Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9RCE5

Protein Details
Accession A0A1J9RCE5    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-42DTPSKAPKPAQKPAPKPAPKDDSHydrophilic
362-390EAAAPASSKKSKKEKKPKERSRVPDDEAGHydrophilic
399-430AADAGEAEKKKKKKEKKHKEGKKDKKDRKSNEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-33KPAQKPA
357-383KRKHGEAAAPASSKKSKKEKKPKERSR
406-429EKKKKKKEKKHKEGKKDKKDRKSN
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 12.166, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MPAVKRTPIPLPGRAVAAADTPSKAPKPAQKPAPKPAPKDDSSDDESSSSDESSSSESVAAQTNGSKKEPVKKAQAAGSKSSSEASDSSEGSEEEEEEEDDDEDDEDDEESSESGDGNAKAEQPKKAEANKATVSGGNASGSGSGSEESESESEEESEEEAAPAQTSSSSRTQTAHFRAAQPFEPPSGFKAVQSGLNPSSNLAKLLKSTDLSKKQIWHITAPADIDIKQIKQFVRGKAALKEPAIEHKGVGYAFLPEEKGTQTGKKLLVPTEKGFAAVPAEITETLRLQQVVNLPKLSEKVTGSARSTAPVQKFVERPEQPARRQPEGLRMRFKPYGHSGDVSGNISDNESSALAQKRKHGEAAAPASSKKSKKEKKPKERSRVPDDEAGEPMEGVEAAADAGEAEKKKKKKEKKHKEGKKDKKDRKSNE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.38
3 0.3
4 0.26
5 0.23
6 0.19
7 0.18
8 0.17
9 0.21
10 0.22
11 0.24
12 0.28
13 0.35
14 0.42
15 0.5
16 0.59
17 0.65
18 0.72
19 0.79
20 0.84
21 0.82
22 0.8
23 0.8
24 0.78
25 0.7
26 0.69
27 0.63
28 0.58
29 0.57
30 0.53
31 0.44
32 0.36
33 0.34
34 0.28
35 0.25
36 0.18
37 0.12
38 0.1
39 0.1
40 0.13
41 0.13
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.13
46 0.16
47 0.16
48 0.13
49 0.16
50 0.21
51 0.24
52 0.25
53 0.29
54 0.3
55 0.39
56 0.47
57 0.5
58 0.54
59 0.57
60 0.6
61 0.62
62 0.65
63 0.59
64 0.56
65 0.52
66 0.43
67 0.38
68 0.35
69 0.27
70 0.22
71 0.19
72 0.18
73 0.17
74 0.16
75 0.17
76 0.17
77 0.17
78 0.16
79 0.16
80 0.12
81 0.1
82 0.11
83 0.1
84 0.09
85 0.1
86 0.09
87 0.09
88 0.08
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.05
101 0.05
102 0.09
103 0.08
104 0.09
105 0.11
106 0.13
107 0.19
108 0.22
109 0.25
110 0.25
111 0.3
112 0.35
113 0.39
114 0.44
115 0.41
116 0.45
117 0.43
118 0.42
119 0.38
120 0.33
121 0.29
122 0.22
123 0.2
124 0.13
125 0.11
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.08
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.09
155 0.13
156 0.14
157 0.15
158 0.17
159 0.19
160 0.26
161 0.3
162 0.32
163 0.31
164 0.33
165 0.35
166 0.36
167 0.35
168 0.29
169 0.26
170 0.21
171 0.2
172 0.17
173 0.15
174 0.18
175 0.17
176 0.15
177 0.16
178 0.16
179 0.18
180 0.18
181 0.2
182 0.16
183 0.17
184 0.17
185 0.15
186 0.17
187 0.14
188 0.15
189 0.12
190 0.11
191 0.1
192 0.12
193 0.13
194 0.11
195 0.15
196 0.21
197 0.27
198 0.3
199 0.31
200 0.32
201 0.35
202 0.38
203 0.36
204 0.3
205 0.26
206 0.24
207 0.23
208 0.2
209 0.17
210 0.14
211 0.12
212 0.12
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.14
217 0.13
218 0.21
219 0.26
220 0.26
221 0.32
222 0.34
223 0.35
224 0.36
225 0.39
226 0.35
227 0.3
228 0.29
229 0.23
230 0.26
231 0.26
232 0.22
233 0.18
234 0.15
235 0.17
236 0.15
237 0.15
238 0.08
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.08
245 0.08
246 0.1
247 0.1
248 0.12
249 0.14
250 0.18
251 0.19
252 0.21
253 0.23
254 0.25
255 0.3
256 0.32
257 0.31
258 0.3
259 0.28
260 0.26
261 0.24
262 0.2
263 0.15
264 0.11
265 0.09
266 0.07
267 0.08
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.1
275 0.09
276 0.11
277 0.17
278 0.21
279 0.23
280 0.23
281 0.22
282 0.23
283 0.24
284 0.23
285 0.2
286 0.16
287 0.17
288 0.21
289 0.25
290 0.25
291 0.28
292 0.26
293 0.25
294 0.27
295 0.29
296 0.27
297 0.3
298 0.3
299 0.31
300 0.33
301 0.35
302 0.42
303 0.38
304 0.42
305 0.46
306 0.52
307 0.51
308 0.57
309 0.6
310 0.55
311 0.58
312 0.53
313 0.54
314 0.56
315 0.59
316 0.59
317 0.54
318 0.56
319 0.57
320 0.55
321 0.52
322 0.49
323 0.49
324 0.43
325 0.42
326 0.37
327 0.35
328 0.37
329 0.32
330 0.25
331 0.18
332 0.16
333 0.15
334 0.13
335 0.1
336 0.09
337 0.08
338 0.08
339 0.13
340 0.2
341 0.23
342 0.25
343 0.32
344 0.37
345 0.39
346 0.42
347 0.38
348 0.35
349 0.41
350 0.45
351 0.43
352 0.39
353 0.37
354 0.39
355 0.44
356 0.44
357 0.44
358 0.49
359 0.53
360 0.62
361 0.73
362 0.8
363 0.85
364 0.92
365 0.95
366 0.95
367 0.96
368 0.94
369 0.92
370 0.9
371 0.83
372 0.79
373 0.71
374 0.62
375 0.53
376 0.46
377 0.36
378 0.26
379 0.21
380 0.14
381 0.11
382 0.08
383 0.06
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.03
389 0.04
390 0.09
391 0.11
392 0.17
393 0.25
394 0.32
395 0.43
396 0.53
397 0.63
398 0.71
399 0.81
400 0.87
401 0.9
402 0.95
403 0.96
404 0.97
405 0.97
406 0.97
407 0.97
408 0.97
409 0.96
410 0.96