FuNGI

A0A1L9SMC6

Protein Details

Accession

A0A1L9SMC6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
75-102	EEWAISRRNERQRGRGMRQQQQQQKSNG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 8.5, mito 7, cyto 3.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MALPRTPQKTGRELQHLVDSLNDRFFLDLPNPLFSSPSMTEGKEKPPGLICYLGIKRLFYNRNVDHLHRVLDNFEEWAISRRNERQRGRGMRQQQQQQKSNGDRLMRPSRDDQDAHIRYLKKLIDDEIWLLNNGAFSPLAEDVESQGRRLAEQLLPRPPSKRRLSSDNEDEDEDEDGESSDFHTAPSSPVKHSCSPIRTLDFTRTAPAAIADEFLDSDLEEGNWNLNNGRTGQATQNDTLAVSTAPRQNPTRQTSTVSVGAGPTFWSEAGPSGRTSLLKKSFSTVATSFMSDTDTIPMNTSFANTTITEPDAGGDDDETDSQSVYEYLLASHAMELFDGVNGVNGMNPKGARMVAEANSIIDQKILDRLLTYGPFSVEQSFPRSIPLRHRYELERIGRAWKVPLKEMLVGDTISFQSHEDFWKWIERHSRRGNAGLPEKSSRKAWDAAVEQFKTDKHSEVVVLTGDLDWCSPSEPGILKLRLNPLRTERTCRFRRRFGADRFMSLTIPAPSRPPNHLRIESHPTLLRESIASWLTQNVHSCLGRKWRPFYVEEVKLKRKSNKGFAEPRFRVDFFAVDGVDFDQYSLRPMPAISPARQDCDRHTPMSLEALVNWHMPPEANRNQSNCKLFQRFSLGLSKTYATVVLKPAQILHLKDLPGRPVMNDGCALMSRSVANAICDHLGMTGNTPSCFQGRIAGAKGLWMVDRHESPLAGEDNDPFWIQITDSQLKIKPHPRDWTGPLDDEQLTFEVLNWSKPLHPVDLNVQLLAILEHGGPMKEYIAELTRRGIRELYQDFAAVLQADSSVLCRGLVQKLRPPGPDGAMMMAMRIKRLEQWMMDDAEYIIRLSEAGFSPRCFLPLRKRLRRFLQEALDRHVDELHIEVPLSTYAYCIADPYGVLQEDEVHFEFSSQWQDPHGQFEDNLLDGVDVLVGRLPAHLPSDIQRRRAVWKPELRHFKDVIVFPTKGNTPLAHLLSGGDYDGDTPWICWDQNIVSQFANCKPPPEEEEYGSQHFGLTNHSIPMDQIPSMDEFLRGTFAFNLTLSNLGRCTVEHEKLKYDESIDHSKAKELACLLSHLVDGRKGGVHLSEQAWKEYRRTISPRMREAPAYKNPERRPKMSNIIDYLKFRVARTERDAVLKQLNDAFPEKDIVHHKDEDLLRPYQEAIAMADEDRRHGGRLHDLLKEIAREIQKQQRAWTATFQGESKEYSSKAEQAVERVRAINPPPGDHPLCHTWQQSPAEWLKHLASATYARHWRSSFPFHAFGETLCQIKASQAPSRSVRNEILACYKVSQRMVQHLTATDQLEETPGGSDADDQVYEGEDAIEAMLVAGYEVGEEFDFDDGKSVE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.59
3	0.54
4	0.46
5	0.44
6	0.39
7	0.33
8	0.32
9	0.29
10	0.21
11	0.21
12	0.22
13	0.2
14	0.18
15	0.23
16	0.23
17	0.26
18	0.27
19	0.26
20	0.27
21	0.23
22	0.28
23	0.22
24	0.25
25	0.24
26	0.25
27	0.31
28	0.34
29	0.4
30	0.41
31	0.4
32	0.39
33	0.42
34	0.44
35	0.41
36	0.4
37	0.35
38	0.36
39	0.38
40	0.4
41	0.35
42	0.33
43	0.33
44	0.39
45	0.44
46	0.39
47	0.47
48	0.44
49	0.51
50	0.55
51	0.56
52	0.54
53	0.52
54	0.5
55	0.43
56	0.41
57	0.34
58	0.31
59	0.28
60	0.21
61	0.18
62	0.16
63	0.14
64	0.19
65	0.21
66	0.2
67	0.26
68	0.34
69	0.44
70	0.54
71	0.6
72	0.63
73	0.7
74	0.79
75	0.8
76	0.8
77	0.8
78	0.79
79	0.82
80	0.82
