FuNGI

A0A1L9SS27

Protein Details

Accession

A0A1L9SS27

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
393-415	EAEAEYRRKKRQEKKDARNESGG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
399-425	RRKKRQEKKDARNESGGASKTRKGHPG
474-497	GGNSRGGRGRGKGSDRGRGNRGRG

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MSDQQVSGHSHGTPDELTEPPMKRPCAIDTPPISATPADSGSDFYNTPWPAGTPSNNEPSDMVAETQTARQSVTSQPASVIPGLNLVNDGLKNLQSEEGKEAMVTDTSDHTAQTVELQAESTDVPVVGQPEDAQQQSNEPDSTGLDAMEVDNSVAPAAGEGNSIEAVNGHAEDVNEGEEEEDEHPEWEVDSSPYESSSDDSSTDSSDDDSDDDDEDYPILSPEEQARILMQAEMGSDDEGDGKGKSGAHLKTANEMPEEVLPIPDMEITAEMKVVLLGHVEAIVDNAVLVMGSTSGEYQVLETGSLLCSEDRKVIGVVSETLGRVEQPLYALRYATTADIEQYGLTKEKAVYYVEQHSTFVFTQPLKGIKGSDASNFHDEEIAEDEIEFSDDEAEAEYRRKKRQEKKDARNESGGASKTRKGHPGPSKLGQTELNYDDEGGEDGYTPLARPKNLHEIMGRQEAPVEGNDHGARGGNSRGGRGRGKGSDRGRGNRGRGGNAPNSQHDRQSHHQRTTSSYHPQQQYQQPQPQPQPQYQHQHQHQHHSTYHHQPQPPAAEPQSTPSSNYSQPAYYQGQQTPYALPQQFPQFTGYPQHQQQPPQPYAQAQVPAQFNFQMPYQQQHFQQMQNPYQNLASAAQINPAFLAVLQQQQQQQQQQQQQQHQPQQPPPPPQTQNTLSFEQVKAQLDLLRQLSNANQAPRQN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.18
3	0.17
4	0.2
5	0.26
6	0.28
7	0.33
8	0.4
9	0.39
10	0.38
11	0.4
12	0.43
13	0.45
14	0.48
15	0.49
16	0.46
17	0.5
18	0.49
19	0.46
20	0.42
21	0.32
22	0.3
23	0.23
24	0.21
25	0.16
26	0.15
27	0.16
28	0.16
29	0.19
30	0.17
31	0.16
32	0.22
33	0.21
34	0.21
35	0.2
36	0.19
37	0.21
38	0.26
39	0.29
40	0.28
41	0.33
42	0.42
43	0.41
44	0.41
45	0.38
46	0.35
47	0.34
48	0.27
49	0.23
50	0.14
51	0.16
52	0.16
53	0.19
54	0.18
55	0.15
56	0.15
57	0.14
58	0.16
59	0.2
60	0.27
61	0.26
62	0.25
63	0.25
64	0.27
65	0.29
66	0.27
67	0.23
68	0.15
69	0.17
70	0.17
71	0.16
72	0.14
73	0.12
74	0.13
75	0.12
76	0.13
77	0.11
78	0.12
79	0.13
80	0.13
81	0.18
82	0.16
83	0.19
84	0.21
85	0.21
86	0.19
87	0.18
88	0.18
89	0.15
90	0.14
91	0.12
92	0.1
93	0.11
94	0.13
95	0.13
96	0.12
97	0.11
98	0.11
99	0.11
100	0.12
101	0.12
102	0.11
103	0.1
104	0.11
105	0.11
106	0.11
107	0.11
108	0.1
109	0.07
110	0.07
111	0.07
112	0.07
113	0.09
114	0.08
115	0.08
116	0.08
117	0.11
118	0.14
119	0.15
120	0.15
121	0.14
122	0.16
123	0.19
124	0.21
125	0.19
126	0.16
127	0.16
128	0.15
129	0.17
130	0.14
131	0.12
132	0.08
133	0.08
134	0.08
135	0.08
136	0.07
137	0.06
138	0.05
139	0.05
140	0.05
141	0.05
142	0.04
143	0.04
144	0.05
145	0.05
146	0.05
147	0.05
148	0.06
149	0.06
150	0.07
151	0.06
152	0.05
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.06
158	0.07
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.07
163	0.07
164	0.07
165	0.06
166	0.08
167	0.08
168	0.1
169	0.09
170	0.09
171	0.1
172	0.09
173	0.1
174	0.08
175	0.09
176	0.08
177	0.09
178	0.1
179	0.1
180	0.11
181	0.11
182	0.11
183	0.11
184	0.13
185	0.12
186	0.11
187	0.12
188	0.12
189	0.12
190	0.12
191	0.11
192	0.1
193	0.09
194	0.09
195	0.08
196	0.09
197	0.08
198	0.09
199	0.09
200	0.09
201	0.09
202	0.08
203	0.08
204	0.07
205	0.07
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.08
210	0.11
211	0.11
212	0.11
213	0.11
214	0.11
215	0.12
216	0.11
217	0.09
218	0.06
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.06
223	0.05
224	0.05
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.07
231	0.08
232	0.09
233	0.15
234	0.15
235	0.19
236	0.23
237	0.23
238	0.26
239	0.28
240	0.28
241	0.22
242	0.22
243	0.19
244	0.15
245	0.17
246	0.12
247	0.1
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.07
252	0.06
253	0.04
254	0.05
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.03
266	0.04
267	0.04
268	0.03
269	0.04
270	0.04
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.02
275	0.02
276	0.02
277	0.02
278	0.02
279	0.02
280	0.03
281	0.03
282	0.03
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.06
293	0.06
294	0.05
295	0.06
296	0.07
297	0.08
298	0.08
299	0.09
300	0.09
301	0.08
302	0.09
303	0.09
304	0.08
305	0.07
306	0.08
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.07
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.08
316	0.09
317	0.09
318	0.1
319	0.09
320	0.09
321	0.1
322	0.09
323	0.08
324	0.06
325	0.06
326	0.07
327	0.07
328	0.06
329	0.06
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.08
336	0.09
337	0.1
338	0.1
339	0.12
340	0.17
341	0.18
342	0.18
343	0.18
344	0.17
345	0.18
346	0.17
347	0.16
348	0.13
349	0.11
350	0.12
351	0.13
352	0.15
353	0.13
354	0.14
355	0.13
356	0.11
357	0.14
358	0.14
359	0.16
360	0.17
361	0.19
362	0.2
363	0.2
364	0.19
365	0.17
366	0.16
367	0.14
368	0.14
369	0.11
370	0.09
371	0.08
372	0.09
373	0.07
374	0.08
375	0.07
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.09
384	0.15
385	0.19
386	0.25
387	0.33
388	0.42
389	0.52
390	0.63
391	0.71
392	0.76
393	0.83
394	0.88
395	0.89
396	0.83
397	0.76
398	0.66
399	0.56
400	0.5
401	0.41
402	0.33
403	0.27
404	0.27
405	0.28
406	0.3
407	0.35
408	0.32
409	0.39
410	0.45
411	0.51
412	0.53
413	0.53
414	0.55
415	0.49
416	0.49
417	0.42
418	0.35
419	0.3
420	0.26
421	0.23
422	0.18
423	0.18
424	0.15
425	0.13
426	0.12
427	0.08
428	0.06
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.09
435	0.11
436	0.12
437	0.13
438	0.18
439	0.28
440	0.29
441	0.31
442	0.28
443	0.3
444	0.34
445	0.39
446	0.35
447	0.24
448	0.24
449	0.21
450	0.21
451	0.18
452	0.15
453	0.09
454	0.12
455	0.12
456	0.12
457	0.11
458	0.12
459	0.11
460	0.11
461	0.12
462	0.13
463	0.14
464	0.16
465	0.19
466	0.23
467	0.25
468	0.26
469	0.3
470	0.31
471	0.35
472	0.41
473	0.42
474	0.46
475	0.5
476	0.53
477	0.55
478	0.55
479	0.55
480	0.52
481	0.51
482	0.46
483	0.45
484	0.45
485	0.44
486	0.43
487	0.42
488	0.41
489	0.46
490	0.43
491	0.44
492	0.42
493	0.42
494	0.46
495	0.54
496	0.57
497	0.56
498	0.59
499	0.55
500	0.57
501	0.55
502	0.53
503	0.5
504	0.49
505	0.51
506	0.51
507	0.52
508	0.54
509	0.58
510	0.61
511	0.61
512	0.64
513	0.6
514	0.65
515	0.68
516	0.69
517	0.65
518	0.61
519	0.6
520	0.59
521	0.63
522	0.62
523	0.65
524	0.65
525	0.7
526	0.68
527	0.71
528	0.69
529	0.65
530	0.62
531	0.58
532	0.58
533	0.57
534	0.63
535	0.59
536	0.57
537	0.52
538	0.55
539	0.54
540	0.51
541	0.46
542	0.39
543	0.35
544	0.33
545	0.36
546	0.37
547	0.31
548	0.3
549	0.28
550	0.31
551	0.29
552	0.31
553	0.28
554	0.23
555	0.24
556	0.28
557	0.29
558	0.28
559	0.31
560	0.32
561	0.33
562	0.34
563	0.34
564	0.3
565	0.28
566	0.32
567	0.28
568	0.26
569	0.26
570	0.33
571	0.33
572	0.32
573	0.34
574	0.27
575	0.28
576	0.33
577	0.33
578	0.33
579	0.35
580	0.42
581	0.42
582	0.46
583	0.52
584	0.55
585	0.53
586	0.5
587	0.48
588	0.42
589	0.42
590	0.4
591	0.37
592	0.29
593	0.33
594	0.32
595	0.31
596	0.31
597	0.29
598	0.25
599	0.22
600	0.22
601	0.22
602	0.2
603	0.26
604	0.29
605	0.32
606	0.34
607	0.4
608	0.43
609	0.41
610	0.46
611	0.47
612	0.51
613	0.54
614	0.53
615	0.46
616	0.43
617	0.39
618	0.34
619	0.27
620	0.22
621	0.17
622	0.17
623	0.2
624	0.2
625	0.19
626	0.17
627	0.16
628	0.14
629	0.1
630	0.13
631	0.1
632	0.15
633	0.18
634	0.22
635	0.26
636	0.32
637	0.38
638	0.42
639	0.48
640	0.52
641	0.58
642	0.62
643	0.67
644	0.71
645	0.75
646	0.77
647	0.79
648	0.78
649	0.78
650	0.77
651	0.79
652	0.77
653	0.76
654	0.72
655	0.72
656	0.69
657	0.65
658	0.66
659	0.61
660	0.62
661	0.58
662	0.56
663	0.49
664	0.49
665	0.46
666	0.43
667	0.42
668	0.36
669	0.32
670	0.3
671	0.3
672	0.28
673	0.33
674	0.3
675	0.27
676	0.24
677	0.24
678	0.25
679	0.3
680	0.34
681	0.32

A0A1L9SS27

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer