FuNGI

A0A1J9QY50

Protein Details

Accession

A0A1J9QY50

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
32-87	IYSPRSQAKPAAKKRGRPARKVVEDSDDEEEPPKKATPKKPAPKKQAKREATPEGE	Hydrophilic
112-133	AAKTETPKSTPKKAKASDKTAV	Hydrophilic
240-262	VDNKSAKKAKPAAKAGRKRKSAE	Hydrophilic
268-298	EAEPPKKARGKKTSPAKKKAKKDEPENAAMK	Basic
1038-1071	EGDITKDKYIKQPKKKAAPKKKATKKSAAADDDD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
39-52	AKPAAKKRGRPARK
63-81	PPKKATPKKPAPKKQAKRE
98-144	KKPARSAPSKASKAAAKTETPKSTPKKAKASDKTAVTPTRTSARKKK
244-261	SAKKAKPAAKAGRKRKSA
270-289	EPPKKARGKKTSPAKKKAKK
1048-1065	KQPKKKAAPKKKATKKSA
1075-1088	EKPKKSKGKGRAKK

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 12.333, cyto 9, mito_nucl 8.166

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003593 AAA+_ATPase IPR003959 ATPase_AAA_core IPR001357 BRCT_dom IPR036420 BRCT_dom_sf IPR008921 DNA_pol3_clamp-load_cplx_C IPR013725 DNA_replication_fac_RFC1_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR012178 RFC1
Gene Ontology	GO:0005663 C:DNA replication factor C complex GO:0005634 C:nucleus GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0003677 F:DNA binding GO:0003689 F:DNA clamp loader activity GO:0006281 P:DNA repair GO:0006271 P:DNA strand elongation involved in DNA replication
Pfam	View protein in Pfam PF00004 AAA PF00533 BRCT PF08519 RFC1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50172 BRCT
CDD	cd00009 AAA cd17752 BRCT_RFC1 cd18140 HLD_clamp_RFC

Amino Acid Sequences

MPADIRSFFGGKPAAQPAKEESTSEEAMQAEIYSPRSQAKPAAKKRGRPARKVVEDSDDEEEPPKKATPKKPAPKKQAKREATPEGEATTASAFFGDKKPARSAPSKASKAAAKTETPKSTPKKAKASDKTAVTPTRTSARKKKPATYSEVKDEDEDFLDDDEDGDDIFTAAFKKKGKHADDYEESSEDEPVALPQRQASGRGQKKLKDEGDFEPEADVDMKDAKPEDDFVVPDDDEEIVDNKSAKKAKPAAKAGRKRKSAETDDELEAEPPKKARGKKTSPAKKKAKKDEPENAAMKELLDSIPTVRPPSPPPKDGDAPKKFNPFKAGAHANSGPAPQSGALDIPEGKPNCLAGMTFVFTGLLEYLDREAGQQLVKRYGGKVTSGPSSKTSYVVLGSDAGPSKLQKIKQFKLKTINEEGLFALIKKLPANGGDSKAAAAYEQKQAAEEKKIKEMAEEMEREERRKGGAGGAGGGSATAAARSAASSQAPGSQTSGSQSAQDNRLWTVKYAPTQLTQICGNKTQVEKLQRWLRNFPKSQKKGFKLGGPDGSGLFRAVMIHGPPGIGKTTAAHLVAKIEGYDVVERNASDARSKKLVQDGLQGVLETTSLLGYFAGDGKKVEESKKKLVLIMDEVDGMSAGDRGGVGALAAVCKKSEIPMILICNDRRLPKMKPFDYVTYDLGFRRPTTDQIRSRIMTIIFREGLKMPKNVIDALIEGTSADIRQVVNMVSTAKLDETAMDYDKSKEMSKAWEKHIILKPWDIVGKILQGHMFSPTSKHTLNDKTELYFNDHELSYLMLQENYLGTNPMRVGNHQGKERNLKLLELVDNAAESISDGDLVDSMIHGSQQQWSLMPTHAMFSFVRPASFVAGTMAGFKTNFPQWLGRNSSQGKLTRMIKEIQGHMRLRTSGDRHEIRQQYVPILWNELVKKLEVEGKEAVPEVIDLMDSYFLTKEDFDAIMELGVGPMDQEKIKIETQAKATFTRLYNQQSHPIPFMKASSIVAPKQAVKEKPDLEEAIEESDEGEVMDEPDAKKDEDEEGDITKDKYIKQPKKKAAPKKKATKKSAAADDDDEEEEKPKKSKGKGRAKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.36
3	0.39
4	0.39
5	0.44
6	0.44
7	0.4
8	0.35
9	0.35
10	0.37
11	0.34
12	0.31
13	0.23
14	0.22
15	0.22
16	0.17
17	0.13
18	0.13
19	0.16
20	0.15
21	0.17
22	0.21
23	0.22
24	0.25
25	0.31
26	0.39
27	0.47
28	0.56
29	0.66
30	0.68
31	0.75
32	0.84
33	0.87
34	0.86
35	0.83
36	0.84
37	0.84
38	0.86
39	0.84
40	0.77
41	0.73
42	0.67
43	0.62
44	0.56
45	0.46
46	0.37
47	0.35
48	0.33
49	0.26
50	0.25
51	0.25
52	0.28
53	0.37
54	0.46
55	0.53
56	0.62
57	0.72
58	0.81
59	0.87
60	0.91
61	0.93
62	0.94
63	0.94
64	0.94
65	0.9
66	0.88
67	0.86
68	0.85
69	0.79
70	0.72
71	0.62
72	0.53
73	0.46
74	0.36
75	0.29
76	0.2
77	0.14
78	0.1
79	0.09
80	0.08
81	0.1
82	0.14
83	0.22
84	0.24
85	0.29
86	0.35
87	0.39
88	0.45
89	0.49
90	0.52
91	0.53
92	0.6
93	0.6
94	0.56
95	0.56
96	0.55
97	0.52
98	0.54
99	0.48
100	0.43
101	0.46
102	0.52
103	0.53
104	0.52
105	0.58
106	0.57
107	0.63
108	0.67
109	0.69
110	0.71
111	0.73
112	0.81
113	0.81
114	0.83
115	0.8
116	0.75
117	0.71
118	0.68
119	0.65
120	0.57
121	0.49
122	0.44
123	0.45
124	0.46
125	0.5
126	0.53
127	0.59
128	0.65
129	0.71
130	0.77
131	0.78
132	0.8
133	0.8
134	0.79
135	0.75
136	0.74
137	0.71
138	0.62
139	0.54
140	0.48
141	0.41
142	0.33
143	0.27
144	0.18
145	0.14
146	0.14
147	0.12
148	0.11
149	0.09
150	0.07
151	0.06
152	0.05
153	0.05
154	0.04
155	0.04
156	0.05
157	0.07
158	0.09
159	0.13
160	0.16
161	0.2
162	0.27
163	0.37
164	0.41
165	0.49
166	0.53
167	0.58
168	0.6
169	0.63
170	0.59
171	0.51
172	0.47
173	0.38
174	0.33
175	0.23
176	0.17
177	0.11
178	0.1
179	0.14
180	0.14
181	0.14
182	0.15
183	0.2
184	0.2
185	0.24
186	0.29
187	0.35
188	0.41
189	0.49
190	0.53
191	0.53
192	0.59
193	0.64
194	0.62
195	0.57
196	0.54
197	0.5
198	0.52
199	0.47
200	0.41
201	0.33
202	0.27
203	0.23
204	0.2
205	0.15
206	0.09
207	0.12
208	0.11
209	0.12
210	0.13
211	0.13
212	0.12
213	0.14
214	0.16
215	0.14
216	0.15
217	0.15
218	0.17
219	0.17
220	0.16
221	0.15
222	0.13
223	0.11
224	0.11
225	0.11
226	0.08
227	0.09
228	0.11
229	0.11
230	0.17
231	0.22
232	0.22
233	0.29
234	0.38
235	0.45
236	0.53
237	0.62
238	0.67
239	0.72
240	0.82
241	0.84
242	0.85
243	0.83
244	0.78
245	0.76
246	0.75
247	0.71
248	0.68
249	0.63
250	0.59
251	0.53
252	0.51
253	0.42
254	0.34
255	0.3
256	0.23
257	0.19
258	0.15
259	0.19
260	0.23
261	0.29
262	0.38
263	0.46
264	0.54
265	0.62
266	0.72
267	0.78
268	0.82
269	0.87
270	0.88
271	0.87
272	0.89
273	0.9
274	0.9
275	0.88
276	0.87
277	0.86
278	0.82
279	0.81
280	0.74
281	0.63
282	0.54
283	0.45
284	0.35
285	0.26
286	0.2
287	0.12
288	0.09
289	0.08
290	0.09
291	0.11
292	0.12
293	0.14
294	0.14
295	0.17
296	0.23
297	0.33
298	0.37
299	0.37
300	0.41
301	0.45
302	0.5
303	0.55
304	0.6
305	0.58
306	0.59
307	0.61
308	0.67
309	0.63
310	0.59
311	0.57
312	0.5
313	0.43
314	0.44
315	0.45
316	0.36
317	0.39
318	0.37
319	0.33
320	0.3
321	0.28
322	0.21
323	0.15
324	0.15
325	0.09
326	0.09
327	0.08
328	0.08
329	0.08
330	0.08
331	0.09
332	0.1
333	0.16
334	0.16
335	0.16
336	0.16
337	0.15
338	0.14
339	0.14
340	0.12
341	0.08
342	0.09
343	0.1
344	0.09
345	0.09
346	0.09
347	0.08
348	0.09
349	0.07
350	0.06
351	0.04
352	0.05
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.07
359	0.09
360	0.11
361	0.13
362	0.16
363	0.17
364	0.18
365	0.18
366	0.2
367	0.2
368	0.19
369	0.19
370	0.18
371	0.23
372	0.23
373	0.24
374	0.24
375	0.27
376	0.25
377	0.24
378	0.22
379	0.17
380	0.17
381	0.15
382	0.13
383	0.1
384	0.1
385	0.11
386	0.11
387	0.1
388	0.1
389	0.1
390	0.14
391	0.17
392	0.2
393	0.26
394	0.34
395	0.4
396	0.49
397	0.53
398	0.54
399	0.6
400	0.61
401	0.59
402	0.56
403	0.54
404	0.45
405	0.42
406	0.36
407	0.27
408	0.23
409	0.17
410	0.13
411	0.09
412	0.09
413	0.09
414	0.09
415	0.09
416	0.1
417	0.14
418	0.15
419	0.17
420	0.17
421	0.17
422	0.16
423	0.15
424	0.14
425	0.1
426	0.09
427	0.1
428	0.13
429	0.14
430	0.13
431	0.14
432	0.16
433	0.18
434	0.24
435	0.27
436	0.25
437	0.28
438	0.31
439	0.3
440	0.28
441	0.28
442	0.23
443	0.23
444	0.22
445	0.19
446	0.25
447	0.26
448	0.27
449	0.26
450	0.23
451	0.19
452	0.2
453	0.18
454	0.13
455	0.14
456	0.12
457	0.12
458	0.12
459	0.11
460	0.09
461	0.08
462	0.06
463	0.04
464	0.03
465	0.02
466	0.02
467	0.02
468	0.03
469	0.03
470	0.04
471	0.05
472	0.05
473	0.06
474	0.06
475	0.1
476	0.11
477	0.11
478	0.12
479	0.11
480	0.11
481	0.12
482	0.14
483	0.1
484	0.11
485	0.13
486	0.15
487	0.17
488	0.18
489	0.17
490	0.17
491	0.19
492	0.18
493	0.16
494	0.17
495	0.17
496	0.18
497	0.2
498	0.2
499	0.19
500	0.21
501	0.2
502	0.18
503	0.19
504	0.19
505	0.18
506	0.19
507	0.18
508	0.19
509	0.19
510	0.2
511	0.22
512	0.25
513	0.25
514	0.31
515	0.38
516	0.4
517	0.42
518	0.48
519	0.5
520	0.53
521	0.57
522	0.58
523	0.6
524	0.61
525	0.67
526	0.68
527	0.64
528	0.63
529	0.61
530	0.55
531	0.5
532	0.48
533	0.42
534	0.34
535	0.31
536	0.24
537	0.22
538	0.18
539	0.13
540	0.09
541	0.06
542	0.05
543	0.05
544	0.05
545	0.05
546	0.05
547	0.05
548	0.05
549	0.05
550	0.06
551	0.06
552	0.06
553	0.06
554	0.06
555	0.07
556	0.09
557	0.09
558	0.09
559	0.08
560	0.09
561	0.09
562	0.08
563	0.07
564	0.05
565	0.05
566	0.06
567	0.07
568	0.07
569	0.07
570	0.08
571	0.08
572	0.09
573	0.1
574	0.09
575	0.12
576	0.14
577	0.16
578	0.19
579	0.2
580	0.21
581	0.25
582	0.28
583	0.25
584	0.29
585	0.27
586	0.25
587	0.24
588	0.22
589	0.17
590	0.14
591	0.12
592	0.06
593	0.05
594	0.03
595	0.03
596	0.03
597	0.03
598	0.03
599	0.03
600	0.05
601	0.06
602	0.06
603	0.06
604	0.07
605	0.1
606	0.12
607	0.17
608	0.23
609	0.28
610	0.34
611	0.39
612	0.39
613	0.38
614	0.37
615	0.34
616	0.29
617	0.25
618	0.19
619	0.14
620	0.14
621	0.11
622	0.1
623	0.08
624	0.05
625	0.04
626	0.03
627	0.03
628	0.03
629	0.03
630	0.03
631	0.03
632	0.02
633	0.03
634	0.03
635	0.04
636	0.04
637	0.05
638	0.05
639	0.05
640	0.05
641	0.06
642	0.08
643	0.09
644	0.11
645	0.13
646	0.15
647	0.18
648	0.21
649	0.2
650	0.22
651	0.23
652	0.23
653	0.23
654	0.25
655	0.28
656	0.33
657	0.43
658	0.4
659	0.43
660	0.45
661	0.46
662	0.47
663	0.46
664	0.39
665	0.3
666	0.3
667	0.25
668	0.23
669	0.2
670	0.15
671	0.16
672	0.15
673	0.2
674	0.26
675	0.34
676	0.38
677	0.42
678	0.47
679	0.44
680	0.44
681	0.41
682	0.35
683	0.29
684	0.26
685	0.25
686	0.21
687	0.2
688	0.2
689	0.19
690	0.23
691	0.23
692	0.23
693	0.2
694	0.22
695	0.23
696	0.22
697	0.21
698	0.16
699	0.14
700	0.14
701	0.12
702	0.09
703	0.07
704	0.07
705	0.07
706	0.06
707	0.05
708	0.05
709	0.04
710	0.05
711	0.06
712	0.06
713	0.06
714	0.07
715	0.08
716	0.07
717	0.07
718	0.08
719	0.07
720	0.07
721	0.07
722	0.06
723	0.08
724	0.1
725	0.11
726	0.11
727	0.12
728	0.13
729	0.15
730	0.16
731	0.15
732	0.15
733	0.15
734	0.23
735	0.31
736	0.36
737	0.38
738	0.45
739	0.45
740	0.53
741	0.58
742	0.54
743	0.48
744	0.44
745	0.41
746	0.35
747	0.36
748	0.26
749	0.21
750	0.16
751	0.17
752	0.15
753	0.15
754	0.14
755	0.13
756	0.13
757	0.15
758	0.14
759	0.11
760	0.13
761	0.15
762	0.18
763	0.18
764	0.2
765	0.24
766	0.31
767	0.35
768	0.38
769	0.37
770	0.34
771	0.37
772	0.36
773	0.36
774	0.29
775	0.27
776	0.24
777	0.22
778	0.21
779	0.18
780	0.17
781	0.11
782	0.12
783	0.11
784	0.08
