Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8BDF8

Protein Details
Accession G8BDF8    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-29MSEQARTRKQPSRKGKKAWRKNVDLNDIEHydrophilic
55-76TPNFTSKEYKTPKKLKTQEILTHydrophilic
268-299LSINKPTKIKIKTKTKRNRQTKHKERVKLEQEHydrophilic
325-353DEGKSRTKPSEKPRSLKRNKLHKYTPIETHydrophilic
387-416SGKIESRVPVHKKRKYAKKVTEKWTYKDFKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-21TRKQPSRKGKKAWRK
273-295PTKIKIKTKTKRNRQTKHKERVK
330-344RTKPSEKPRSLKRNK
397-405HKKRKYAKK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011687  Nop53/GLTSCR2  
Gene Ontology GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000460  P:maturation of 5.8S rRNA  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF07767  Nop53  
Amino Acid Sequences MSEQARTRKQPSRKGKKAWRKNVDLNDIEAKLQEVRDEEIVKGPSAQDDFVIDETPNFTSKEYKTPKKLKTQEILTNKSKVPALVNNRAKKNATIQGVKKTEMLRLLKLRGGKYKDESITMARIEQDGLVSGDSEDLWDDDSSTTTKHKAKIPDYGTSTAEVTPATVVPPTLRVKPIQVTKNDLTEKAVHAGKSYNPSLESWKELIDQEYGVEYQRELTRQSMEDHKLRIQELMVTLNDNMFSDGSDEEEEEKEEEDIIGENEKDYSLSINKPTKIKIKTKTKRNRQTKHKERVKLEQEIKDLKKQLKDLSNLDKILQKQQQEEDEGKSRTKPSEKPRSLKRNKLHKYTPIETPLELKLSDELTSNLKNLKPEGNLFYDQMLNLQSSGKIESRVPVHKKRKYAKKVTEKWTYKDFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.91
3 0.92
4 0.94
5 0.95
6 0.93
7 0.91
8 0.91
9 0.9
10 0.88
11 0.79
12 0.73
13 0.68
14 0.59
15 0.49
16 0.4
17 0.31
18 0.24
19 0.22
20 0.19
21 0.15
22 0.16
23 0.2
24 0.21
25 0.21
26 0.24
27 0.26
28 0.24
29 0.23
30 0.21
31 0.21
32 0.21
33 0.2
34 0.14
35 0.14
36 0.16
37 0.15
38 0.16
39 0.12
40 0.11
41 0.13
42 0.14
43 0.14
44 0.13
45 0.13
46 0.18
47 0.21
48 0.31
49 0.38
50 0.46
51 0.55
52 0.64
53 0.71
54 0.76
55 0.82
56 0.81
57 0.8
58 0.79
59 0.78
60 0.78
61 0.78
62 0.72
63 0.68
64 0.6
65 0.54
66 0.47
67 0.38
68 0.34
69 0.34
70 0.38
71 0.43
72 0.51
73 0.56
74 0.59
75 0.62
76 0.59
77 0.53
78 0.52
79 0.49
80 0.46
81 0.47
82 0.47
83 0.53
84 0.54
85 0.53
86 0.49
87 0.43
88 0.39
89 0.39
90 0.37
91 0.33
92 0.36
93 0.37
94 0.36
95 0.39
96 0.4
97 0.4
98 0.42
99 0.4
100 0.4
101 0.45
102 0.44
103 0.41
104 0.39
105 0.34
106 0.32
107 0.28
108 0.24
109 0.18
110 0.17
111 0.15
112 0.13
113 0.1
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.04
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.11
132 0.14
133 0.19
134 0.22
135 0.27
136 0.34
137 0.37
138 0.45
139 0.47
140 0.48
141 0.48
142 0.47
143 0.42
144 0.35
145 0.33
146 0.24
147 0.21
148 0.14
149 0.1
150 0.08
151 0.07
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.1
157 0.12
158 0.14
159 0.16
160 0.16
161 0.18
162 0.24
163 0.31
164 0.31
165 0.31
166 0.36
167 0.36
168 0.42
169 0.41
170 0.36
171 0.31
172 0.27
173 0.26
174 0.22
175 0.23
176 0.16
177 0.15
178 0.16
179 0.16
180 0.19
181 0.19
182 0.16
183 0.15
184 0.16
185 0.19
186 0.19
187 0.2
188 0.16
189 0.16
190 0.16
191 0.16
192 0.16
193 0.13
194 0.11
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.07
202 0.09
203 0.09
204 0.1
205 0.11
206 0.13
207 0.14
208 0.16
209 0.2
210 0.23
211 0.25
212 0.26
213 0.27
214 0.27
215 0.27
216 0.25
217 0.18
218 0.16
219 0.14
220 0.14
221 0.12
222 0.11
223 0.11
224 0.1
225 0.1
226 0.08
227 0.08
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.08
239 0.09
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.08
254 0.09
255 0.11
256 0.18
257 0.24
258 0.27
259 0.29
260 0.33
261 0.39
262 0.44
263 0.5
264 0.53
265 0.59
266 0.65
267 0.74
268 0.81
269 0.84
270 0.88
271 0.9
272 0.9
273 0.9
274 0.93
275 0.92
276 0.93
277 0.91
278 0.89
279 0.83
280 0.83
281 0.79
282 0.78
283 0.74
284 0.68
285 0.65
286 0.65
287 0.63
288 0.59
289 0.57
290 0.52
291 0.49
292 0.47
293 0.49
294 0.47
295 0.49
296 0.49
297 0.52
298 0.53
299 0.49
300 0.47
301 0.44
302 0.39
303 0.43
304 0.41
305 0.35
306 0.33
307 0.37
308 0.39
309 0.39
310 0.4
311 0.36
312 0.39
313 0.39
314 0.37
315 0.36
316 0.35
317 0.37
318 0.41
319 0.45
320 0.48
321 0.57
322 0.64
323 0.7
324 0.77
325 0.82
326 0.85
327 0.87
328 0.86
329 0.86
330 0.86
331 0.87
332 0.84
333 0.82
334 0.81
335 0.75
336 0.73
337 0.68
338 0.62
339 0.53
340 0.48
341 0.41
342 0.35
343 0.3
344 0.23
345 0.19
346 0.18
347 0.18
348 0.15
349 0.14
350 0.17
351 0.18
352 0.19
353 0.22
354 0.22
355 0.24
356 0.26
357 0.3
358 0.29
359 0.33
360 0.36
361 0.37
362 0.38
363 0.36
364 0.35
365 0.31
366 0.27
367 0.24
368 0.21
369 0.15
370 0.13
371 0.14
372 0.13
373 0.13
374 0.16
375 0.16
376 0.18
377 0.18
378 0.23
379 0.28
380 0.37
381 0.45
382 0.52
383 0.61
384 0.65
385 0.74
386 0.8
387 0.84
388 0.86
389 0.88
390 0.88
391 0.89
392 0.92
393 0.91
394 0.92
395 0.87
396 0.82