Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9QY13

Protein Details
Accession A0A1J9QY13    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
159-180CPLGPRCAKKHVRRDRLCRYYLHydrophilic
246-271GGPGKFRGGWQGRKKRGGRRGGGGRYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-270ARREEERERERFEERNPGMGGPGKFRGGWQGRKKRGGRRGGGGR
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045348  CPSF4/Yth1  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0098789  P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MAVELQQQPGGGAPMATAAATLPLAQRILQPDTQQQFNFNFSDFLKREYRFGLDPSRPICNAFKQGHCPLGNACPDKHPTSSAFNNSFHGSLVCKHWLRGLCKKGEACEFLHEYNLRRMPECNHYSRHLTCSNGDDCLYLHIDPESKRPPCPHYDRGFCPLGPRCAKKHVRRDRLCRYYLAGFCPNGKQCREGAHPRWQDDLKKPEVRAEKSPEELERERAQREEEARREEERERERFEERNPGMGGPGKFRGGWQGRKKRGGRRGGGGRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.08
4 0.07
5 0.05
6 0.06
7 0.06
8 0.07
9 0.07
10 0.08
11 0.09
12 0.1
13 0.13
14 0.17
15 0.21
16 0.23
17 0.25
18 0.32
19 0.35
20 0.4
21 0.38
22 0.37
23 0.35
24 0.35
25 0.33
26 0.25
27 0.24
28 0.2
29 0.29
30 0.26
31 0.28
32 0.32
33 0.31
34 0.33
35 0.33
36 0.36
37 0.28
38 0.32
39 0.36
40 0.33
41 0.37
42 0.38
43 0.4
44 0.36
45 0.37
46 0.37
47 0.33
48 0.38
49 0.38
50 0.39
51 0.41
52 0.45
53 0.49
54 0.46
55 0.41
56 0.35
57 0.36
58 0.39
59 0.35
60 0.32
61 0.29
62 0.33
63 0.34
64 0.33
65 0.3
66 0.26
67 0.3
68 0.34
69 0.37
70 0.36
71 0.35
72 0.36
73 0.35
74 0.32
75 0.26
76 0.21
77 0.15
78 0.13
79 0.16
80 0.2
81 0.19
82 0.19
83 0.23
84 0.28
85 0.33
86 0.4
87 0.42
88 0.39
89 0.43
90 0.44
91 0.42
92 0.41
93 0.37
94 0.3
95 0.28
96 0.27
97 0.23
98 0.25
99 0.24
100 0.22
101 0.25
102 0.28
103 0.24
104 0.23
105 0.24
106 0.24
107 0.31
108 0.34
109 0.31
110 0.3
111 0.33
112 0.37
113 0.36
114 0.38
115 0.31
116 0.28
117 0.26
118 0.27
119 0.25
120 0.21
121 0.2
122 0.15
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.1
130 0.1
131 0.16
132 0.21
133 0.21
134 0.23
135 0.26
136 0.3
137 0.35
138 0.42
139 0.45
140 0.46
141 0.5
142 0.51
143 0.54
144 0.52
145 0.44
146 0.42
147 0.38
148 0.38
149 0.38
150 0.38
151 0.36
152 0.44
153 0.53
154 0.56
155 0.63
156 0.66
157 0.72
158 0.77
159 0.84
160 0.85
161 0.84
162 0.77
163 0.68
164 0.61
165 0.56
166 0.49
167 0.45
168 0.38
169 0.31
170 0.3
171 0.34
172 0.35
173 0.33
174 0.32
175 0.29
176 0.26
177 0.32
178 0.37
179 0.41
180 0.42
181 0.48
182 0.53
183 0.53
184 0.57
185 0.54
186 0.53
187 0.52
188 0.53
189 0.51
190 0.51
191 0.49
192 0.51
193 0.56
194 0.54
195 0.53
196 0.54
197 0.5
198 0.48
199 0.51
200 0.45
201 0.44
202 0.42
203 0.41
204 0.4
205 0.39
206 0.38
207 0.36
208 0.36
209 0.35
210 0.39
211 0.43
212 0.43
213 0.45
214 0.47
215 0.48
216 0.49
217 0.48
218 0.51
219 0.5
220 0.5
221 0.49
222 0.5
223 0.52
224 0.52
225 0.51
226 0.53
227 0.46
228 0.46
229 0.42
230 0.38
231 0.36
232 0.38
233 0.36
234 0.3
235 0.32
236 0.27
237 0.26
238 0.26
239 0.34
240 0.36
241 0.44
242 0.5
243 0.58
244 0.65
245 0.76
246 0.83
247 0.83
248 0.84
249 0.84
250 0.8
251 0.79