785	0.08
786	0.09
787	0.09
788	0.08
789	0.08
790	0.08
791	0.07
792	0.09
793	0.1
794	0.14
795	0.14
796	0.14
797	0.23
798	0.29
799	0.34
800	0.38
801	0.42
802	0.43
803	0.51
804	0.52
805	0.52
806	0.44
807	0.4
808	0.36
809	0.35
810	0.31
811	0.24
812	0.23
813	0.15
814	0.14
815	0.14
816	0.12
817	0.07
818	0.06
819	0.05
820	0.04
821	0.05
822	0.05
823	0.05
824	0.05
825	0.05
826	0.05
827	0.04
828	0.05
829	0.04
830	0.05
831	0.05
832	0.06
833	0.09
834	0.11
835	0.12
836	0.12
837	0.13
838	0.14
839	0.15
840	0.17
841	0.14
842	0.14
843	0.14
844	0.16
845	0.15
846	0.15
847	0.22
848	0.2
849	0.19
850	0.18
851	0.19
852	0.19
853	0.19
854	0.17
855	0.11
856	0.11
857	0.11
858	0.13
859	0.13
860	0.1
861	0.1
862	0.11
863	0.13
864	0.15
865	0.17
866	0.17
867	0.22
868	0.24
869	0.32
870	0.4
871	0.38
872	0.43
873	0.44
874	0.45
875	0.46
876	0.47
877	0.43
878	0.42
879	0.46
880	0.42
881	0.43
882	0.42
883	0.41
884	0.42
885	0.45
886	0.45
887	0.48
888	0.44
889	0.43
890	0.44
891	0.4
892	0.38
893	0.39
894	0.36
895	0.34
896	0.41
897	0.43
898	0.43
899	0.52
900	0.53
901	0.49
902	0.51
903	0.47
904	0.41
905	0.4
906	0.4
907	0.32
908	0.31
909	0.29
910	0.27
911	0.27
912	0.27
913	0.25
914	0.22
915	0.21
916	0.18
917	0.23
918	0.2
919	0.22
920	0.22
921	0.22
922	0.22
923	0.22
924	0.2
925	0.15
926	0.14
927	0.11
928	0.07
929	0.07
930	0.06
931	0.06
932	0.07
933	0.06
934	0.08
935	0.07
936	0.08
937	0.09
938	0.09
939	0.09
940	0.11
941	0.11
942	0.11
943	0.11
944	0.11
945	0.1
946	0.1
947	0.09
948	0.06
949	0.06
950	0.05
951	0.04
952	0.05
953	0.07
954	0.07
955	0.08
956	0.11
957	0.15
958	0.16
959	0.23
960	0.25
961	0.28
962	0.34
963	0.39
964	0.39
965	0.38
966	0.39
967	0.38
968	0.37
969	0.37
970	0.38
971	0.4
972	0.45
973	0.46
974	0.52
975	0.52
976	0.54
977	0.53
978	0.48
979	0.43
980	0.37
981	0.36
982	0.3
983	0.26
984	0.24
985	0.25
986	0.28
987	0.27
988	0.29
989	0.3
990	0.31
991	0.37
992	0.43
993	0.41
994	0.41
995	0.48
996	0.48
997	0.49
998	0.51
999	0.45
1000	0.39
1001	0.37
1002	0.33
1003	0.28
1004	0.24
1005	0.2
1006	0.15
1007	0.14
1008	0.12
1009	0.09
1010	0.08
1011	0.06
1012	0.07
1013	0.08
1014	0.11
1015	0.12
1016	0.16
1017	0.18
1018	0.18
1019	0.18
1020	0.19
1021	0.22
1022	0.22
1023	0.25
1024	0.22
1025	0.23
1026	0.24
1027	0.26
1028	0.25
1029	0.24
1030	0.24
1031	0.24
1032	0.32
1033	0.41
1034	0.49
1035	0.58
1036	0.68
1037	0.75
1038	0.83
1039	0.91
1040	0.92
1041	0.92
1042	0.93
1043	0.93
1044	0.93
1045	0.94
1046	0.94
1047	0.92
1048	0.91
1049	0.89
1050	0.87
1051	0.87
1052	0.8
1053	0.74
1054	0.66
1055	0.6
1056	0.52
1057	0.45
1058	0.36
1059	0.27
1060	0.26
1061	0.25
1062	0.25
1063	0.26
1064	0.29
1065	0.35
1066	0.44
1067	0.53
1068	0.6

A0A1J9QY50

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer