Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8BAB5

Protein Details
Accession G8BAB5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-108YLQKEDLKKKHQKEKEHEREAKSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-100KKHQKEK
177-214KATSKATSKKSGKASGGKGSVGSSSGAIGKGKKLKKVG
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037802  SGF29  
IPR010750  SGF29_tudor-like_dom  
IPR047288  Tudor_SGF29_rpt1  
Gene Ontology GO:0140671  C:ADA complex  
GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0046695  C:SLIK (SAGA-like) complex  
GO:0035064  F:methylated histone binding  
GO:0016573  P:histone acetylation  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0008104  P:protein localization  
GO:0072742  P:SAGA complex localization to transcription regulatory region  
Pfam View protein in Pfam  
PF07039  DUF1325  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51518  SGF29_C  
CDD cd20393  Tudor_SGF29_rpt1  
Amino Acid Sequences MGSEVEGNWDIIITSLQDICTSNESLSFDSIHKLDRDQDESQYYKNLSSDELTKLKQDIIDHKSNIGTAKRLIDTSMENLSRLIEYLQKEDLKKKHQKEKEHEREAKSSTKKEDVDDGVDDYDDENDAEDDEEDEVPIASTKKRRASSASSKSGTPIPPIHHRRGTSESTKPTSTSKATSKATSKKSGKASGGKGSVGSSSGAIGKGKKLKKVGRSYWTSKYNPSEPIYIGSEVAFKLRNRINEWIQCEVVKIIGDGIKFEIRDPEPDENNNPGHTFRANYKEILLIPTEEAARDLINYAYGTKVLARYPDTTTYYSAIVVGHKKDGIVRLKFDGEEEVNKECEVERRFVLPLPSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.09
4 0.11
5 0.12
6 0.14
7 0.17
8 0.18
9 0.16
10 0.18
11 0.2
12 0.2
13 0.2
14 0.19
15 0.17
16 0.19
17 0.2
18 0.21
19 0.2
20 0.2
21 0.26
22 0.3
23 0.35
24 0.33
25 0.37
26 0.39
27 0.4
28 0.4
29 0.38
30 0.34
31 0.29
32 0.28
33 0.25
34 0.2
35 0.21
36 0.23
37 0.24
38 0.27
39 0.27
40 0.27
41 0.28
42 0.28
43 0.27
44 0.28
45 0.3
46 0.33
47 0.4
48 0.39
49 0.39
50 0.38
51 0.37
52 0.38
53 0.31
54 0.26
55 0.22
56 0.25
57 0.25
58 0.24
59 0.23
60 0.21
61 0.21
62 0.22
63 0.26
64 0.22
65 0.21
66 0.2
67 0.21
68 0.18
69 0.17
70 0.14
71 0.12
72 0.14
73 0.16
74 0.21
75 0.24
76 0.26
77 0.34
78 0.39
79 0.44
80 0.52
81 0.59
82 0.64
83 0.68
84 0.76
85 0.78
86 0.84
87 0.84
88 0.86
89 0.84
90 0.78
91 0.76
92 0.7
93 0.68
94 0.63
95 0.57
96 0.51
97 0.5
98 0.47
99 0.43
100 0.45
101 0.38
102 0.35
103 0.31
104 0.27
105 0.2
106 0.19
107 0.17
108 0.12
109 0.1
110 0.07
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.06
125 0.07
126 0.09
127 0.14
128 0.19
129 0.27
130 0.28
131 0.31
132 0.35
133 0.43
134 0.51
135 0.55
136 0.57
137 0.51
138 0.5
139 0.49
140 0.48
141 0.4
142 0.32
143 0.26
144 0.22
145 0.31
146 0.37
147 0.41
148 0.41
149 0.41
150 0.42
151 0.44
152 0.45
153 0.41
154 0.41
155 0.4
156 0.39
157 0.39
158 0.36
159 0.32
160 0.3
161 0.27
162 0.25
163 0.24
164 0.27
165 0.28
166 0.3
167 0.35
168 0.39
169 0.42
170 0.47
171 0.47
172 0.47
173 0.51
174 0.52
175 0.5
176 0.49
177 0.48
178 0.44
179 0.42
180 0.36
181 0.31
182 0.27
183 0.22
184 0.17
185 0.13
186 0.07
187 0.06
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.11
193 0.19
194 0.22
195 0.25
196 0.32
197 0.37
198 0.46
199 0.55
200 0.59
201 0.59
202 0.64
203 0.65
204 0.65
205 0.67
206 0.6
207 0.56
208 0.53
209 0.49
210 0.47
211 0.44
212 0.38
213 0.31
214 0.32
215 0.29
216 0.24
217 0.21
218 0.16
219 0.15
220 0.12
221 0.13
222 0.14
223 0.11
224 0.17
225 0.2
226 0.24
227 0.27
228 0.33
229 0.39
230 0.41
231 0.45
232 0.42
233 0.4
234 0.36
235 0.32
236 0.26
237 0.2
238 0.14
239 0.1
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.11
245 0.13
246 0.12
247 0.13
248 0.18
249 0.17
250 0.21
251 0.25
252 0.29
253 0.3
254 0.33
255 0.36
256 0.34
257 0.34
258 0.32
259 0.29
260 0.23
261 0.22
262 0.2
263 0.19
264 0.2
265 0.26
266 0.27
267 0.26
268 0.27
269 0.28
270 0.27
271 0.27
272 0.23
273 0.16
274 0.15
275 0.16
276 0.15
277 0.12
278 0.12
279 0.1
280 0.09
281 0.08
282 0.09
283 0.07
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.1
291 0.12
292 0.13
293 0.16
294 0.19
295 0.21
296 0.25
297 0.31
298 0.33
299 0.32
300 0.33
301 0.31
302 0.29
303 0.26
304 0.22
305 0.17
306 0.18
307 0.21
308 0.21
309 0.22
310 0.22
311 0.22
312 0.25
313 0.32
314 0.36
315 0.35
316 0.37
317 0.38
318 0.41
319 0.4
320 0.38
321 0.36
322 0.3
323 0.31
324 0.31
325 0.3
326 0.28
327 0.28
328 0.27
329 0.23
330 0.27
331 0.25
332 0.26
333 0.26
334 0.27
335 0.29
336 0.32