81	0.81
82	0.81
83	0.81
84	0.77
85	0.78
86	0.74
87	0.73
88	0.69
89	0.64
90	0.59
91	0.6
92	0.64
93	0.57
94	0.55
95	0.54
96	0.54
97	0.55
98	0.52
99	0.49
100	0.49
101	0.49
102	0.48
103	0.48
104	0.44
105	0.39
106	0.45
107	0.41
108	0.34
109	0.33
110	0.33
111	0.29
112	0.3
113	0.31
114	0.29
115	0.28
116	0.24
117	0.23
118	0.2
119	0.17
120	0.14
121	0.13
122	0.09
123	0.08
124	0.1
125	0.1
126	0.1
127	0.1
128	0.11
129	0.12
130	0.21
131	0.21
132	0.18
133	0.21
134	0.2
135	0.2
136	0.22
137	0.24
138	0.19
139	0.27
140	0.34
141	0.39
142	0.43
143	0.45
144	0.49
145	0.51
146	0.57
147	0.58
148	0.6
149	0.58
150	0.63
151	0.69
152	0.73
153	0.76
154	0.73
155	0.66
156	0.58
157	0.53
158	0.45
159	0.38
160	0.29
161	0.19
162	0.13
163	0.11
164	0.09
165	0.08
166	0.08
167	0.08
168	0.08
169	0.08
170	0.09
171	0.09
172	0.13
173	0.21
174	0.23
175	0.24
176	0.3
177	0.36
178	0.39
179	0.44
180	0.49
181	0.46
182	0.48
183	0.51
184	0.5
185	0.49
186	0.48
187	0.49
188	0.46
189	0.42
190	0.4
191	0.34
192	0.29
193	0.25
194	0.23
195	0.17
196	0.13
197	0.13
198	0.1
199	0.09
200	0.09
201	0.09
202	0.08
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.08
210	0.09
211	0.1
212	0.1
213	0.11
214	0.13
215	0.13
216	0.15
217	0.15
218	0.17
219	0.21
220	0.26
221	0.28
222	0.27
223	0.27
224	0.25
225	0.23
226	0.21
227	0.16
228	0.11
229	0.08
230	0.12
231	0.18
232	0.2
233	0.24
234	0.28
235	0.34
236	0.43
237	0.49
238	0.5
239	0.46
240	0.49
241	0.48
242	0.49
243	0.45
244	0.36
245	0.3
246	0.24
247	0.22
248	0.17
249	0.14
250	0.1
251	0.08
252	0.08
253	0.07
254	0.07
255	0.11
256	0.13
257	0.14
258	0.14
259	0.15
260	0.16
261	0.18
262	0.2
263	0.26
264	0.31
265	0.32
266	0.32
267	0.35
268	0.37
269	0.36
270	0.39
271	0.31
272	0.28
273	0.26
274	0.26
275	0.23
276	0.19
277	0.19
278	0.14
279	0.14
280	0.12
281	0.12
282	0.12
283	0.13
284	0.13
285	0.12
286	0.12
287	0.12
288	0.11
289	0.1
290	0.12
291	0.11
292	0.13
293	0.14
294	0.15
295	0.14
296	0.13
297	0.13
298	0.11
299	0.11
300	0.09
301	0.08
302	0.08
303	0.08
304	0.08
305	0.09
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.08
320	0.07
321	0.06
322	0.07
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.06
331	0.07
332	0.08
333	0.09
334	0.09
335	0.1
336	0.11
337	0.11
338	0.1
339	0.12
340	0.15
341	0.14
342	0.17
343	0.16
344	0.15
345	0.16
346	0.16
347	0.14
348	0.1
