Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9SDP5

Protein Details
Accession A0A1L9SDP5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
154-178AFSLAKYTLRKRKKYMRRFTPIPLDHydrophilic
374-400STMKASKRNAFYRKRNRWARTRNVVDEHydrophilic
539-562IQAAGNQSRKRRKVSQKETTAPATHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12, cyto 7, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHSYIRPNDYVGVRLPSEGTRIIRPVPNTTVSLGKYGSFPANQIIGRPYHLTFEITETPDEDGNILRVVSAAELHAESLISDGSGEADGEGEELEMYGDGDAPMRTNREIVDDSSTQKMTLEEIEALKKEAGGAGREIIAKLLESHTALDQKTAFSLAKYTLRKRKKYMRRFTPIPLDVGFLTNYMLGEKDAAKIMELRDEAIGLIGCWGNVHHGGNTPIEDAMGSRPNSRYFVVDETGGLIVAAMAERMGILFSEDGDDEATSTVPEPSQHPANEDGQTEADQTEPGAEDSVPSRSPHQQPMSASGNTITLLHAHTRPNLSLLKYFGFDYDNPDESHPLFKHLKTVSWLQLVDPSTDPIYSNEPEEPSQETLSTMKASKRNAFYRKRNRWARTRNVVDEARAGGFDGLIVASLMEPATIMKYAVPLLTGSASVVAFSPTVEPLSELVDLYSTHRKTAFITQKRQIREQDEEDQVQGLAELEAEFIVDPSLLVAASVQTSRVRSWQVLPGRTHPLMSSRGGPEGYIFHAIRVLPAQDHIQAAGNQSRKRRKVSQKETTAPATTATDSGDANTDIQMRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.28
3 0.23
4 0.25
5 0.26
6 0.26
7 0.25
8 0.28
9 0.32
10 0.35
11 0.37
12 0.4
13 0.4
14 0.4
15 0.38
16 0.37
17 0.38
18 0.34
19 0.34
20 0.28
21 0.24
22 0.22
23 0.23
24 0.25
25 0.2
26 0.2
27 0.2
28 0.24
29 0.23
30 0.25
31 0.25
32 0.23
33 0.25
34 0.27
35 0.24
36 0.23
37 0.24
38 0.23
39 0.2
40 0.25
41 0.28
42 0.27
43 0.26
44 0.24
45 0.25
46 0.24
47 0.23
48 0.18
49 0.13
50 0.12
51 0.12
52 0.11
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.08
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.05
68 0.05
69 0.04
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.06
89 0.08
90 0.1
91 0.12
92 0.13
93 0.13
94 0.14
95 0.18
96 0.2
97 0.2
98 0.24
99 0.23
100 0.26
101 0.29
102 0.28
103 0.23
104 0.22
105 0.2
106 0.16
107 0.15
108 0.14
109 0.13
110 0.14
111 0.17
112 0.17
113 0.19
114 0.17
115 0.15
116 0.14
117 0.13
118 0.13
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.14
123 0.14
124 0.14
125 0.12
126 0.11
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.09
132 0.1
133 0.12
134 0.16
135 0.16
136 0.17
137 0.16
138 0.15
139 0.15
140 0.16
141 0.14
142 0.1
143 0.12
144 0.14
145 0.21
146 0.26
147 0.34
148 0.42
149 0.51
150 0.58
151 0.65
152 0.72
153 0.75
154 0.81
155 0.83
156 0.84
157 0.84
158 0.82
159 0.8
160 0.8
161 0.7
162 0.62
163 0.51
164 0.42
165 0.33
166 0.29
167 0.23
168 0.13
169 0.11
170 0.09
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.05
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.11
182 0.11
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.1
190 0.1
191 0.05
192 0.06
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.08
199 0.09
200 0.08
201 0.1
202 0.12
203 0.13
204 0.13
205 0.12
206 0.1
207 0.1
208 0.09
209 0.07
210 0.09
211 0.13
212 0.13
213 0.15
214 0.17
215 0.19
216 0.21
217 0.21
218 0.2
219 0.17
220 0.19
221 0.18
222 0.16
223 0.14
224 0.13
225 0.13
226 0.11
227 0.08
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.02
