Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9SWU1

Protein Details
Accession A0A1L9SWU1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-73GVKRGRSPVRDGIKKRKKRNRWGDAQENKAABasic
270-294EDGGRIRRQDRYSRQRLRQGRKRSLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-63KRGRSPVRDGIKKRKKRNR
285-292RLRQGRKR
Subcellular Location(s) plas 14, nucl 5, mito 3, cyto 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045071  BBP-like  
IPR032570  SF1-HH  
IPR047086  SF1-HH_sf  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0045131  F:pre-mRNA branch point binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF16275  SF1-HH  
Amino Acid Sequences MSWRTQGMTGSNNIPLGRRRFAGDEPEDESRTATPASAAGDVGVKRGRSPVRDGIKKRKKRNRWGDAQENKAAGLMGLPTMIMANFTNEQLEAYTLHLRIEEISQKLRINDVVPADGDRSPSPPPQYDNFGRRVNTREFRYRKRLEDERHKLVEKAMKTIPNYHPPADYRRPTKTQEKVYVPVNDYPEINFSMITNPLTPNCLAFRPQMISGSRFWLTLLLLLLLLLLLILHTSLLYPFDQYRTRLTLSASCYLSQSWLTHRTSWQHSEEDGGRIRRQDRYSRQRLRQGRKRSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.32
3 0.33
4 0.34
5 0.32
6 0.33
7 0.35
8 0.38
9 0.44
10 0.41
11 0.39
12 0.4
13 0.43
14 0.41
15 0.37
16 0.35
17 0.26
18 0.23
19 0.2
20 0.15
21 0.11
22 0.11
23 0.13
24 0.12
25 0.11
26 0.1
27 0.14
28 0.13
29 0.16
30 0.18
31 0.16
32 0.16
33 0.23
34 0.27
35 0.26
36 0.33
37 0.39
38 0.46
39 0.56
40 0.63
41 0.67
42 0.74
43 0.8
44 0.85
45 0.87
46 0.87
47 0.89
48 0.92
49 0.91
50 0.91
51 0.91
52 0.91
53 0.88
54 0.84
55 0.77
56 0.66
57 0.55
58 0.44
59 0.35
60 0.23
61 0.15
62 0.09
63 0.05
64 0.05
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.05
70 0.05
71 0.07
72 0.08
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.08
78 0.09
79 0.07
80 0.09
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.13
88 0.15
89 0.14
90 0.16
91 0.19
92 0.2
93 0.21
94 0.21
95 0.19
96 0.16
97 0.17
98 0.15
99 0.14
100 0.13
101 0.13
102 0.13
103 0.13
104 0.14
105 0.11
106 0.12
107 0.14
108 0.16
109 0.19
110 0.19
111 0.21
112 0.22
113 0.28
114 0.31
115 0.33
116 0.35
117 0.36
118 0.35
119 0.34
120 0.37
121 0.37
122 0.38
123 0.39
124 0.43
125 0.46
126 0.52
127 0.6
128 0.6
129 0.57
130 0.59
131 0.62
132 0.6
133 0.65
134 0.66
135 0.63
136 0.62
137 0.58
138 0.51
139 0.46
140 0.43
141 0.32
142 0.29
143 0.25
144 0.25
145 0.25
146 0.32
147 0.33
148 0.36
149 0.38
150 0.35
151 0.34
152 0.33
153 0.4
154 0.4
155 0.42
156 0.38
157 0.41
158 0.45
159 0.48
160 0.55
161 0.55
162 0.55
163 0.57
164 0.57
165 0.54
166 0.55
167 0.54
168 0.48
169 0.44
170 0.39
171 0.31
172 0.27
173 0.25
174 0.21
175 0.18
176 0.15
177 0.12
178 0.09
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.1
184 0.11
185 0.13
186 0.12
187 0.12
188 0.13
189 0.13
190 0.14
191 0.15
192 0.17
193 0.18
194 0.19
195 0.22
196 0.22
197 0.23
198 0.22
199 0.25
200 0.23
201 0.2
202 0.19
203 0.16
204 0.14
205 0.13
206 0.12
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.05
212 0.05
213 0.03
214 0.02
215 0.02
216 0.02
217 0.02
218 0.02
219 0.02
220 0.03
221 0.03
222 0.05
223 0.06
224 0.08
225 0.09
226 0.14
227 0.18
228 0.19
229 0.24
230 0.26
231 0.28
232 0.28
233 0.29
234 0.3
235 0.31
236 0.36
237 0.33
238 0.29
239 0.29
240 0.27
241 0.26
242 0.23
243 0.2
244 0.2
245 0.25
246 0.28
247 0.3
248 0.34
249 0.39
250 0.44
251 0.48
252 0.47
253 0.42
254 0.4
255 0.43
256 0.41
257 0.4
258 0.4
259 0.39
260 0.37
261 0.4
262 0.43
263 0.45
264 0.49
265 0.54
266 0.58
267 0.64
268 0.73
269 0.77
270 0.83
271 0.86
272 0.9
273 0.9
274 0.89