349	0.09
350	0.07
351	0.11
352	0.11
353	0.09
354	0.09
355	0.11
356	0.13
357	0.14
358	0.14
359	0.11
360	0.12
361	0.12
362	0.13
363	0.15
364	0.14
365	0.14
366	0.19
367	0.19
368	0.18
369	0.22
370	0.24
371	0.25
372	0.33
373	0.4
374	0.42
375	0.42
376	0.46
377	0.45
378	0.49
379	0.55
380	0.49
381	0.44
382	0.38
383	0.41
384	0.39
385	0.36
386	0.34
387	0.29
388	0.27
389	0.26
390	0.28
391	0.26
392	0.28
393	0.28
394	0.24
395	0.21
396	0.19
397	0.17
398	0.14
399	0.12
400	0.09
401	0.09
402	0.08
403	0.08
404	0.09
405	0.11
406	0.11
407	0.12
408	0.13
409	0.21
410	0.21
411	0.24
412	0.34
413	0.36
414	0.44
415	0.51
416	0.56
417	0.51
418	0.55
419	0.55
420	0.52
421	0.55
422	0.48
423	0.43
424	0.42
425	0.42
426	0.39
427	0.37
428	0.32
429	0.28
430	0.28
431	0.26
432	0.27
433	0.28
434	0.33
435	0.38
436	0.35
437	0.32
438	0.3
439	0.3
440	0.28
441	0.26
442	0.21
443	0.15
444	0.16
445	0.16
446	0.15
447	0.16
448	0.11
449	0.1
450	0.09
451	0.08
452	0.07
453	0.06
454	0.06
455	0.05
456	0.05
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.08
461	0.09
462	0.12
463	0.18
464	0.2
465	0.2
466	0.23
467	0.32
468	0.34
469	0.35
470	0.35
471	0.35
472	0.43
473	0.44
474	0.49
475	0.46
476	0.51
477	0.58
478	0.66
479	0.66
480	0.65
481	0.7
482	0.7
483	0.74
484	0.71
485	0.73
486	0.64
487	0.6
488	0.55
489	0.48
490	0.39
491	0.3
492	0.25
493	0.17
494	0.17
495	0.14
496	0.14
497	0.17
498	0.2
499	0.25
500	0.28
501	0.32
502	0.37
503	0.42
504	0.43
505	0.44
506	0.5
507	0.46
508	0.44
509	0.4
510	0.34
511	0.31
512	0.28
513	0.22
514	0.14
515	0.13
516	0.14
517	0.11
518	0.11
519	0.09
520	0.11
521	0.12
522	0.13
523	0.14
524	0.13
525	0.15
526	0.16
527	0.17
528	0.18
529	0.26
530	0.31
531	0.34
532	0.36
533	0.38
534	0.4
535	0.4
536	0.44
537	0.43
538	0.45
539	0.48
540	0.51
541	0.54
542	0.56
543	0.6
544	0.59
545	0.59
546	0.57
547	0.6
548	0.6
549	0.61
550	0.65
551	0.67
552	0.71
553	0.64
554	0.61
555	0.56
556	0.49
557	0.42
558	0.33
559	0.27
560	0.17
561	0.18
562	0.13
563	0.09
564	0.09
565	0.08
566	0.08
567	0.07
568	0.06
569	0.05
570	0.05
571	0.07
572	0.08
573	0.07
574	0.07
575	0.07
576	0.08
577	0.15
578	0.19
579	0.18
580	0.24
581	0.25
582	0.28
583	0.3
584	0.3
585	0.27
586	0.33
587	0.34
588	0.28
589	0.28
590	0.25
591	0.24
592	0.25
593	0.22
594	0.13
595	0.1
596	0.11
597	0.11
598	0.11
599	0.1
600	0.08
601	0.07
602	0.07
603	0.09
604	0.15
605	0.2
606	0.25
607	0.27
608	0.3
609	0.35
610	0.41
611	0.42
612	0.38
613	0.38
614	0.37
615	0.35
616	0.34
617	0.36
618	0.31
619	0.31
620	0.34
621	0.29
622	0.26
623	0.27
624	0.25
625	0.18
626	0.17
627	0.17
628	0.1
629	0.1
630	0.12
631	0.13
632	0.13
633	0.13
634	0.13
635	0.15
636	0.17
637	0.16
638	0.17
639	0.17
640	0.17
641	0.19
642	0.2
643	0.18
644	0.18
645	0.17
646	0.14
647	0.16
648	0.16
649	0.15
650	0.14
651	0.12
652	0.11
653	0.11
654	0.11
655	0.07
656	0.07
657	0.06
658	0.06
659	0.07
660	0.07
661	0.07
662	0.07
663	0.08
664	0.07
665	0.07
666	0.07
667	0.06
668	0.06
669	0.06
670	0.06
671	0.08
672	0.09
673	0.09
674	0.1
675	0.1
676	0.1
677	0.11
678	0.1
679	0.11
680	0.12
681	0.14
682	0.14
683	0.14
684	0.14
685	0.13
686	0.13
687	0.1
688	0.09
689	0.07
690	0.08
691	0.09
692	0.1
693	0.11
694	0.11
695	0.1
696	0.1
697	0.12
698	0.12
699	0.1
700	0.1
701	0.1
702	0.1
703	0.11
704	0.11
705	0.07
706	0.07
707	0.06
708	0.06
709	0.08
710	0.13
711	0.14
712	0.14
713	0.17
714	0.2
715	0.21
716	0.26
717	0.31
718	0.32
719	0.36
720	0.41
721	0.43
722	0.45
723	0.47
724	0.49
725	0.44
726	0.39
727	0.35
728	0.32
729	0.28
730	0.23
731	0.2
732	0.13
733	0.11
734	0.09
735	0.08
736	0.09
737	0.1
738	0.1
739	0.1
740	0.1
741	0.11
742	0.14
743	0.15
744	0.14
745	0.14
746	0.15
747	0.19
748	0.24
749	0.23
750	0.2
751	0.18
752	0.16
753	0.15
754	0.14
755	0.09
756	0.04
757	0.03
758	0.04
759	0.05
760	0.05
761	0.05
762	0.05
763	0.05
764	0.05
765	0.05
766	0.05
767	0.08
768	0.09
769	0.1
770	0.13
771	0.16
772	0.16
773	0.17
774	0.17
775	0.15
776	0.22
777	0.23
778	0.22
779	0.19
780	0.18
781	0.17
782	0.17
783	0.15
784	0.08
785	0.06
786	0.04
787	0.04
788	0.04
789	0.04
790	0.05
791	0.05
792	0.04
793	0.05
794	0.05
795	0.07
796	0.13
797	0.17
798	0.19
799	0.23
800	0.29
801	0.33
802	0.33
803	0.34
804	0.31
805	0.28
806	0.28
807	0.23
808	0.18
809	0.16
810	0.15
811	0.12
812	0.12
813	0.1
814	0.09
815	0.09
816	0.08
817	0.09
818	0.12
819	0.15
820	0.13
821	0.17
822	0.2
823	0.21
824	0.2
825	0.18
826	0.16
827	0.14
828	0.13
829	0.09
830	0.06
831	0.04
832	0.04
833	0.04
834	0.06
835	0.06
836	0.1
837	0.11
838	0.12
839	0.15
840	0.15
841	0.17
842	0.16
843	0.2
844	0.27
845	0.35
846	0.46
847	0.53
848	0.6
849	0.66
850	0.73
851	0.76
852	0.71
853	0.69
854	0.67
855	0.64
856	0.6
857	0.58
858	0.52
859	0.44
860	0.38
861	0.32
862	0.23
863	0.16
864	0.15
865	0.1
866	0.07
867	0.07
868	0.06
869	0.06
870	0.07
871	0.07
872	0.06
873	0.05
874	0.06
875	0.07
876	0.07
877	0.07
878	0.07
879	0.06
880	0.06
881	0.08
882	0.09
883	0.08
884	0.08
885	0.08
886	0.1
887	0.1
888	0.13
889	0.13
890	0.11
891	0.11
892	0.11
893	0.12
894	0.11
895	0.16
896	0.13
897	0.13
898	0.13
899	0.18
900	0.18
901	0.23
902	0.23
903	0.19
904	0.18
905	0.2
906	0.2
907	0.16
908	0.15
909	0.1
910	0.08
911	0.07
912	0.07
913	0.05
914	0.04
915	0.03
916	0.04
917	0.04
918	0.04
919	0.05
920	0.05
921	0.06
922	0.08
923	0.08
924	0.08
925	0.13
926	0.24
927	0.27
928	0.3
929	0.32
930	0.33
931	0.39
932	0.46
933	0.48
934	0.47
935	0.52
936	0.56
937	0.62
938	0.71
939	0.7
940	0.68
941	0.62
942	0.55
943	0.52
944	0.48
945	0.43
946	0.38
947	0.34
948	0.28
949	0.3
950	0.28
951	0.24
952	0.23
953	0.19
954	0.17
955	0.22
956	0.23
957	0.2
958	0.19
959	0.17
960	0.16
961	0.16
962	0.12
963	0.06
964	0.05
965	0.06
966	0.06
967	0.06
968	0.06
969	0.06
970	0.08
971	0.1
972	0.1
973	0.09
974	0.11
975	0.12
976	0.16
977	0.18
978	0.18
979	0.16
980	0.17
981	0.2
982	0.22
983	0.28
984	0.23
985	0.25
986	0.25
987	0.29
988	0.32
989	0.37
990	0.37
991	0.31
992	0.37
993	0.38
994	0.39
995	0.35
996	0.31
997	0.23
998	0.22
999	0.19
1000	0.17
1001	0.16
1002	0.15
1003	0.16
1004	0.16
1005	0.16
1006	0.15
1007	0.17
1008	0.15
1009	0.11
1010	0.1
1011	0.11
1012	0.12
1013	0.13
1014	0.13
1015	0.11
1016	0.1
1017	0.1
1018	0.12
1019	0.11
1020	0.11
1021	0.1
1022	0.11
1023	0.11
1024	0.11
1025	0.12
1026	0.1
1027	0.13
1028	0.12
1029	0.13
1030	0.12
1031	0.12
1032	0.12
1033	0.11
1034	0.18
1035	0.21
1036	0.27
1037	0.31
1038	0.33
1039	0.37
1040	0.39
1041	0.41
1042	0.35
1043	0.31
1044	0.28
1045	0.29
1046	0.35
1047	0.33
1048	0.35
1049	0.33
1050	0.35
1051	0.37
1052	0.33
1053	0.29
1054	0.23
1055	0.22
1056	0.19
1057	0.2
1058	0.19
1059	0.15
1060	0.15
1061	0.15
1062	0.15
1063	0.14
1064	0.13
1065	0.13
1066	0.13
1067	0.12
1068	0.13
1069	0.12
1070	0.12
1071	0.15
1072	0.17
1073	0.22
1074	0.22
1075	0.25
1076	0.29
1077	0.29
1078	0.3
1079	0.33
1080	0.35
1081	0.36
1082	0.42
1083	0.49
1084	0.54
1085	0.61
1086	0.67
1087	0.66
1088	0.65
1089	0.62
1090	0.6
1091	0.59
1092	0.58
1093	0.59
1094	0.57
1095	0.61
1096	0.66
1097	0.72
1098	0.73
1099	0.69
1100	0.66
1101	0.65
1102	0.69
1103	0.67
1104	0.65
1105	0.6
1106	0.6
1107	0.6
1108	0.56
1109	0.52
1110	0.47
1111	0.41
1112	0.35
1113	0.39
1114	0.36
1115	0.38
1116	0.42
1117	0.45
1118	0.41
1119	0.46
1120	0.48
1121	0.42
1122	0.45
1123	0.39
1124	0.34
1125	0.34
1126	0.32
1127	0.29
1128	0.3
1129	0.27
1130	0.21
1131	0.24
1132	0.22
1133	0.22
1134	0.28
1135	0.3
1136	0.32
1137	0.33
1138	0.32
1139	0.36
1140	0.39
1141	0.4
1142	0.38
1143	0.35
1144	0.31
1145	0.3
1146	0.31
1147	0.24
1148	0.22
1149	0.16
1150	0.13
1151	0.12
1152	0.12
1153	0.12
1154	0.15
1155	0.15
1156	0.15
1157	0.18
1158	0.18
1159	0.17
1160	0.19
1161	0.22
1162	0.27
1163	0.33
1164	0.36
1165	0.36
1166	0.36
1167	0.37
1168	0.37
1169	0.35
1170	0.28
1171	0.27
1172	0.26
1173	0.26
1174	0.32
1175	0.39
1176	0.43
1177	0.44
1178	0.47
1179	0.5
1180	0.5
1181	0.49
1182	0.49
1183	0.45
1184	0.41
1185	0.41
1186	0.38
1187	0.32
1188	0.3
1189	0.29
1190	0.26
1191	0.25
1192	0.22
1193	0.24
1194	0.26
1195	0.28
1196	0.29
1197	0.32
1198	0.31
1199	0.34
1200	0.41
1201	0.4
1202	0.39
1203	0.37
1204	0.35
1205	0.35
1206	0.36
1207	0.36
1208	0.31
1209	0.31
1210	0.33
1211	0.38
1212	0.4
1213	0.35
1214	0.38
1215	0.37
1216	0.39
1217	0.41
1218	0.4
1219	0.35
1220	0.4
1221	0.44
1222	0.4
1223	0.41
1224	0.43
1225	0.41
1226	0.4
1227	0.4
1228	0.34
1229	0.33
1230	0.3
1231	0.23
1232	0.21
1233	0.23
1234	0.25
1235	0.3
1236	0.34
1237	0.34
1238	0.39
1239	0.4
1240	0.42
1241	0.44
1242	0.5
1243	0.48
1244	0.48
1245	0.52
1246	0.47
1247	0.5
1248	0.45
1249	0.38
1250	0.36
1251	0.32
1252	0.27
1253	0.21
1254	0.21
1255	0.17
1256	0.19
1257	0.24
1258	0.22
1259	0.27
1260	0.3
1261	0.36
1262	0.41
1263	0.49
1264	0.49
1265	0.5
1266	0.48
1267	0.48
1268	0.46
1269	0.43
1270	0.45
1271	0.39
1272	0.37
1273	0.35
1274	0.36
1275	0.35
1276	0.35
1277	0.36
1278	0.33
1279	0.41
1280	0.45
1281	0.44
1282	0.43
1283	0.39
1284	0.4
1285	0.39
1286	0.36
1287	0.27
1288	0.23
1289	0.2
1290	0.19
1291	0.17
1292	0.15
1293	0.11
1294	0.1
1295	0.1
1296	0.1
1297	0.11
1298	0.11
1299	0.13
1300	0.13
1301	0.12
1302	0.11
1303	0.12
1304	0.12
1305	0.11
1306	0.09
1307	0.07
1308	0.07
1309	0.07
1310	0.06
1311	0.04
1312	0.04
1313	0.04
1314	0.04
1315	0.04
1316	0.04
1317	0.03
1318	0.04
1319	0.04
1320	0.05
1321	0.05
1322	0.05
1323	0.06
1324	0.07
1325	0.08
1326	0.08

A0A1L9SMC6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer