Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9RNK9

Protein Details
Accession A0A1J9RNK9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-53YALSSKRRRVVRHGIRHKQAWREHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
241-243RRG
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 8.5, mito 7, cyto 4.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006565  BTP  
IPR037818  TAF8  
IPR019473  TFIID_su8_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF07524  Bromo_TP  
PF10406  TAF8_C  
CDD cd08049  TAF8  
Amino Acid Sequences MMPGLRYPDASSTQNHAAGSKRPLAPDDEQYALSSKRRRVVRHGIRHKQAWREDPSIAAPQDEAFFQAQILRACSISLTAVGFESAKPTALEAFRGQVDEYVRVSMEHARRTTATPSDFARALAHTGYTASDLEPQLALPLPAAIALPPVPDAPPAEEPPPRLEAVLGAELSGAADKNARAYIPTHLPAFPSKHTWQATPVYSSRETDPRKIRERATQEGILAEQALRKLMAANRTGSSRRRGKDTGVAGDKRRSPPASKQMWEDAMREIIREDEMKRGDVIMGGMDDEQSGDKTNDFVVDTGLLVNYDKKYWRKGVQSTAWS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.34
3 0.32
4 0.31
5 0.34
6 0.37
7 0.38
8 0.36
9 0.35
10 0.37
11 0.4
12 0.41
13 0.42
14 0.41
15 0.35
16 0.33
17 0.32
18 0.34
19 0.31
20 0.33
21 0.33
22 0.34
23 0.39
24 0.45
25 0.49
26 0.54
27 0.63
28 0.67
29 0.72
30 0.78
31 0.81
32 0.82
33 0.85
34 0.82
35 0.79
36 0.76
37 0.73
38 0.69
39 0.62
40 0.56
41 0.5
42 0.47
43 0.44
44 0.37
45 0.29
46 0.22
47 0.19
48 0.19
49 0.17
50 0.16
51 0.1
52 0.1
53 0.09
54 0.11
55 0.13
56 0.14
57 0.16
58 0.14
59 0.13
60 0.13
61 0.13
62 0.12
63 0.09
64 0.09
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.07
71 0.09
72 0.08
73 0.09
74 0.08
75 0.09
76 0.12
77 0.12
78 0.14
79 0.13
80 0.15
81 0.14
82 0.15
83 0.15
84 0.14
85 0.15
86 0.15
87 0.15
88 0.13
89 0.13
90 0.12
91 0.13
92 0.18
93 0.2
94 0.23
95 0.23
96 0.24
97 0.25
98 0.27
99 0.3
100 0.28
101 0.25
102 0.22
103 0.23
104 0.24
105 0.23
106 0.22
107 0.19
108 0.15
109 0.14
110 0.12
111 0.1
112 0.08
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.1
119 0.09
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.03
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.08
141 0.11
142 0.12
143 0.14
144 0.15
145 0.16
146 0.18
147 0.2
148 0.17
149 0.15
150 0.13
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.09
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.04
161 0.03
162 0.04
163 0.04
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.08
169 0.11
170 0.14
171 0.16
172 0.16
173 0.16
174 0.18
175 0.2
176 0.22
177 0.2
178 0.23
179 0.22
180 0.28
181 0.29
182 0.29
183 0.29
184 0.31
185 0.31
186 0.29
187 0.29
188 0.26
189 0.26
190 0.27
191 0.26
192 0.3
193 0.31
194 0.36
195 0.43
196 0.46
197 0.52
198 0.55
199 0.56
200 0.56
201 0.59
202 0.58
203 0.55
204 0.49
205 0.42
206 0.38
207 0.35
208 0.26
209 0.2
210 0.13
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.1
217 0.12
218 0.17
219 0.18
220 0.21
221 0.21
222 0.25
223 0.29
224 0.3
225 0.36
226 0.39
227 0.4
228 0.44
229 0.45
230 0.46
231 0.5
232 0.51
233 0.51
234 0.51
235 0.53
236 0.5
237 0.54
238 0.56
239 0.51
240 0.52
241 0.47
242 0.44
243 0.49
244 0.55
245 0.58
246 0.54
247 0.55
248 0.55
249 0.57
250 0.55
251 0.46
252 0.38
253 0.36
254 0.33
255 0.29
256 0.23
257 0.18
258 0.18
259 0.19
260 0.18
261 0.2
262 0.21
263 0.22
264 0.22
265 0.22
266 0.2
267 0.18
268 0.17
269 0.11
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.07
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.13
284 0.13
285 0.12
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.09
292 0.09
293 0.13
294 0.13
295 0.16
296 0.23
297 0.27
298 0.34
299 0.42
300 0.49
301 0.54
302 0.61
303 0.67