Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9SEF6

Protein Details
Accession A0A1J9SEF6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-68ALRNVIRNKFRRNRHVHSAKHLKLHydrophilic
302-332ELAEAERKGRRAKKQRARRAKKRSEDVEATFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
308-348RKGRRAKKQRARRAKKRSEDVEATFGKEDGAGRRRTRRRPR
Subcellular Location(s) mito 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008011  Complex1_LYR_dom  
IPR046896  Cup1-like_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF05347  Complex1_LYR  
CDD cd20273  Complex1_LYR_unchar  
Amino Acid Sequences MSAFVVPARSGAHRVAAIALYRALLTQCSPKASPSLPLADNQRAALRNVIRNKFRRNRHVHSAKHLKLSFTAGYELLDILDRASSTTPTTTTTTTPTSPPPPTPTSHHLLQTLLPLAPPHLLRFPPPPRGPRRLDPSPEACPPPARRLLARRPLPASALGGTGVRRVPRIVSANLFPMLRYRKPQPRSLSRVLTDKVKQRQRRLNVRREAETEWMAWGVGEDVWDRLVGVAVEEEEDEGVGRKRGRRGGDVVRDGEGEGDEASWTYEPQRIAKMISAQLGSQKRELVRTVKVMQDVVDKEAELAEAERKGRRAKKQRARRAKKRSEDVEATFGKEDGAGRRRTRRRPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.2
4 0.19
5 0.17
6 0.16
7 0.13
8 0.13
9 0.13
10 0.12
11 0.1
12 0.11
13 0.17
14 0.19
15 0.24
16 0.25
17 0.25
18 0.3
19 0.3
20 0.33
21 0.3
22 0.34
23 0.3
24 0.34
25 0.39
26 0.39
27 0.39
28 0.35
29 0.36
30 0.31
31 0.31
32 0.34
33 0.34
34 0.36
35 0.44
36 0.51
37 0.55
38 0.61
39 0.7
40 0.72
41 0.76
42 0.79
43 0.79
44 0.79
45 0.82
46 0.84
47 0.79
48 0.81
49 0.82
50 0.75
51 0.76
52 0.69
53 0.59
54 0.51
55 0.5
56 0.41
57 0.31
58 0.29
59 0.19
60 0.18
61 0.17
62 0.15
63 0.11
64 0.09
65 0.08
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.08
72 0.09
73 0.1
74 0.1
75 0.13
76 0.15
77 0.16
78 0.16
79 0.19
80 0.21
81 0.22
82 0.23
83 0.25
84 0.28
85 0.29
86 0.31
87 0.34
88 0.33
89 0.35
90 0.39
91 0.4
92 0.39
93 0.39
94 0.39
95 0.34
96 0.32
97 0.3
98 0.26
99 0.23
100 0.17
101 0.14
102 0.12
103 0.11
104 0.13
105 0.12
106 0.12
107 0.13
108 0.13
109 0.16
110 0.25
111 0.29
112 0.36
113 0.4
114 0.47
115 0.51
116 0.59
117 0.62
118 0.61
119 0.64
120 0.62
121 0.61
122 0.58
123 0.56
124 0.53
125 0.5
126 0.45
127 0.38
128 0.36
129 0.34
130 0.34
131 0.34
132 0.31
133 0.31
134 0.37
135 0.45
136 0.49
137 0.52
138 0.5
139 0.47
140 0.46
141 0.44
142 0.37
143 0.29
144 0.2
145 0.15
146 0.12
147 0.1
148 0.09
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.12
156 0.16
157 0.16
158 0.16
159 0.17
160 0.18
161 0.19
162 0.19
163 0.14
164 0.16
165 0.19
166 0.19
167 0.21
168 0.27
169 0.34
170 0.38
171 0.46
172 0.49
173 0.54
174 0.6
175 0.63
176 0.61
177 0.54
178 0.56
179 0.5
180 0.47
181 0.42
182 0.42
183 0.45
184 0.48
185 0.53
186 0.56
187 0.64
188 0.67
189 0.75
190 0.76
191 0.78
192 0.77
193 0.75
194 0.7
195 0.65
196 0.58
197 0.5
198 0.42
199 0.32
200 0.23
201 0.19
202 0.15
203 0.11
204 0.09
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.06
227 0.09
228 0.12
229 0.16
230 0.21
231 0.27
232 0.3
233 0.33
234 0.39
235 0.46
236 0.52
237 0.53
238 0.5
239 0.45
240 0.42
241 0.37
242 0.31
243 0.21
244 0.13
245 0.08
246 0.07
247 0.06
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.11
254 0.12
255 0.14
256 0.17
257 0.18
258 0.19
259 0.21
260 0.25
261 0.24
262 0.26
263 0.24
264 0.21
265 0.28
266 0.32
267 0.31
268 0.28
269 0.3
270 0.28
271 0.31
272 0.34
273 0.31
274 0.31
275 0.35
276 0.37
277 0.36
278 0.37
279 0.34
280 0.32
281 0.34
282 0.31
283 0.27
284 0.24
285 0.2
286 0.18
287 0.18
288 0.17
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.13
293 0.16
294 0.19
295 0.23
296 0.32
297 0.4
298 0.49
299 0.57
300 0.65
301 0.73
302 0.82
303 0.89
304 0.92
305 0.95
306 0.95
307 0.95
308 0.95
309 0.95
310 0.94
311 0.89
312 0.87
313 0.84
314 0.77
315 0.74
316 0.65
317 0.57
318 0.48
319 0.41
320 0.31
321 0.25
322 0.23
323 0.24
324 0.3
325 0.34
326 0.4
327 0.51
328 0.61