.43
56 0.49
57 0.5
58 0.6
59 0.66
60 0.75
61 0.83
62 0.83
63 0.8
64 0.79
65 0.75
66 0.74
67 0.67
68 0.61
69 0.56
70 0.46
71 0.42
72 0.35
73 0.3
74 0.2
75 0.17
76 0.13
77 0.1
78 0.1
79 0.11
80 0.12
81 0.19
82 0.23
83 0.33
84 0.42
85 0.5
86 0.6
87 0.69
88 0.78
89 0.8
90 0.87
91 0.89
92 0.9
93 0.91
94 0.89
95 0.89
96 0.86
97 0.81
98 0.73
99 0.66
100 0.59
101 0.49
102 0.42
103 0.33
104 0.25
105 0.2
106 0.16
107 0.12
108 0.08
109 0.07
110 0.05
111 0.05
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.09
139 0.1
140 0.11
141 0.09
142 0.07
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.08
148 0.07
149 0.11
150 0.12
151 0.12
152 0.15
153 0.17
154 0.24
155 0.24
156 0.33
157 0.39
158 0.48
159 0.57
160 0.61
161 0.68
162 0.69
163 0.78
164 0.79
165 0.81
166 0.82
167 0.83
168 0.87
169 0.87
170 0.9
171 0.88
172 0.85
173 0.82
174 0.77
175 0.71
176 0.62
177 0.51
178 0.41
179 0.34
180 0.26
181 0.16
182 0.13
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.18
192 0.18
193 0.2
194 0.2
195 0.2
196 0.19
197 0.2
198 0.21
199 0.13
200 0.15
201 0.13
202 0.13
203 0.16
204 0.15
205 0.14
206 0.15
207 0.16
208 0.15
209 0.19
210 0.24
211 0.26
212 0.34
213 0.37
214 0.4
215 0.45
216 0.5
217 0.53
218 0.55
219 0.51
220 0.45
221 0.42
222 0.4
223 0.35
224 0.3
225 0.26
226 0.18
227 0.17
228 0.15
229 0.14
230 0.1
231 0.09
232 0.07
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.03
237 0.03
238 0.04
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.08
247 0.07
248 0.11
249 0.12
250 0.13
251 0.15
252 0.21
253 0.23
254 0.22
255 0.31
256 0.31
257 0.41
258 0.46
259 0.48
260 0.44
261 0.44
262 0.44
263 0.4
264 0.37
265 0.31
266 0.3
267 0.33
268 0.41
269 0.43
270 0.49
271 0.48
272 0.52
273 0.58
274 0.65
275 0.69
276 0.69
277 0.76
278 0.78
279 0.83
280 0.89
281 0.87
282 0.86
283 0.84
284 0.84
285 0.8
286 0.8
287 0.8
288 0.8
289 0.78
290 0.78
291 0.77
292 0.73
293 0.75
294 0.72
295 0.72
296 0.67
297 0.69
298 0.71
299 0.71
300 0.76
301 0.73
302 0.75
303 0.69
304 0.65
305 0.6
306 0.59
307 0.57
308 0.59
309 0.62
310 0.58
311 0.57
312 0.56
313 0.52
314 0.45
315 0.38
316 0.3
317 0.25
318 0.2
319 0.22
320 0.25
321 0.23
322 0.23
323 0.23
324 0.2
325 0.16
326 0.17
327 0.17
328 0.15
329 0.16
330 0.16
331 0.16
332 0.16
333 0.15
334 0.14
335 0.11
336 0.11
337 0.1
338 0.07
339 0.07
340 0.06
341 0.08
342 0.09
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.06
350 0.05
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.11
358 0.15
359 0.14
360 0.15
361 0.16
362 0.16
363 0.18
364 0.28
365 0.3
366 0.34
367 0.43
368 0.5
369 0.59
370 0.68
371 0.75
372 0.77
373 0.82
374 0.85
375 0.87
376 0.91
377 0.9
378 0.9
379 0.89
380 0.85
381 0.84
382 0.81
383 0.74
384 0.67
385 0.63
386 0.61
387 0.56
388 0.52
389 0.47
390 0.44
391 0.49
392 0.49
393 0.48
394 0.42
395 0.43
396 0.41
397 0.37
398 0.35
399 0.27
400 0.26
401 0.24
402 0.22
403 0.17
404 0.16
405 0.18
406 0.18
407 0.18
408 0.26
409 0.32
410 0.4
411 0.49
412 0.58
413 0.66
414 0.74
415 0.82