233 0.02
234 0.02
235 0.02
236 0.02
237 0.02
238 0.02
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.04
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.06
255 0.07
256 0.09
257 0.14
258 0.14
259 0.15
260 0.17
261 0.2
262 0.21
263 0.2
264 0.18
265 0.14
266 0.15
267 0.13
268 0.11
269 0.08
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.04
277 0.05
278 0.06
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.11
283 0.16
284 0.2
285 0.26
286 0.28
287 0.29
288 0.29
289 0.35
290 0.37
291 0.31
292 0.28
293 0.21
294 0.19
295 0.16
296 0.16
297 0.1
298 0.06
299 0.07
300 0.09
301 0.11
302 0.11
303 0.13
304 0.15
305 0.15
306 0.17
307 0.18
308 0.18
309 0.17
310 0.18
311 0.17
312 0.16
313 0.16
314 0.14
315 0.14
316 0.13
317 0.17
318 0.19
319 0.19
320 0.19
321 0.2
322 0.2
323 0.19
324 0.24
325 0.18
326 0.2
327 0.22
328 0.21
329 0.27
330 0.27
331 0.28
332 0.25
333 0.3
334 0.28
335 0.28
336 0.28
337 0.21
338 0.25
339 0.24
340 0.23
341 0.19
342 0.17
343 0.14
344 0.14
345 0.15
346 0.11
347 0.14
348 0.13
349 0.14
350 0.15
351 0.16
352 0.16
353 0.17
354 0.18
355 0.16
356 0.16
357 0.14
358 0.14
359 0.13
360 0.13
361 0.14
362 0.13
363 0.16
364 0.2
365 0.24
366 0.29
367 0.36
368 0.43
369 0.51
370 0.59
371 0.65
372 0.72
373 0.79
374 0.83
375 0.86
376 0.84
377 0.85
378 0.86
379 0.85
380 0.84
381 0.8
382 0.74
383 0.71
384 0.65
385 0.56
386 0.48
387 0.39
388 0.29
389 0.22
390 0.18
391 0.11
392 0.09
393 0.08
394 0.06
395 0.04
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.06
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.06
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.06
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.06
424 0.06
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.08
430 0.08
431 0.1
432 0.1
433 0.09
434 0.09
435 0.09
436 0.09
437 0.13
438 0.21
439 0.19
440 0.2
441 0.21
442 0.22
443 0.24
444 0.34
445 0.41
446 0.41
447 0.49
448 0.55
449 0.61
450 0.65
451 0.69
452 0.65
453 0.61
454 0.59
455 0.57
456 0.57
457 0.56
458 0.52
459 0.47
460 0.4
461 0.34
462 0.26
463 0.2
464 0.13
465 0.07
466 0.06
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.05
472 0.04
473 0.05
474 0.04
475 0.04
476 0.04
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.06
483 0.06
484 0.08
485 0.1
486 0.12
487 0.14
488 0.18
489 0.21
490 0.22
491 0.26
492 0.33
493 0.38
494 0.43
495 0.46
496 0.47
497 0.52
498 0.5
499 0.47
500 0.39
501 0.36
502 0.33
503 0.32
504 0.32
505 0.27
506 0.29
507 0.28
508 0.27
509 0.24
510 0.22
511 0.23
512 0.24
513 0.21
514 0.18
515 0.21
516 0.21
517 0.21
518 0.21
519 0.2
520 0.14
521 0.16
522 0.19
523 0.18
524 0.19
525 0.18
526 0.2
527 0.19
528 0.23
529 0.28
530 0.32
531 0.34
532 0.44
533 0.53
534 0.56
535 0.63
536 0.69
537 0.73
538 0.78
539 0.84
540 0.86
541 0.86
542 0.87
543 0.85
544 0.8
545 0.72
546 0.61
547 0.52
548 0.44
549 0.35
550 0.28
551 0.23
552 0.19
553 0.16
554 0.16
555 0.17
556 0.15
557 0.14
558 0.15