Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9SJ76

Protein Details
Accession A0A1J9SJ76    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-48KTRPVGTLPPRSKPKRQTCCANPTPEDHydrophilic
414-438GEGTPEKRRPGRPRKSKDPPPPVADBasic
543-566EEANGGPKKKKPRKKVPQLGDMSEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-27RPPRERLSSLKDAGKTRPVG
29-35LPPRSKP
343-349RAKKRRK
419-431EKRRPGRPRKSKD
546-557NGGPKKKKPRKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF00382  TFIIB  
Amino Acid Sequences MSAIPRPRPPRERLSSLKDAGKTRPVGTLPPRSKPKRQTCCANPTPEDMDGVMVCTSCGNVINESHIVSEVSFGETSSGAAMVQGGFVGDEQRHANTMGSSARRLGLGGSDGRSTAESNGQDAIRGLMTALRMTGEGLEGQAMNIYRLAAKERFTHGRRPIVIAACCLYYVCRTKRDNKYLLIDFAEKIKLNVFKLGETYKELLSKLFISDPSKKDQYAALEPEPLIKKYVDKLEFGEVGGRKVAEDAVKILKRMKRDWMVEGRQPAGICGACIILAARMNNFRRTVREVVYVVKVADMTIAKRLVEFKRTQSGQLTVNEFRTNFDALPDESEPPSVYQARERAKKRRKLTSAEAEAENLSESGSRQASVAPDPSQEPRRDADGFLIPTVPASMPIDPSLLAATNLAVEELQAGEGTPEKRRPGRPRKSKDPPPPVADEDLAVEQEIEEEIENILHDPEVNNVEDVNFALVEARSKALANQMRGEQRAPETEIVEDHEFDDDPEVANCLLSPAEIAIKERIWVTHNHDWLREQQAKMLKKALEEANGGPKKKKPRKKVPQLGDMSEYTRDSPIHSAADGMQRMVQRRGKGFSRNINYEKLNALMGKNEPEASQTSSSRPSNSGSPDPSEASLEYEEEPLDGPVDPQQSLVTPPVTQQSQGGQQQQQATVINDEENDESEVEEDQDVDDTAAGIGLAGLTGEGEFDEADDWYE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.76
3 0.74
4 0.73
5 0.68
6 0.64
7 0.6
8 0.6
9 0.55
10 0.47
11 0.47
12 0.42
13 0.45
14 0.49
15 0.54
16 0.52
17 0.58
18 0.67
19 0.68
20 0.77
21 0.79
22 0.82
23 0.82
24 0.84
25 0.86
26 0.85
27 0.88
28 0.86
29 0.84
30 0.75
31 0.7
32 0.66
33 0.56
34 0.48
35 0.37
36 0.31
37 0.22
38 0.21
39 0.16
40 0.11
41 0.1
42 0.09
43 0.09
44 0.07
45 0.11
46 0.1
47 0.12
48 0.13
49 0.17
50 0.18
51 0.19
52 0.18
53 0.16
54 0.15
55 0.13
56 0.14
57 0.11
58 0.12
59 0.12
60 0.11
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.09
65 0.09
66 0.06
67 0.06
68 0.07
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.04
73 0.04
74 0.05
75 0.07
76 0.06
77 0.09
78 0.11
79 0.12
80 0.13
81 0.14
82 0.15
83 0.13
84 0.16
85 0.2
86 0.21
87 0.21
88 0.21
89 0.21
90 0.21
91 0.2
92 0.18
93 0.13
94 0.14
95 0.16
96 0.16
97 0.16
98 0.16
99 0.17
100 0.17
101 0.16
102 0.14
103 0.17
104 0.16
105 0.17
106 0.2
107 0.19
108 0.19
109 0.18
110 0.17
111 0.11
112 0.11
113 0.1
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.15
136 0.15
137 0.17
138 0.21
139 0.27
140 0.36
141 0.38
142 0.46
143 0.48
144 0.54
145 0.53
146 0.54
147 0.53
148 0.5
149 0.48
150 0.41
151 0.35
152 0.27
153 0.26
154 0.21
155 0.16
156 0.15
157 0.22
158 0.24
159 0.31
160 0.35
161 0.46
162 0.56
163 0.65
164 0.65
165 0.62
166 0.66
167 0.61
168 0.59
169 0.52
170 0.43
171 0.34
172 0.32
173 0.3
174 0.22
175 0.19
176 0.21
177 0.21
178 0.2
179 0.25
180 0.23
181 0.2
182 0.23
183 0.24
184 0.21
185 0.21
186 0.22
187 0.19
188 0.2
189 0.2
190 0.17
191 0.18
192 0.16
193 0.14
194 0.14
195 0.16
196 0.19
197 0.26
198 0.28
199 0.33
200 0.35
201 0.34
202 0.33
203 0.33
204 0.33
205 0.31
206 0.34
207 0.28
208 0.28
209 0.28
210 0.33
211 0.32
212 0.27
213 0.23
214 0.19
215 0.19
216 0.21
217 0.3
218 0.25
219 0.24
220 0.26
221 0.28
222 0.28
223 0.26
224 0.28
225 0.2
226 0.19
227 0.18
228 0.16
229 0.12
230 0.12
231 0.13
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.17
236 0.18
237 0.19
238 0.24
239 0.25
240 0.29
241 0.31
242 0.36
243 0.36
244 0.38
245 0.44
246 0.48
247 0.5
248 0.5
249 0.5
250 0.43
251 0.37
252 0.34
253 0.28
254 0.21
255 0.16
256 0.12
257 0.09
258 0.08
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.14
267 0.17
268 0.2
269 0.23
270 0.23
271 0.25
272 0.3
273 0.33
274 0.29
275 0.31
276 0.28
277 0.29
278 0.29
279 0.26
280 0.21
281 0.17
282 0.15
283 0.1
284 0.11
285 0.09
286 0.08
287 0.1
288 0.11
289 0.1
290 0.11
291 0.16
292 0.16
293 0.21
294 0.23
295 0.23
296 0.3
297 0.31
298 0.32
299 0.29
300 0.3
301 0.29
302 0.3
303 0.31
304 0.24
305 0.26
306 0.25
307 0.23
308 0.21
309 0.19
310 0.17
311 0.13
312 0.12
313 0.12
314 0.11
315 0.14
316 0.14
317 0.13
318 0.12
319 0.13
320 0.12
321 0.11
322 0.13
323 0.12
324 0.11
325 0.13
326 0.19
327 0.25
328 0.33
329 0.38
330 0.46
331 0.55
332 0.63
333 0.66
334 0.7
335 0.69
336 0.68
337 0.71
338 0.69
339 0.66
340 0.6
341 0.53
342 0.44
343 0.38
344 0.31
345 0.23
346 0.13
347 0.07
348 0.05
349 0.05
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.07
355 0.09
356 0.1
357 0.12
358 0.1
359 0.11
360 0.12
361 0.16
362 0.21
363 0.2
364 0.21
365 0.2
366 0.23
367 0.24
368 0.22
369 0.21
370 0.2
371 0.2
372 0.18
373 0.17
374 0.13
375 0.12
376 0.12
377 0.09
378 0.06
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.06
403 0.08
404 0.1
405 0.14
406 0.17
407 0.23
408 0.31
409 0.42
410 0.51
411 0.6
412 0.69
413 0.75
414 0.82
415 0.87
416 0.89
417 0.89
418 0.88
419 0.83
420 0.77
421 0.72
422 0.64
423 0.56
424 0.46
425 0.35
426 0.26
427 0.2
428 0.16
429 0.11
430 0.08
431 0.06
432 0.06
433 0.05
434 0.04
435 0.03
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.05
441 0.05
442 0.04
443 0.05
444 0.04
445 0.07
446 0.09
447 0.09
448 0.09
449 0.09
450 0.09
451 0.09
452 0.09
453 0.07
454 0.05
455 0.04
456 0.05
457 0.05
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.08
463 0.08
464 0.16
465 0.2
466 0.21
467 0.23
468 0.28
469 0.31
470 0.32
471 0.32
472 0.26
473 0.24
474 0.25
475 0.25
476 0.21
477 0.19
478 0.18
479 0.17
480 0.19
481 0.18
482 0.16
483 0.13
484 0.13
485 0.12
486 0.11
487 0.13
488 0.09
489 0.08
490 0.08
491 0.09
492 0.08
493 0.08
494 0.07
495 0.06
496 0.06
497 0.05
498 0.05
499 0.04
500 0.06
501 0.07
502 0.09
503 0.11
504 0.11
505 0.12
506 0.12
507 0.13
508 0.13
509 0.17
510 0.24
511 0.29
512 0.34
513 0.35
514 0.36
515 0.37
516 0.4
517 0.44
518 0.42
519 0.35
520 0.34
521 0.41
522 0.43
523 0.44
524 0.45
525 0.38
526 0.32
527 0.38
528 0.36
529 0.31
530 0.3
531 0.3
532 0.34
533 0.38
534 0.39
535 0.36
536 0.39
537 0.47
538 0.54
539 0.62
540 0.63
541 0.69
542 0.79
543 0.88
544 0.93
545 0.91
546 0.91
547 0.87
548 0.79
549 0.72
550 0.62
551 0.52
552 0.44
553 0.35
554 0.26
555 0.22
556 0.19
557 0.17
558 0.18
559 0.19
560 0.18
561 0.17
562 0.17
563 0.17
564 0.24
565 0.22
566 0.2
567 0.21
568 0.22
569 0.25
570 0.32
571 0.34
572 0.32
573 0.36
574 0.41
575 0.44
576 0.49
577 0.54
578 0.56
579 0.6
580 0.64
581 0.63
582 0.63
583 0.59
584 0.52
585 0.46
586 0.37
587 0.31
588 0.25
589 0.22
590 0.2
591 0.2
592 0.21
593 0.21
594 0.21
595 0.19
596 0.19
597 0.21
598 0.22
599 0.25
600 0.23
601 0.25
602 0.31
603 0.33
604 0.33
605 0.32
606 0.31
607 0.32
608 0.37
609 0.4
610 0.37
611 0.39
612 0.39
613 0.39
614 0.37
615 0.34
616 0.28
617 0.24
618 0.22
619 0.19
620 0.17
621 0.16
622 0.15
623 0.13
624 0.13
625 0.1
626 0.1
627 0.09
628 0.08
629 0.12
630 0.15
631 0.14
632 0.14
633 0.15
634 0.15
635 0.17
636 0.19
637 0.16
638 0.14
639 0.16
640 0.22
641 0.22
642 0.22
643 0.22
644 0.23
645 0.3
646 0.35
647 0.41
648 0.38
649 0.41
650 0.45
651 0.44
652 0.42
653 0.36
654 0.32
655 0.28
656 0.26
657 0.22
658 0.18
659 0.19
660 0.17
661 0.16
662 0.16
663 0.13
664 0.12
665 0.12
666 0.12
667 0.12
668 0.11
669 0.09
670 0.08
671 0.09
672 0.09
673 0.09
674 0.08
675 0.07
676 0.07
677 0.07
678 0.06
679 0.05
680 0.04
681 0.04
682 0.03
683 0.03
684 0.03
685 0.03
686 0.03
687 0.03
688 0.03
689 0.04
690 0.04
691 0.05
692 0.06