Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9QXA1

Protein Details
Accession A0A1J9QXA1    Localization Confidence High Confidence Score 25.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
327-350DTEASRSRSTKRRKKNQSASEGEAHydrophilic
380-402ETSASAKKRGRGRPKKWERLPGEBasic
624-676EPYEKLWRLREHVKKKHKYTLNAPRINAKGSKKKARRTKKNKEKTEEESKGKEBasic
683-704KGNEKDDTKGKKRKSATSQKREBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
332-361RSRSTKRRKKNQSASEGEAKVKRGRGRPPK
385-397AKKRGRGRPKKWE
633-704REHVKKKHKYTLNAPRINAKGSKKKARRTKKNKEKTEEESKGKEKEKNNGKGNEKDDTKGKKRKSATSQKRE
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR019622  Rrn9_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF10680  RRN9  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MSLFGGPLPPESPANPRDESPYFRSSSLPLPSSPPPVPDPDNDELVSSVERDPSTDGHAPEAGDDEESGSEYTSSDSESDRPRFHGKWQTYRRYIQEERDLTESLVKLRAEDLSLHLYDVHALKRRLLSEQAARKAENEKTGVADEGDDDDEQWKPGRMWTAWPLEPEQVPRPYERFTILPTIDPDEEHTVRRPGHERQRPIRDIKEILVGLVQKKAREKWDRKEWEDDTEPEAGEAGPASRGSSHEGSMEIDGQAPNRGASASRAATPTGFRREFILDDDKAYEALGPTTRSIVSKLNVVLMAVHERNRSRGRSTTSRKGANTATDTEASRSRSTKRRKKNQSASEGEAKVKRGRGRPPKSASQTPGPDSTPYVTEGEETSASAKKRGRGRPKKWERLPGESYYMVRKRLAQLAADGQLPDAAAGSNPPSRAQTTEPEPDSSRPPTPNNPSASAANLLARPRSDSTSSEDSDDNRPRKPSGGKAPPLKDWRDVLGKASSLGGFSDAVIARATRRCAELFGENATVRTADSGGAVEEPAEETQAEPVVVEDVGEGPSVRRLPQAKTEDDRDPATEPDAHRRQSHPLPSDIDPVDDDEERDEHDRPFWDSSSLTCPHPDCDRHTEPYEKLWRLREHVKKKHKYTLNAPRINAKGSKKKARRTKKNKEKTEEESKGKEKEKNNGKGNEKDDTKGKKRKSATSQKRE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.31
3 0.32
4 0.37
5 0.39
6 0.44
7 0.43
8 0.46
9 0.42
10 0.41
11 0.42
12 0.38
13 0.41
14 0.41
15 0.37
16 0.32
17 0.35
18 0.38
19 0.43
20 0.41
21 0.38
22 0.34
23 0.37
24 0.39
25 0.38
26 0.42
27 0.38
28 0.41
29 0.37
30 0.35
31 0.29
32 0.27
33 0.24
34 0.18
35 0.16
36 0.16
37 0.16
38 0.16
39 0.18
40 0.18
41 0.24
42 0.27
43 0.26
44 0.25
45 0.27
46 0.26
47 0.24
48 0.25
49 0.19
50 0.14
51 0.13
52 0.11
53 0.1
54 0.11
55 0.11
56 0.09
57 0.08
58 0.08
59 0.09
60 0.08
61 0.09
62 0.09
63 0.11
64 0.16
65 0.24
66 0.29
67 0.3
68 0.35
69 0.41
70 0.41
71 0.48
72 0.53
73 0.53
74 0.59
75 0.67
76 0.73
77 0.73
78 0.78
79 0.75
80 0.74
81 0.71
82 0.68
83 0.68
84 0.61
85 0.57
86 0.54
87 0.49
88 0.4
89 0.39
90 0.32
91 0.24
92 0.25
93 0.22
94 0.19
95 0.19
96 0.2
97 0.17
98 0.17
99 0.18
100 0.18
101 0.18
102 0.18
103 0.17
104 0.16
105 0.17
106 0.18
107 0.2
108 0.22
109 0.23
110 0.26
111 0.3
112 0.31
113 0.32
114 0.34
115 0.35
116 0.37
117 0.45
118 0.49
119 0.48
120 0.47
121 0.46
122 0.48
123 0.45
124 0.41
125 0.35
126 0.28
127 0.27
128 0.28
129 0.26
130 0.21
131 0.17
132 0.13
133 0.12
134 0.13
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.11
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.11
143 0.14
144 0.19
145 0.18
146 0.23
147 0.29
148 0.34
149 0.35
150 0.36
151 0.36
152 0.33
153 0.34
154 0.33
155 0.32
156 0.3
157 0.3
158 0.31
159 0.32
160 0.31
161 0.31
162 0.3
163 0.25
164 0.23
165 0.29
166 0.26
167 0.26
168 0.25
169 0.28
170 0.25
171 0.24
172 0.24
173 0.24
174 0.24
175 0.24
176 0.25
177 0.26
178 0.26
179 0.3
180 0.32
181 0.34
182 0.44
183 0.5
184 0.57
185 0.61
186 0.71
187 0.72
188 0.73
189 0.69
190 0.63
191 0.57
192 0.5
193 0.46
194 0.36
195 0.3
196 0.26
197 0.24
198 0.19
199 0.22
200 0.22
201 0.18
202 0.23
203 0.26
204 0.33
205 0.42
206 0.49
207 0.54
208 0.63
209 0.7
210 0.69
211 0.74
212 0.67
213 0.63
214 0.59
215 0.51
216 0.43
217 0.36
218 0.32
219 0.23
220 0.21
221 0.14
222 0.1
223 0.08
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.07
230 0.11
231 0.13
232 0.13
233 0.13
234 0.13
235 0.14
236 0.14
237 0.14
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.09
249 0.13
250 0.12
251 0.14
252 0.15
253 0.15
254 0.15
255 0.18
256 0.21
257 0.24
258 0.24
259 0.22
260 0.24
261 0.26
262 0.26
263 0.27
264 0.28
265 0.2
266 0.2
267 0.21
268 0.19
269 0.17
270 0.16
271 0.12
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.12
281 0.14
282 0.13
283 0.15
284 0.15
285 0.15
286 0.14
287 0.14
288 0.12
289 0.1
290 0.13
291 0.11
292 0.13
293 0.14
294 0.15
295 0.2
296 0.24
297 0.26
298 0.25
299 0.3
300 0.34
301 0.42
302 0.49
303 0.54
304 0.56
305 0.59
306 0.56
307 0.54
308 0.49
309 0.42
310 0.37
311 0.3
312 0.26
313 0.22
314 0.22
315 0.2
316 0.21
317 0.2
318 0.19
319 0.19
320 0.22
321 0.3
322 0.4
323 0.48
324 0.56
325 0.64
326 0.73
327 0.82
328 0.88
329 0.88
330 0.87
331 0.82
332 0.76
333 0.72
334 0.63
335 0.54
336 0.46
337 0.39
338 0.32
339 0.3
340 0.31
341 0.29
342 0.37
343 0.46
344 0.51
345 0.58
346 0.6
347 0.65
348 0.66
349 0.66
350 0.6
351 0.56
352 0.52
353 0.45
354 0.42
355 0.35
356 0.29
357 0.25
358 0.22
359 0.16
360 0.15
361 0.13
362 0.1
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.09
367 0.08
368 0.08
369 0.11
370 0.11
371 0.15
372 0.17
373 0.21
374 0.3
375 0.39
376 0.49
377 0.57
378 0.65
379 0.72
380 0.81
381 0.87
382 0.84
383 0.85
384 0.78
385 0.76
386 0.71
387 0.62
388 0.55
389 0.46
390 0.41
391 0.38
392 0.36
393 0.3
394 0.26
395 0.25
396 0.24
397 0.28
398 0.29
399 0.22
400 0.21
401 0.22
402 0.23
403 0.21
404 0.19
405 0.13
406 0.11
407 0.11
408 0.08
409 0.06
410 0.04
411 0.03
412 0.04
413 0.06
414 0.08
415 0.09
416 0.09
417 0.11
418 0.12
419 0.14
420 0.16
421 0.18
422 0.22
423 0.28
424 0.29
425 0.3
426 0.31
427 0.31
428 0.32
429 0.32
430 0.3
431 0.28
432 0.3
433 0.35
434 0.41
435 0.45
436 0.45
437 0.44
438 0.43
439 0.4
440 0.38
441 0.31
442 0.25
443 0.2
444 0.18
445 0.16
446 0.15
447 0.14
448 0.15
449 0.16
450 0.18
451 0.19
452 0.18
453 0.24
454 0.28
455 0.29
456 0.28
457 0.28
458 0.27
459 0.33
460 0.4
461 0.36
462 0.33
463 0.35
464 0.34
465 0.38
466 0.41
467 0.41
468 0.43
469 0.51
470 0.55
471 0.61
472 0.63
473 0.65
474 0.67
475 0.61
476 0.54
477 0.46
478 0.43
479 0.4
480 0.37
481 0.32
482 0.29
483 0.26
484 0.23
485 0.22
486 0.18
487 0.12
488 0.12
489 0.1
490 0.07
491 0.07
492 0.11
493 0.1
494 0.1
495 0.1
496 0.1
497 0.12
498 0.15
499 0.17
500 0.15
501 0.17
502 0.17
503 0.18
504 0.21
505 0.22
506 0.2
507 0.21
508 0.23
509 0.21
510 0.21
511 0.19
512 0.16
513 0.13
514 0.12
515 0.09
516 0.06
517 0.07
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.06
523 0.06
524 0.07
525 0.06
526 0.07
527 0.06
528 0.06
529 0.07
530 0.08
531 0.08
532 0.06
533 0.06
534 0.07
535 0.06
536 0.06
537 0.05
538 0.05
539 0.06
540 0.06
541 0.06
542 0.06
543 0.1
544 0.11
545 0.12
546 0.17
547 0.2
548 0.23
549 0.33
550 0.38
551 0.41
552 0.45
553 0.49
554 0.48
555 0.48
556 0.46
557 0.38
558 0.35
559 0.29
560 0.27
561 0.26
562 0.24
563 0.31
564 0.36
565 0.38
566 0.39
567 0.4
568 0.45
569 0.49
570 0.56
571 0.5
572 0.48
573 0.5
574 0.48
575 0.53
576 0.45
577 0.38
578 0.3
579 0.28
580 0.26
581 0.22
582 0.2
583 0.15
584 0.15
585 0.16
586 0.19
587 0.18
588 0.16
589 0.19
590 0.21
591 0.23
592 0.26
593 0.24
594 0.24
595 0.22
596 0.24
597 0.27
598 0.27
599 0.25
600 0.26
601 0.26
602 0.27
603 0.34
604 0.36
605 0.36
606 0.43
607 0.47
608 0.49
609 0.52
610 0.55
611 0.49
612 0.55
613 0.58
614 0.54
615 0.53
616 0.55
617 0.56
618 0.56
619 0.64
620 0.66
621 0.67
622 0.73
623 0.79
624 0.81
625 0.84
626 0.88
627 0.86
628 0.84
629 0.84
630 0.84
631 0.84
632 0.8
633 0.74
634 0.72
635 0.66
636 0.63
637 0.59
638 0.57
639 0.57
640 0.59
641 0.69
642 0.7
643 0.77
644 0.84
645 0.88
646 0.9
647 0.91
648 0.93
649 0.93
650 0.95
651 0.95
652 0.94
653 0.91
654 0.88
655 0.88
656 0.86
657 0.82
658 0.79
659 0.75
660 0.74
661 0.72
662 0.71
663 0.66
664 0.67
665 0.7
666 0.71
667 0.74
668 0.75
669 0.76
670 0.77
671 0.75
672 0.74
673 0.67
674 0.61
675 0.61
676 0.62
677 0.65
678 0.66
679 0.69
680 0.68
681 0.73
682 0.79
683 0.81
684 0.82