Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9RH02

Protein Details
Accession A0A1J9RH02    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-38TLSNSSQTGKKRPRPDANVPVYSHydrophilic
233-267VTAPRDVKPLNNQPQKKKKKAPRKGMKTSNTHMLNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
246-258PQKKKKKAPRKGM
Subcellular Location(s) nucl 18.5, mito_nucl 12, mito 4.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040501  TFA2_Winged_2  
IPR016656  TFIIE-bsu  
IPR003166  TFIIE_bsu_DNA-bd  
Gene Ontology GO:0005673  C:transcription factor TFIIE complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF18121  TFA2_Winged_2  
PF02186  TFIIE_beta  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51351  TFIIE_BETA_C  
Amino Acid Sequences MSFLKPGSTPSAPSPTLSNSSQTGKKRPRPDANVPVYSQPSNTNTGEKTITRVTYALDYLRENDRPMLFENVFNFLSIQLPGGPGAKPRPAPKGGRDWNVLEFILQRHEKVEYDAAGLNGLGSYRYRPKHNVRSAEQLKGLLQRQTSSVGIKVAELKDGWPGALDAIEELDKKGEILVTRNQKTNSPQLVWQNDPSLSHNIDAEFRSMFLSIALPANPDDMRSRLEAAGLKPVTAPRDVKPLNNQPQKKKKKAPRKGMKTSNTHMLNVFRDYSDKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.32
3 0.35
4 0.33
5 0.31
6 0.27
7 0.33
8 0.39
9 0.42
10 0.48
11 0.54
12 0.61
13 0.68
14 0.75
15 0.79
16 0.81
17 0.85
18 0.85
19 0.83
20 0.8
21 0.72
22 0.67
23 0.6
24 0.52
25 0.43
26 0.36
27 0.31
28 0.31
29 0.3
30 0.29
31 0.26
32 0.28
33 0.3
34 0.26
35 0.28
36 0.27
37 0.26
38 0.23
39 0.23
40 0.21
41 0.2
42 0.21
43 0.19
44 0.16
45 0.16
46 0.18
47 0.22
48 0.22
49 0.21
50 0.24
51 0.23
52 0.22
53 0.24
54 0.28
55 0.24
56 0.25
57 0.25
58 0.25
59 0.24
60 0.22
61 0.2
62 0.14
63 0.14
64 0.12
65 0.11
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.13
73 0.17
74 0.2
75 0.23
76 0.29
77 0.33
78 0.37
79 0.39
80 0.47
81 0.49
82 0.51
83 0.51
84 0.46
85 0.43
86 0.4
87 0.35
88 0.25
89 0.2
90 0.15
91 0.18
92 0.16
93 0.15
94 0.14
95 0.15
96 0.15
97 0.16
98 0.17
99 0.11
100 0.13
101 0.14
102 0.13
103 0.11
104 0.11
105 0.08
106 0.06
107 0.06
108 0.04
109 0.04
110 0.06
111 0.12
112 0.15
113 0.18
114 0.25
115 0.34
116 0.44
117 0.51
118 0.56
119 0.53
120 0.61
121 0.61
122 0.57
123 0.49
124 0.39
125 0.33
126 0.3
127 0.28
128 0.2
129 0.17
130 0.15
131 0.15
132 0.17
133 0.17
134 0.13
135 0.12
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.13
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.1
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.1
164 0.17
165 0.25
166 0.28
167 0.32
168 0.33
169 0.35
170 0.39
171 0.44
172 0.42
173 0.35
174 0.37
175 0.41
176 0.45
177 0.44
178 0.41
179 0.35
180 0.31
181 0.3
182 0.29
183 0.25
184 0.22
185 0.2
186 0.19
187 0.17
188 0.18
189 0.18
190 0.16
191 0.12
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.1
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.12
204 0.11
205 0.12
206 0.13
207 0.13
208 0.15
209 0.16
210 0.19
211 0.16
212 0.19
213 0.21
214 0.2
215 0.28
216 0.26
217 0.24
218 0.23
219 0.26
220 0.25
221 0.26
222 0.27
223 0.2
224 0.31
225 0.32
226 0.35
227 0.42
228 0.51
229 0.57
230 0.65
231 0.71
232 0.71
233 0.81
234 0.87
235 0.88
236 0.89
237 0.89
238 0.9
239 0.93
240 0.93
241 0.93
242 0.93
243 0.94
244 0.93
245 0.92
246 0.89
247 0.84
248 0.82
249 0.74
250 0.65
251 0.57
252 0.52
253 0.46
254 0.41
255 0.37
256 0.28
257 0.3