Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9SHP6

Protein Details
Accession A0A1L9SHP6    Localization Confidence High Confidence Score 23.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
175-199VPIPGAQQHKRPRRRYEEIERMYKCHydrophilic
232-252FKEIRKEWKARKKEEEAQRKABasic
1031-1052VFPTWEQRKTFRENHPRSRVYDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
233-252KEIRKEWKARKKEEEAQRKA
512-517KREKKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039327  CON7-like  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF13041  PPR_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MDTRPPSEYAQSAADQASAAATAQYTPQPEVRSSSQYTPQPEVRSANNTPQSEYGLNQPASTRSPAYPEYLARPPQYHHAPSSQAGGAADPSIAASSPTYPPPYSPYQPQGHDMSQYQGHPPPGPQMYARPEWPHGYPQHQHGLPGPYSSPATTVGSTSPTATPGPHPGQVYSFVPIPGAQQHKRPRRRYEEIERMYKCGWNGCEKAYGTLNHLNAHVTMQSHGAKRTPEEFKEIRKEWKARKKEEEAQRKAAEERERAAAAQAAQANQVEAGGPTDPSQGAQPPSYAGGVRPQLPPIGYQPADGQVPGQYSAPGAGGMVYQGNGQMAYPPNYPHSPYGQGSQVYQQHWEKSLDLENSSDWEKSLDLENSSDWENSLDPMKEEKEEEEEEEEEEEEEESESPKEQALRVLETEVSRKVVNMELRWLKDPRALADRVARLLLGEELPLAVALVRTAHKEGIESSVAWNHILDHLMGTERPFLAWRLYNDMKKRQKAPTSRTYTIMLDGLSKAKREKKKGTIDPVRTAYTIYQSIFAPNSPVKPHIIHSNAMLNVCRCHDDMYTMWKVAGSLPEEGPGAPDASTYTIIFKAIIESTRKEIGAMPPNRMDLVLAKKAHGVAEAKRVWSDVIYRWKRGGLVLDNMLVNAVARLLLEGSSPRDVYDLFRLFHQTAGIPIFPKEPPEDKSSPQLDTSTNNSSSPKYNRDVAAAALDHIPFVPEDAHLLAEDKESPEKKEEEEEEEEEVEDEENFENLFEPVDSYPPQIEIGNRDLSIILDACANMDQGVGVGKDYWRYFTKEDNDHNVQPDSHSFHQYLRLLRVARSSRETLHIVRDQIVPGGLAERKTFFIALSCCRRDRKNMNVFKNASELIELMDAALPLPDPRALQHYLEMVNFFLKNPSDLMSLSGIASEDKPRQSLLARSNCMQLELRKAAARTLQPIITKLDLAMSASLTEPALDARLAEKFQKAAVAGHHVLNALIKTRALVDGIFKTPSGGGKVRLAKTDRLLFEDIRDRLRKYSAAGMADRFAATLVFPTWEQRKTFRENHPRSRVYDRVPDRWSSRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.17
3 0.16
4 0.13
5 0.09
6 0.08
7 0.06
8 0.06
9 0.06
10 0.09
11 0.12
12 0.14
13 0.16
14 0.2
15 0.23
16 0.24
17 0.3
18 0.33
19 0.36
20 0.39
21 0.42
22 0.46
23 0.49
24 0.53
25 0.53
26 0.55
27 0.52
28 0.52
29 0.5
30 0.47
31 0.48
32 0.47
33 0.5
34 0.53
35 0.5
36 0.48
37 0.46
38 0.46
39 0.4
40 0.37
41 0.35
42 0.35
43 0.34
44 0.32
45 0.32
46 0.3
47 0.32
48 0.34
49 0.3
50 0.22
51 0.28
52 0.29
53 0.32
54 0.32
55 0.32
56 0.35
57 0.39
58 0.43
59 0.41
60 0.42
61 0.4
62 0.45
63 0.5
64 0.48
65 0.45
66 0.44
67 0.44
68 0.43
69 0.46
70 0.38
71 0.31
72 0.26
73 0.23
74 0.19
75 0.15
76 0.14
77 0.08
78 0.08
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.09
84 0.12
85 0.16
86 0.2
87 0.21
88 0.22
89 0.27
90 0.34
91 0.35
92 0.4
93 0.45
94 0.47
95 0.49
96 0.53
97 0.53
98 0.47
99 0.46
100 0.4
101 0.36
102 0.33
103 0.32
104 0.32
105 0.3
106 0.31
107 0.29
108 0.29
109 0.32
110 0.31
111 0.31
112 0.29
113 0.32
114 0.36
115 0.38
116 0.41
117 0.38
118 0.39
119 0.41
120 0.42
121 0.42
122 0.4
123 0.44
124 0.44
125 0.45
126 0.51
127 0.47
128 0.46
129 0.44
130 0.45
131 0.38
132 0.36
133 0.31
134 0.24
135 0.25
136 0.24
137 0.2
138 0.16
139 0.18
140 0.16
141 0.17
142 0.15
143 0.17
144 0.17
145 0.18
146 0.16
147 0.15
148 0.16
149 0.16
150 0.18
151 0.23
152 0.26
153 0.28
154 0.28
155 0.27
156 0.29
157 0.31
158 0.3
159 0.24
160 0.22
161 0.18
162 0.17
163 0.17
164 0.17
165 0.2
166 0.26
167 0.26
168 0.33
169 0.44
170 0.54
171 0.64
172 0.71
173 0.75
174 0.76
175 0.84
176 0.84
177 0.85
178 0.86
179 0.83
180 0.84
181 0.75
182 0.69
183 0.61
184 0.54
185 0.44
186 0.39
187 0.34
188 0.32
189 0.33
190 0.31
191 0.35
192 0.33
193 0.35
194 0.33
195 0.32
196 0.3
197 0.33
198 0.33
199 0.28
200 0.28
201 0.26
202 0.22
203 0.22
204 0.18
205 0.13
206 0.12
207 0.15
208 0.19
209 0.2
210 0.22
211 0.24
212 0.24
213 0.26
214 0.32
215 0.35
216 0.32
217 0.38
218 0.4
219 0.45
220 0.52
221 0.53
222 0.54
223 0.56
224 0.63
225 0.66
226 0.72
227 0.74
228 0.73
229 0.79
230 0.79
231 0.8
232 0.82
233 0.83
234 0.79
235 0.78
236 0.72
237 0.64
238 0.58
239 0.55
240 0.51
241 0.43
242 0.38
243 0.34
244 0.32
245 0.3
246 0.29
247 0.24
248 0.18
249 0.19
250 0.18
251 0.15
252 0.15
253 0.15
254 0.14
255 0.12
256 0.11
257 0.07
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.09
264 0.08
265 0.09
266 0.1
267 0.13
268 0.15
269 0.15
270 0.14
271 0.14
272 0.15
273 0.16
274 0.14
275 0.11
276 0.15
277 0.17
278 0.2
279 0.2
280 0.19
281 0.2
282 0.2
283 0.21
284 0.19
285 0.24
286 0.21
287 0.21
288 0.21
289 0.21
290 0.21
291 0.2
292 0.17
293 0.11
294 0.12
295 0.12
296 0.11
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.07
302 0.06
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.08
314 0.1
315 0.13
316 0.15
317 0.16
318 0.19
319 0.21
320 0.23
321 0.22
322 0.23
323 0.25
324 0.25
325 0.26
326 0.26
327 0.26
328 0.24
329 0.28
330 0.29
331 0.25
332 0.29
333 0.28
334 0.27
335 0.29
336 0.29
337 0.24
338 0.22
339 0.27
340 0.23
341 0.21
342 0.2
343 0.18
344 0.18
345 0.19
346 0.16
347 0.11
348 0.1
349 0.09
350 0.1
351 0.13
352 0.12
353 0.12
354 0.13
355 0.13
356 0.14
357 0.15
358 0.14
359 0.1
360 0.1
361 0.09
362 0.09
363 0.12
364 0.11
365 0.1
366 0.13
367 0.14
368 0.14
369 0.15
370 0.15
371 0.16
372 0.17
373 0.17
374 0.17
375 0.16
376 0.16
377 0.15
378 0.15
379 0.1
380 0.1
381 0.08
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.07
388 0.07
389 0.08
390 0.09
391 0.08
392 0.12
393 0.13
394 0.15
395 0.15
396 0.15
397 0.16
398 0.16
399 0.18
400 0.15
401 0.14
402 0.13
403 0.12
404 0.12
405 0.15
406 0.17
407 0.16
408 0.22
409 0.25
410 0.27
411 0.3
412 0.3
413 0.27
414 0.27
415 0.27
416 0.23
417 0.24
418 0.23
419 0.21
420 0.26
421 0.26
422 0.24
423 0.23
424 0.2
425 0.14
426 0.14
427 0.13
428 0.07
429 0.06
430 0.05
431 0.04
432 0.05
433 0.04
434 0.04
435 0.03
436 0.02
437 0.03
438 0.04
439 0.05
440 0.06
441 0.07
442 0.08
443 0.08
444 0.09
445 0.1
446 0.11
447 0.12
448 0.11
449 0.11
450 0.12
451 0.12
452 0.12
453 0.11
454 0.08
455 0.08
456 0.09
457 0.08
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.08
468 0.1
469 0.12
470 0.13
471 0.19
472 0.23
473 0.27
474 0.32
475 0.41
476 0.46
477 0.48
478 0.53
479 0.52
480 0.57
481 0.6
482 0.63
483 0.63
484 0.64
485 0.61
486 0.58
487 0.53
488 0.46
489 0.38
490 0.32
491 0.22
492 0.14
493 0.12
494 0.14
495 0.12
496 0.12
497 0.15
498 0.22
499 0.29
500 0.35
501 0.42
502 0.48
503 0.58
504 0.64
505 0.7
506 0.72
507 0.7
508 0.68
509 0.63
510 0.55
511 0.45
512 0.39
513 0.29
514 0.22
515 0.19
516 0.14
517 0.12
518 0.11
519 0.12
520 0.12
521 0.11
522 0.11
523 0.1
524 0.12
525 0.12
526 0.13
527 0.14
528 0.15
529 0.16
530 0.2
531 0.21
532 0.2
533 0.2
534 0.23
535 0.22
536 0.22
537 0.21
538 0.15
539 0.14
540 0.14
541 0.14
542 0.1
543 0.11
544 0.11
545 0.12
546 0.13
547 0.18
548 0.19
549 0.17
550 0.17
551 0.15
552 0.15
553 0.14
554 0.15
555 0.1
556 0.1
557 0.1
558 0.11
559 0.12
560 0.11
561 0.11
562 0.09
563 0.08
564 0.06
565 0.06
566 0.05
567 0.07
568 0.08
569 0.07
570 0.08
571 0.08
572 0.08
573 0.08
574 0.07
575 0.07
576 0.07
577 0.1
578 0.11
579 0.12
580 0.15
581 0.16
582 0.16
583 0.15
584 0.17
585 0.2
586 0.27
587 0.28
588 0.28
589 0.27
590 0.28
591 0.27
592 0.25
593 0.2
594 0.14
595 0.18
596 0.21
597 0.2
598 0.2
599 0.21
600 0.21
601 0.21
602 0.2
603 0.16
604 0.13
605 0.21
606 0.22
607 0.21
608 0.21
609 0.21
610 0.19
611 0.17
612 0.18
613 0.15
614 0.25
615 0.28
616 0.29
617 0.29
618 0.3
619 0.3
620 0.28
621 0.27
622 0.19
623 0.19
624 0.19
625 0.2
626 0.19
627 0.18
628 0.17
629 0.12
630 0.09
631 0.05
632 0.04
633 0.03
634 0.03
635 0.03
636 0.03
637 0.03
638 0.04
639 0.05
640 0.07
641 0.09
642 0.09
643 0.09
644 0.09
645 0.1
646 0.12
647 0.18
648 0.19
649 0.18
650 0.19
651 0.22
652 0.22
653 0.22
654 0.21
655 0.13
656 0.12
657 0.13
658 0.13
659 0.11
660 0.11
661 0.13
662 0.12
663 0.14
664 0.15
665 0.17
666 0.19
667 0.26
668 0.28
669 0.28
670 0.36
671 0.36
672 0.34
673 0.32
674 0.31
675 0.25
676 0.25
677 0.28
678 0.25
679 0.24
680 0.23
681 0.24
682 0.24
683 0.29
684 0.31
685 0.31
686 0.29
687 0.32
688 0.32
689 0.33
690 0.32
691 0.26
692 0.24
693 0.19
694 0.17
695 0.14
696 0.13
697 0.11
698 0.1
699 0.09
700 0.06
701 0.07
702 0.06
703 0.05
704 0.06
705 0.07
706 0.07
707 0.07
708 0.08
709 0.08
710 0.08
711 0.09
712 0.09
713 0.15
714 0.16
715 0.18
716 0.2
717 0.21
718 0.22
719 0.26
720 0.27
721 0.28
722 0.31
723 0.3
724 0.28
725 0.27
726 0.26
727 0.2
728 0.19
729 0.13
730 0.08
731 0.08
732 0.06
733 0.06
734 0.06
735 0.06
736 0.06
737 0.06
738 0.06
739 0.05
740 0.07
741 0.07
742 0.1
743 0.1
744 0.11
745 0.12
746 0.12
747 0.13
748 0.12
749 0.13
750 0.14
751 0.17
752 0.19
753 0.18
754 0.18
755 0.17
756 0.16
757 0.16
758 0.12
759 0.09
760 0.07
761 0.07
762 0.07
763 0.07
764 0.07
765 0.06
766 0.05
767 0.05
768 0.04
769 0.06
770 0.05
771 0.05
772 0.06
773 0.07
774 0.11
775 0.11
776 0.15
777 0.16
778 0.21
779 0.22
780 0.29
781 0.36
782 0.4
783 0.45
784 0.5
785 0.53
786 0.51
787 0.53
788 0.47
789 0.39
790 0.33
791 0.32
792 0.3
793 0.27
794 0.28
795 0.25
796 0.25
797 0.32
798 0.34
799 0.34
800 0.31
801 0.33
802 0.31
803 0.32
804 0.39
805 0.36
806 0.36
807 0.38
808 0.37
809 0.34
810 0.37
811 0.39
812 0.33
813 0.36
814 0.36
815 0.32
816 0.32
817 0.32
818 0.28
819 0.25
820 0.23
821 0.16
822 0.12
823 0.14
824 0.13
825 0.13
826 0.13
827 0.14
828 0.15
829 0.16
830 0.16
831 0.13
832 0.16
833 0.18
834 0.24
835 0.32
836 0.35
837 0.38
838 0.43
839 0.46
840 0.51
841 0.56
842 0.59
843 0.61
844 0.67
845 0.7
846 0.75
847 0.74
848 0.66
849 0.62
850 0.52
851 0.41
852 0.32
853 0.24
854 0.16
855 0.14
856 0.12
857 0.08
858 0.08
859 0.07
860 0.07
861 0.07
862 0.06
863 0.05
864 0.07
865 0.08
866 0.07
867 0.09
868 0.14
869 0.16
870 0.17
871 0.19
872 0.21
873 0.22
874 0.23
875 0.22
876 0.18
877 0.18
878 0.17
879 0.15
880 0.15
881 0.14
882 0.14
883 0.15
884 0.16
885 0.15
886 0.15
887 0.17
888 0.15
889 0.15
890 0.14
891 0.13
892 0.11
893 0.11
894 0.12
895 0.15
896 0.18
897 0.19
898 0.2
899 0.2
900 0.22
901 0.25
902 0.3
903 0.36
904 0.4
905 0.42
906 0.43
907 0.48
908 0.46
909 0.45
910 0.41
911 0.35
912 0.34
913 0.33
914 0.34
915 0.32
916 0.32
917 0.32
918 0.35
919 0.34
920 0.31
921 0.32
922 0.33
923 0.31
924 0.33
925 0.34
926 0.29
927 0.27
928 0.22
929 0.2
930 0.16
931 0.16
932 0.14
933 0.11
934 0.1
935 0.1
936 0.11
937 0.09
938 0.08
939 0.07
940 0.07
941 0.08
942 0.07
943 0.07
944 0.08
945 0.11
946 0.13
947 0.16
948 0.17
949 0.17
950 0.18
951 0.2
952 0.19
953 0.19
954 0.2
955 0.26
956 0.26
957 0.26
958 0.26
959 0.24
960 0.23
961 0.23
962 0.21
963 0.15
964 0.14
965 0.13
966 0.12
967 0.14
968 0.14
969 0.13
970 0.13
971 0.15
972 0.19
973 0.21
974 0.22
975 0.2
976 0.2
977 0.21
978 0.23
979 0.24
980 0.22
981 0.23
982 0.31
983 0.39
984 0.41
985 0.47
986 0.48
987 0.47
988 0.52
989 0.56
990 0.5
991 0.47
992 0.48
993 0.41
994 0.44
995 0.47
996 0.43
997 0.43
998 0.45
999 0.42
1000 0.42
1001 0.45
1002 0.41
1003 0.36
1004 0.42
1005 0.4
1006 0.4
1007 0.41
1008 0.4
1009 0.37
1010 0.36
1011 0.32
1012 0.24
1013 0.18
1014 0.13
1015 0.1
1016 0.1
1017 0.09
1018 0.1
1019 0.1
1020 0.17
1021 0.23
1022 0.28
1023 0.31
1024 0.35
1025 0.41
1026 0.48
1027 0.57
1028 0.62
1029 0.67
1030 0.72
1031 0.8
1032 0.84
1033 0.82
1034 0.79
1035 0.79
1036 0.76
1037 0.71
1038 0.72
1039 0.68
1040 0.66
1041 0.65
1042 0.67