Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1L9SHQ4

Protein Details
Accession A0A1L9SHQ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
199-223KRRTLQQGLSPRKKRAKSRTSSSADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
209-215PRKKRAK
457-464PKRHKAGR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR038718  SNF2-like_sf  
IPR000330  SNF2_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0140658  F:ATP-dependent chromatin remodeler activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00271  Helicase_C  
PF00176  SNF2-rel_dom  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18000  DEXHc_ERCC6  
cd18793  SF2_C_SNF  
Amino Acid Sequences MSLLQRLHTDIRAQDDIERDLSRKADKELAEQADERDKKMLERTLKEKEKLETQILKFHQRLSQPIGTSARVRTQNEIGRLEERLSSIETDLRDIQERLDQRQQGQDDEEISRSGRLPNESRRDYLIRTGKITPFSNMGAGPNEGPFANLQNALIDAEDERAEQEALEQAKNGSAVSHRELRLPDLGFNETSDTSVGQKRRTLQQGLSPRKKRAKSRTSSSADALSDDDDDSANYVAIEETESEDEEEFLPEGQPERAIPVRHKTKRSEVHDDGNEAMYQTRLQDWASRRSAARKRATASSGLVSEEEEEGEQDEWYMPHPTVPDTILDQGLRIPGDIFPLLFDYQKTGVKWIWELHQQRVGGIIGDEMGLGKTIQVIAFLASLHHSKQFTKPALVVCPATLLQQWVQEFHRWWPAFRVSILHSTGSGMLNVGSESNREDMLTSQMWRSSNGRSGVPKRHKAGRKIVQRVVQEGHVLLTTYAGLHTYSDLLTPVEWGYVILDEGHKIRNPDTTITIYAKELRTPHRLILSGTPMQNNLTELWSLFDFVFPMRLGTLVSFRNQFDIPIRQGGYANASNLQVQTAARCAETLKDAISPFLLQRLKMDVAADLPNKSEQVLFCKLSPAQRTAYERFLASPDMTAILNKRKEVLYGIDLLRKICNHTDLIEHEMNSHKADYGNPKRSGKMEVVQSLLELWKKTGHKTLLFAQHKITLNILQKLISAMPGFNYRRMDGETAVEKRQAIVDEFNNDPEIHIFLLTTKVGGLGINLTGADRVIIFDPDWNPSTDLQARERAWRLGQKREVMICRLVCKGTIEEKIYHRQIYKQFLSNKILKDPKQRQNFQLSDLQDLFTLQPDTQSETETSKLFKDAQVTYDTGRQDIKSEEGGETRKIRAIAGVSGLEEYHDESEGKDKETDSEATNSEARIMQGIFSKSGVHSAMEHEQIVNGKRVIRADPKIIEAEAKRVAAEAAEELRRAGEAARSVPIGTPTWTGQSGVAGRPAFQQRGGASSRARRAGAGPSSASVLANLSSRGQSLSSSSASASLPTNGAAGTAPVNFLTRIRDFMISHGGTVYTQMLIDRFNHECDTPRRSAEFKEILRTIAEITPGGRSGRSQWTLKSAYARP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.33
3 0.34
4 0.33
5 0.32
6 0.27
7 0.27
8 0.3
9 0.32
10 0.31
11 0.32
12 0.35
13 0.35
14 0.4
15 0.45
16 0.46
17 0.44
18 0.42
19 0.42
20 0.45
21 0.44
22 0.4
23 0.36
24 0.32
25 0.32
26 0.38
27 0.43
28 0.42
29 0.48
30 0.54
31 0.6
32 0.68
33 0.69
34 0.67
35 0.64
36 0.63
37 0.61
38 0.62
39 0.6
40 0.54
41 0.58
42 0.58
43 0.62
44 0.55
45 0.54
46 0.51
47 0.45
48 0.49
49 0.48
50 0.5
51 0.42
52 0.47
53 0.47
54 0.44
55 0.44
56 0.41
57 0.41
58 0.42
59 0.43
60 0.41
61 0.46
62 0.5
63 0.52
64 0.52
65 0.47
66 0.42
67 0.42
68 0.38
69 0.32
70 0.26
71 0.22
72 0.2
73 0.19
74 0.18
75 0.2
76 0.19
77 0.21
78 0.22
79 0.22
80 0.24
81 0.23
82 0.23
83 0.27
84 0.29
85 0.32
86 0.38
87 0.39
88 0.38
89 0.46
90 0.47
91 0.43
92 0.42
93 0.38
94 0.33
95 0.32
96 0.3
97 0.23
98 0.22
99 0.21
100 0.19
101 0.2
102 0.21
103 0.25
104 0.31
105 0.4
106 0.49
107 0.51
108 0.52
109 0.55
110 0.55
111 0.51
112 0.54
113 0.53
114 0.46
115 0.46
116 0.5
117 0.48
118 0.5
119 0.49
120 0.41
121 0.36
122 0.33
123 0.31
124 0.26
125 0.24
126 0.21
127 0.2
128 0.19
129 0.16
130 0.16
131 0.13
132 0.13
133 0.12
134 0.13
135 0.14
136 0.13
137 0.13
138 0.12
139 0.13
140 0.12
141 0.12
142 0.09
143 0.07
144 0.08
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.09
150 0.08
151 0.09
152 0.12
153 0.14
154 0.15
155 0.15
156 0.14
157 0.15
158 0.16
159 0.14
160 0.11
161 0.11
162 0.15
163 0.19
164 0.26
165 0.26
166 0.29
167 0.31
168 0.33
169 0.36
170 0.33
171 0.31
172 0.27
173 0.29
174 0.25
175 0.25
176 0.24
177 0.18
178 0.18
179 0.15
180 0.13
181 0.14
182 0.2
183 0.23
184 0.24
185 0.27
186 0.31
187 0.39
188 0.46
189 0.47
190 0.44
191 0.49
192 0.56
193 0.64
194 0.7
195 0.68
196 0.7
197 0.75
198 0.79
199 0.8
200 0.81
201 0.81
202 0.79
203 0.82
204 0.83
205 0.8
206 0.76
207 0.68
208 0.62
209 0.51
210 0.43
211 0.34
212 0.25
213 0.19
214 0.15
215 0.13
216 0.09
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.08
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.13
244 0.17
245 0.19
246 0.22
247 0.31
248 0.41
249 0.48
250 0.54
251 0.56
252 0.62
253 0.69
254 0.73
255 0.73
256 0.67
257 0.68
258 0.65
259 0.61
260 0.52
261 0.43
262 0.36
263 0.26
264 0.21
265 0.13
266 0.11
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.1
271 0.16
272 0.2
273 0.28
274 0.31
275 0.33
276 0.33
277 0.42
278 0.49
279 0.52
280 0.56
281 0.53
282 0.54
283 0.56
284 0.57
285 0.5
286 0.45
287 0.38
288 0.31
289 0.26
290 0.22
291 0.17
292 0.16
293 0.13
294 0.11
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.07
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.1
305 0.09
306 0.1
307 0.11
308 0.11
309 0.12
310 0.13
311 0.12
312 0.13
313 0.14
314 0.15
315 0.14
316 0.13
317 0.12
318 0.13
319 0.12
320 0.1
321 0.09
322 0.07
323 0.1
324 0.1
325 0.09
326 0.08
327 0.1
328 0.11
329 0.11
330 0.1
331 0.11
332 0.13
333 0.17
334 0.17
335 0.17
336 0.18
337 0.18
338 0.2
339 0.19
340 0.21
341 0.26
342 0.29
343 0.3
344 0.34
345 0.32
346 0.3
347 0.3
348 0.26
349 0.18
350 0.15
351 0.11
352 0.07
353 0.07
354 0.06
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.07
370 0.08
371 0.08
372 0.12
373 0.12
374 0.14
375 0.19
376 0.27
377 0.27
378 0.28
379 0.3
380 0.29
381 0.31
382 0.31
383 0.27
384 0.19
385 0.18
386 0.16
387 0.15
388 0.13
389 0.11
390 0.1
391 0.13
392 0.13
393 0.14
394 0.15
395 0.18
396 0.19
397 0.2
398 0.28
399 0.25
400 0.26
401 0.28
402 0.3
403 0.28
404 0.27
405 0.27
406 0.2
407 0.25
408 0.26
409 0.21
410 0.18
411 0.17
412 0.18
413 0.16
414 0.13
415 0.08
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.05
421 0.05
422 0.06
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.08
428 0.11
429 0.12
430 0.12
431 0.12
432 0.15
433 0.15
434 0.17
435 0.18
436 0.17
437 0.21
438 0.22
439 0.24
440 0.28
441 0.33
442 0.42
443 0.48
444 0.52
445 0.5
446 0.57
447 0.62
448 0.62
449 0.67
450 0.66
451 0.67
452 0.69
453 0.7
454 0.67
455 0.61
456 0.57
457 0.48
458 0.4
459 0.3
460 0.23
461 0.18
462 0.12
463 0.11
464 0.07
465 0.06
466 0.05
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.04
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.06
477 0.05
478 0.05
479 0.06
480 0.06
481 0.05
482 0.05
483 0.04
484 0.04
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.05
490 0.06
491 0.08
492 0.09
493 0.1
494 0.1
495 0.14
496 0.15
497 0.16
498 0.18
499 0.18
500 0.2
501 0.2
502 0.2
503 0.17
504 0.19
505 0.18
506 0.18
507 0.18
508 0.21
509 0.25
510 0.26
511 0.27
512 0.25
513 0.26
514 0.25
515 0.25
516 0.25
517 0.23
518 0.23
519 0.21
520 0.19
521 0.19
522 0.18
523 0.16
524 0.12
525 0.09
526 0.08
527 0.07
528 0.08
529 0.07
530 0.08
531 0.07
532 0.06
533 0.06
534 0.06
535 0.07
536 0.06
537 0.06
538 0.05
539 0.05
540 0.06
541 0.06
542 0.09
543 0.08
544 0.1
545 0.12
546 0.12
547 0.14
548 0.14
549 0.14
550 0.14
551 0.17
552 0.17
553 0.18
554 0.18
555 0.16
556 0.17
557 0.17
558 0.18
559 0.15
560 0.14
561 0.12
562 0.12
563 0.12
564 0.11
565 0.11
566 0.08
567 0.07
568 0.07
569 0.07
570 0.07
571 0.07
572 0.07
573 0.07
574 0.07
575 0.09
576 0.09
577 0.08
578 0.09
579 0.09
580 0.09
581 0.1
582 0.09
583 0.08
584 0.14
585 0.14
586 0.12
587 0.13
588 0.16
589 0.16
590 0.16
591 0.16
592 0.1
593 0.11
594 0.15
595 0.15
596 0.12
597 0.12
598 0.12
599 0.12
600 0.12
601 0.11
602 0.08
603 0.13
604 0.17
605 0.17
606 0.17
607 0.19
608 0.2
609 0.24
610 0.26
611 0.23
612 0.21
613 0.24
614 0.29
615 0.3
616 0.32
617 0.28
618 0.26
619 0.24
620 0.23
621 0.2
622 0.14
623 0.12
624 0.09
625 0.09
626 0.09
627 0.09
628 0.1
629 0.16
630 0.17
631 0.17
632 0.19
633 0.18
634 0.18
635 0.2
636 0.19
637 0.14
638 0.17
639 0.18
640 0.19
641 0.2
642 0.2
643 0.19
644 0.17
645 0.18
646 0.14
647 0.16
648 0.13
649 0.14
650 0.16
651 0.16
652 0.22
653 0.21
654 0.19
655 0.19
656 0.2
657 0.2
658 0.19
659 0.17
660 0.12
661 0.11
662 0.14
663 0.23
664 0.3
665 0.38
666 0.42
667 0.44
668 0.45
669 0.46
670 0.46
671 0.39
672 0.34
673 0.31
674 0.27
675 0.27
676 0.26
677 0.24
678 0.21
679 0.19
680 0.16
681 0.11
682 0.1
683 0.14
684 0.15
685 0.18
686 0.24
687 0.26
688 0.26
689 0.29
690 0.35
691 0.4
692 0.42
693 0.41
694 0.36
695 0.38
696 0.38
697 0.35
698 0.3
699 0.25
700 0.27
701 0.28
702 0.27
703 0.21
704 0.19
705 0.2
706 0.18
707 0.14
708 0.1
709 0.08
710 0.09
711 0.16
712 0.17
713 0.2
714 0.22
715 0.21
716 0.22
717 0.24
718 0.24
719 0.17
720 0.2
721 0.22
722 0.23
723 0.24
724 0.24
725 0.21
726 0.2
727 0.21
728 0.18
729 0.14
730 0.15
731 0.15
732 0.18
733 0.18
734 0.19
735 0.18
736 0.17
737 0.16
738 0.13
739 0.12
740 0.09
741 0.08
742 0.07
743 0.06
744 0.09
745 0.08
746 0.07
747 0.06
748 0.06
749 0.06
750 0.06
751 0.06
752 0.05
753 0.05
754 0.05
755 0.05
756 0.05
757 0.05
758 0.05
759 0.04
760 0.04
761 0.05
762 0.05
763 0.06
764 0.06
765 0.1
766 0.11
767 0.14
768 0.15
769 0.15
770 0.16
771 0.16
772 0.21
773 0.22
774 0.24
775 0.23
776 0.29
777 0.29
778 0.33
779 0.36
780 0.33
781 0.33
782 0.37
783 0.39
784 0.42
785 0.46
786 0.45
787 0.46
788 0.5
789 0.49
790 0.44
791 0.45
792 0.37
793 0.34
794 0.32
795 0.29
796 0.24
797 0.22
798 0.23
799 0.23
800 0.26
801 0.26
802 0.28
803 0.32
804 0.39
805 0.41
806 0.41
807 0.36
808 0.38
809 0.41
810 0.46
811 0.46
812 0.45
813 0.47
814 0.5
815 0.55
816 0.53
817 0.49
818 0.49
819 0.53
820 0.5
821 0.56
822 0.6
823 0.64
824 0.69
825 0.71
826 0.69
827 0.71
828 0.68
829 0.61
830 0.57
831 0.5
832 0.45
833 0.4
834 0.35
835 0.25
836 0.24
837 0.2
838 0.15
839 0.15
840 0.1
841 0.11
842 0.12
843 0.16
844 0.15
845 0.17
846 0.16
847 0.17
848 0.19
849 0.18
850 0.19
851 0.15
852 0.17
853 0.17
854 0.17
855 0.21
856 0.2
857 0.22
858 0.23
859 0.24
860 0.23
861 0.27
862 0.25
863 0.21
864 0.22
865 0.2
866 0.19
867 0.19
868 0.2
869 0.18
870 0.19
871 0.19
872 0.2
873 0.23
874 0.25
875 0.26
876 0.25
877 0.26
878 0.24
879 0.23
880 0.22
881 0.21
882 0.18
883 0.18
884 0.17
885 0.14
886 0.14
887 0.14
888 0.12
889 0.1
890 0.1
891 0.08
892 0.09
893 0.09
894 0.09
895 0.17
896 0.18
897 0.2
898 0.2
899 0.19
900 0.21
901 0.24
902 0.26
903 0.21
904 0.23
905 0.21
906 0.23
907 0.24
908 0.21
909 0.19
910 0.18
911 0.16
912 0.15
913 0.14
914 0.13
915 0.17
916 0.18
917 0.17
918 0.17
919 0.18
920 0.16
921 0.19
922 0.18
923 0.13
924 0.13
925 0.16
926 0.2
927 0.2
928 0.21
929 0.18
930 0.19
931 0.22
932 0.23
933 0.23
934 0.2
935 0.21
936 0.23
937 0.25
938 0.29
939 0.33
940 0.35
941 0.38
942 0.39
943 0.39
944 0.39
945 0.37
946 0.37
947 0.3
948 0.31
949 0.28
950 0.26
951 0.23
952 0.21
953 0.21
954 0.15
955 0.15
956 0.12
957 0.13
958 0.14
959 0.14
960 0.14
961 0.14
962 0.14
963 0.14
964 0.12
965 0.11
966 0.13
967 0.14
968 0.16
969 0.17
970 0.17
971 0.18
972 0.2
973 0.18
974 0.17
975 0.18
976 0.17
977 0.2
978 0.2
979 0.19
980 0.17
981 0.2
982 0.21
983 0.2
984 0.24
985 0.21
986 0.21
987 0.27
988 0.33
989 0.3
990 0.28
991 0.3
992 0.25
993 0.31
994 0.33
995 0.3
996 0.31
997 0.37
998 0.43
999 0.43
1000 0.43
1001 0.39
1002 0.39
1003 0.43
1004 0.41
1005 0.37
1006 0.31
1007 0.28
1008 0.3
1009 0.29
1010 0.26
1011 0.18
1012 0.14
1013 0.12
1014 0.12
1015 0.12
1016 0.12
1017 0.12
1018 0.12
1019 0.13
1020 0.13
1021 0.12
1022 0.14
1023 0.17
1024 0.17
1025 0.17
1026 0.16
1027 0.18
1028 0.17
1029 0.18
1030 0.17
1031 0.14
1032 0.14
1033 0.13
1034 0.13
1035 0.11
1036 0.11
1037 0.09
1038 0.09
1039 0.09
1040 0.09
1041 0.09
1042 0.09
1043 0.11
1044 0.11
1045 0.12
1046 0.17
1047 0.17
1048 0.2
1049 0.22
1050 0.26
1051 0.25
1052 0.27
1053 0.35
1054 0.29
1055 0.28
1056 0.26
1057 0.24
1058 0.19
1059 0.21
1060 0.19
1061 0.1
1062 0.1
1063 0.1
1064 0.1
1065 0.12
1066 0.14
1067 0.17
1068 0.18
1069 0.21
1070 0.23
1071 0.23
1072 0.3
1073 0.35
1074 0.4
1075 0.4
1076 0.42
1077 0.43
1078 0.44
1079 0.47
1080 0.49
1081 0.51
1082 0.47
1083 0.51
1084 0.48
1085 0.45
1086 0.43
1087 0.4
1088 0.33
1089 0.26
1090 0.25
1091 0.17
1092 0.17
1093 0.18
1094 0.19
1095 0.2
1096 0.17
1097 0.17
1098 0.21
1099 0.3
1100 0.35
1101 0.35
1102 0.36
1103 0.43
1104 0.46
1105 0.48