Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9SHQ3

Protein Details
Accession A0A1L9SHQ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-57SGGAYAHTQRPRKRVRQDAEALKAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
561-607GGPQGRGRGPGPARGAGGRGGGGQRGGGGGGGGAQRGAPQRGRGQPS
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_mito 8, nucl 7, pero 3, cysk 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MAASLATALSQLKLDAQQVRTPDFDARLVEEESGGAYAHTQRPRKRVRQDAEALKAELERDFLTPSPRFSPEWLNRLQRRWDVPTDYTDLFDVAATQTRTVTRFTREGLEGRVTGYVEVTVPAASATAKNSTSLLRRPAGRADFVRGAAGFFPFAPGGLDGVEALAAMESEAQAAEQSRLGGAKQSGLDRIINFNTEDGLLEIPPGFSRGLKFEKAKSTEADQEVEATLQEEEVVGSSREDEEAIPGAEEKGKTEEDEDVSEGEEEDIDTLLPVEFPSLEPRAPLLSTIAKKGGKEWAHVVDVNKDIPNFNELVPDMAREWPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRTTFDDVGILTGDVQINPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKKKDIYVISTAKRPVPLEHYLWAGHNKHKIVDSNKRFLEQGWKSADEILSGRDKVKAQKAAEAQAQSQAHQSQRGGGGPQGRGRGPGPARGAGGRGGGGQRGGGGGGGGAQRGAPQRGRGQPSNRGTGNIARTGRGGGRTTVAQDRNIWVHLVQHLRKENLLPGCIFVFSKKRCEENADSLSKQDFCTASEKSLIHMFIEKSLTRLKPEDRSLPQILRLRELLSRGIAVHHGGLLPIMKEIVEILFAKSLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGFRKHDGKGFRDLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGYVIIVTSGRDEAPPVGALRRMILGDPTKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSENATQALLPEHEKQVQLSEASLAKIKREPCSICDIDLANCHQAAIEYEKLTGELNLGLLASPVGRRLFIPKRLVVYRKEGLRTAGIVVKEGVSGGTTPSIQVLEIGTLSSRRHPSDILPFTPAFRHLLQPLPTRAADMTLKVCRVPIQDLECVTKTLIKLGGPIWYLNIKKEAAKYADKELSKLCASWTNPVWDEVDYERIKELQVRDILEKRQAQINIAQSCKSLECPTFLAHFEMQHDEWQVKENINQLKQLMSDQNLQLLPDYEQRIFVLKELGFIDDHSRVQLKGKVACEIHSADELVLTELILENVLAEFEPEEIVALLSAFVFQEKTENVPTLTPRLEKGKEAIIRISDKVNDFQVLHQVIQSSEDQNDFASKPRFGLAEVVYEWAKGMSFNRITDLTDVMEGTIVRTVSRLDETCREVKNAAKLVGDPTLYTKMQQAQELIKRDVIFAASLYM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.24
3 0.27
4 0.29
5 0.33
6 0.35
7 0.34
8 0.34
9 0.34
10 0.3
11 0.29
12 0.28
13 0.28
14 0.28
15 0.28
16 0.26
17 0.21
18 0.18
19 0.16
20 0.15
21 0.11
22 0.07
23 0.08
24 0.14
25 0.21
26 0.29
27 0.36
28 0.43
29 0.53
30 0.64
31 0.72
32 0.77
33 0.81
34 0.8
35 0.82
36 0.85
37 0.84
38 0.82
39 0.76
40 0.66
41 0.57
42 0.5
43 0.41
44 0.32
45 0.24
46 0.18
47 0.14
48 0.16
49 0.17
50 0.23
51 0.24
52 0.28
53 0.3
54 0.32
55 0.33
56 0.34
57 0.43
58 0.44
59 0.49
60 0.53
61 0.58
62 0.61
63 0.66
64 0.7
65 0.67
66 0.65
67 0.65
68 0.65
69 0.61
70 0.58
71 0.56
72 0.54
73 0.47
74 0.41
75 0.35
76 0.28
77 0.21
78 0.18
79 0.14
80 0.1
81 0.14
82 0.14
83 0.14
84 0.16
85 0.18
86 0.2
87 0.23
88 0.25
89 0.26
90 0.28
91 0.3
92 0.34
93 0.35
94 0.37
95 0.37
96 0.38
97 0.32
98 0.3
99 0.29
100 0.24
101 0.21
102 0.18
103 0.14
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.09
114 0.13
115 0.14
116 0.14
117 0.16
118 0.2
119 0.25
120 0.29
121 0.34
122 0.35
123 0.38
124 0.4
125 0.47
126 0.47
127 0.48
128 0.44
129 0.45
130 0.44
131 0.41
132 0.4
133 0.32
134 0.29
135 0.23
136 0.21
137 0.15
138 0.11
139 0.12
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.09
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.03
154 0.03
155 0.04
156 0.03
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.06
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.1
167 0.1
168 0.14
169 0.13
170 0.16
171 0.18
172 0.19
173 0.21
174 0.23
175 0.25
176 0.22
177 0.26
178 0.24
179 0.23
180 0.22
181 0.2
182 0.18
183 0.16
184 0.15
185 0.11
186 0.1
187 0.08
188 0.09
189 0.09
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.11
196 0.16
197 0.21
198 0.27
199 0.3
200 0.35
201 0.43
202 0.47
203 0.48
204 0.45
205 0.45
206 0.47
207 0.45
208 0.41
209 0.32
210 0.29
211 0.27
212 0.24
213 0.19
214 0.12
215 0.09
216 0.07
217 0.07
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.07
222 0.06
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.11
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.11
235 0.13
236 0.13
237 0.13
238 0.15
239 0.15
240 0.15
241 0.16
242 0.19
243 0.18
244 0.2
245 0.19
246 0.16
247 0.16
248 0.15
249 0.14
250 0.1
251 0.08
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.11
265 0.13
266 0.13
267 0.13
268 0.14
269 0.16
270 0.15
271 0.15
272 0.14
273 0.19
274 0.21
275 0.23
276 0.28
277 0.28
278 0.28
279 0.3
280 0.35
281 0.3
282 0.31
283 0.32
284 0.3
285 0.32
286 0.34
287 0.33
288 0.29
289 0.29
290 0.29
291 0.26
292 0.22
293 0.2
294 0.18
295 0.19
296 0.16
297 0.14
298 0.15
299 0.13
300 0.15
301 0.15
302 0.15
303 0.14
304 0.17
305 0.17
306 0.15
307 0.16
308 0.15
309 0.15
310 0.15
311 0.16
312 0.15
313 0.17
314 0.19
315 0.18
316 0.17
317 0.17
318 0.18
319 0.19
320 0.18
321 0.17
322 0.15
323 0.15
324 0.14
325 0.14
326 0.14
327 0.1
328 0.07
329 0.06
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.06
349 0.05
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.1
357 0.11
358 0.18
359 0.19
360 0.21
361 0.23
362 0.26
363 0.26
364 0.3
365 0.38
366 0.38
367 0.47
368 0.47
369 0.52
370 0.53
371 0.55
372 0.6
373 0.51
374 0.45
375 0.43
376 0.45
377 0.38
378 0.34
379 0.32
380 0.21
381 0.21
382 0.18
383 0.11
384 0.06
385 0.07
386 0.07
387 0.06
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.06
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.06
401 0.07
402 0.07
403 0.08
404 0.07
405 0.07
406 0.08
407 0.11
408 0.1
409 0.09
410 0.1
411 0.11
412 0.11
413 0.11
414 0.11
415 0.09
416 0.09
417 0.1
418 0.08
419 0.07
420 0.07
421 0.09
422 0.07
423 0.06
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.09
428 0.09
429 0.07
430 0.09
431 0.09
432 0.07
433 0.07
434 0.08
435 0.09
436 0.08
437 0.08
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.05
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.04
452 0.03
453 0.03
454 0.04
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.06
459 0.06
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.09
465 0.1
466 0.1
467 0.16
468 0.22
469 0.26
470 0.29
471 0.34
472 0.38
473 0.4
474 0.45
475 0.41
476 0.41
477 0.44
478 0.47
479 0.44
480 0.43
481 0.41
482 0.37
483 0.37
484 0.31
485 0.25
486 0.25
487 0.27
488 0.25
489 0.24
490 0.25
491 0.23
492 0.24
493 0.27
494 0.24
495 0.24
496 0.27
497 0.26
498 0.25
499 0.27
500 0.31
501 0.33
502 0.41
503 0.43
504 0.46
505 0.46
506 0.46
507 0.43
508 0.38
509 0.42
510 0.33
511 0.33
512 0.29
513 0.29
514 0.28
515 0.3
516 0.29
517 0.2
518 0.18
519 0.14
520 0.13
521 0.13
522 0.13
523 0.14
524 0.16
525 0.2
526 0.26
527 0.3
528 0.28
529 0.34
530 0.35
531 0.36
532 0.38
533 0.34
534 0.28
535 0.28
536 0.27
537 0.22
538 0.22
539 0.21
540 0.19
541 0.19
542 0.19
543 0.15
544 0.17
545 0.17
546 0.15
547 0.15
548 0.18
549 0.18
550 0.21
551 0.21
552 0.19
553 0.2
554 0.2
555 0.25
556 0.21
557 0.25
558 0.24
559 0.23
560 0.24
561 0.22
562 0.23
563 0.16
564 0.16
565 0.11
566 0.09
567 0.08
568 0.08
569 0.07
570 0.06
571 0.06
572 0.05
573 0.05
574 0.04
575 0.03
576 0.03
577 0.04
578 0.04
579 0.04
580 0.04
581 0.04
582 0.06
583 0.08
584 0.1
585 0.1
586 0.12
587 0.18
588 0.25
589 0.3
590 0.33
591 0.36
592 0.44
593 0.46
594 0.49
595 0.44
596 0.39
597 0.35
598 0.34
599 0.32
600 0.29
601 0.26
602 0.21
603 0.21
604 0.2
605 0.2
606 0.18
607 0.16
608 0.11
609 0.12
610 0.12
611 0.14
612 0.19
613 0.19
614 0.17
615 0.17
616 0.18
617 0.18
618 0.18
619 0.16
620 0.1
621 0.1
622 0.14
623 0.19
624 0.18
625 0.23
626 0.25
627 0.25
628 0.26
629 0.25
630 0.26
631 0.21
632 0.21
633 0.16
634 0.14
635 0.14
636 0.14
637 0.13
638 0.1
639 0.16
640 0.16
641 0.22
642 0.23
643 0.26
644 0.26
645 0.33
646 0.35
647 0.36
648 0.41
649 0.38
650 0.36
651 0.34
652 0.35
653 0.29
654 0.25
655 0.19
656 0.13
657 0.11
658 0.15
659 0.14
660 0.14
661 0.17
662 0.17
663 0.16
664 0.18
665 0.16
666 0.13
667 0.15
668 0.14
669 0.12
670 0.15
671 0.14
672 0.13
673 0.18
674 0.18
675 0.17
676 0.2
677 0.21
678 0.25
679 0.28
680 0.34
681 0.32
682 0.37
683 0.38
684 0.36
685 0.4
686 0.39
687 0.36
688 0.3
689 0.28
690 0.24
691 0.22
692 0.23
693 0.17
694 0.13
695 0.12
696 0.11
697 0.11
698 0.09
699 0.09
700 0.07
701 0.06
702 0.06
703 0.05
704 0.05
705 0.05
706 0.05
707 0.04
708 0.04
709 0.04
710 0.04
711 0.04
712 0.04
713 0.05
714 0.05
715 0.05
716 0.06
717 0.06
718 0.07
719 0.07
720 0.08
721 0.07
722 0.07
723 0.06
724 0.06
725 0.08
726 0.08
727 0.09
728 0.08
729 0.08
730 0.08
731 0.08
732 0.07
733 0.06
734 0.07
735 0.07
736 0.07
737 0.07
738 0.07
739 0.07
740 0.07
741 0.07
742 0.08
743 0.1
744 0.12
745 0.18
746 0.2
747 0.24
748 0.25
749 0.25
750 0.29
751 0.31
752 0.32
753 0.34
754 0.35
755 0.32
756 0.33
757 0.33
758 0.3
759 0.26
760 0.23
761 0.17
762 0.14
763 0.13
764 0.1
765 0.11
766 0.09
767 0.08
768 0.09
769 0.11
770 0.11
771 0.12
772 0.12
773 0.12
774 0.13
775 0.12
776 0.11
777 0.09
778 0.09
779 0.08
780 0.07
781 0.06
782 0.06
783 0.05
784 0.04
785 0.04
786 0.05
787 0.05
788 0.05
789 0.06
790 0.06
791 0.07
792 0.08
793 0.08
794 0.08
795 0.09
796 0.09
797 0.09
798 0.1
799 0.09
800 0.09
801 0.12
802 0.13
803 0.15
804 0.17
805 0.19
806 0.22
807 0.24
808 0.25
809 0.25
810 0.28
811 0.32
812 0.33
813 0.37
814 0.36
815 0.38
816 0.38
817 0.36
818 0.32
819 0.25
820 0.22
821 0.15
822 0.13
823 0.09
824 0.07
825 0.06
826 0.05
827 0.06
828 0.06
829 0.07
830 0.09
831 0.11
832 0.13
833 0.14
834 0.14
835 0.15
836 0.16
837 0.18
838 0.17
839 0.2
840 0.2
841 0.21
842 0.21
843 0.2
844 0.19
845 0.17
846 0.17
847 0.15
848 0.15
849 0.15
850 0.16
851 0.16
852 0.16
853 0.17
854 0.17
855 0.14
856 0.12
857 0.13
858 0.11
859 0.12
860 0.15
861 0.14
862 0.14
863 0.18
864 0.2
865 0.22
866 0.27
867 0.28
868 0.27
869 0.35
870 0.34
871 0.31
872 0.31
873 0.28
874 0.23
875 0.24
876 0.24
877 0.16
878 0.15
879 0.14
880 0.12
881 0.11
882 0.11
883 0.13
884 0.14
885 0.13
886 0.13
887 0.13
888 0.14
889 0.14
890 0.12
891 0.09
892 0.06
893 0.06
894 0.06
895 0.06
896 0.05
897 0.05
898 0.05
899 0.04
900 0.04
901 0.07
902 0.07
903 0.08
904 0.08
905 0.16
906 0.23
907 0.3
908 0.35
909 0.35
910 0.41
911 0.46
912 0.5
913 0.46
914 0.46
915 0.44
916 0.44
917 0.44
918 0.4
919 0.36
920 0.33
921 0.3
922 0.25
923 0.23
924 0.18
925 0.16
926 0.16
927 0.14
928 0.12
929 0.11
930 0.09
931 0.06
932 0.06
933 0.06
934 0.06
935 0.06
936 0.06
937 0.07
938 0.07
939 0.06
940 0.07
941 0.06
942 0.06
943 0.06
944 0.06
945 0.06
946 0.08
947 0.09
948 0.14
949 0.17
950 0.18
951 0.2
952 0.21
953 0.25
954 0.33
955 0.38
956 0.34
957 0.34
958 0.33
959 0.33
960 0.33
961 0.3
962 0.23
963 0.19
964 0.21
965 0.19
966 0.25
967 0.29
968 0.33
969 0.35
970 0.35
971 0.34
972 0.32
973 0.3
974 0.27
975 0.23
976 0.19
977 0.22
978 0.21
979 0.22
980 0.2
981 0.21
982 0.2
983 0.22
984 0.23
985 0.23
986 0.24
987 0.26
988 0.28
989 0.32
990 0.3
991 0.29
992 0.26
993 0.23
994 0.19
995 0.19
996 0.19
997 0.14
998 0.16
999 0.15
1000 0.2
1001 0.18
1002 0.18
1003 0.17
1004 0.21
1005 0.21
1006 0.21
1007 0.24
1008 0.21
1009 0.23
1010 0.26
1011 0.3
1012 0.29
1013 0.34
1014 0.35
1015 0.38
1016 0.44
1017 0.41
1018 0.41
1019 0.36
1020 0.36
1021 0.31
1022 0.29
1023 0.23
1024 0.23
1025 0.24
1026 0.29
1027 0.3
1028 0.31
1029 0.31
1030 0.32
1031 0.31
1032 0.25
1033 0.26
1034 0.21
1035 0.26
1036 0.21
1037 0.21
1038 0.21
1039 0.2
1040 0.2
1041 0.22
1042 0.23
1043 0.21
1044 0.25
1045 0.26
1046 0.31
1047 0.36
1048 0.38
1049 0.4
1050 0.41
1051 0.37
1052 0.39
1053 0.37
1054 0.34
1055 0.35
1056 0.4
1057 0.38
1058 0.37
1059 0.36
1060 0.3
1061 0.31
1062 0.3
1063 0.27
1064 0.23
1065 0.19
1066 0.2
1067 0.21
1068 0.23
1069 0.24
1070 0.24
1071 0.25
1072 0.22
1073 0.22
1074 0.22
1075 0.24
1076 0.23
1077 0.23
1078 0.23
1079 0.2
1080 0.19
1081 0.22
1082 0.22
1083 0.18
1084 0.2
1085 0.25
1086 0.31
1087 0.32
1088 0.34
1089 0.3
1090 0.3
1091 0.3
1092 0.31
1093 0.29
1094 0.24
1095 0.28
1096 0.26
1097 0.3
1098 0.28
1099 0.28
1100 0.24
1101 0.21
1102 0.21
1103 0.21
1104 0.24
1105 0.2
1106 0.2
1107 0.21
1108 0.24
1109 0.22
1110 0.21
1111 0.21
1112 0.18
1113 0.2
1114 0.2
1115 0.21
1116 0.17
1117 0.18
1118 0.22
1119 0.18
1120 0.18
1121 0.18
1122 0.19
1123 0.18
1124 0.22
1125 0.26
1126 0.27
1127 0.3
1128 0.31
1129 0.36
1130 0.35
1131 0.36
1132 0.36
1133 0.33
1134 0.3
1135 0.25
1136 0.24
1137 0.17
1138 0.17
1139 0.16
1140 0.13
1141 0.11
1142 0.09
1143 0.07
1144 0.07
1145 0.07
1146 0.06
1147 0.05
1148 0.04
1149 0.04
1150 0.05
1151 0.04
1152 0.04
1153 0.05
1154 0.05
1155 0.06
1156 0.05
1157 0.06
1158 0.06
1159 0.06
1160 0.05
1161 0.05
1162 0.05
1163 0.04
1164 0.05
1165 0.05
1166 0.05
1167 0.05
1168 0.05
1169 0.09
1170 0.1
1171 0.14
1172 0.17
1173 0.19
1174 0.2
1175 0.23
1176 0.26
1177 0.27
1178 0.31
1179 0.28
1180 0.28
1181 0.35
1182 0.36
1183 0.35
1184 0.35
1185 0.39
1186 0.39
1187 0.4
1188 0.41
1189 0.38
1190 0.39
1191 0.39
1192 0.39
1193 0.35
1194 0.33
1195 0.33
1196 0.32
1197 0.29
1198 0.27
1199 0.27
1200 0.31
1201 0.29
1202 0.27
1203 0.25
1204 0.24
1205 0.21
1206 0.23
1207 0.24
1208 0.18
1209 0.17
1210 0.18
1211 0.17
1212 0.17
1213 0.2
1214 0.18
1215 0.22
1216 0.25
1217 0.23
1218 0.24
1219 0.26
1220 0.26
1221 0.23
1222 0.29
1223 0.23
1224 0.24
1225 0.24
1226 0.25
1227 0.23
1228 0.22
1229 0.21
1230 0.15
1231 0.14
1232 0.1
1233 0.12
1234 0.18
1235 0.21
1236 0.22
1237 0.25
1238 0.26
1239 0.28
1240 0.28
1241 0.28
1242 0.2
1243 0.18
1244 0.17
1245 0.14
1246 0.14
1247 0.12
1248 0.12
1249 0.13
1250 0.11
1251 0.1
1252 0.11
1253 0.12
1254 0.13
1255 0.19
1256 0.2
1257 0.22
1258 0.28
1259 0.34
1260 0.4
1261 0.42
1262 0.42
1263 0.39
1264 0.42
1265 0.46
1266 0.46
1267 0.43
1268 0.37
1269 0.36
1270 0.37
1271 0.39
1272 0.34
1273 0.26
1274 0.24
1275 0.27
1276 0.26
1277 0.26
1278 0.27
1279 0.3
1280 0.33
1281 0.36
1282 0.35
1283 0.38
1284 0.45
1285 0.51
1286 0.48
1287 0.45
1288 0.42
1289 0.4
1290 0.38
1291 0.3
1292 0.23