FuNGI

G8BDV6

Protein Details

Accession

G8BDV6

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
41-60	RTVIEIPKSKKRKQAEQEGD	Hydrophilic
92-111	EEEKVIKKAKKKDENDNLEA	Acidic
348-368	TSGNKKARKLRISRAKANVKP	Hydrophilic
438-470	AGIKGLKSGKVKKPRIRDRSTKFKNEREAMKKE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
49-52	SKKR
352-363	KKARKLRISRAK
413-473	ADRSRVGKPKKVIIEGERATKGQKIAGIKGLKSGKVKKPRIRDRSTKFKNEREAMKKEVKR

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0030684 C:preribosome GO:0019843 F:rRNA binding GO:0000463 P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MTGFSSLFGKSTEKYDQSVSELFKNSADGPISKNQLIDKKRTVIEIPKSKKRKQAEQEGDASEEDAESRVSEESEGSEGSGEEESNEDEEIEEEKVIKKAKKKDENDNLEAKYFEKVMRADEKDEEEGDVDDDSKIEQLANKDSSSVEKETKKTKSAQTIDFKEAELEKAERTAFVGNVPSDVITSKTVAKNFKKLFKQFGKIDSIRFRSISFDENLPRKVSFAKKSLHNSRDSVNAYVVFVEKSSSLAAKKLNAIVFENHHLRVDHVAHPAPKDNKRTIFVGNLDFEEKEESLWNYFNNKLDNDVESVRIIRDSKTNMGKGFALVQFNDTLTVNRALMLNDKPMDVTSGNKKARKLRISRAKANVKPSLMSPNHIENAKKAYASNKSREQQQGLTDTQRTKLGRAQTILGKADRSRVGKPKKVIIEGERATKGQKIAGIKGLKSGKVKKPRIRDRSTKFKNEREAMKKEVKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.32
3	0.33
4	0.35
5	0.39
6	0.36
7	0.35
8	0.36
9	0.34
10	0.31
11	0.32
12	0.28
13	0.27
14	0.26
15	0.22
16	0.23
17	0.3
18	0.34
19	0.33
20	0.34
21	0.35
22	0.41
23	0.45
24	0.48
25	0.48
26	0.49
27	0.5
28	0.52
29	0.51
30	0.51
31	0.57
32	0.59
33	0.61
34	0.65
35	0.72
36	0.75
37	0.79
38	0.78
39	0.78
40	0.78
41	0.8
42	0.8
43	0.78
44	0.78
45	0.72
46	0.65
47	0.54
48	0.45
49	0.33
50	0.23
51	0.17
52	0.1
53	0.08
54	0.06
55	0.07
56	0.07
57	0.08
58	0.08
59	0.08
60	0.09
61	0.11
62	0.1
63	0.09
64	0.09
65	0.09
66	0.1
67	0.1
68	0.08
69	0.07
70	0.08
71	0.09
72	0.09
73	0.09
74	0.08
75	0.07
76	0.08
77	0.09
78	0.09
79	0.08
80	0.09
81	0.11
82	0.14
83	0.2
84	0.24
85	0.3
86	0.39
87	0.5
88	0.59
89	0.64
90	0.71
91	0.76
92	0.81
93	0.79
94	0.76
95	0.67
96	0.58
97	0.52
98	0.41
99	0.32
100	0.25
101	0.2
102	0.17
103	0.16
104	0.2
105	0.27
106	0.29
107	0.3
108	0.31
109	0.34
110	0.32
111	0.31
112	0.27
113	0.19
114	0.17
115	0.15
116	0.12
117	0.09
118	0.07
119	0.07
120	0.07
121	0.06
122	0.06
123	0.06
124	0.08
125	0.1
126	0.16
127	0.18
128	0.17
129	0.18
130	0.18
131	0.21
132	0.22
133	0.23
134	0.24
135	0.27
136	0.31
137	0.38
138	0.41
139	0.42
140	0.44
141	0.47
142	0.51
143	0.52
144	0.56
145	0.58
146	0.58
147	0.58
148	0.53
149	0.47
150	0.39
151	0.34
152	0.26
153	0.2
154	0.16
155	0.12
156	0.13
157	0.13
158	0.11
159	0.12
160	0.12
161	0.1
162	0.1
163	0.12
164	0.1
165	0.11
166	0.11
167	0.1
168	0.09
169	0.09
170	0.09
171	0.07
172	0.08
173	0.12
174	0.15
175	0.19
176	0.26
177	0.29
178	0.37
179	0.4
180	0.47
181	0.51
182	0.52
183	0.58
184	0.56
185	0.61
186	0.55
187	0.55
188	0.55
189	0.48
190	0.5
191	0.47
192	0.44
193	0.38
194	0.36
195	0.32
196	0.26
197	0.27
198	0.25
199	0.2
200	0.19
201	0.22
202	0.25
203	0.26
204	0.25
205	0.23
206	0.21
207	0.24
208	0.27
209	0.26
210	0.29
211	0.32
212	0.37
213	0.45
214	0.53
215	0.53
216	0.5
217	0.46
218	0.42
219	0.44
220	0.4
221	0.33
222	0.24
223	0.2
224	0.17
225	0.16
226	0.15
227	0.09
228	0.07
229	0.06
230	0.05
231	0.06
232	0.06
233	0.07
234	0.07
235	0.09
236	0.1
237	0.11
238	0.13
239	0.15
240	0.16
241	0.15
242	0.17
243	0.16
244	0.17
245	0.2
246	0.21
247	0.18
248	0.18
249	0.17
250	0.16
251	0.18
252	0.19
253	0.18
254	0.19
255	0.21
256	0.21
257	0.22
258	0.28
259	0.31
260	0.33
261	0.36
262	0.38
263	0.39
264	0.4
265	0.41
266	0.37
267	0.35
268	0.32
269	0.29
270	0.25
271	0.22
272	0.21
273	0.19
274	0.17
275	0.15
276	0.12
277	0.1
278	0.1
279	0.1
280	0.1
281	0.11
282	0.12
283	0.13
284	0.15
285	0.17
286	0.18
287	0.18
288	0.19
289	0.2
290	0.2
291	0.2
292	0.18
293	0.17
294	0.15
295	0.15
296	0.12
297	0.13
298	0.13
299	0.11
300	0.15
301	0.17
302	0.23
303	0.29
304	0.31
305	0.3
306	0.31
307	0.3
308	0.27
309	0.28
310	0.24
311	0.19
312	0.16
313	0.17
314	0.16
315	0.16
316	0.16
317	0.12
318	0.1
319	0.11
320	0.13
321	0.11
322	0.12
323	0.12
324	0.11
325	0.15
326	0.16
327	0.18
328	0.17
329	0.17
330	0.16
331	0.16
332	0.18
333	0.14
334	0.17
335	0.21
336	0.3
337	0.36
338	0.39
339	0.44
340	0.5
341	0.59
342	0.64
343	0.64
344	0.65
345	0.7
346	0.75
347	0.79
348	0.81
349	0.82
350	0.77
351	0.77
352	0.72
353	0.63
354	0.55
355	0.48
356	0.48
357	0.39
358	0.37
359	0.33
360	0.33
361	0.35
362	0.36
363	0.35
364	0.28
365	0.33
366	0.32
367	0.29
368	0.24
369	0.27
370	0.35
371	0.41
372	0.46
373	0.49
374	0.51
375	0.58
376	0.64
377	0.62
378	0.56
379	0.54
380	0.52
381	0.46
382	0.48
383	0.45
384	0.4
385	0.38
386	0.4
387	0.36
388	0.33
389	0.34
390	0.37
391	0.38
392	0.38
393	0.41
394	0.4
395	0.44
396	0.45
397	0.41
398	0.37
399	0.32
400	0.36
401	0.38
402	0.36
403	0.39
404	0.45
405	0.54
406	0.58
407	0.62
408	0.65
409	0.65
410	0.67
411	0.66
412	0.62
413	0.62
414	0.58
415	0.6
416	0.53
417	0.47
418	0.43
419	0.4
420	0.35
421	0.28
422	0.28
423	0.26
424	0.27
425	0.35
426	0.38
427	0.34
428	0.41
429	0.43
430	0.44
431	0.48
432	0.53
433	0.55
434	0.61
435	0.72
436	0.72
437	0.79
438	0.85
439	0.88
440	0.88
441	0.89
442	0.87
443	0.88
444	0.89
445	0.89
446	0.87
447	0.86
448	0.86
449	0.84
450	0.85
451	0.82
452	0.79
453	0.76

G8BDV6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer